BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-281F15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 121,791,105 - 121,932,884
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043295, Calcb
Upstream geneEG434228, Spon1, Rras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca
Downstream geneInsc, EG627967, LOC668472, Sox6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-281F15.bB6Ng01-281F15.g
ACCGA080854GA080855
length502628
definitionB6Ng01-281F15.b B6Ng01-281F15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(121,791,105 - 121,791,605)(121,932,257 - 121,932,884)
sequence
gggaattccatttccaattgttacttcattttttctcccagctaaacatg
ctgatttatatgtgctacacccccactcaccatgtgagttatacacatcc
aaaaagtcccactaacgctgttcatggaacactgggcgctctgtgctgct
gaagagcttcaatttgactgctttccaggaggaagtaaaggaagaacagg
aaaagccatgtctcttcccgccttcggtctcagctaggtagctaactggt
ctccagttttaagaaacagaggggcagtcttgttttactttgccagctgc
tgcaagaggattaggaagaccctgagtacagtgacaccatttcaccaaat
agccaagtgctttgactacgccatgctgaatgtagctcaccggtagaatg
gttggctagctgtgtaagcttcaggtttgattcccagtaccactgtgggt
gagaggaaagatgtgtaggaagaaaggaggaggaagaagtgtggagggga
ga
gaattcagagctttcagcccatggttactttgttccatagctttgatgac
tgtggtgaggtatataagttctttcaaggcccatgccaccagcaatctca
ctaaggccctgcctcttgctcctcttctcaacagcacaaccggctggaag
caaagtgatcaacaaagggacctttggagaacttatagaaaccaaatcat
aacaagtatcagggctcccagtgcagcctccaagggggagccaggaagga
gaggagattagagccatgaatgttgcaggcctagacccatcatggaaagc
ctatagacccaatgcttgagcaaagtcctcacttccgacccgcacaggag
gcacactcagtccttgctatttaaaatctataaggatgagaaagacagtg
agattttagaagccgtgcaaattaaagtctcaatcgattgctcattcttc
cgccaaacgtagattgacaaaattattgatttctctggcgtatgcgtgtt
tgtgcctgtgtgtgtctgtggttatgaattcatctaagttgccctcctgt
gtctatgtgtgggtttatctcccaacctgcacaagtgctgagatgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_121791105_121791605
seq2: B6Ng01-281F15.b_47_547

seq1  GGAATTCCATTTCCAATTGTTACTTCATTTTTTCTCCCAGCTAAACATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTCCATTTCCAATTGTTACTTCATTTTTTCTCCCAGCTAAACATGC  50

seq1  TGATTTATATGTGCTACACCCCCACTCACCATGTGAGTTATACACATCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTATATGTGCTACACCCCCACTCACCATGTGAGTTATACACATCCA  100

seq1  AAAAGTCCCACTAACGCTGTTCATGGAACACTGGGCGCTCTGTGCTGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTCCCACTAACGCTGTTCATGGAACACTGGGCGCTCTGTGCTGCTG  150

seq1  AAGAGCTTCAATTTGACTGCTTTCCAGGAGGAAGTAAAGGAAGAACAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTTCAATTTGACTGCTTTCCAGGAGGAAGTAAAGGAAGAACAGGA  200

seq1  AAAGCCATGTCTCTTCCCGCCTTCGGTCTCAGCTAGGTAGCTAACTGGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCATGTCTCTTCCCGCCTTCGGTCTCAGCTAGGTAGCTAACTGGTC  250

seq1  TCCAGTTTTAAGAAACAGAGGGGCAGTCTTGTTTTACTTTGCCAGCTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTTTTAAGAAACAGAGGGGCAGTCTTGTTTTACTTTGCCAGCTGCT  300

seq1  GCAAGAGGATTAGGAAGACCCTGAGTACAGTGACACCATTTCACCAAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGGATTAGGAAGACCCTGAGTACAGTGACACCATTTCACCAAATA  350

seq1  GCCAAGTGCTTTGACTACGCCATGCTGAATGTAGCTCACCGGTAGAATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTGCTTTGACTACGCCATGCTGAATGTAGCTCACCGGTAGAATGG  400

seq1  TTGGCTAGCTGTGTAAGCTTCAGGTTTGATTCCCAGTACCACTGTGGGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTAGCTGTGTAAGCTTCAGGTTTGATTCCCAGTACCACTGTGGGTG  450

seq1  AGAGGAAAGATGTGTAGGAAGAAAGGAGGAGGAAGAAGTGTGGAGGGGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAAGATGTGTAGGAAGAAAGGAGGAGGAAGAAGTGTGGAGGGGAG  500

seq1  A  501
      |
seq2  A  501

seq1: chr7_121932257_121932884
seq2: B6Ng01-281F15.g_65_692 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACATCTCAGCACTTGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACATCTCAGCACTTGTGC  50

seq1  AGGTTGGGAGATAAACCCACACATAGACACAGGAGGGCAACTTAGATGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGGGAGATAAACCCACACATAGACACAGGAGGGCAACTTAGATGAA  100

seq1  TTCATAACCACAGACACACACAGGCACAAACACGCATACGCCAGAGAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAACCACAGACACACACAGGCACAAACACGCATACGCCAGAGAAAT  150

seq1  CAATAATTTTGTCAATCTACGTTTGGCGGAAGAATGAGCAATCGATTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAATTTTGTCAATCTACGTTTGGCGGAAGAATGAGCAATCGATTGAG  200

seq1  ACTTTAATTTGCACGGCTTCTAAAATCTCACTGTCTTTCTCATCCTTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAATTTGCACGGCTTCTAAAATCTCACTGTCTTTCTCATCCTTATA  250

seq1  GATTTTAAATAGCAAGGACTGAGTGTGCCTCCTGTGCGGGTCGGAAGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTAAATAGCAAGGACTGAGTGTGCCTCCTGTGCGGGTCGGAAGTGA  300

seq1  GGACTTTGCTCAAGCATTGGGTCTATAGGCTTTCCATGATGGGTCTAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTGCTCAAGCATTGGGTCTATAGGCTTTCCATGATGGGTCTAGGC  350

seq1  CTGCAACATTCATGGCTCTAATCTCCTCTCCTTCCTGGCTCCCCCTTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAACATTCATGGCTCTAATCTCCTCTCCTTCCTGGCTCCCCCTTGGA  400

seq1  GGCTGCACTGGGAGCCCTGATACTTGTTATGATTTGGTTTCTATAAGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCACTGGGAGCCCTGATACTTGTTATGATTTGGTTTCTATAAGTTC  450

seq1  TCCAAAGGTCCCTTTGTTGATCACTTTGCTTCCAGCCGGTTGTGCTGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGGTCCCTTTGTTGATCACTTTGCTTCCAGCCGGTTGTGCTGTTG  500

seq1  AGAAGAGGAGCAAGAGGCAGGGCCTTAGTGAGATTGCTGGTGGCATGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGAGCAAGAGGCAGGGCCTTAGTGAGATTGCTGGTGGCATGGGC  550

seq1  CTTGAAAGAACTTATATACCTCACCACAGTCATCAAAGCTATGGAACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAAGAACTTATATACCTCACCACAGTCATCAAAGCTATGGAACAAA  600

seq1  GTAACCATGGGCTGAAAGCTCTGAATTC  628
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCATGGGCTGAAAGCTCTGAATTC  628