BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-281J18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 96,260,597 - 96,326,968
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem135
Upstream geneGrm5, Ctsc, LOC100039756, Rab38, LOC100039924, LOC666598, EG621562
Downstream geneLOC100039969, Fzd4, Prss23, LOC100040001, Me3, Ccdc81, l7Rn6, Eed, E230029C05Rik, EG384719, 2310010J17Rik, Picalm
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-281J18.bB6Ng01-281J18.g
ACCGA081042GA081043
length1,0371,083
definitionB6Ng01-281J18.b B6Ng01-281J18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,325,946 - 96,326,968)(96,260,597 - 96,261,678)
sequence
gaattctaagaggtatctgttgtgtttctaggctaaataaaatgattcct
tgtttgtagtgaaatactatttaagaaatcttagtatctgtgttcaggac
cctaccatttatctccttggaaacaggtacatgaatattattacattgaa
catttgtatttcaaagactggaatcatcattgtctggtgagctcagtggg
gccctttctggcttcacttgattctcctttctgcctcctgggctctggcc
tctgaagcatgacttccccatttctacaaatgtacaagtagaataaggtg
tggctcacagtcaaaagtaagttcctgcacttaagactagcaaccagtac
aggcttgagtccagagcctgtctatcagacacttggctggtgggtgaacc
caggcctttgactgtaagaatgtggagctctgaggcactgttgcccagac
tgtgagaacacatcactcataagattggatttgtgtctgacaggatacta
aaagctcagaaacagtccccatgcagatgtattggaaagcaatggagttt
tcaccatggtagagtctcagagtagaagaacctaagctcctctgggtctt
aaagttttcacctcacttcactttccctgtgccccacagaggtccctcgt
catgcaacaagggcagtttgaaataaagtagttgcttttttctttactct
attttgaagtatatatgtagtagaaatggtgaaattgtgttgagatggtt
ttagaagaaggaaatagatatacttggaactctttacaaagtcctcatag
ctcagctttatccatcttaaaggaggaaaatagatgaacccgaatggttg
tacatgtatacatgcacatggaagcaaagtgtggtgacacaaacacaatt
caaggtagctgctgcttgctgctgcgagggtgggggatggaaatccagca
tgtgtcctatggccaagcattaactacccaccctaagttttattagcaac
cttaaaatgtttaaaatcaattttttggaggggagta
gaattccttcagcatgtgccagctgtgagaggccgatggcttagactaaa
tccctggtatctgtgtgcttggtttcttttctttcattaggactaagagc
cacagcagactgtgggctgcaattccacagtgttgttaaggtggcaaagc
ctctacctggctcctatgactgtccaccagcgatgagtggggaagacagc
cctgcagagactttcaggctccctcccatctctctgcaagagtccatctc
tctcccataattcttcaagcatttctcttacatctgctctcaaggagtgg
agaagtttccccaatgaaggttaaatgatttatactgaaaatcagtgtac
aataggtatgtatggatatatgagcagttagaatgaatggctatgtttga
ctataatttaattacaaacaaaaagtctctttttaatatgtagtgtaggc
tgacaacttcatcaggataagggaaagttcaaaaatagctagaaatgaaa
tacagatgaagtagatccctgtaggaaagcgcttcaaggcatgcattatc
aatactgttcttgcttgatcatttcttcagcacctttattaaagaatatt
tatatttatattctatatttcaaatgcacactatttaagtgtatactatc
ttgattgtgaatcatctttattttgagagaaatataatattactttagtt
catcatttattcacattttcttcataaaagctattaaataattttgaggt
aaatggatgatgggctatattgttacatccatccatccatccatccattc
attcatttgcatccagatcacagcccccctcctcccaaacccccttccct
tctttgagaaaggaataggtcccccatgggtatcaacacaccctggcaca
tgaagtcactgaaggacgtaggcacatcctttcccactaagggccagaca
aggaaacccaaatatgggaacaggattcacagggcaggcaacagagtcag
agtgagcctgactcagttacttggggggatgtacatgaagacagcaactc
tcttactacatacctatgtcagcaatgtatgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_96325946_96326968
seq2: B6Ng01-281J18.b_49_1085 (reverse)

seq1  TACTCCCC-CCAAAAA--TGATTTAAAACATTTTTAGG-TGCTAATAAAA  46
      |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||
seq2  TACTCCCCTCCAAAAAATTGATTTTAAACATTTTAAGGTTGCTAATAAAA  50

seq1  CTTAGGGT--GTAGTT-ATGCTTGG-CATAGGACACATGCTGGA-TTCCA  91
      ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||
seq2  CTTAGGGTGGGTAGTTAATGCTTGGCCATAGGACACATGCTGGATTTCCA  100

seq1  T-CCCCACCCTCGCAGCAGC-AGCAGCAGCTACC-TGGATTGTGTTTGTG  138
      | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||
seq2  TCCCCCACCCTCGCAGCAGCAAGCAGCAGCTACCTTGAATTGTGTTTGTG  150

seq1  TCTCCACAC-TTGCTTCCATGTGCATGTATACATGTAC-ACCATTCGGGT  186
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCACCACACTTTGCTTCCATGTGCATGTATACATGTACAACCATTCGGGT  200

seq1  TCATCTATTTTCCTCCTTTAAGATGGATAAAGCTGAGCTATGAGGACTTT  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTATTTTCCTCCTTTAAGATGGATAAAGCTGAGCTATGAGGACTTT  250

seq1  GT-AAGAGTTCCAAGTATATCTATTTCCTTCTTCTAAAACCATCTCAACA  285
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGAGTTCCAAGTATATCTATTTCCTTCTTCTAAAACCATCTCAACA  300

seq1  CAATTTCACCATTTTCTACTACATATATACTTCAAAATAGAGTAAAGAAA  335
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTCACCA-TTTCTACTACATATATACTTCAAAATAGAGTAAAGAAA  349

seq1  AAAGCAACTACTTTATTTCAAACTGCCCTTGTTGCATGACGAGGGACCTC  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAACTACTTTATTTCAAACTGCCCTTGTTGCATGACGAGGGACCTC  399

seq1  TGTGGGGCACAGGGAAAGTGAAGTGAGGTGAAAACTTTAAGACCCAGAGG  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGCACAGGGAAAGTGAAGTGAGGTGAAAACTTTAAGACCCAGAGG  449

seq1  AGCTTAGGTTCTTCTACTCTGAGACTCTACCATGGTGAAAACTCCATTGC  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAGGTTCTTCTACTCTGAGACTCTACCATGGTGAAAACTCCATTGC  499

seq1  TTTCCAATACATCTGCATGGGGACTGTTTCTGAGCTTTTAGTATCCTGTC  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAATACATCTGCATGGGGACTGTTTCTGAGCTTTTAGTATCCTGTC  549

seq1  AGACACAAATCCAATCTTATGAGTGATGTGTTCTCACAGTCTGGGCAACA  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAAATCCAATCTTATGAGTGATGTGTTCTCACAGTCTGGGCAACA  599

seq1  GTGCCTCAGAGCTCCACATTCTTACAGTCAAAGGCCTGGGTTCACCCACC  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTCAGAGCTCCACATTCTTACAGTCAAAGGCCTGGGTTCACCCACC  649

seq1  AGCCAAGTGTCTGATAGACAGGCTCTGGACTCAAGCCTGTACTGGTTGCT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGTGTCTGATAGACAGGCTCTGGACTCAAGCCTGTACTGGTTGCT  699

seq1  AGTCTTAAGTGCAGGAACTTACTTTTGACTGTGAGCCACACCTTATTCTA  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTAAGTGCAGGAACTTACTTTTGACTGTGAGCCACACCTTATTCTA  749

seq1  CTTGTACATTTGTAGAAATGGGGAAGTCATGCTTCAGAGGCCAGAGCCCA  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTACATTTGTAGAAATGGGGAAGTCATGCTTCAGAGGCCAGAGCCCA  799

seq1  GGAGGCAGAAAGGAGAATCAAGTGAAGCCAGAAAGGGCCCCACTGAGCTC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGAAAGGAGAATCAAGTGAAGCCAGAAAGGGCCCCACTGAGCTC  849

seq1  ACCAGACAATGATGATTCCAGTCTTTGAAATACAAATGTTCAATGTAATA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACAATGATGATTCCAGTCTTTGAAATACAAATGTTCAATGTAATA  899

seq1  ATATTCATGTACCTGTTTCCAAGGAGATAAATGGTAGGGTCCTGAACACA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCATGTACCTGTTTCCAAGGAGATAAATGGTAGGGTCCTGAACACA  949

seq1  GATACTAAGATTTCTTAAATAGTATTTCACTACAAACAAGGAATCATTTT  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTAAGATTTCTTAAATAGTATTTCACTACAAACAAGGAATCATTTT  999

seq1  ATTTAGCCTAGAAACACAACAGATACCTCTTAGAATTC  1023
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGCCTAGAAACACAACAGATACCTCTTAGAATTC  1037

seq1: chr7_96260597_96261678
seq2: B6Ng01-281J18.g_67_1149

seq1  GAATTCCTTCAGCATGTGCCAGCTGTGAGAGGCCGATGGCTTAGACTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCAGCATGTGCCAGCTGTGAGAGGCCGATGGCTTAGACTAAA  50

seq1  TCCCTGGTATCTGTGTGCTTGGTTTCTTTTCTTTCATTAGGACTAAGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGTATCTGTGTGCTTGGTTTCTTTTCTTTCATTAGGACTAAGAGC  100

seq1  CACAGCAGACTGTGGGCTGCAATTCCACAGTGTTGTTAAGGTGGCAAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAGACTGTGGGCTGCAATTCCACAGTGTTGTTAAGGTGGCAAAGC  150

seq1  CTCTACCTGGCTCCTATGACTGTCCACCAGCGATGAGTGGGGAAGACAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCTGGCTCCTATGACTGTCCACCAGCGATGAGTGGGGAAGACAGC  200

seq1  CCTGCAGAGACTTTCAGGCTCCCTCCCATCTCTCTGCAAGAGTCCATCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGAGACTTTCAGGCTCCCTCCCATCTCTCTGCAAGAGTCCATCTC  250

seq1  TCTCCCATAATTCTTCAAGCATTTCTCTTACATCTGCTCTCAAGGAGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCATAATTCTTCAAGCATTTCTCTTACATCTGCTCTCAAGGAGTGG  300

seq1  AGAAGTTTCCCCAATGAAGGTTAAATGATTTATACTGAAAATCAGTGTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTTCCCCAATGAAGGTTAAATGATTTATACTGAAAATCAGTGTAC  350

seq1  AATAGGTATGTATGGATATATGAGCAGTTAGAATGAATGGCTATGTTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGTATGTATGGATATATGAGCAGTTAGAATGAATGGCTATGTTTGA  400

seq1  CTATAATTTAATTACAAACAAAAAGTCTCTTTTTAATATGTAGTGTAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAATTTAATTACAAACAAAAAGTCTCTTTTTAATATGTAGTGTAGGC  450

seq1  TGACAACTTCATCAGGATAAGGGAAAGTTCAAAAATAGCTAGAAATGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAACTTCATCAGGATAAGGGAAAGTTCAAAAATAGCTAGAAATGAAA  500

seq1  TACAGATGAAGTAGATCCCTGTAGGAAAGCGCTTCAAGGCATGCATTATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATGAAGTAGATCCCTGTAGGAAAGCGCTTCAAGGCATGCATTATC  550

seq1  AATACTGTTCTTGCTTGATCATTTCTTCAGCACCTTTATTAAAGAATATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTGTTCTTGCTTGATCATTTCTTCAGCACCTTTATTAAAGAATATT  600

seq1  TATATTTATATTCTATATTTCAAATGCACACTATTTAAGTGTATACTATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTATATTCTATATTTCAAATGCACACTATTTAAGTGTATACTATC  650

seq1  TTGATTGTGAATCATCTTTATTTTGAGAGAAATATAATATTACTTTAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTGTGAATCATCTTTATTTTGAGAGAAATATAATATTACTTTAGTT  700

seq1  CATCATTTATTCACATTTTCTTCATAAAAGCTATTAAATAATTTTGAGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTTATTCACATTTTCTTCATAAAAGCTATTAAATAATTTTGAGGT  750

seq1  AAATGGATGATGGGCTATATTGTTACATCCATCCATCCATCCATCCATTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGATGATGGGCTATATTGTTACATCCATCCATCCATCCATCCATTC  800

seq1  ATTCATTTGCATCCAGATCACAGCCCCCCTCCTCCCAAACCCCCTTCCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTGCATCCAGATCACAGCCCCCCTCCTCCCAAACCCCCTTCCCT  850

seq1  TCTTTGAG-AAGGAATAGGTCCCCCATGGGTATCAACACACCCTGGCACA  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGAGAAAGGAATAGGTCCCCCATGGGTATCAACACACCCTGGCACA  900

seq1  TGAAGTCACTGAA-GACGTAGGCACATCCTTTCCCACT-AGGGCCAGACA  947
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGAAGTCACTGAAGGACGTAGGCACATCCTTTCCCACTAAGGGCCAGACA  950

seq1  AGGAAACCCAATTATGGGAACAGGATTCACA-GGCAGGCAACAGAGTCAG  996
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACCCAAATATGGGAACAGGATTCACAGGGCAGGCAACAGAGTCAG  1000

seq1  AGTGAGCCCTGACTCCAGTTACT--GGGGGATGTACATGAAGACCAAGCA  1044
      |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||
seq2  AGTGAG-CCTGACT-CAGTTACTTGGGGGGATGTACATGAAGAC--AGCA  1046

seq1  ACTCTTCTACTACATA-CTATGTCCAGCAATTGTATGCT  1082
      |||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||
seq2  ACTCTCTTACTACATACCTATGT-CAGCAA-TGTATGCT  1083