BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282H12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 86,067,112 - 86,220,906
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAcan
Upstream geneA330068G13Rik, Ntrk3, Mrpl46, Mrps11, Det1, Isg20l1, Isg20
Downstream geneHapln3, Mfge8, Abhd2, Rlbp1, BC025462, Polg, AI854517, Rhcg, 5730590G19Rik, Plin, Pex11a, EG626359, EG665900, Mesp1, Mesp2, Anpep, Ap3s2, 2610034B18Rik, Zfp710
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282H12.bB6Ng01-282H12.g
ACCGA081678GA081679
length1,1571,128
definitionB6Ng01-282H12.b B6Ng01-282H12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,219,757 - 86,220,906)(86,067,112 - 86,068,246)
sequence
gaattctctgaggttctaaatgtgaacttcacgcagcctaagaagctttt
gacatctagggacagagtagacttcatgtccccctttaatggactccttc
ttggttaggggcctcctcgagctggcctgctctgttttcaccagccagga
ctatagacaaagcccattctccgggagaatttcacacatgcagaaagatt
ctggttacccgtgtgtgtagtcaagaaggggaggagaatcgggcagtgag
ggcatgagggtcctgctgtgtctatcgaatgtagggcaggtaatgggtaa
ggatgagggcaagagccagactcggcggtaccactgggggcggggagcaa
gacatggagaagtgactcctggctggctgcagctttggctttatgcagat
gtgggcttgggcttgtctccctttgtgccctgcttgcctctggtctggcc
ccttccccagactcctttctactacacagttctgtccgtgcacagtattc
tcccttcagcttgagtctgactagacctagtctgcccgacctagtctgct
tctatcttaaaggcccagcacaaatgccaccccgagaagatgctctaaag
acctcaataagaaacagtcttctcttggccatgccttttcttgtctttgt
tgtggtgctgatggtggaacctatggcctcctatggtctggccaagtgct
ccacacccagacccagccttggctctctttcacattttattttgagatag
agtctagctatgttgcctaggatagcctttgaactcactgtgtggactat
ccaggccttgaacttgtaatcccctgcctcagtctcctgagtacctggga
ttacaggcctatacatgtaggcttggctgttctttgccttttctgtgtga
aaaccagtttatggatgaacacatcctggcaaggtggcttctctcacacg
gatgctctactctatgagatcaactgttacaggtatgaggacagtgattt
ccaagggatggctcacaagggaggatgcaggggtttggggaggctgttac
agtgcgagagtgtttgcactggagtcagatcgatctttgttaagtccact
aggctgtgaacactttaaacaggaacatcttaccatattagcttcttgtg
gctctgc
gaattcaaatacgaaccacaaagggccaggtagaagacagaatttattgc
aaagcaagtgccatcaagggggtgggggcagacaatggccaaagagacca
gtgactggacttacacaccaggcaggcttggcgtcacttctacaatccca
agaacaaagccctggcattcctttgaggcctctgttccagtccatggtgt
ttctctttggagcagcttgctctgatttccaggaggaggctcagtggtgt
gtgtctggaataatgtggtttttccttccttactagaaggctcccctttt
catgaacttcaggactccgtggagccatttcaaatagttaggctgtccaa
gggggtcccaaccatgtgaccaccgatacccagaagtccctgtcctttgt
tttataggctgcagactatgaggcaggctccagcgcctaagctttccaag
cctgttaatatctaactacctaacagaggctccaacccagaccagcagaa
cgggaagctactggggacgctcagtaccgactgcatactgagtgtgagca
ctctgtactcaagtcccagggtccctcagaaagcacctcatggcttcaca
ctgcagaggaccaggctcacacatagagcttgaaaacaaaacaaaacaaa
acagacaccccatgtgacccgactacaggagtcgggtcctggattagtag
atctgcagtggaacacatgggtgagaacagtaagctgcctttgactctaa
tgggcagagacctccttacccacgcttggcatttccatcccaaagggtcc
tggctttgaaaaggactgcttgagtgacaggcaagtgcaatacgcagtta
cagttgacagccggcctcaacccaggaagcttggtcacctttctggcctc
ttctgcctggagtacccatgcagaaaggaggtctgaggccctacaggttg
ggatcctaagtagtcttggttcgagatgaggggctcgtggaggagtactg
agatatggcctagttgtgaatttggcatgagcaagccctggcattgatcc
caggaccgcaataaccagcatggttactgtatatcaggaatctcgcacaa
gagctggagcagaaggctcagaagttca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_86219757_86220906
seq2: B6Ng01-282H12.b_47_1203 (reverse)

seq1  GCAGAGCCACAAGGAGACTAAATAATTGTA--GTGTCCCTGTTT-AAGTG  47
      ||||||||||||| || ||||   || |||   ||| ||||||| |||||
seq2  GCAGAGCCACAAGAAG-CTAA--TATGGTAAGATGTTCCTGTTTAAAGTG  47

seq1  -TCACAGC--TGT-GACTTAAC-AAGATCTGTCTGACTCCAGTGC-AACA  91
       |||||||   || |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||
seq2  TTCACAGCCTAGTGGACTTAACAAAGATCGATCTGACTCCAGTGCAAACA  97

seq1  CTCTCGCAACTGT-ACAGCCTCCCCAAACCCCTGCATCCTCCCTTGTGAG  140
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCGC-ACTGTAACAGCCTCCCCAAACCCCTGCATCCTCCCTTGTGAG  146

seq1  CCATCCCTTGG-AATCACTGTCCTCATACCTGTAAACAGTTGATCTCATA  189
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCATCCCTTGGAAATCACTGTCCTCATACCTGT-AACAGTTGATCTCATA  195

seq1  GAGTAGAGCATCCGTGTGAGAGAAGCCACC-TGCCAGGATGTGTTCATCC  238
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGAGCATCCGTGTGAGAGAAGCCACCTTGCCAGGATGTGTTCATCC  245

seq1  ATAAACTGGTTTTCACACAGAAAAGGCAAAGAACAGCCAAGCCTACATGT  288
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTGGTTTTCACACAGAAAAGGCAAAGAACAGCCAAGCCTACATGT  295

seq1  ATAGGCCTGTAATCCCAGGTACTCAGGAGACTGAGGCAGGGGATTACAAG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCCTGTAATCCCAGGTACTCAGGAGACTGAGGCAGGGGATTACAAG  345

seq1  TTCAAGGCCTGGATAGTCCACACAGTGAGTTCAAAGGCTATCCTAGGCAA  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGGCCTGGATAGTCCACACAGTGAGTTCAAAGGCTATCCTAGGCAA  395

seq1  CATAGCTAGACTCTATCTCAAAATAAAATGTGAAAGAGAGCCAAGGCTGG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCTAGACTCTATCTCAAAATAAAATGTGAAAGAGAGCCAAGGCTGG  445

seq1  GTCTGGGTGTGGAGCACTTGGCCAGACCATAGGAGGCCATAGGTTCCACC  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGGTGTGGAGCACTTGGCCAGACCATAGGAGGCCATAGGTTCCACC  495

seq1  ATCAGCACCACAACAAAGACAAGAAAAGGCATGGCCAAGAGAAGACTGTT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCACCACAACAAAGACAAGAAAAGGCATGGCCAAGAGAAGACTGTT  545

seq1  TCTTATTGAGGTCTTTAGAGCATCTTCTCGGGGTGGCATTTGTGCTGGGC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTGAGGTCTTTAGAGCATCTTCTCGGGGTGGCATTTGTGCTGGGC  595

seq1  CTTTAAGATAGAAGCAGACTAGGTCGGGCAGACTAGGTCTAGTCAGACTC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAGATAGAAGCAGACTAGGTCGGGCAGACTAGGTCTAGTCAGACTC  645

seq1  AAGCTGAAGGGAGAATACTGTGCACGGACAGAACTGTGTAGTAGAAAGGA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAAGGGAGAATACTGTGCACGGACAGAACTGTGTAGTAGAAAGGA  695

seq1  GTCTGGGGAAGGGGCCAGACCAGAGGCAAGCAGGGCACAAAGGGAGACAA  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGGGAAGGGGCCAGACCAGAGGCAAGCAGGGCACAAAGGGAGACAA  745

seq1  GCCCAAGCCCACATCTGCATAAAGCCAAAGCTGCAGCCAGCCAGGAGTCA  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAAGCCCACATCTGCATAAAGCCAAAGCTGCAGCCAGCCAGGAGTCA  795

seq1  CTTCTCCATGTCTTGCTCCCCGCCCCCAGTGGTACCGCCGAGTCTGGCTC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCCATGTCTTGCTCCCCGCCCCCAGTGGTACCGCCGAGTCTGGCTC  845

seq1  TTGCCCTCATCCTTACCCATTACCTGCCCTACATTCGATAGACACAGCAG  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCTCATCCTTACCCATTACCTGCCCTACATTCGATAGACACAGCAG  895

seq1  GACCCTCATGCCCTCACTGCCCGATTCTCCTCCCCTTCTTGACTACACAC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCTCATGCCCTCACTGCCCGATTCTCCTCCCCTTCTTGACTACACAC  945

seq1  ACGGGTAACCAGAATCTTTCTGCATGTGTGAAATTCTCCCGGAGAATGGG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGTAACCAGAATCTTTCTGCATGTGTGAAATTCTCCCGGAGAATGGG  995

seq1  CTTTGTCTATAGTCCTGGCTGGTGAAAACAGAGCAGGCCAGCTCGAGGAG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTCTATAGTCCTGGCTGGTGAAAACAGAGCAGGCCAGCTCGAGGAG  1045

seq1  GCCCCTAACCAAGAAGGAGTCCATTAAAGGGGGACATGAAGTCTACTCTG  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTAACCAAGAAGGAGTCCATTAAAGGGGGACATGAAGTCTACTCTG  1095

seq1  TCCCTAGATGTCAAAAGCTTCTTAGGCTGCGTGAAGTTCACATTTAGAAC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAGATGTCAAAAGCTTCTTAGGCTGCGTGAAGTTCACATTTAGAAC  1145

seq1  CTCAGAGAATTC  1150
      ||||||||||||
seq2  CTCAGAGAATTC  1157

seq1: chr7_86067112_86068246
seq2: B6Ng01-282H12.g_65_1192

seq1  GAATTCAAATACGAACCACAAAGGGCCAGGTAGAAGACAGAATTTATTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATACGAACCACAAAGGGCCAGGTAGAAGACAGAATTTATTGC  50

seq1  AAAGCAAGTGCCATCAAGGGGGTGGGGGCAGACAATGGCCAAAGAGACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAGTGCCATCAAGGGGGTGGGGGCAGACAATGGCCAAAGAGACCA  100

seq1  GTGACTGGACTTACACACCAGGCAGGCTTGGCGTCACTTCTACAATCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGGACTTACACACCAGGCAGGCTTGGCGTCACTTCTACAATCCCA  150

seq1  AGAACAAAGCCCTGGCATTCCTTTGAGGCCTCTGTTCCAGTCCATGGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAAGCCCTGGCATTCCTTTGAGGCCTCTGTTCCAGTCCATGGTGT  200

seq1  TTCTCTTTGGAGCAGCTTGCTCTGATTTCCAGGAGGAGGCTCAGTGGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTTGGAGCAGCTTGCTCTGATTTCCAGGAGGAGGCTCAGTGGTGT  250

seq1  GTGTCTGGAATAATGTGGTTTTTCCTTCCTTACTAGAAGGCTCCCCTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGGAATAATGTGGTTTTTCCTTCCTTACTAGAAGGCTCCCCTTTT  300

seq1  CATGAACTTCAGGACTCCGTGGAGCCATTTCAAATAGTTAGGCTGTCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACTTCAGGACTCCGTGGAGCCATTTCAAATAGTTAGGCTGTCCAA  350

seq1  GGGGGTCCCAACCATGTGACCACCGATACCCAGAAGTCCCTGTCCTTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTCCCAACCATGTGACCACCGATACCCAGAAGTCCCTGTCCTTTGT  400

seq1  TTTATAGGCTGCAGACTATGAGGCAGGCTCCAGCGCCTAAGCTTTCCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGGCTGCAGACTATGAGGCAGGCTCCAGCGCCTAAGCTTTCCAAG  450

seq1  CCTGTTAATATCTAACTACCTAACAGAGGCTCCAACCCAGACCAGCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTAATATCTAACTACCTAACAGAGGCTCCAACCCAGACCAGCAGAA  500

seq1  CGGGAAGCTACTGGGGACGCTCAGTACCGACTGCATACTGAGTGTGAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGAAGCTACTGGGGACGCTCAGTACCGACTGCATACTGAGTGTGAGCA  550

seq1  CTCTGTACTCAAGTCCCAGGGTCCCTCAGAAAGCACCTCATGGCTTCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTACTCAAGTCCCAGGGTCCCTCAGAAAGCACCTCATGGCTTCACA  600

seq1  CTGCAGAGGACCAGGCTCACACATAGAGCTTGAAAACAAAACAAAACAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAGGACCAGGCTCACACATAGAGCTTGAAAACAAAACAAAACAAA  650

seq1  ACAGACACCCCATGTGACCCGACTACAGGAGTCGGGTCCTGGATTAGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACACCCCATGTGACCCGACTACAGGAGTCGGGTCCTGGATTAGTAG  700

seq1  ATCTGCAGTGGAACACATGGGTGAGAACAGTAAGCTGCCTTTGACTCTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCAGTGGAACACATGGGTGAGAACAGTAAGCTGCCTTTGACTCTAA  750

seq1  TGGGCAGAGACCTCCTTACCCACGCTTGGCATTTCCATCCCAAAGGGTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGAGACCTCCTTACCCACGCTTGGCATTTCCATCCCAAAGGGTCC  800

seq1  TGGCTTTGAAAAGGACTGCTTGAGTGACAGGCAAGTGCAATACGCAGTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTGAAAAGGACTGCTTGAGTGACAGGCAAGTGCAATACGCAGTTA  850

seq1  CAGTTGACAGCCGGCCTCAACCCAGGAAGCTTGGTCACCTTTCTGGCCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGACAGCCGGCCTCAACCCAGGAAGCTTGGTCACCTTTCTGGCCTC  900

seq1  TTCTGCCTGGAGTACCCATGCAG-AAGGAGGTCTGAGGCCCTACAGGTT-  948
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCTGCCTGGAGTACCCATGCAGAAAGGAGGTCTGAGGCCCTACAGGTTG  950

seq1  GGATCCTAAGTAGTCTTGGTTCGAAGATGAGGGGCTCGTGGGAGGAGTAC  998
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGATCCTAAGTAGTCTTGGTTCG-AGATGAGGGGCTCGT-GGAGGAGTAC  998

seq1  TGAGGATATGG-CTAGTTTGTGAATTTGGCATGAGCAAGGCCCTGGCATT  1047
      ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGA-GATATGGCCTAG-TTGTGAATTTGGCATGAGCAA-GCCCTGGCATT  1045

seq1  GATCCCCAGGACCGCATAAACCAGGCATGG-TACTGTATATCAGGAATCT  1096
      ||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAT-CCCAGGACCGCAATAACCA-GCATGGTTACTGTATATCAGGAATCT  1093

seq1  CGGCACACAGGAGGCTGAGGCAGAAAGCTCAGAAGTTCA  1135
      ||   |||| || ||||  |||||| |||||||||||||
seq2  CG---CACAAGA-GCTGGAGCAGAAGGCTCAGAAGTTCA  1128