BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282K15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 59,455,630 - 59,576,050
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668779, Tmem16e, Slc17a6, EG620599, LOC654473, LOC100040608, Gas2, 1700015G11Rik, EG668783
Downstream geneEG620782, LOC100040692, Gm1865, LOC100040718
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282K15.bB6Ng01-282K15.g
ACCGA081822GA081823
length1,2021,087
definitionB6Ng01-282K15.b B6Ng01-282K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,455,630 - 59,456,819)(59,574,953 - 59,576,050)
sequence
gaattccacaaacacaaacaaagtacaaaaacaaaataagaaaaaaaatt
ttttgttaagtgatgataattatgataatcagttcatttcccctactaaa
atcataagtttgttagtaagatgcaaaaatgaaatcaggatggattttta
ttttttctaaaaattcaaataccatatactgttgaaatgaagacccccaa
atattaactgaaacaaataaaatacaaaaggcaacagcaatgaacctgaa
ttatatgagaacgtactgcaggccctggtgtagggattctgttttcagta
tagctctgagtcctgagtcagctctgagtcaggagataattaaagaaaag
gcttcctaggaagaagacatcagactccacctcggaatgtgctctgtgtg
tatccagcttgggaactgaagatgaggtgacgcaggttattgtaccctgc
agtggtcacaataaccccaagtttgcaaaattgtaaggtgggggatccta
tagcgttcaaggtcatctaagacaaatgcttaacattatagacaagcttg
tccctgtcattaaaccttctgtaaggtggctcagctgacctgggatgttg
ctggtcaaaagccagtcatctttgcccatctttatcctctttaatagcca
tttattgaccacctttgcatgtgacctaacatccttgtgactgataagta
aatcctttgcaatgtgtaacagtcccctaattgtcactaaacccaaagct
aagaatgtccagagatggagcctgctgcctgcgtcagagatttattagct
ctcctgtcatgcacatacctgatgcttccaccaccatgcagttgaaaatc
atgttgatctatggctttattttgttctcgttctataaaagcttcatgaa
cttcacatgtctgtgtgtgtgaataaaacttcccttctagaggaacattt
gaattctcatcaagtgaaaacaagggactaattattttaataataaatat
cagcccagttccatgatactatagatgtatattctgggaataattttacc
tgccctacagtatactaaattttcattataatagtttcatgtattccagg
ttcccaatttaaaattgaaaagtttatataccccaccccaccagacatgt
tgaaggttattaaaccattcatgaaccgccactggaattgtagagatttt
ct
gaattccagggagcctgggatacacagagcattgaaggacaacccatgat
atatatttaaaaaaaaaaacagctaaaaagttaaaaatccctaaataatc
atgatatgccatgacatcttgaatatatttacaaacaaacttggtattgt
aattcaaatttaaattaaatatagtatagggacatttggttccacattta
aaagtaaattacttaatgtacaattaccatatcttaaataatacaatata
catattattttataaaacaagcacagtgttataagaatgctcactttaaa
taaatcaatagaagatcatcaaaatagataagtataatttaagaaagaaa
cactactatatataatgaaaattataaactttcatttagggatataacat
tcatgaggctgacactcaagcttagtgccccttcttttagccctcaaatc
atggccatttgattagaggatgaaatccctttggccacatgaaacctttt
aatgggtaagtgtgtgcataacattcctatgaatttaagccttatataca
ggtgagattgattaagacttgggaagtcaacaaaatttacacagctcaaa
caataaatcacagatctcaggaagttcttgaaacaatgacacattctgtt
tttcctcttatgctttgtgagctctcctgacaaatatcaagtacaaagtg
agcttgcaattccctcctttggagggctctcttccatcctgcctaacttt
cagatgtctgctccagggctatgaaagtcatcttgctaaacactttctcc
cttctcttttggtattttcacacaatataattcagtggaatatagttatc
aaagcataaaaaaataataaatattaatcatctacatgaaaatattatga
tagttttccaagtctttatattcaaaatttaaaacaaactctgtagtgta
atcatgtagtgcccagaatttgcattatgttgggtaaaatataataactt
gaatatacttactcagtgtagccactgactttgtattgcaaaatatacaa
aacatcaaatttgacattacatatgtattgtactgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_59455630_59456819
seq2: B6Ng01-282K15.b_44_1245

seq1  GAATTCCACAAACACAAACAAAGTACAAAAACAAAATAAGAAAAAAAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAAACACAAACAAAGTACAAAAACAAAATAAGAAAAAAAATT  50

seq1  TTTTGTTAAGTGATGATAATTATGATAATCAGTTCATTTCCCCTACTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTAAGTGATGATAATTATGATAATCAGTTCATTTCCCCTACTAAA  100

seq1  ATCATAAGTTTGTTAGTAAGATGCAAAAATGAAATCAGGATGGATTTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAAGTTTGTTAGTAAGATGCAAAAATGAAATCAGGATGGATTTTTA  150

seq1  TTTTTTCTAAAAATTCAAATACCATATACTGTTGAAATGAAGACCCCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCTAAAAATTCAAATACCATATACTGTTGAAATGAAGACCCCCAA  200

seq1  ATATTAACTGAAACAAATAAAATACAAAAGGCAACAGCAATGAACCTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAACTGAAACAAATAAAATACAAAAGGCAACAGCAATGAACCTGAA  250

seq1  TTATATGAGAACGTACTGCAGGCCCTGGTGTAGGGATTCTGTTTTCAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGAGAACGTACTGCAGGCCCTGGTGTAGGGATTCTGTTTTCAGTA  300

seq1  TAGCTCTGAGTCCTGAGTCAGCTCTGAGTCAGGAGATAATTAAAGAAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCTGAGTCCTGAGTCAGCTCTGAGTCAGGAGATAATTAAAGAAAAG  350

seq1  GCTTCCTAGGAAGAAGACATCAGACTCCACCTCGGAATGTGCTCTGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTAGGAAGAAGACATCAGACTCCACCTCGGAATGTGCTCTGTGTG  400

seq1  TATCCAGCTTGGGAACTGAAGATGAGGTGACGCAGGTTATTGTACCCTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCAGCTTGGGAACTGAAGATGAGGTGACGCAGGTTATTGTACCCTGC  450

seq1  AGTGGTCACAATAACCCCAAGTTTGCAAAATTGTAAGGTGGGGGATCCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCACAATAACCCCAAGTTTGCAAAATTGTAAGGTGGGGGATCCTA  500

seq1  TAGCGTTCAAGGTCATCTAAGACAAATGCTTAACATTATAGACAAGCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCGTTCAAGGTCATCTAAGACAAATGCTTAACATTATAGACAAGCTTG  550

seq1  TCCCTGTCATTAAACCTTCTGTAAGGTGGCTCAGCTGACCTGGGATGTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTCATTAAACCTTCTGTAAGGTGGCTCAGCTGACCTGGGATGTTG  600

seq1  CTGGTCAAAAGCCAGTCATCTTTGCCCATCTTTATCCTCTTTAATAGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCAAAAGCCAGTCATCTTTGCCCATCTTTATCCTCTTTAATAGCCA  650

seq1  TTTATTGACCACCTTTGCATGTGACCTAACATCCTTGTGACTGATAAGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGACCACCTTTGCATGTGACCTAACATCCTTGTGACTGATAAGTA  700

seq1  AATCCTTTGCAATGTGTAACAGTCCCCTAATTGTCACTAAACCCAAAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTTGCAATGTGTAACAGTCCCCTAATTGTCACTAAACCCAAAGCT  750

seq1  AAGAATGTCCAGAGATGGAGCCTGCTGCCTGCGTCAGAGATTTATTAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGTCCAGAGATGGAGCCTGCTGCCTGCGTCAGAGATTTATTAGCT  800

seq1  CTCCTGTCATGCACATACCTGATGCTTCCACCACCATGCAGTTGAAAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTCATGCACATACCTGATGCTTCCACCACCATGCAGTTGAAAATC  850

seq1  ATGTTGATCTATGGCTTTATTTTGTTCTCGTTCTATAAAAGCTTCATGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGATCTATGGCTTTATTTTGTTCTCGTTCTATAAAAGCTTCATGAA  900

seq1  CTTCACATGTCTGTGTGTGTGAATAAAACTTCCCTTCTAGAGGAACATTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACATGTCTGTGTGTGTGAATAAAACTTCCCTTCTAGAGGAACATTT  950

seq1  GAATTCTCATCAAGTGAAAACAAGGGACTAATTATTTTAATAATAAATAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATCAAGTGAAAACAAGGGACTAATTATTTTAATAATAAATAT  1000

seq1  CAGCCCAGTTCCATGATAACTATAGATGTAATATTCT-GGAATAATTTTA  1049
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  CAGCCCAGTTCCATGAT-ACTATAGATGT-ATATTCTGGGAATAATTTTA  1048

seq1  CCTG-CCTACAGTATACTAAATTTCATTTAATATAGTTTCATGTATT-CA  1097
      |||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||| ||
seq2  CCTGCCCTACAGTATACTAAATTTTCATTATAATAGTTTCATGTATTCCA  1098

seq1  GGT--CCAATT--AAAATGAAAAGTTTATATA---CACACACACAGACAT  1140
      |||  ||||||  ||| |||||||||||||||   ||| |   |||||||
seq2  GGTTCCCAATTTAAAATTGAAAAGTTTATATACCCCACCCCACCAGACAT  1148

seq1  G-TGAA-GTTATTAAACAATCCAGTGAA-CGCCACTGGAATTG-AG-GAT  1185
      | |||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||| || |||
seq2  GTTGAAGGTTATTAAACCATTCA-TGAACCGCCACTGGAATTGTAGAGAT  1197

seq1  TTTCT  1190
      |||||
seq2  TTTCT  1202

seq1: chr7_59574953_59576050
seq2: B6Ng01-282K15.g_65_1151 (reverse)

seq1  GACAGTACAATACCAATATGTAATTGTCAAATTTGATGTTTTTGTAATTA  50
      |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||
seq2  GACAGTACAATAC--ATATGTAA-TGTCAAATTTGATG-TTTTGTA--TA  44

seq1  TTTTGCCAATACAAAGTCAGTGGCTACACTGAAGTAAGTATATTCAAGTT  100
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTTG-CAATACAAAGTCAGTGGCTACACTG-AGTAAGTATATTCAAGTT  92

seq1  ATTATATTTTAACCCAACATAATGCAAATTCTGGGCAACTACATGATTAC  150
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATTATATTTT-ACCCAACATAATGCAAATTCTGGGC-ACTACATGATTAC  140

seq1  ACTACAGAGTTTTGTTTTAAATTTTGAATATAAAGACTTGGAAAACTATC  200
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGAG-TTTGTTTTAAATTTTGAATATAAAGACTTGGAAAACTATC  189

seq1  ATAATATTTTCATGTAGATGATTAATATTTATTATTTTTTTATGCTTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATTTTCATGTAGATGATTAATATTTATTATTTTTTTATGCTTTGA  239

seq1  TAACTATATTCCACTGAATTATATTGTGTGAAAATACCAAAAGAGAAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTATATTCCACTGAATTATATTGTGTGAAAATACCAAAAGAGAAGGG  289

seq1  AGAAAGTGTTTAGCAAGATGACTTTCATAGCCCTGGAGCAGACATCTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTGTTTAGCAAGATGACTTTCATAGCCCTGGAGCAGACATCTGAA  339

seq1  AGTTAGGCAGGATGGAAGAGAGCCCTCCAAAGGAGGGAATTGCAAGCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGGCAGGATGGAAGAGAGCCCTCCAAAGGAGGGAATTGCAAGCTCA  389

seq1  CTTTGTACTTGATATTTGTCAGGAGAGCTCACAAAGCATAAGAGGAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTACTTGATATTTGTCAGGAGAGCTCACAAAGCATAAGAGGAAAAA  439

seq1  CAGAATGTGTCATTGTTTCAAGAACTTCCTGAGATCTGTGATTTATTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGTGTCATTGTTTCAAGAACTTCCTGAGATCTGTGATTTATTGTT  489

seq1  TGAGCTGTGTAAATTTTGTTGACTTCCCAAGTCTTAATCAATCTCACCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTGTGTAAATTTTGTTGACTTCCCAAGTCTTAATCAATCTCACCTG  539

seq1  TATATAAGGCTTAAATTCATAGGAATGTTATGCACACACTTACCCATTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAAGGCTTAAATTCATAGGAATGTTATGCACACACTTACCCATTAA  589

seq1  AAGGTTTCATGTGGCCAAAGGGATTTCATCCTCTAATCAAATGGCCATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTTCATGTGGCCAAAGGGATTTCATCCTCTAATCAAATGGCCATGA  639

seq1  TTTGAGGGCTAAAAGAAGGGGCACTAAGCTTGAGTGTCAGCCTCATGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGGCTAAAAGAAGGGGCACTAAGCTTGAGTGTCAGCCTCATGAAT  689

seq1  GTTATATCCCTAAATGAAAGTTTATAATTTTCATTATATATAGTAGTGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATATCCCTAAATGAAAGTTTATAATTTTCATTATATATAGTAGTGTT  739

seq1  TCTTTCTTAAATTATACTTATCTATTTTGATGATCTTCTATTGATTTATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTTAAATTATACTTATCTATTTTGATGATCTTCTATTGATTTATT  789

seq1  TAAAGTGAGCATTCTTATAACACTGTGCTTGTTTTATAAAATAATATGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTGAGCATTCTTATAACACTGTGCTTGTTTTATAAAATAATATGTA  839

seq1  TATTGTATTATTTAAGATATGGTAATTGTACATTAAGTAATTTACTTTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTATTATTTAAGATATGGTAATTGTACATTAAGTAATTTACTTTTA  889

seq1  AATGTGGAACCAAATGTCCCTATACTATATTTAATTTAAATTTGAATTAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGAACCAAATGTCCCTATACTATATTTAATTTAAATTTGAATTAC  939

seq1  AATACCAAGTTTGTTTGTAAATATATTCAAGATGTCATGGCATATCATGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCAAGTTTGTTTGTAAATATATTCAAGATGTCATGGCATATCATGA  989

seq1  TTATTTAGGGATTTTTAACTTTTTAGCTGTTTTTTTTTTTAAATATATAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAGGGATTTTTAACTTTTTAGCTGTTTTTTTTTTTAAATATATAT  1039

seq1  CATGGGTTGTCCTTCAATGCTCTGTGTATCCCAGGCTCCCTGGAATTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGTTGTCCTTCAATGCTCTGTGTATCCCAGGCTCCCTGGAATTC  1087