BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284K06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,541,417 - 136,691,025
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRgs10, LOC100043643, Tial1, Bag3, EG639030, Inpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip, LOC210714, LOC100043144, Ppapdc1a
Downstream geneBrwd2, LOC100043150, Fgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284K06.bB6Ng01-284K06.g
ACCGA083291GA083292
length7801,099
definitionB6Ng01-284K06.b B6Ng01-284K06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,541,417 - 136,542,488)(136,689,924 - 136,691,025)
sequence
gaattccttgcctggccagtggaagttgggtggagactataggtcaaagt
tcactggatttaaagaaaataaaggaacctggaaagttaggtggtttctg
aagttctcttctcaaaaccccatagacaccagtatttcataggttgctag
tgtcttcagtgtgtgaagagagaccaaatgacctaaggtgaggagaagcc
atgttttcaattttaattaacaatctagcagcttaacactgaaggatctg
gggtccacagaaggtcaaccaataacctaagtcttaccgtgtggagaaga
taacactgggtttgatttatgaactcgtaacattttttgtcacggttcac
agagaccttgtgtgtttctcattgctgagatggaatgcttggcacaggtg
tttcacatccattttggctttcacactgaagttcatcagggtggagaggc
catggaggcaggactgtgaagcagtggaccacatatcaatggtcagcaag
cagagagagatgaacactggtgcctcgctcatggtcttcttgtcctcgat
cttttcccagggatagcacagcatatccacactcaggatgggtcttccct
ttccagttaactctctctagacacaccctcgatgacacaccccagaggtg
agcttccacagtcagtctacatccaatcaagctgatagtgaagaggagcc
ttggctgtcctcacctagagactgcacttcaccccaggaagtgggaagtg
aacaaaagctgaagagcagataagatcctg
gaattccaatgcagactgaaatcctgttcaaccatagaaaaacactgttt
aaaaagaaacagcttaactgtatgtggtgacacatgcctttaatcccagt
actcaggaggcagaggcagtcagatctctgtaagttcgaggcctgccttg
tctacaaattgagtccaggacagccagggctacacagagaaaccctgtct
caaaaaaccaaaagaaaagaaaaaagaataaagaaacggcctgaggccaa
caaaactctagccatcatggtacagagggaatgcatggggatgggactgg
tttctagtgctgtgataaacacaccatgaccaaagaaacttgtaggcaga
aagagttggtgtggctgtgtcctacttcattgttgagggaagccagggca
ggacctcaaggtaggaacctggaggcaggaaccgaagcagagggtttgga
gaaattctgcttactggcttgctctccatggattgcttagtctattttct
taagttaaagggagaccacctgcccaggggtggcactacccacagtaggc
ctgggccttcccacattaattatcaatcaagaaaatgccccacaggcttg
cctacagaccaattgctggaagaatttctatgtttgtggtttttgtacct
tgataactctagttcaggtcaacttgataaaaaacaccaaccagcacact
gcctgtggagataccacaagccatagaaattgcctctcatggttgatggg
gcttgttctctagggcaaaaaacaccattatcctccaaatgagaattttg
agctcctgcttctatgagtttatagattttacaaactaaagttatcagca
cctgatttcttctttttaaagtaatgccttcttttatattgttggcttaa
ataagatgatctactgaacagttactagtagactgttgttaagtcaatgc
aatacagttgtgggctataattactatccctgctaaatattccaggaggt
aattctgagggttgcagttgttagatggcctcattatctaatttgttcta
aggcatgaaagggcatggtgctttgagttgaattaaccttaagccttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136541417_136542488
seq2: B6Ng01-284K06.b_47_1119

seq1  GAATTCCTTGCCTGGCCAGTGGAAGTTGGGTGGAGACTATAGGTCAAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGCCTGGCCAGTGGAAGTTGGGTGGAGACTATAGGTCAAAGT  50

seq1  TCACTGGATTTAAAGAAAATAAAGGAACCTGGAAAGTTAGGTGGTTTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGATTTAAAGAAAATAAAGGAACCTGGAAAGTTAGGTGGTTTCTG  100

seq1  AAGTTCTCTTCTCAAAACCCCATAGACACCAGTATTTCATAGGTTGCTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTCTTCTCAAAACCCCATAGACACCAGTATTTCATAGGTTGCTAG  150

seq1  TGTCTTCAGTGTGTGAAGAGAGACCAAATGACCTAAGGTGAGGAGAAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCAGTGTGTGAAGAGAGACCAAATGACCTAAGGTGAGGAGAAGCC  200

seq1  ATGTTTTCAATTTTAATTAACAATCTAGCAGCTTAACACTGAAGGATCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTCAATTTTAATTAACAATCTAGCAGCTTAACACTGAAGGATCTG  250

seq1  GGGTCCACAGAAGGTCAACCAATAACCTAAGTCTTACCGTGTGGAGAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCACAGAAGGTCAACCAATAACCTAAGTCTTACCGTGTGGAGAAGA  300

seq1  TAACACTGGGTTTGATTTATGAACTCGTAACATTTTTTGTCACGGTTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACTGGGTTTGATTTATGAACTCGTAACATTTTTTGTCACGGTTCAC  350

seq1  AGAGACCTTGTGTGTTTCTCATTGCTGAGATGGAATGCTTGGCACAGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCTTGTGTGTTTCTCATTGCTGAGATGGAATGCTTGGCACAGGTG  400

seq1  TTTCACATCCATTTTGGCTTTCACACTGAAGTTCATCAGGGTGGAGAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATCCATTTTGGCTTTCACACTGAAGTTCATCAGGGTGGAGAGGC  450

seq1  CATGGAGGCAGGACTGTGAAGCAGTGGACCACATATCAATGGTCAGCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAGGCAGGACTGTGAAGCAGTGGACCACATATCAATGGTCAGCAAG  500

seq1  CAGAGAGAGATGAACACTGGTGCCTCGCTCATGGTCTTCTTGTCCTCGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGAGATGAACACTGGTGCCTCGCTCATGGTCTTCTTGTCCTCGAT  550

seq1  CTTTTCCCAGGGATAGCACAGCATATCCACACTCAGGATGGGTCTTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCCAGGGATAGCACAGCATATCCACACTCAGGATGGGTCTTCCCT  600

seq1  TTCCAGTTAACTCTCTCTAGACACACCCTCGATGACACACCCCAGAGGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTTAACTCTCTCTAGACACACCCTCGATGACACACCCCAGAGGTG  650

seq1  AGCTTCCACAGTCAGTCTACATCCAATCAAGCTGATAGTGAAGAGGAGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCACAGTCAGTCTACATCCAATCAAGCTGATAGTGAAGAGGAGCC  700

seq1  TTGGCTGTCCTCACCTAGAGACTGCACTTCACCCCAGGAAGTGGGAAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGTCCTCACCTAGAGACTGCACTTCACCCCAGGAAGTGGGAAGTG  750

seq1  AACAAAAGCTGAAGAGCAGATAAGATCCTGAAACAGAGAAGCTGGCTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||                 |||
seq2  AACAAAAGCTGAAGAGCAGATAAGATCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNTAT  800

seq1  GGGCTAGGGGTGCTTTGGTGGGTAAGCTGTTTGCTGCATAAACACGAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTAGGGGTGCTTTGGTGGGTAAGCTGTTTGCTGCATAAACACGAAGA  850

seq1  CCTGGGTTCAAATCCCAAGCACCCATATAAAAGCCAGGAGCAACACTATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTTCAAATCCCAAGCACCCATATAAAAGCCAGGAGCAACACTATA  900

seq1  ATCCCAGCACAGGGAAAAAGGCAGAGATACTATGGCCATCAAGTCCTGCT  950
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGCACAGGG-AAAAGGCAGAGATACTATGGCCATCAAGTCCTGCT  949

seq1  GAAACAGCAAGTCACAAG-TTCAGTTGTGAAACCTTGTATCAAGATTAAG  999
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||
seq2  GAAACAGCAAGTCACAAGTTTCAGTTGTGAAACCTTGTATTCAGATT-AG  998

seq1  ACATAGAACCATTGAGGAAGACACCAGACATTAACC-TCT--GAGCTACC  1046
      |||||| | |||||||||||||||   ||||||||| |||  ||||||||
seq2  ACATAGCA-CATTGAGGAAGACACAGAACATTAACCTTCTTGGAGCTACC  1047

seq1  CACGTACATGCAGGCATGTGCATGCT  1072
       |||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTACATGCAGGCATGTGCATGCT  1073

seq1: chr7_136689924_136691025
seq2: B6Ng01-284K06.g_69_1167 (reverse)

seq1  CCAA-GCTT-ATGTTAATCCAACTCAAAGCACTATGCCCTTTTCATGCCT  48
      |||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  CCAAGGCTTAAGGTTAATTCAACTCAAAGCACCATGCCC-TTTCATGCCT  49

seq1  TAGAAACAAAATTTAGATAATGAGGCCATCCTACAACTGCAACCCCTCAG  98
      ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||
seq2  TAG-AACAAA--TTAGATAATGAGGCCATCTAACAACTGCAA-CCCTCAG  95

seq1  AATTACCT-CTGGATATTTTAGCAGTGATAGTAATTATAGCCCACACTTG  147
      |||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||  ||
seq2  AATTACCTCCTGGAATATTTAGCAGGGATAGTAATTATAGCCCACAACTG  145

seq1  TATTGCATTGACTTAACAACAGTCTACTAGTAACTGTTTCAGTAGATCAT  197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATTGCATTGACTTAACAACAGTCTACTAGTAACTG-TTCAGTAGATCAT  194

seq1  CTTATTTAAGCCAACAATATAAAAGAAGGCATTACTTTAAAAAGAAGAAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTAAGCCAACAATATAAAAGAAGGCATTACTTTAAAAAGAAGAAA  244

seq1  TCAGGTGCTGATAACTTTAGTTTGTAAAATCTATAAACTCATAGAAGCAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTGCTGATAACTTTAGTTTGTAAAATCTATAAACTCATAGAAGCAG  294

seq1  GAGCTCAAAATTCTCATTTGGAGGATAATGGTGTTTTTTGCCCTAGAGAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCAAAATTCTCATTTGGAGGATAATGGTGTTTTTTGCCCTAGAGAA  344

seq1  CAAGCCCCATCAACCATGAGAGGCAATTTCTATGGCTTGTGGTATCTCCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCCCATCAACCATGAGAGGCAATTTCTATGGCTTGTGGTATCTCCA  394

seq1  CAGGCAGTGTGCTGGTTGGTGTTTTTTATCAAGTTGACCTGAACTAGAGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGTGTGCTGGTTGGTGTTTTTTATCAAGTTGACCTGAACTAGAGT  444

seq1  TATCAAGGTACAAAAACCACAAACATAGAAATTCTTCCAGCAATTGGTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAGGTACAAAAACCACAAACATAGAAATTCTTCCAGCAATTGGTCT  494

seq1  GTAGGCAAGCCTGTGGGGCATTTTCTTGATTGATAATTAATGTGGGAAGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCAAGCCTGTGGGGCATTTTCTTGATTGATAATTAATGTGGGAAGG  544

seq1  CCCAGGCCTACTGTGGGTAGTGCCACCCCTGGGCAGGTGGTCTCCCTTTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCCTACTGTGGGTAGTGCCACCCCTGGGCAGGTGGTCTCCCTTTA  594

seq1  ACTTAAGAAAATAGACTAAGCAATCCATGGAGAGCAAGCCAGTAAGCAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAGAAAATAGACTAAGCAATCCATGGAGAGCAAGCCAGTAAGCAGA  644

seq1  ATTTCTCCAAACCCTCTGCTTCGGTTCCTGCCTCCAGGTTCCTACCTTGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCCAAACCCTCTGCTTCGGTTCCTGCCTCCAGGTTCCTACCTTGA  694

seq1  GGTCCTGCCCTGGCTTCCCTCAACAATGAAGTAGGACACAGCCACACCAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGCCCTGGCTTCCCTCAACAATGAAGTAGGACACAGCCACACCAA  744

seq1  CTCTTTCTGCCTACAAGTTTCTTTGGTCATGGTGTGTTTATCACAGCACT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCTGCCTACAAGTTTCTTTGGTCATGGTGTGTTTATCACAGCACT  794

seq1  AGAAACCAGTCCCATCCCCATGCATTCCCTCTGTACCATGATGGCTAGAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACCAGTCCCATCCCCATGCATTCCCTCTGTACCATGATGGCTAGAG  844

seq1  TTTTGTTGGCCTCAGGCCGTTTCTTTATTCTTTTTTCTTTTCTTTTGGTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTGGCCTCAGGCCGTTTCTTTATTCTTTTTTCTTTTCTTTTGGTT  894

seq1  TTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGACTCAATTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGACTCAATTT  944

seq1  GTAGACAAGGCAGGCCTCGAACTTACAGAGATCTGACTGCCTCTGCCTCC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACAAGGCAGGCCTCGAACTTACAGAGATCTGACTGCCTCTGCCTCC  994

seq1  TGAGTACTGGGATTAAAGGCATGTGTCACCACATACAGTTAAGCTGTTTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTACTGGGATTAAAGGCATGTGTCACCACATACAGTTAAGCTGTTTC  1044

seq1  TTTTTAAACAGTGTTTTTCTATGGTTGAACAGGATTTCAGTCTGCATTGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAACAGTGTTTTTCTATGGTTGAACAGGATTTCAGTCTGCATTGG  1094

seq1  AATTC  1102
      |||||
seq2  AATTC  1099