BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285D02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 124,263,430 - 124,409,538
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePlekha7, Rps13, Pik3c2a, LOC100042798, Nucb2, LOC100043320, EG668484, LOC668485, LOC546993, LOC100043330
Downstream geneXylt1, LOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285D02.bB6Ng01-285D02.g
ACCGA083704GA083705
length9921,035
definitionB6Ng01-285D02.b B6Ng01-285D02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,408,911 - 124,409,538)(124,263,430 - 124,264,463)
sequence
gaattcttaaaaagagaaacagtctcatatgtttggccctttagcacaca
gcagtttctgagtctatttctttaccatagtgtggcacaggcaggagcct
tgggatcttcacacatgagtcattaacaaaataaacttctttagaaagtt
cccagagtcaggtttgaagtggaaacttctagtttctttggaaagtcagt
tatgttaaatgctattttgctgggggcacacaggtgaaaggatgtcttgc
taaagcagacacaggaaagaatgttttcctgaagcagacccaggagaagg
gatatttggctatagcagacatgtgaaaaggatgctgtgatgaaggatat
agatctgaccccacagacagtgggagctggagcattggtttgctttgctc
cgcctcactattcttccctaactacacgcgagttttggctcaccttatat
tgccattgttgagttctgcctgtggtgacaccagagagaaactcgctaaa
gaactgcttgtgaggatcctgcagcagcttgctgcttccttggcctcagg
ccagtaggcaagctttgcagttacttcaggattgaactatagcttgcccg
ggtctgcctatctagagcactggtctgcagctgctggttcatatgtggtg
tttgtacgggaccgaactgctgatatccagtgacacttaattgagctcac
ccctaaaggaatattgttaaacaggtccacttcctccatatcctaataaa
cattcttttccactacttcttgtgggtggtgagttagaggagaagttgaa
ctcttattaaaataggctaggaaaaatgtatgccgacacaggtattgtct
ttatgacaacatagtgtgcactagcaccacttctgtgtcaatacctgttt
acccctaagcatgcctcagaacatggagcacatgggagtgcacacattgt
tgcacatgcgcggacacagacagaacaggcaggcaggttggg

gaattcagggtacacatgcccatgtgaacatgctcaggtaagaggtgaat
gtcaggtctctttatcagtttctaccttacttttaaaaacagggactctc
acttgatctgaagatcaccagttgggcaagactagctccggctggagagt
ccaggtaattcccttgtcttcatttcctaacatagcctgcggctgcgtat
cacatgctgactttctatgagagttctggatcccgactcaggtctttgtg
tttacttggcaggaattccacagtctcagccccttaaagcaacgattttt
aaattttacctactaaattagtaaatactgaaaatataccaaagtttata
aatattgattggtagacagctagaaggttttaaactactacattcattct
gacaagttttgataaaacatatctggtatattaaagtgatcttgcccttt
gagtagagtaaagccagttttagaacatctaaaatgaacaaatgtccata
cttcaggatatttattgctgagttcatccaaataacaaaaatctaaataa
caaaatagatgatcacaatattagtaacagatgaataaaatatttggcat
ctctctatggtaagttgtcttgacttggttaagaaaacagggggtttgtg
aagaaagtttacttcctggaaaatgcttaaataatagtccaagacagtgt
aaccaaaaagcaaaattatgtacagtccttcactgcttaacaatggggag
ggcttctgagaggtgagaccttaggcgattctgtcattgtgaggacatgg
tatgtacatggactaagacagtcagagcatctggggaaggacacttgaga
ttagtatgtttgggtgcctctgcaatagttattgccacaggcaaggctta
ttttccctggtgacccagaatctttattgtacagtttattttacttttga
ttagtacacatactatatgcatctatggggtatgctgtggttttatatag
atgctgtgtgtaagaataatgtgtgttgggtgttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_124408911_124409538
seq2: B6Ng01-285D02.b_44_671 (reverse)

seq1  GCAGACCAGTGCTCTAGATAGGCAGACCCGGGCAAGCTATAGTTCAATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACCAGTGCTCTAGATAGGCAGACCCGGGCAAGCTATAGTTCAATCC  50

seq1  TGAAGTAACTGCAAAGCTTGCCTACTGGCCTGAGGCCAAGGAAGCAGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAACTGCAAAGCTTGCCTACTGGCCTGAGGCCAAGGAAGCAGCAA  100

seq1  GCTGCTGCAGGATCCTCACAAGCAGTTCTTTAGCGAGTTTCTCTCTGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGCAGGATCCTCACAAGCAGTTCTTTAGCGAGTTTCTCTCTGGTG  150

seq1  TCACCACAGGCAGAACTCAACAATGGCAATATAAGGTGAGCCAAAACTCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCACAGGCAGAACTCAACAATGGCAATATAAGGTGAGCCAAAACTCG  200

seq1  CGTGTAGTTAGGGAAGAATAGTGAGGCGGAGCAAAGCAAACCAATGCTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTAGTTAGGGAAGAATAGTGAGGCGGAGCAAAGCAAACCAATGCTCC  250

seq1  AGCTCCCACTGTCTGTGGGGTCAGATCTATATCCTTCATCACAGCATCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCCACTGTCTGTGGGGTCAGATCTATATCCTTCATCACAGCATCCT  300

seq1  TTTCACATGTCTGCTATAGCCAAATATCCCTTCTCCTGGGTCTGCTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATGTCTGCTATAGCCAAATATCCCTTCTCCTGGGTCTGCTTCAG  350

seq1  GAAAACATTCTTTCCTGTGTCTGCTTTAGCAAGACATCCTTTCACCTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACATTCTTTCCTGTGTCTGCTTTAGCAAGACATCCTTTCACCTGTG  400

seq1  TGCCCCCAGCAAAATAGCATTTAACATAACTGACTTTCCAAAGAAACTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCCAGCAAAATAGCATTTAACATAACTGACTTTCCAAAGAAACTAG  450

seq1  AAGTTTCCACTTCAAACCTGACTCTGGGAACTTTCTAAAGAAGTTTATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCCACTTCAAACCTGACTCTGGGAACTTTCTAAAGAAGTTTATTT  500

seq1  TGTTAATGACTCATGTGTGAAGATCCCAAGGCTCCTGCCTGTGCCACACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATGACTCATGTGTGAAGATCCCAAGGCTCCTGCCTGTGCCACACT  550

seq1  ATGGTAAAGAAATAGACTCAGAAACTGCTGTGTGCTAAAGGGCCAAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAAAGAAATAGACTCAGAAACTGCTGTGTGCTAAAGGGCCAAACAT  600

seq1  ATGAGACTGTTTCTCTTTTTAAGAATTC  628
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACTGTTTCTCTTTTTAAGAATTC  628


seq1: chr7_124263430_124264463
seq2: B6Ng01-285D02.g_67_1100

seq1  GAATTCAGGGTACACATGCCCATGTGAACATGCTCAGGTAAGAGGTGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGGTACACATGCCCATGTGAACATGCTCAGGTAAGAGGTGAAT  50

seq1  GTCAGGTCTCTTTATCAGTTTCTACCTTACTTTTAAAAACAGGGACTCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGTCTCTTTATCAGTTTCTACCTTACTTTTAAAAACAGGGACTCTC  100

seq1  ACTTGATCTGAAGATCACCAGTTGGGCAAGACTAGCTCCGGCTGGAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATCTGAAGATCACCAGTTGGGCAAGACTAGCTCCGGCTGGAGAGT  150

seq1  CCAGGTAATTCCCTTGTCTTCATTTCCTAACATAGCCTGCGGCTGCGTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTAATTCCCTTGTCTTCATTTCCTAACATAGCCTGCGGCTGCGTAT  200

seq1  CACATGCTGACTTTCTATGAGAGTTCTGGATCCCGACTCAGGTCTTTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCTGACTTTCTATGAGAGTTCTGGATCCCGACTCAGGTCTTTGTG  250

seq1  TTTACTTGGCAGGAATTCCACAGTCTCAGCCCCTTAAAGCAACGATTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTGGCAGGAATTCCACAGTCTCAGCCCCTTAAAGCAACGATTTTT  300

seq1  AAATTTTACCTACTAAATTAGTAAATACTGAAAATATACCAAAGTTTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTACCTACTAAATTAGTAAATACTGAAAATATACCAAAGTTTATA  350

seq1  AATATTGATTGGTAGACAGCTAGAAGGTTTTAAACTACTACATTCATTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGATTGGTAGACAGCTAGAAGGTTTTAAACTACTACATTCATTCT  400

seq1  GACAAGTTTTGATAAAACATATCTGGTATATTAAAGTGATCTTGCCCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGTTTTGATAAAACATATCTGGTATATTAAAGTGATCTTGCCCTTT  450

seq1  GAGTAGAGTAAAGCCAGTTTTAGAACATCTAAAATGAACAAATGTCCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGAGTAAAGCCAGTTTTAGAACATCTAAAATGAACAAATGTCCATA  500

seq1  CTTCAGGATATTTATTGCTGAGTTCATCCAAATAACAAAAATCTAAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGGATATTTATTGCTGAGTTCATCCAAATAACAAAAATCTAAATAA  550

seq1  CAAAATAGATGATCACAATATTAGTAACAGATGAATAAAATATTTGGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATAGATGATCACAATATTAGTAACAGATGAATAAAATATTTGGCAT  600

seq1  CTCTCTATGGTAAGTTGTCTTGACTTGGTTAAGAAAACAGGGGGTTTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTATGGTAAGTTGTCTTGACTTGGTTAAGAAAACAGGGGGTTTGTG  650

seq1  AAGAAAGTTTACTTCCTGGAAAATGCTTAAATAATAGTCCAAGACAGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTTTACTTCCTGGAAAATGCTTAAATAATAGTCCAAGACAGTGT  700

seq1  AACCAAAAAGCAAAATTATGTACAGTCCTTCACTGCTTAACAATGGGGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAAAAGCAAAATTATGTACAGTCCTTCACTGCTTAACAATGGGGAG  750

seq1  GGCTTCTGAGAGGTGAGACCTTAGGCGATTCTGTCATTGTGAGGACATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCTGAGAGGTGAGACCTTAGGCGATTCTGTCATTGTGAGGACATGG  800

seq1  TATGTACATGGACTAAGACAGTCAGAGCATCTGGGGAAGGACACTTGAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACATGGACTAAGACAGTCAGAGCATCTGGGGAAGGACACTTGAGA  850

seq1  TTAGTATGTTTGGGTGCCTCTGCAATAGTTATTGCCACAGGCAAGGCTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTATGTTTGGGTGCCTCTGCAATAGTTATTGCCACAGGCAAGGCTTA  900

seq1  TTTT-CCTGGTGACCCAGAATCTTTATGTTAACAGTTTATTTTACTTTTG  949
      |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCCTGGTGACCCAGAATCTTTAT-TGTACAGTTTATTTTACTTTTG  949

seq1  ATTAGTACACAATAACTATATGCATCTATGGGGTATGCTGTGGTTTTATA  999
      |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTACACA--TACTATATGCATCTATGGGGTATGCTGTGGTTTTATA  997

seq1  TAGATGCTGTGTGTAAGAAT-ATGTGTG-TGGGTGTT  1034
      |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  TAGATGCTGTGTGTAAGAATAATGTGTGTTGGGTGTT  1034


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |