BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291E06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 61,151,091 - 61,339,836
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040692, Gm1865, LOC100040718, LOC668789
Downstream geneMrps33p, LOC622146, Luzp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291E06.bB6Ng01-291E06.g
ACCGA088199GA088200
length1,1851,106
definitionB6Ng01-291E06.b B6Ng01-291E06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,338,645 - 61,339,836)(61,151,091 - 61,152,206)
sequence
gaattcaatcagatgcaattttatgtttgaatgaaagagaggcagaggta
tggtccgaaataacctgaccaatgaggaacaaaacttcacctgactattg
aggaatcatgggaggaaaagaatgtgacattagttagtcagcctttaatt
ttgaaaaacctattagctgtctgagagttatattattagttgcacgtatg
agtctgaaacagggaaaagaactggaaggaaacacattttttttttcgag
acagggtttctctgtgtagtcctggcagtcctggaactcactctgtagac
caggctggcctctaactcagaaatccgcctgcctctgcctcccgagtgct
gggatcaaaggcgtgcgccaccacgtccagctaagaaacacattttatca
gcaggacacagtgagatactcagctttacaattatggagctttatttggg
accagagtgctgggtaacatgaaagaagcataaaaccacttttatacagc
agagactctggctaaagttgcgtctttagtggagaatataacactgagat
tcatgttggcaaagaatcaagaatcagaagggaggcttacaaaagtaaac
tacatcttgctcccccccccccacacacacacaattccctgttttctctc
taagtttattgttccccagcacctagtgctctgaatacctcccgttgtat
cacacatctatgaatgtgatcttctctttgcacccagacctgaagccatt
aagtgtttgatctcacctagaaaatctataggaattgttcataggttgtt
ttttttttgttttcttttgtttttaatctgtaaactctcataacagtctg
acccattcaccatgagcaaagcacagataacatcctcaaggccatggaca
caatgcctggaaaaccactttctccatgagctcagcctgttgttgatgct
gacacaagtctgtgtgagttatgcaagtaggagccacactgatccatcga
atgttctgtgtcctcacatcctacccatgggtctctctaccaccatttcc
actgggttcttgtctctactcatactgaattgacttttagccgacatcat
gctcctctgtcatgctctaggagatctcatcaggatccttcatttcgtct
atgccttcactcatgatgaaccgatatctgaacct

gaattcttcagactttatgtgattaaagatacagtagcattcccaggact
gactggttgtccatctgttcacactgtaacacatatctgaatgggaaaag
aaagccaataacaggtgccagacttcatatttttcctcttatgtcttaat
tttattagtgataatacttataacctgagttataggcttagagagggcaa
ataaatctaaatgttttattggaagactaacttgagccagggtagagtcc
gcagactttatccattctgtaaactggtcaggaggaattataaagagact
gatatacagccagaaactgaagtatttgaagacggaaccaaattccaaac
tagaaaaaaattaaaaagtcgattatgcgtggaagatttgtaagctgttc
actcttgggtccaggagatggctcagtggtttagagcaggtagtgatttt
gcaaaggacctgagtctataactccagcttcaagagttctatgacctaaa
taggcaaccacattcttgtgtacctacctgtgcacacagccacaaacata
cagacacattattacaaaataaatcttttaaagaattgtcaacaattact
gttgcattttttaaaggtaaagaaaagcctggttttcacaatgtcattgg
ctttctgtaattctaggaaaaccttattttcacagctgtgcaagcatcac
atctagtttggtattacaaaattcatggtatttcatggtattctactgat
ttaaaaactggcaagacaatatgtaaagaataagtatgtactgagtgaga
gtaattactagcatatgacatattataaactaagtataatcacaagcaga
tataaacatttcagctttccctgattacaaagaatactttgcaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaagagtctcttgggtcagccacctaacatttgtagtcagt
ttccagtcacatcacacctatggataatgaatatgtcccaagactccact
actagaaagttggatcctgaaagatgtatttatcacttgggggggagctg
actttgtgccctgatctagtaaatggactgaatcactaaggtatcaatgt
tgaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_61338645_61339836
seq2: B6Ng01-291E06.b_47_1231 (reverse)

seq1  AGGTTCAGATATATTGGTGTCATCATGGAGT-AAGGAATAGAAGGAAATG  49
      ||||||||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||| | ||||| 
seq2  AGGTTCAG--ATATCGGT-TCATCAT-GAGTGAAGGCATAG-ACGAAAT-  44

seq1  GAAGGAT-CTGATGAGATCTTCCTAGAGCATGACAGGAGAGCATGATGTC  98
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||
seq2  GAAGGATCCTGATGAGATC-TCCTAGAGCATGACAGAGGAGCATGATGTC  93

seq1  GGCTAAAAGTCAATTCAAGTATGAGGTTAGAGACAAGAACCAAGTGGAAA  148
      |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||
seq2  GGCTAAAAGTCAATTC-AGTATGAG--TAGAGACAAGAACCCAGTGGAAA  140

seq1  TGGTGGTAAGAGAGACCCATGGGTAGGATGTGAGGACACAGAACATTCGA  198
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGT-AGAGAGACCCATGGGTAGGATGTGAGGACACAGAACATTCGA  189

seq1  TGGATCAGTGTGGCTCCTACTTGCATAACTCACACAGAC-TGTGTCAGCA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGGATCAGTGTGGCTCCTACTTGCATAACTCACACAGACTTGTGTCAGCA  239

seq1  TC-ACAACAGGCTGAGCTCATGGAGAAAGTGGTTTTCCAGGCATTGTGTC  296
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAACAGGCTGAGCTCATGGAGAAAGTGGTTTTCCAGGCATTGTGTC  289

seq1  CATGGCCTTGAGGATGTTAATCTGTGCTTTGCTCATGGTGAATGGGTCAG  346
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCCTTGAGGATGTT-ATCTGTGCTTTGCTCATGGTGAATGGGTCAG  338

seq1  ACTGTTATGAGAGTTTACAGATTAAAAACAAAAGAAAACAAAAAAAAAAC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTATGAGAGTTTACAGATTAAAAACAAAAGAAAACAAAAAAAAAAC  388

seq1  AACCTATGAACAATTCCTATAGATTTTCTAGGTGAGATCAAACACTTAAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTATGAACAATTCCTATAGATTTTCTAGGTGAGATCAAACACTTAAT  438

seq1  GGCTTCAGGTCTGGGTGCAAAGAGAAGATCACATTCATAGATGTGTGATA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGGTCTGGGTGCAAAGAGAAGATCACATTCATAGATGTGTGATA  488

seq1  CAACGGGAGGTATTCAGAGCACTAGGTGCTGGGGAACAATAAACTTAGAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGGGAGGTATTCAGAGCACTAGGTGCTGGGGAACAATAAACTTAGAG  538

seq1  AGAAAACAGGGAATTGTGTGTGTGT-GGGGGGGGGGAGCAAGATGTAGTT  595
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACAGGGAATTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGAGCAAGATGTAGTT  588

seq1  TACTTTTGTAAGCCTCCCTTCTGATTCTTGATTCTTTGCCAACATGAATC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTGTAAGCCTCCCTTCTGATTCTTGATTCTTTGCCAACATGAATC  638

seq1  TCAGTGTTATATTCTCCACTAAAGACGCAACTTTAGCCAGAGTCTCTGCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTTATATTCTCCACTAAAGACGCAACTTTAGCCAGAGTCTCTGCT  688

seq1  GTATAAAAGTGGTTTTATGCTTCTTTCATGTTACCCAGCACTCTGGTCCC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAAAAGTGGTTTTATGCTTCTTTCATGTTACCCAGCACTCTGGTCCC  738

seq1  AAATAAAGCTCCATAATTGTAAAGCTGAGTATCTCACTGTGTCCTGCTGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGCTCCATAATTGTAAAGCTGAGTATCTCACTGTGTCCTGCTGA  788

seq1  TAAAATGTGTTTCTTAGCTGGACGTGGTGGCGCACGCCTTTGATCCCAGC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGTGTTTCTTAGCTGGACGTGGTGGCGCACGCCTTTGATCCCAGC  838

seq1  ACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTAGAGGCCAGCCTGGTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTAGAGGCCAGCCTGGTC  888

seq1  TACAGAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTCTC  938

seq1  GAAAAAAAAAATGTGTTTCCTTCCAGTTCTTTTCCCTGTTTCAGACTCAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAAAAATGTGTTTCCTTCCAGTTCTTTTCCCTGTTTCAGACTCAT  988

seq1  ACGTGCAACTAATAATATAACTCTCAGACAGCTAATAGGTTTTTCAAAAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGCAACTAATAATATAACTCTCAGACAGCTAATAGGTTTTTCAAAAT  1038

seq1  TAAAGGCTGACTAACTAATGTCACATTCTTTTCCTCCCATGATTCCTCAA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGCTGACTAACTAATGTCACATTCTTTTCCTCCCATGATTCCTCAA  1088

seq1  TAGTCAGGTGAAGTTTTGTTCCTCATTGGTCAGGTTATTTCGGACCATAC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAGGTGAAGTTTTGTTCCTCATTGGTCAGGTTATTTCGGACCATAC  1138

seq1  CTCTGCCTCTCTTTCATTCAAACATAAAATTGCATCTGATTGAATTC  1192
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCTCTCTTTCATTCAAACATAAAATTGCATCTGATTGAATTC  1185


seq1: chr7_61151091_61152206
seq2: B6Ng01-291E06.g_68_1173

seq1  GAATTCTTCAGACTTTATGTGATTAAAGATACAGTAGCATTCCCAGGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCAGACTTTATGTGATTAAAGATACAGTAGCATTCCCAGGACT  50

seq1  GACTGGTTGTCCATCTGTTCACACTGTAACACATATCTGAATGGGAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGTTGTCCATCTGTTCACACTGTAACACATATCTGAATGGGAAAAG  100

seq1  AAAGCCAATAACAGGTGCCAGACTTCATATTTTTCCTCTTATGTCTTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCAATAACAGGTGCCAGACTTCATATTTTTCCTCTTATGTCTTAAT  150

seq1  TTTATTAGTGATAATACTTATAACCTGAGTTATAGGCTTAGAGAGGGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAGTGATAATACTTATAACCTGAGTTATAGGCTTAGAGAGGGCAA  200

seq1  ATAAATCTAAATGTTTTATTGGAAGACTAACTTGAGCCAGGGTAGAGTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATCTAAATGTTTTATTGGAAGACTAACTTGAGCCAGGGTAGAGTCC  250

seq1  GCAGACTTTATCCATTCTGTAAACTGGTCAGGAGGAATTATAAAGAGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACTTTATCCATTCTGTAAACTGGTCAGGAGGAATTATAAAGAGACT  300

seq1  GATATACAGCCAGAAACTGAAGTATTTGAAGACGGAACCAAATTCCAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATACAGCCAGAAACTGAAGTATTTGAAGACGGAACCAAATTCCAAAC  350

seq1  TAGAAAAAAATTAAAAAGTCGATTATGCGTGGAAGATTTGTAAGCTGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAAAAATTAAAAAGTCGATTATGCGTGGAAGATTTGTAAGCTGTTC  400

seq1  ACTCTTGGGTCCAGGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAGCAGGTAGTGATTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGGGTCCAGGAGATGGCTCAGTGGTTTAGAGCAGGTAGTGATTTT  450

seq1  GCAAAGGACCTGAGTCTATAACTCCAGCTTCAAGAGTTCTATGACCTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGACCTGAGTCTATAACTCCAGCTTCAAGAGTTCTATGACCTAAA  500

seq1  TAGGCAACCACATTCTTGTGTACCTACCTGTGCACACAGCCACAAACATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCAACCACATTCTTGTGTACCTACCTGTGCACACAGCCACAAACATA  550

seq1  CAGACACATTATTACAAAATAAATCTTTTAAAGAATTGTCAACAATTACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACACATTATTACAAAATAAATCTTTTAAAGAATTGTCAACAATTACT  600

seq1  GTTGCATTTTTTAAAGGTAAAGAAAAGCCTGGTTTTCACAATGTCATTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCATTTTTTAAAGGTAAAGAAAAGCCTGGTTTTCACAATGTCATTGG  650

seq1  CTTTCTGTAATTCTAGGAAAACCTTATTTTCACAGCTGTGCAAGCATCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGTAATTCTAGGAAAACCTTATTTTCACAGCTGTGCAAGCATCAC  700

seq1  ATCTAGTTTGGTATTACAAAATTCATGGTATTTCATGGTATTCTACTGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGTTTGGTATTACAAAATTCATGGTATTTCATGGTATTCTACTGAT  750

seq1  TTAAAAACTGGCAAGACAATATGTAAAGAATAAGTATGTACTGAGTGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAACTGGCAAGACAATATGTAAAGAATAAGTATGTACTGAGTGAGA  800

seq1  GTAATTACTAGCATATGACATATTATAAACTAAGTATAATCACAAGCAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTACTAGCATATGACATATTATAAACTAAGTATAATCACAAGCAGA  850

seq1  TATAAACATTTCAGCTTTCCCTGATTACAAAAGAATACTTTGCAAAAAAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||
seq2  TATAAACATTTCAGCTTTCCCTGATTAC-AAAGAATACTTTGC-----AA  894

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTCTCTTGGGTCAGCCA-CTAACATTTGTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTCTCTTGGGTCAGCCACCTAACATTTGTA  944

seq1  GTCAGTTTCCAGTCACATCAACACCTATGGAT-ATGAATATGTTCCCAAG  998
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GTCAGTTTCCAGTCACATC-ACACCTATGGATAATGAATATG-TCCCAAG  992

seq1  ACTCACTTACTAAGAAGTTGGATCCTGAAAGATGTATTTAATCAC-TGGG  1047
      ||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  ACTCCACTACTAGAAAGTTGGATCCTGAAAGATGTATTT-ATCACTTGGG  1041

seq1  GGGGAGCCTGACTTTTGTTGCCCTGATCTAGTAAATAGACTGATACACTT  1097
      |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  |||| 
seq2  GGGGAG-CTGACTTT--GTGCCCTGATCTAGTAAATGGACTGAATCACTA  1088

seq1  AGGTATCAATGTTTGAAGA  1116
      ||||||||||| |||||||
seq2  AGGTATCAATG-TTGAAGA  1106


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |