BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-292A09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,108,387 - 119,295,089
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3
Upstream geneMrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658, Galntl4
Downstream geneMical2, Micalcl, Parva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-292A09.bB6Ng01-292A09.g
ACCGA088766GA088767
length1,1831,112
definitionB6Ng01-292A09.b B6Ng01-292A09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,293,903 - 119,295,089)(119,108,387 - 119,109,501)
sequence
gaattcctctggactctgtgagcctcagtttagatacttgtaaagtggag
ataataacattcatttcctaggaggttgtgatattaaaagggaaaaataa
ttgacataggtaatgcaaagccacaagtgtcaaagagatcaacaggaaat
agattaaaaaatagaattggggacccgagagatggctcagcagttaggaa
cactgactgttcttccagaggtcctgagttcaattcccagcaaccacatg
gtggctcacaaccatctacagtgggctctgatgccctcttctggtgtgtc
tgatgatagcaacagtgtactcacatacataacataaacatacaaacaaa
caaacaaatcttttaaaaaaaaccagaagtggggaaagtgtttgagggga
gaggcatgtatgtgtgcacgtgtgtgttatgttgaatgtgtggcggatca
gaacaaatgttccgatgttagttttcctcttcaccttgttgaggcagggt
ctctctgctgctgctctgtggactccccgatgattcccgccccctgcctc
ccatactcttgtagctgtgctgggattacagttcagagggaccacatctg
acccttttacatgggttccaggaataaaactcaggacttttggcttgctg
gctaagataacccttctgaggtcatgtaaaacgtttggaactcatgtcta
atggccactcagtggcctgccgctgtcaccagtcttggcacctatagaag
aggggaagagaaggcagccccttttcttcacctcagttgtaactgaaaga
aaccgttttgtgtctttgatttgatagatggaggcggaagaagcagctgc
taaacgtcctctgaggtgaacctggcaagcttacctcccaactatcacaa
tgagaccagcacggagaccagggttggggaaataacacagtccatgtgcc
accaggaagttcacaaagtagggccgttgcacagccaaggcttcttccca
caggcagctggggaaaggggcttgttgacaaggtggggtaccaagcaatg
atgttgagtgagctatagaaagcagacttaaaacccaaaggaaggaggtg
ctgttcaaggggacagtgtgttctcaagcacttaattgcttctgcacttc
ttgaccatgtctgccagtgaagcttcttctcag
gaattcatactgtagataggccctttcaaggcctggtcacttttctggaa
gagaaggaggaagaagaggaagggaaagagggtgacagttgggagtggat
gctactgttctccccttcctagcctctggtacatggatctcctgtggatc
tgttgtaggccttgattttttcaaaacctactttaataagggttcacaaa
tgctttgacactccctccttctaggccaccatccaaaagtaggggagaaa
aatggtaaataggacaaggtgacgtggacatgcttagaagtagttctttg
gggccaatctccatttgtcaggataccagtagtccagttcaaaagtgcca
ccaaatatgaatcatcaatggcagcacaatccagcagaaaccacaaggct
tctgctgaatgatcaggagtcagcgccaaggcagtgggagcaaccaggac
cagcaagaattccaagagttctctgtcgtgcctctctcaatgaagtaaga
tcagcaaagatgagagaccaatgaagagctgcacagctagctattcaaga
gccccatcactgtccactgagtgttactgacattctttctaaccatcgag
tgtcctcccaggggtcttgccttagcataacaccaggtgagtctgtatca
cctaacatacccagaaacttccacttcatagaaatcctgagaatctgata
aaaagtcatgggccaacttctcttcgtccagacctaaacatcctatgaca
gttgcacactcacttttatgtcccaatgtcacctaacacactaacccttc
ccttaatatattatttggcatgagtctgcattacatgacacaaccagaaa
cttccacttcaacctccttcagcttccttaggagcacaggctgtttatgg
aaggtatctgctgagtaggttttgggacacaagactcaaaggccggagct
actcactgtatccattcttttaggttgagaaagggctcaagaatgtgttc
aactgaatctagaatgatgtcactatgctgcaagccatatttctgggtta
tgagccaatatagctcctataaagttccaatgccagtagttcctgtagga
tcaccatgccta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_119293903_119295089
seq2: B6Ng01-292A09.b_46_1228 (reverse)

seq1  CTGAGAAGAAGCCTCAACTGCAAGACATGGTGTAAGAAGTGCAGAAGCCA  50
      |||||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||| |
seq2  CTGAGAAGAAGCTTC-ACTGGCAGACATGGT-CAAGAAGTGCAGAAGCAA  48

seq1  TTTAGTGCCTGAG-ACACGCCTGTCCCCTTGAACAGCACCCTCCCTTCCT  99
      || ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  TTAAGTGCTTGAGAACAC-ACTGTCCCCTTGAACAGCACC--TCCTTCCT  95

seq1  TTGGGTTTT-AGTCTGCTTTCTATAGCTCTCACTTCAACATCATGGCTTG  148
      ||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||
seq2  TTGGGTTTTAAGTCTGCTTTCTATAGCTCAC---TCAACATCATTGCTTG  142

seq1  GTACCCCACC-TGTCAACAAGCCCCTTTCCCCAGCTGCCTGTGGGAAGAA  197
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCCACCTTGTCAACAAGCCCCTTTCCCCAGCTGCCTGTGGGAAGAA  192

seq1  GCCTTGGCTGTGCCACGGCCCTTACCTTGTGAACTTCCTGGT-GCACATG  246
      ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||
seq2  GCCTTGGCTGTGCAACGGCCC-TACTTTGTGAACTTCCTGGTGGCACATG  241

seq1  GACTGTGTTATTTCCC--ACCCTGGTCTCCGTGCTGGTCTCATTGTGATA  294
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGTTATTTCCCCAACCCTGGTCTCCGTGCTGGTCTCATTGTGATA  291

seq1  GTTGGGAGGTAAGCTTGCCAGGTTCACCTCAGAGGACGTTTTAGCAGCTG  344
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTTGGGAGGTAAGCTTGCCAGGTTCACCTCAGAGGACG-TTTAGCAGCTG  340

seq1  CTTCTTCCGCCTCCATCTATCAAATCAAAGACACAAAACGGTTTCTTTCA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCCGCCTCCATCTATCAAATCAAAGACACAAAACGGTTTCTTTCA  390

seq1  GTTACAACTGAGGTGAAGAAAAGGGGCTGCCTTCTCTTCCCCTCTTCTAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAACTGAGGTGAAGAAAAGGGGCTGCCTTCTCTTCCCCTCTTCTAT  440

seq1  AGGTGCCAAGACTGGTGACAGCGGCAGGCCACTGAGTGGCCATTAGACAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCCAAGACTGGTGACAGCGGCAGGCCACTGAGTGGCCATTAGACAT  490

seq1  GAGTTCCAAACGTTTTACATGACCTCAGAAGGGTTATCTTAGCCAGCAAG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCAAACGTTTTACATGACCTCAGAAGGGTTATCTTAGCCAGCAAG  540

seq1  CCAAAAGTCCTGAGTTTTATTCCTGGAACCCATGTAAAAGGGTCAGATGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAGTCCTGAGTTTTATTCCTGGAACCCATGTAAAAGGGTCAGATGT  590

seq1  GGTCCCTCTGAACTGTAATCCCAGCACAGCTACAAGAGTATGGGAGGCAG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCTCTGAACTGTAATCCCAGCACAGCTACAAGAGTATGGGAGGCAG  640

seq1  GGGGCGGGAATCATCGGGGAGTCCACAGAGCAGCAGCAGAGAGACCCTGC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCGGGAATCATCGGGGAGTCCACAGAGCAGCAGCAGAGAGACCCTGC  690

seq1  CTCAACAAGGTGAAGAGGAAAACTAACATCGGAACATTTGTTCTGATCCG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACAAGGTGAAGAGGAAAACTAACATCGGAACATTTGTTCTGATCCG  740

seq1  CCACACATTCAACATAACACACACGTGCACACATACATGCCTCTCCCCTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATTCAACATAACACACACGTGCACACATACATGCCTCTCCCCTC  790

seq1  AAACACTTTCCCCACTTCTGGTTTTTTTTAAAAGATTTGTTTGTTTGTTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTTTCCCCACTTCTGGTTTTTTTTAAAAGATTTGTTTGTTTGTTT  840

seq1  GTATGTTTATGTTATGTATGTGAGTACACTGTTGCTATCATCAGACACAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTTTATGTTATGTATGTGAGTACACTGTTGCTATCATCAGACACAC  890

seq1  CAGAAGAGGGCATCAGAGCCCACTGTAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAGGGCATCAGAGCCCACTGTAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG  940

seq1  TTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAACAGTCAGTGTTCCTAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAACAGTCAGTGTTCCTAA  990

seq1  CTGCTGAGCCATCTCTCGGGTCCCCAATTCTATTTTTTAATCTATTTCCT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGCCATCTCTCGGGTCCCCAATTCTATTTTTTAATCTATTTCCT  1040

seq1  GTTGATCTCTTTGACACTTGTGGCTTTGCATTACCTATGTCAATTATTTT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATCTCTTTGACACTTGTGGCTTTGCATTACCTATGTCAATTATTTT  1090

seq1  TCCCTTTTAATATCACAACCTCCTAGGAAATGAATGTTATTATCTCCACT  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTTAATATCACAACCTCCTAGGAAATGAATGTTATTATCTCCACT  1140

seq1  TTACAAGTATCTAAACTGAGGCTCACAGAGTCCAGAGGAATTC  1187
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGTATCTAAACTGAGGCTCACAGAGTCCAGAGGAATTC  1183

seq1: chr7_119108387_119109501
seq2: B6Ng01-292A09.g_63_1174

seq1  GAATTCATACTGTAGATAGGCCCTTTCAAGGCCTGGTCACTTTTCTGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATACTGTAGATAGGCCCTTTCAAGGCCTGGTCACTTTTCTGGAA  50

seq1  GAGAAGGAGGAAGAAGAGGAAGGGAAAGAGGGTGACAGTTGGGAGTGGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGAGGAAGAAGAGGAAGGGAAAGAGGGTGACAGTTGGGAGTGGAT  100

seq1  GCTACTGTTCTCCCCTTCCTAGCCTCTGGTACATGGATCTCCTGTGGATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTGTTCTCCCCTTCCTAGCCTCTGGTACATGGATCTCCTGTGGATC  150

seq1  TGTTGTAGGCCTTGATTTTTTCAAAACCTACTTTAATAAGGGTTCACAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAGGCCTTGATTTTTTCAAAACCTACTTTAATAAGGGTTCACAAA  200

seq1  TGCTTTGACACTCCCTCCTTCTAGGCCACCATCCAAAAGTAGGGGAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGACACTCCCTCCTTCTAGGCCACCATCCAAAAGTAGGGGAGAAA  250

seq1  AATGGTAAATAGGACAAGGTGACGTGGACATGCTTAGAAGTAGTTCTTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTAAATAGGACAAGGTGACGTGGACATGCTTAGAAGTAGTTCTTTG  300

seq1  GGGCCAATCTCCATTTGTCAGGATACCAGTAGTCCAGTTCAAAAGTGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCAATCTCCATTTGTCAGGATACCAGTAGTCCAGTTCAAAAGTGCCA  350

seq1  CCAAATATGAATCATCAATGGCAGCACAATCCAGCAGAAACCACAAGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATATGAATCATCAATGGCAGCACAATCCAGCAGAAACCACAAGGCT  400

seq1  TCTGCTGAATGATCAGGAGTCAGCGCCAAGGCAGTGGGAGCAACCAGGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGAATGATCAGGAGTCAGCGCCAAGGCAGTGGGAGCAACCAGGAC  450

seq1  CAGCAAGAATTCCAAGAGTTCTCTGTCGTGCCTCTCTCAATGAAGTAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGAATTCCAAGAGTTCTCTGTCGTGCCTCTCTCAATGAAGTAAGA  500

seq1  TCAGCAAAGATGAGAGACCAATGAAGAGCTGCACAGCTAGCTATTCAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAAGATGAGAGACCAATGAAGAGCTGCACAGCTAGCTATTCAAGA  550

seq1  GCCCCATCACTGTCCACTGAGTGTTACTGACATTCTTTCTAACCATCGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCATCACTGTCCACTGAGTGTTACTGACATTCTTTCTAACCATCGAG  600

seq1  TGTCCTCCCAGGGGTCTTGCCTTAGCATAACACCAGGTGAGTCTGTATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCCCAGGGGTCTTGCCTTAGCATAACACCAGGTGAGTCTGTATCA  650

seq1  CCTAACATACCCAGAAACTTCCACTTCATAGAAATCCTGAGAATCTGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACATACCCAGAAACTTCCACTTCATAGAAATCCTGAGAATCTGATA  700

seq1  AAAAGTCATGGGCCAACTTCTCTTCGTCCAGACCTAAACATCCTATGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTCATGGGCCAACTTCTCTTCGTCCAGACCTAAACATCCTATGACA  750

seq1  GTTGCACACTCACTTTTATGTCCCAATGTCACCTAACACACTAACCCTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCACACTCACTTTTATGTCCCAATGTCACCTAACACACTAACCCTTC  800

seq1  CCTTAATATATTATTTGGCATGAGTCTGCATTACATGACACAACCAGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAATATATTATTTGGCATGAGTCTGCATTACATGACACAACCAGAAA  850

seq1  CTTCCACTTCAACCTCCTTCAGCTTCCTTAGGAGCACAGGCTGTTTATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACTTCAACCTCCTTCAGCTTCCTTAGGAGCACAGGCTGTTTATGG  900

seq1  AAGGTATCTGCTGAGTAGGTTTT-GGACACAAGACTCAAAGGCCGGAGCT  949
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATCTGCTGAGTAGGTTTTGGGACACAAGACTCAAAGGCCGGAGCT  950

seq1  ACTCACTTGTATCCATTC-TTTAGGTTGAGATAGGGCTCAAAGAATGTGT  998
      |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  ACTCAC-TGTATCCATTCTTTTAGGTTGAGAAAGGGCTC-AAGAATGTGT  998

seq1  TCAACTGAATCTAGAATGATGTCAACTATGCTGCAAAGCCATA-TTCTGG  1047
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||
seq2  TCAACTGAATCTAGAATGATGTC-ACTATGCTGC-AAGCCATATTTCTGG  1046

seq1  G-TATGAGCAAATATAAGCT-CTATAAGGTTTCCAATG-CAGTAGTCCCT  1094
      | ||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| |||
seq2  GTTATGAGCCAATAT-AGCTCCTATAAAG-TTCCAATGCCAGTAGTTCCT  1094

seq1  GTAGGATTTCACCCATGCCTA  1115
      ||||||  ||| |||||||||
seq2  GTAGGA--TCA-CCATGCCTA  1112