BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-294L16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 131,132,974 - 131,249,909
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG628779
Upstream geneLOC628696, LOC100042977, LOC100042981, Tnrc6a, Slc5a11, Arhgap17, Lcmt1, Aqp8, Zkscan2, LOC100043482
Downstream geneEG545999
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-294L16.bB6Ng01-294L16.g
ACCGA090784GA090785
length1,0941,098
definitionB6Ng01-294L16.b B6Ng01-294L16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(131,248,811 - 131,249,909)(131,132,974 - 131,134,071)
sequence
gaattcatggctctatgacctgggtaaggtctaactacaacagtgtttac
tagaaatccttgcattgatagcagtctttctttatgctactaccatgtga
caacagtagatactagaaagataggaccacaccatggtcagggtgtacct
catggacacatgcttaaacacttcctaggtatgtgaacaggtgaccagga
tccaagtttatctctatgaaatggctaagcatcataagtaattttctgtc
tttacctttctcatttaattttctactctattctgtaatgaattttactg
ctctacagtttccatataataaaaaacaaagccattacacagttagcatg
atagggtttgacaaccatgtacttatgagttacttctacaaaaaaaccaa
aaaacaaaaacaaaaacaaacaaacaaacaaaaaacccaagttagaaagc
aaagccattgcctccaaaatccctttgtgctcctcccagaccactgactg
ccaatcaaccatagacaaacaagatcaagatcatatcaaacattatcttt
ttttgtctgataatgcccttttaaatttattttttgagaatttaaaaaag
actaatgtttttgcctttcatgcatgatgtcatgcgtagcactgcccttt
ctggtgtagctgtcaatgatcccttgaatgaacatgtatcacaatctctt
gagcatttatccttacatgtgaattgctttcaggtttgggtttttataaa
gctgtcatgcacatttttaaagaagtcatcttgtagatatgagttcaaat
ttctcttaagtaaagtatctggcagtggacttctggtttactgggtaaac
agaggtaaatttttataagaaattaacaagcagttctttaccacagcatg
gcattgaacacatcccacaagcaaggcagtattccaactgtggccccaca
tccctaacatttgctttcataagtttttttgctttttgccattgtgaagg
attatagaatatttctggtagttttatttagattttcttgtaaatatata
ttggctgtttcatcaacttctagctctaatatgatttttctgtc
gaattcttaacttaatgatctgaagtgaccacacctgatctgaccacaga
gatgacttgggtttataagatctattcccgtagggagggtggagacctac
gaggtaggaaaagtggcttcaaggttttgctttgttatgtcagctaccag
cgtgcttatattaataaagcccattttctgactgagacactttgatcctc
gaatgcatttatgtagcaggctctttacagggatggatgtaggagtctga
agggatatggtgtgaggcaggcccctttcatctctgagccaggatccaca
gcacgctcactgtgtgaccttgggtaagttgagagatatcttgcagcttc
agcttctccatctatagaatgggctcactgttgtttccaaagcactatat
gacaatgaaccacagggacatctcaaaggccttgtgtagagttggcgaca
taaggtaccttacctggcttcttcattttccttcaatgccttccttttat
tctgccctgcagcatggaggacccgaaggagaaagccaggctcatttgtc
attcattggatgccgccttttatttcaagattctatctgaaagagagctt
gcgagtccccagcagctcttaagtagttatccagaggacaatcagagggt
tccagaagtcggcctgttggctctgagtgggagatgagtctaatttcctg
aggtgatctggtcatgctcacccacccagaggaactggaggaaaaatggc
ccagttctctgggttgtcgctctcttgagcctttggcaggagagcagacc
atttgctctggatatcccagaagcagtaagctgccaggcaggtaggtgtg
tctttcatcttccccacagtacccaaaggcacctgtcactctcctgcctg
agctctggtgaaatcactcaggtgctccagccatctgactgtggcttata
ttttatctttgtaagcctttccaagcccgttttacttttaagggctgtag
aagcttgaaaacactgggtgagttgagattgctgggctcggaacgctcag
agcttgaaagttgcttttctaatgaatgctagctcctggaaggggttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_131248811_131249909
seq2: B6Ng01-294L16.b_49_1142 (reverse)

seq1  GACAGAAAAAACCATA-TAGAGCTAGGAAGTTGATGAAAACAAGCCAATA  49
      ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||
seq2  GACAG-AAAAATCATATTAGAGCTA-GAAGTTGATGAAA--CAGCCAATA  46

seq1  TAATTATTTACCAAGGAAATCTAAATTAAAACTACCAAGAAATATTCTAT  99
      ||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  TA--TATTTA-CAAGAAAATCTAAA-TAAAACTACC-AGAAATATTCTAT  91

seq1  -ATCCTTCACAATGGCAAAAAGCAAAAAA--CTATGAAAGCAAATGTTA-  145
       ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| 
seq2  AATCCTTCACAATGGCAAAAAGCAAAAAAACTTATGAAAGCAAATGTTAG  141

seq1  GGATGTGGGGGCCACAGTTGGAATACTGCCTTGCTTGTGGGATGTGTTCA  195
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGT-GGGGCCACAGTTGGAATACTGCCTTGCTTGTGGGATGTGTTCA  190

seq1  ATGCCATGCTGTGGTAAAGAACTGCTTGTTAATTTCTTATAAAAATTTAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCATGCTGTGGTAAAGAACTGCTTGTTAATTTCTTATAAAAATTTAC  240

seq1  CTCTGTTTACCCAGTAAACCAGAAGTCCACTGCCAGATACTTTACTTAAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTTACCCAGTAAACCAGAAGTCCACTGCCAGATACTTTACTTAAG  290

seq1  AGAAATTTGAACTCATATCTACAAGATGACTTCTTTAAAAATGTGCATGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTTGAACTCATATCTACAAGATGACTTCTTTAAAAATGTGCATGA  340

seq1  CAGCTTTATAAAAACCCAAACCTGAAAGCAATTCACATGTAAGGATAAAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTATAAAAACCCAAACCTGAAAGCAATTCACATGTAAGGATAAAT  390

seq1  GCTCAAGAGATTGTGATACATGTTCATTCAAGGGATCATTGACAGCTACA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGAGATTGTGATACATGTTCATTCAAGGGATCATTGACAGCTACA  440

seq1  CCAGAAAGGGCAGTGCTACGCATGACATCATGCATGAAAGGCAAAAACAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAGGGCAGTGCTACGCATGACATCATGCATGAAAGGCAAAAACAT  490

seq1  TAGTCTTTTTTAAATTCTCAAAAAATAAATTTAAAAGGGCATTATCAGAC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTTTTTAAATTCTCAAAAAATAAATTTAAAAGGGCATTATCAGAC  540

seq1  AAAAAAAGATAATGTTTGATATGATCTTGATCTTGTTTGTCTATGGTTGA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGATAATGTTTGATATGATCTTGATCTTGTTTGTCTATGGTTGA  590

seq1  TTGGCAGTCAGTGGTCTGGGAGGAGCACAAAGGGATTTTGGAGGCAATGG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGTCAGTGGTCTGGGAGGAGCACAAAGGGATTTTGGAGGCAATGG  640

seq1  CTTTGCTTTCTAACTTGGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTTTCTAACTTGGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTG  690

seq1  TTTTTTGGTTTTTTTGTAGAAGTAACTCATAAGTACATGGTTGTCAAACC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGGTTTTTTTGTAGAAGTAACTCATAAGTACATGGTTGTCAAACC  740

seq1  CTATCATGCTAACTGTGTAATGGCTTTGTTTTTTATTATATGGAAACTGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCATGCTAACTGTGTAATGGCTTTGTTTTTTATTATATGGAAACTGT  790

seq1  AGAGCAGTAAAATTCATTACAGAATAGAGTAGAAAATTAAATGAGAAAGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGTAAAATTCATTACAGAATAGAGTAGAAAATTAAATGAGAAAGG  840

seq1  TAAAGACAGAAAATTACTTATGATGCTTAGCCATTTCATAGAGATAAACT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACAGAAAATTACTTATGATGCTTAGCCATTTCATAGAGATAAACT  890

seq1  TGGATCCTGGTCACCTGTTCACATACCTAGGAAGTGTTTAAGCATGTGTC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCTGGTCACCTGTTCACATACCTAGGAAGTGTTTAAGCATGTGTC  940

seq1  CATGAGGTACACCCTGACCATGGTGTGGTCCTATCTTTCTAGTATCTACT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGGTACACCCTGACCATGGTGTGGTCCTATCTTTCTAGTATCTACT  990

seq1  GTTGTCACATGGTAGTAGCATAAAGAAAGACTGCTATCAATGCAAGGATT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCACATGGTAGTAGCATAAAGAAAGACTGCTATCAATGCAAGGATT  1040

seq1  TCTAGTAAACACTGTTGTAGTTAGACCTTACCCAGGTCATAGAGCCATGA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTAAACACTGTTGTAGTTAGACCTTACCCAGGTCATAGAGCCATGA  1090

seq1  ATTC  1099
      ||||
seq2  ATTC  1094

seq1: chr7_131132974_131134071
seq2: B6Ng01-294L16.g_66_1163

seq1  GAATTCTTAACTTAATGATCTGAAGTGACCACACCTGATCTGACCACAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAACTTAATGATCTGAAGTGACCACACCTGATCTGACCACAGA  50

seq1  GATGACTTGGGTTTATAAGATCTATTCCCGTAGGGAGGGTGGAGACCTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACTTGGGTTTATAAGATCTATTCCCGTAGGGAGGGTGGAGACCTAC  100

seq1  GAGGTAGGAAAAGTGGCTTCAAGGTTTTGCTTTGTTATGTCAGCTACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGGAAAAGTGGCTTCAAGGTTTTGCTTTGTTATGTCAGCTACCAG  150

seq1  CGTGCTTATATTAATAAAGCCCATTTTCTGACTGAGACACTTTGATCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTTATATTAATAAAGCCCATTTTCTGACTGAGACACTTTGATCCTC  200

seq1  GAATGCATTTATGTAGCAGGCTCTTTACAGGGATGGATGTAGGAGTCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCATTTATGTAGCAGGCTCTTTACAGGGATGGATGTAGGAGTCTGA  250

seq1  AGGGATATGGTGTGAGGCAGGCCCCTTTCATCTCTGAGCCAGGATCCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATATGGTGTGAGGCAGGCCCCTTTCATCTCTGAGCCAGGATCCACA  300

seq1  GCACGCTCACTGTGTGACCTTGGGTAAGTTGAGAGATATCTTGCAGCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGCTCACTGTGTGACCTTGGGTAAGTTGAGAGATATCTTGCAGCTTC  350

seq1  AGCTTCTCCATCTATAGAATGGGCTCACTGTTGTTTCCAAAGCACTATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTCCATCTATAGAATGGGCTCACTGTTGTTTCCAAAGCACTATAT  400

seq1  GACAATGAACCACAGGGACATCTCAAAGGCCTTGTGTAGAGTTGGCGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGAACCACAGGGACATCTCAAAGGCCTTGTGTAGAGTTGGCGACA  450

seq1  TAAGGTACCTTACCTGGCTTCTTCATTTTCCTTCAATGCCTTCCTTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTACCTTACCTGGCTTCTTCATTTTCCTTCAATGCCTTCCTTTTAT  500

seq1  TCTGCCCTGCAGCATGGAGGACCCGAAGGAGAAAGCCAGGCTCATTTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCTGCAGCATGGAGGACCCGAAGGAGAAAGCCAGGCTCATTTGTC  550

seq1  ATTCATTGGATGCCGCCTTTTATTTCAAGATTCTATCTGAAAGAGAGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTGGATGCCGCCTTTTATTTCAAGATTCTATCTGAAAGAGAGCTT  600

seq1  GCGAGTCCCCAGCAGCTCTTAAGTAGTTATCCAGAGGACAATCAGAGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAGTCCCCAGCAGCTCTTAAGTAGTTATCCAGAGGACAATCAGAGGGT  650

seq1  TCCAGAAGTCGGCCTGTTGGCTCTGAGTGGGAGATGAGTCTAATTTCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAAGTCGGCCTGTTGGCTCTGAGTGGGAGATGAGTCTAATTTCCTG  700

seq1  AGGTGATCTGGTCATGCTCACCCACCCAGAGGAACTGGAGGAAAAATGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGATCTGGTCATGCTCACCCACCCAGAGGAACTGGAGGAAAAATGGC  750

seq1  CCAGTTCTCTGGGTTGTCGCTCTCTTGAGCCTTTGGCAGGAGAGCAGACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTCTCTGGGTTGTCGCTCTCTTGAGCCTTTGGCAGGAGAGCAGACC  800

seq1  ATTTGCTCTGGATATCCCAGAAGCAGTAAGCTGCCAGGCAGGTAGGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTCTGGATATCCCAGAAGCAGTAAGCTGCCAGGCAGGTAGGTGTG  850

seq1  TC-TTCATCTTCCCCACAGTACCC-AAGGCACCCTGTCACTCTCCTGCCT  898
      || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCATCTTCCCCACAGTACCCAAAGGCA-CCTGTCACTCTCCTGCCT  899

seq1  GAGCTCTGGTGAAATCACTCAGGTGCTCCAGCCATCTGACTGTGGCTTAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTGGTGAAATCACTCAGGTGCTCCAGCCATCTGACTGTGGCTTAT  949

seq1  ATTTTATCTTTGTAAGCCTTTCCAAGCCCGTTTTACTTTTAAAGGCTGTA  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATTTTATCTTTGTAAGCCTTTCCAAGCCCGTTTTACTTTTAAGGGCTGTA  999

seq1  GAAGCCTTGAGACACTGGGTGAGTTGAGA-TGCT-GGCTCGG-ACGCTCC  1045
      ||||| |  | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |
seq2  GAAGCTTGAAAACACTGGGTGAGTTGAGATTGCTGGGCTCGGAACGCT-C  1048

seq1  AGAGCTTGAAAGGTTTGGTTTTTCCTAATGGATGCTAGCT-CTGGAAGGG  1094
      ||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||
seq2  AGAGCTTGAAAG--TTGCTTTT--CTAATGAATGCTAGCTCCTGGAAGGG  1094

seq1  GTTG  1098
      ||||
seq2  GTTG  1098