BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298O19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 81,413,714 - 81,545,954
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlco3a1, EG665308
Upstream gene4930429H19Rik, LOC665588, Rgma, Chd2, 1810026B05Rik, EG665610, LOC244061, A830073O21Rik, St8sia2, LOC100042127, LOC100042140, LOC546979
Downstream geneEG665641, 0610006L08Rik, Sv2b, 1500012K07Rik, LOC100042171
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298O19.bB6Ng01-298O19.g
ACCGA093906GA093907
length1,0931,140
definitionB6Ng01-298O19.b B6Ng01-298O19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,413,714 - 81,414,825)(81,544,822 - 81,545,954)
sequence
gaattcagagcaccttagaagtgtaccactgtaggcttccaccaaaatgc
acaaatgaagaactgcattaaaaaaaaaaatgtgacaaacagataccaac
gttcttgtggctcttagagctatgactagagacatggactcagaaagaga
accgcagcctggtgttccaaagtagaagaacaatggtggtacgggaagga
aaaacacccattttaccccaggttcacagacatgaatcctgctaatcatt
accatttgttgtgaattcatgagcaattcaaagagtttatgaactgagtt
tctaaagccttttcaattctgtatgtggttaccatgctcttggacactct
aacatagataatgctcttttgcatcctgtttaaaatcaaattcccaatct
agtttccccttctctctctataacactggagtctgcttctccttcgaaag
atccctccctccctctccgctggatcctttcttagcttctaacaactgtg
cttacttggattggagtacacatatctaaaacttaaaagctgccattcca
catctaagagaaaacatgcagtgtctgtcttttttgagtctgggttactt
cactcaaatcagggaacacatcgtcaagataaaatatttatttgctgaga
tttttttcatcccgagtattgccttatccacacagttacacaaagatcaa
aaggatttgtgactgtgtgtggctgattgtcacaggcatagcttttttta
gagatatatatttctaagactgaatgcacgatgatttgggggaaagaatt
aatacgtaatttgaattcaaacgacaagcttaaaaagaaatattccgctt
ggagaagcattcttaaatatctctggggaatacatttcttttattaatcc
agccagccactggatgtcattctcccaatttaattacgtttatctgccaa
tgggtgatgctgctctatgcatgtatttggtcgtgcaatggtgatgcaat
cattgtctgaggagatatgctgttatattattactcatgcaggtagcatg
tgtgaatttacctcgtcagatgatcttgaaatacgatgggaga
gaattcactgaccacgaggtttagcttcaaattaagtgagtggctgaatg
caccttctagagaagagtggataggagcaggtaagaggtctggttcccag
agtaaccccatgcagttctgaattccattgctttcttctgtctgccacaa
cgttcaatagaagatgctgtgtcccactccccactcctaccctgatcttc
ccagccaaggcaaacacttcaattctttttactgctagcatttagcatat
atcagtcattaaatatgtctggcaaagggtatgctgagtctctgcagaac
ctgaaatgggttttaaaaggatagaatgttgactgttgccaacaaatatg
gaagttgacctcagggattcactaaaacctagtactggttatttatgtct
tctaaaagatgactgatttggggagcatttagaaagttgggtaaccatag
gctgtaaggctgctgaacatacaaagctgtgtgacaggctctacaatgag
caatgggagatatcagagtgacattattcttgggagtaactgatagagca
atctggtgctccaagctcatcaaaggacttagagagtaagctattgatta
ccacaggggtgtagcatggagggaaggtgaaacttcagcagagccaggtg
agtaggagttcaccagcaagccaagagggggactgagaggagatggtggc
ataaagatacagaaacatggaaggacatgacaggcttcacaagcagcacc
cttcagactagctaaaggagaagaaaaagtgatgtcaggctgtggacata
cccaggcagagggtgccagggatgcagtcagggtggatggaaaggcgtca
gagggtctcaagctttgttttttgtgagcaagactttggtggccagagaa
tggttgaaaagatagaggaatgctctagaagaaagacaagcaggatgagc
tgcccttgtttcttgttatcagtgttgatttcttgtgacccacctcgatg
ccattgtccacagctattggctgcttcatcagtgagagtctttttgtccc
tgctgttggcgctaacatttttagtgactggcaggcatgcaattgacctt
gtttgttgctaagccagctctctccagctctagccttgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_81413714_81414825
seq2: B6Ng01-298O19.b_48_1140

seq1  GAATTCAGAGCACCTTAGAAGTGTACCACTGTAGGCTTCCACCAAAATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGCACCTTAGAAGTGTACCACTGTAGGCTTCCACCAAAATGC  50

seq1  ACAAATGAAGAACTGCATTAAAAAAAAAAATGTGACAAACAGATACCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGAAGAACTGCATTAAAAAAAAAAATGTGACAAACAGATACCAAC  100

seq1  GTTCTTGTGGCTCTTAGAGCTATGACTAGAGACATGGACTCAGAAAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGTGGCTCTTAGAGCTATGACTAGAGACATGGACTCAGAAAGAGA  150

seq1  ACCGCAGCCTGGTGTTCCAAAGTAGAAGAACAATGGTGGTACGGGAAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCAGCCTGGTGTTCCAAAGTAGAAGAACAATGGTGGTACGGGAAGGA  200

seq1  AAAACACCCATTTTACCCCAGGTTCACAGACATGAATCCTGCTAATCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACCCATTTTACCCCAGGTTCACAGACATGAATCCTGCTAATCATT  250

seq1  ACCATTTGTTGTGAATTCATGAGCAATTCAAAGAGTTTATGAACTGAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTTGTTGTGAATTCATGAGCAATTCAAAGAGTTTATGAACTGAGTT  300

seq1  TCTAAAGCCTTTTCAATTCTGTATGTGGTTACCATGCTCTTGGACACTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGCCTTTTCAATTCTGTATGTGGTTACCATGCTCTTGGACACTCT  350

seq1  AACATAGATAATGCTCTTTTGCATCCTGTTTAAAATCAAATTCCCAATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGATAATGCTCTTTTGCATCCTGTTTAAAATCAAATTCCCAATCT  400

seq1  AGTTTCCCCTTCTCTCTCTATAACACTGGAGTCTGCTTCTCCTTCGAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCCCCTTCTCTCTCTATAACACTGGAGTCTGCTTCTCCTTCGAAAG  450

seq1  ATCCCTCCCTCCCTCTCCGCTGGATCCTTTCTTAGCTTCTAACAACTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTCCCTCCCTCTCCGCTGGATCCTTTCTTAGCTTCTAACAACTGTG  500

seq1  CTTACTTGGATTGGAGTACACATATCTAAAACTTAAAAGCTGCCATTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTTGGATTGGAGTACACATATCTAAAACTTAAAAGCTGCCATTCCA  550

seq1  CATCTAAGAGAAAACATGCAGTGTCTGTCTTTTTTGAGTCTGGGTTACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTAAGAGAAAACATGCAGTGTCTGTCTTTTTTGAGTCTGGGTTACTT  600

seq1  CACTCAAATCAGGGAACACATCGTCAAGATAAAATATTTATTTGCTGAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAAATCAGGGAACACATCGTCAAGATAAAATATTTATTTGCTGAGA  650

seq1  TTTTTTTCATCCCGAGTATTGCCTTATCCACACAGTTACACAAAGATCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTCATCCCGAGTATTGCCTTATCCACACAGTTACACAAAGATCAA  700

seq1  AAGGATTTGTGACTGTGTGTGGCTGATTGTCACAGGCATAGCTTTTTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATTTGTGACTGTGTGTGGCTGATTGTCACAGGCATAGCTTTTTTTA  750

seq1  GAGATATATATTTCTAAGACTGAATGCACGATGATTTGGGGGAAAGAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATATATATTTCTAAGACTGAATGCACGATGATTTGGGGGAAAGAATT  800

seq1  AATACGTAATTTGAATTCAAACGACAAGCTTAAAAAGAAATATTCCGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACGTAATTTGAATTCAAACGACAAGCTTAAAAAGAAATATTCCGCTT  850

seq1  GGAGAAGCATTCTTAAATATCTCTGGGGAATACATTTCTTTTATTAATCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGCATTCTTAAATATCTCTGGGGAATACATTTCTTTTATTAATCC  900

seq1  AGCCAGCCACTGGATGTCATTCTCCCAATTTAATTACGTTTATCTGCCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGCCACTGGATGTCATTCTCCCAATTTAATTACGTTTATCTGCCAA  950

seq1  TGGGTGATGCTGCTTCTTATGCATGTAATTTGGGTCGGTGCAAATGGTGA  1000
      ||||||||||||||   ||||||||||  || |||| |||| ||||||||
seq2  TGGGTGATGCTGCT--CTATGCATGTA--TTTGGTC-GTGC-AATGGTGA  994

seq1  TGGCAAATCATTGTCCTGAGGGAGATAATTGCTGTTATAATTATTTACTC  1050
      ||   ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||
seq2  TG--CAATCATTGT-CTGA-GGAGATA--TGCTGTTAT-ATTA-TTACTC  1036

seq1  ATGCAAGTTAGGCATGTGTGAATTTTACCTCGGTCAGATGATCTGGAAAT  1100
      ||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||
seq2  ATGCAGGT--AGCATGTGTGAA-TTTACCTC-GTCAGATGATCTTGAAAT  1082

seq1  ACGAATGGGAGA  1112
      ||| ||||||||
seq2  ACG-ATGGGAGA  1093

seq1: chr7_81544822_81545954
seq2: B6Ng01-298O19.g_68_1207 (reverse)

seq1  AGCAAGGCCAGAGCT-GAGAG-GCTGGCTTTAGCCAACCAACAAGGTCAA  48
      |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||
seq2  AGCAAGGCTAGAGCTGGAGAGAGCTGGC-TTAG-CAACAAACAAGGTCAA  48

seq1  -TGCATGCCCTTGGCCAGTCACTAAAATTG-TAGCGCCAACAGCAGGGAC  96
       ||||||||    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||
seq2  TTGCATGCC---TGCCAGTCACTAAAAATGTTAGCGCCAACAGCAGGGAC  95

seq1  -AAAAGACTCTCACTGATGAAGCAGCC-ATAGCTGT-GACAATGGCATCG  143
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  AAAAAGACTCTCACTGATGAAGCAGCCAATAGCTGTGGACAATGGCATCG  145

seq1  AGGTGGGTCACAAGAAATC-ACACTGATAACAGGAA--CAGGGCAGCTCA  190
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||
seq2  AGGTGGGTCACAAGAAATCAACACTGATAACAAGAAACAAGGGCAGCTCA  195

seq1  TCCTGCTTGTCTTTCTTCTAGAGCATTCCTCTTATCTTTTC-ACCATTCT  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TCCTGCTTGTCTTTCTTCTAGAGCATTCCTC-TATCTTTTCAACCATTCT  244

seq1  CTGGCCACCAAAGTCTTGCTCACAAAAAACAAAGCTTGAGACCCTCTGAC  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCACCAAAGTCTTGCTCACAAAAAACAAAGCTTGAGACCCTCTGAC  294

seq1  GCC-TTCCATCCACCCTGACTGCATCCCTGGCACCCTCTGCCTGGGTATG  338
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTCCATCCACCCTGACTGCATCCCTGGCACCCTCTGCCTGGGTATG  344

seq1  TCCACAGCCTGACATCACTTTTTCTTCTCC-TTAGCTAGTCTGAAGGGTG  387
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGCCTGACATCACTTTTTCTTCTCCTTTAGCTAGTCTGAAGGGTG  394

seq1  CTGCTTGTGAAGCCTGTCATGTCCTTCCATGTTTCTGTATCTTTATGCCA  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTGTGAAGCCTGTCATGTCCTTCCATGTTTCTGTATCTTTATGCCA  444

seq1  CCATCTCCTCTCAGTCCCCCTCTTGGCTTGCTGGTGAACTCCTACTCACC  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCTCTCAGTCCCCCTCTTGGCTTGCTGGTGAACTCCTACTCACC  494

seq1  TGGCTCTGCTGAAGTTTCACCTTCCCTCCATGCTACACCCCTGTGGTAAT  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCTGCTGAAGTTTCACCTTCCCTCCATGCTACACCCCTGTGGTAAT  544

seq1  CAATAGCTTACTCTCTAAGTCCTTTGATGAGCTTGGAGCACCAGATTGCT  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCTTACTCTCTAAGTCCTTTGATGAGCTTGGAGCACCAGATTGCT  594

seq1  CTATCAGTTACTCCCAAGAATAATGTCACTCTGATATCTCCCATTGCTCA  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCAGTTACTCCCAAGAATAATGTCACTCTGATATCTCCCATTGCTCA  644

seq1  TTGTAGAGCCTGTCACACAGCTTTGTATGTTCAGCAGCCTTACAGCCTAT  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGAGCCTGTCACACAGCTTTGTATGTTCAGCAGCCTTACAGCCTAT  694

seq1  GGTTACCCAACTTTCTAAATGCTCCCCAAATCAGTCATCTTTTAGAAGAC  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTACCCAACTTTCTAAATGCTCCCCAAATCAGTCATCTTTTAGAAGAC  744

seq1  ATAAATAACCAGTACTAGGTTTTAGTGAATCCCTGAGGTCAACTTCCATA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAACCAGTACTAGGTTTTAGTGAATCCCTGAGGTCAACTTCCATA  794

seq1  TTTGTTGGCAACAGTCAACATTCTATCCTTTTAAAACCCATTTCAGGTTC  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGGCAACAGTCAACATTCTATCCTTTTAAAACCCATTTCAGGTTC  844

seq1  TGCAGAGACTCAGCATACCCTTTGCCAGACATATTTAATGACTGATATAT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGACTCAGCATACCCTTTGCCAGACATATTTAATGACTGATATAT  894

seq1  GCTAAATGCTAGCAGTAAAAAGAATTGAAGTGTTTGCCTTGGCTGGGAAG  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAATGCTAGCAGTAAAAAGAATTGAAGTGTTTGCCTTGGCTGGGAAG  944

seq1  ATCAGGGTAGGAGTGGGGAGTGGGACACAGCATCTTCTATTGAACGTTGT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGGTAGGAGTGGGGAGTGGGACACAGCATCTTCTATTGAACGTTGT  994

seq1  GGCAGACAGAAGAAAGCAATGGAATTCAGAACTGCATGGGGTTACTCTGG  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGACAGAAGAAAGCAATGGAATTCAGAACTGCATGGGGTTACTCTGG  1044

seq1  GAACCAGACCTCTTACCTGCTCCTATCCACTCTTCTCTAGAAGGTGCATT  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAGACCTCTTACCTGCTCCTATCCACTCTTCTCTAGAAGGTGCATT  1094

seq1  CAGCCACTCACTTAATTTGAAGCTAAACCTCGTGGTCAGTGAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACTCACTTAATTTGAAGCTAAACCTCGTGGTCAGTGAATTC  1140