BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-299I18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 146,572,291 - 146,733,920
singlet/doubletdoublet
Overlap geneInpp5a
Upstream geneTcerg1l, LOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2
Downstream geneNkx6-2, E030019B06Rik, 9330101J02Rik, LOC100043472, EG434253, EG664869, Gpr123, LOC244229, Kndc1, Utf1, LOC100039095, 6430531B16Rik, Adam8, Tubgcp2, Zfp511, Msx3, Drd1ip, Prap1, 1810014F10Rik, Echs1, Paox, Mtg1, Sprn, Olfr522, Olfr523, Olfr524, E430002D04Rik, 5830411N06Rik, EG622335, Olfr525, Olfr527, GA_x5J8B7W72BC-152913-152037, Olfr60, GA_x5J8B7W72BC-125691-125311, Olfr530, LOC622973, Olfr531, Olfr532, Olfr533, Olfr534-ps1, Olfr535, Olfr536, Olfr537-ps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-299I18.bB6Ng01-299I18.g
ACCGA094357GA094358
length1,1441,162
definitionB6Ng01-299I18.b B6Ng01-299I18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,732,768 - 146,733,920)(146,572,291 - 146,573,444)
sequence
gaattcaccctgccaacccttcttatcttggacacacacacatacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacaccttctcgatgttagccc
tgctacatccccatctcccttgaagttgaggtaggagtcagtgggtgtct
tgtcccatagggaagctgttctgtggccagatccgcaaccagcactgcag
tcactgctgtagttgtggcagctcaggctcccaaggccacatctatagcc
tctcaggtgcctagggaagcccagcacataaagcacccacacctgagtgt
cccatagctctcaatagcccaagtgtgcgtcactgagtggggaggcaaag
cacagggagtggactggtggctataggactgtgggcagctgctcagtcca
ccctcagtgaggccagcagttcagactgactcagcaaaaccagggacagg
attttataagattgcctaagctttttagattgggttctacctgacacagg
aggcctactgtaggtcacagggctgggcaaaaggcccactgtgcaaagtt
caccttacagaatcagcaacggatgctgtttggggagctgtctatcagta
cccacagaggcctgtccagtctccttctccttgctggacagtggcagcta
ctcatctaaaacagagcatcacaaacagcctgtcatctcttctcccaaaa
cggcttgccttgcagcagctggtgcttgtgtccaggttattagtggcact
gagtgacttgttcatcccacctaggtaggacaggacctacttttataaga
gtataggcacaagctgagactcacacaatttgtgtgagcacccacagccc
agaagtatctcacaagattgtgtaagcccctgtggcttacactctgtctt
ggctggggctagacctgcagcaggactccttccagatgccccaagctcac
acagctgggaaagcagagaaagcagagcacagagttcccacaggttcttc
gagctgcagcagtcatgagtacgcagcaaacagcttcttgatcagtgagt
caaagactagctactctaataggatctgagatagtaaaacagtagatcca
ctgctataaagtatttcaatttgatcttgagagtaatactctga
gaattcagcacgggccctagctgtgtgagacctggtcccccttccccaca
acaaagacaaacaaacaaacaagataatgcttggcatgcgttaactttgt
tgaattattcagctccgtggggatggcaaaatgacacagacaggaagttt
gactgcagacatttatttcttacagctccagagcttggaaattcaagttc
cagcacagggtgctcctggtgttaggcagaggtcctcttgctgtgctcac
atgacctttatgtgcagctggaggggcagaggacagaggacttctgatcc
cactttttataaggacactaatcccagtagatcagaacgccgcccttcag
gcccctgtaactttaaagaccccaggatagtccttatttcccaataaccg
aatgtggagttagggcttaagtctaccgagtctggatggggtacgcagtt
cagttcacagcagacatctactactgagtggtgtggacactaatcagttg
agagatggatttttgtggaataaaagggttgagaggtagactagagacag
gcagagataaaggcaaaccacactgcagcttgagcttgatgccattgcag
agtgtagcagagcagtaggagcataccctatgtctgtgcaaagtggggtg
aagatggacaccagtctttgcttctttatagcagcatttccacctcattg
gcagtgcaaatttgcctgctcccatcatgcatcttggcatcatgacaacc
ctaaacccataagggcagaagagagaataaaccttattttggtaaagtgc
caatccagtcttagaatgtctttccctaactttaactcttgaataccctc
tcttcttctaaagcttgtctataagatagagcattcaaaagcacggccac
aggttttttctccagaagcctgtacacactgactcctttgagtggtgggc
ttctctctgtaatactactttctcttaatccctttcttgtcgcatctctg
acttctttctcagatggtgcccaagagtgggaaacacttgtagggagcat
ggtggtaactggccactgcgcctgtaagcaccagaatactcaattcaagg
cctttgcctgtggggaagctcatacatgctaaatgctaggtccaacaccc
tggatgcatgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_146732768_146733920
seq2: B6Ng01-299I18.b_49_1192 (reverse)

seq1  TCAGAGTATTTACTTCTACAAAGATCAATTTG-AATACTTTAATTAGCCA  49
      |||||||| |||| |||   |||||||| ||| |||||||||  ||| ||
seq2  TCAGAGTA-TTAC-TCT--CAAGATCAAATTGAAATACTTTA--TAG-CA  43

seq1  GTGATTCTACTGTTTTACTATCTCAAGATTCTATTAGAGTAGCTAGGTCT  99
      |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||
seq2  GTGGATCTACTGTTTTACTATCTC-AGATCCTATTAGAGTAGCTA-GTCT  91

seq1  TTGACTCACTGATCAAGAAGCTGTTTGGCTGCGTACTCATGACCTGCTGC  149
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  TTGACTCACTGATCAAGAAGCTGTTT-GCTGCGTACTCATGA-CTGCTGC  139

seq1  AGCTCCGAAG-ACCTGTGGGAACTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTTT-CC  197
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGCT-CGAAGAACCTGTGGGAACTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTTTCCC  188

seq1  AGCTGTGTGAGCTTGGGGCATCTGGAAGGAGTCCTGCTGCAGGTCTAGCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTGTGAGCTTGGGGCATCTGGAAGGAGTCCTGCTGCAGGTCTAGCC  238

seq1  CCAGCCAAGACAGAGTGTAAGCCACAGGGGCTTACACAATCTTGTGAGAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCAAGACAGAGTGTAAGCCACAGGGGCTTACACAATCTTGTGAGAT  288

seq1  ACTTCTGGGCTGTGGGTGCTCACACAAATTGTGTGAGTCTCAGCTTGTGC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTGGGCTGTGGGTGCTCACACAAATTGTGTGAGTCTCAGCTTGTGC  338

seq1  CTATACTCTTATAAAAGTAGGTCCTGTCCTACCTAGGTGGGATGAACAAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACTCTTATAAAAGTAGGTCCTGTCCTACCTAGGTGGGATGAACAAG  388

seq1  TCACTCAGTGCCACTAATAACCTGGACACAAGCACCAGCTGCTGCAAGGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCAGTGCCACTAATAACCTGGACACAAGCACCAGCTGCTGCAAGGC  438

seq1  AAGCCGTTTTGGGAGAAGAGATGACAGGCTGTTTGTGATGCTCTGTTTTA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCGTTTTGGGAGAAGAGATGACAGGCTGTTTGTGATGCTCTGTTTTA  488

seq1  GATGAGTAGCTGCCACTGTCCAGCAAGGAGAAGGAGACTGGACAGGCCTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTAGCTGCCACTGTCCAGCAAGGAGAAGGAGACTGGACAGGCCTC  538

seq1  TGTGGGTACTGATAGACAGCTCCCCAAACAGCATCCGTTGCTGATTCTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTACTGATAGACAGCTCCCCAAACAGCATCCGTTGCTGATTCTGT  588

seq1  AAGGTGAACTTTGCACAGTGGGCCTTTTGCCCAGCCCTGTGACCTACAGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGAACTTTGCACAGTGGGCCTTTTGCCCAGCCCTGTGACCTACAGT  638

seq1  AGGCCTCCTGTGTCAGGTAGAACCCAATCTAAAAAGCTTAGGCAATCTTA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCCTGTGTCAGGTAGAACCCAATCTAAAAAGCTTAGGCAATCTTA  688

seq1  TAAAATCCTGTCCCTGGTTTTGCTGAGTCAGTCTGAACTGCTGGCCTCAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCCTGTCCCTGGTTTTGCTGAGTCAGTCTGAACTGCTGGCCTCAC  738

seq1  TGAGGGTGGACTGAGCAGCTGCCCACAGTCCTATAGCCACCAGTCCACTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGTGGACTGAGCAGCTGCCCACAGTCCTATAGCCACCAGTCCACTC  788

seq1  CCTGTGCTTTGCCTCCCCACTCAGTGACGCACACTTGGGCTATTGAGAGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGCTTTGCCTCCCCACTCAGTGACGCACACTTGGGCTATTGAGAGC  838

seq1  TATGGGACACTCAGGTGTGGGTGCTTTATGTGCTGGGCTTCCCTAGGCAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGACACTCAGGTGTGGGTGCTTTATGTGCTGGGCTTCCCTAGGCAC  888

seq1  CTGAGAGGCTATAGATGTGGCCTTGGGAGCCTGAGCTGCCACAACTACAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGGCTATAGATGTGGCCTTGGGAGCCTGAGCTGCCACAACTACAG  938

seq1  CAGTGACTGCAGTGCTGGTTGCGGATCTGGCCACAGAACAGCTTCCCTAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACTGCAGTGCTGGTTGCGGATCTGGCCACAGAACAGCTTCCCTAT  988

seq1  GGGACAAGACACCCACTGACTCCTACCTCAACTTCAAGGGAGATGGGGAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAAGACACCCACTGACTCCTACCTCAACTTCAAGGGAGATGGGGAT  1038

seq1  GTAGCAGGGCTAACATCGAGAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGGGCTAACATCGAGAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  1088

seq1  TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTCCAAGATAAGAAGGGTTGGCAGGGT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTCCAAGATAAGAAGGGTTGGCAGGGT  1138

seq1  GAATTC  1153
      ||||||
seq2  GAATTC  1144

seq1: chr7_146572291_146573444
seq2: B6Ng01-299I18.g_68_1229

seq1  GAATTCAGCACGGGCCCTAGCTGTGTGAGACCTGGTCCCCCTTCCCCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCACGGGCCCTAGCTGTGTGAGACCTGGTCCCCCTTCCCCACA  50

seq1  ACAAAGACAAACAAACAAACAAGATAATGCTTGGCATGCGTTAACTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGACAAACAAACAAACAAGATAATGCTTGGCATGCGTTAACTTTGT  100

seq1  TGAATTATTCAGCTCCGTGGGGATGGCAAAATGACACAGACAGGAAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTATTCAGCTCCGTGGGGATGGCAAAATGACACAGACAGGAAGTTT  150

seq1  GACTGCAGACATTTATTTCTTACAGCTCCAGAGCTTGGAAATTCAAGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCAGACATTTATTTCTTACAGCTCCAGAGCTTGGAAATTCAAGTTC  200

seq1  CAGCACAGGGTGCTCCTGGTGTTAGGCAGAGGTCCTCTTGCTGTGCTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAGGGTGCTCCTGGTGTTAGGCAGAGGTCCTCTTGCTGTGCTCAC  250

seq1  ATGACCTTTATGTGCAGCTGGAGGGGCAGAGGACAGAGGACTTCTGATCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTTTATGTGCAGCTGGAGGGGCAGAGGACAGAGGACTTCTGATCC  300

seq1  CACTTTTTATAAGGACACTAATCCCAGTAGATCAGAACGCCGCCCTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTTTATAAGGACACTAATCCCAGTAGATCAGAACGCCGCCCTTCAG  350

seq1  GCCCCTGTAACTTTAAAGACCCCAGGATAGTCCTTATTTCCCAATAACCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTGTAACTTTAAAGACCCCAGGATAGTCCTTATTTCCCAATAACCG  400

seq1  AATGTGGAGTTAGGGCTTAAGTCTACCGAGTCTGGATGGGGTACGCAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGAGTTAGGGCTTAAGTCTACCGAGTCTGGATGGGGTACGCAGTT  450

seq1  CAGTTCACAGCAGACATCTACTACTGAGTGGTGTGGACACTAATCAGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCACAGCAGACATCTACTACTGAGTGGTGTGGACACTAATCAGTTG  500

seq1  AGAGATGGATTTTTGTGGAATAAAAGGGTTGAGAGGTAGACTAGAGACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGGATTTTTGTGGAATAAAAGGGTTGAGAGGTAGACTAGAGACAG  550

seq1  GCAGAGATAAAGGCAAACCACACTGCAGCTTGAGCTTGATGCCATTGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGATAAAGGCAAACCACACTGCAGCTTGAGCTTGATGCCATTGCAG  600

seq1  AGTGTAGCAGAGCAGTAGGAGCATACCCTATGTCTGTGCAAAGTGGGGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAGCAGAGCAGTAGGAGCATACCCTATGTCTGTGCAAAGTGGGGTG  650

seq1  AAGATGGACACCAGTCTTTGCTTCTTTATAGCAGCATTTCCACCTCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGGACACCAGTCTTTGCTTCTTTATAGCAGCATTTCCACCTCATTG  700

seq1  GCAGTGCAAATTTGCCTGCTCCCATCATGCATCTTGGCATCATGACAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGCAAATTTGCCTGCTCCCATCATGCATCTTGGCATCATGACAACC  750

seq1  CTAAACCCATAAGGGCAGAAGAGAGAATAAACCTTATTTTGGTAAAGTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACCCATAAGGGCAGAAGAGAGAATAAACCTTATTTTGGTAAAGTGC  800

seq1  CAATCCAGTCTTAGAATGTCTTTCCCTAACTTTAACTCTTGAATACCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCAGTCTTAGAATGTCTTTCCCTAACTTTAACTCTTGAATACCCTC  850

seq1  TCTTCTTCTAAAGCTTGTCTATAAGATAGAGCATTCAAAAGCACGGCCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCTAAAGCTTGTCTATAAGATAGAGCATTCAAAAGCACGGCCAC  900

seq1  AGG-TTTTTCTCCAGAAGCCTGTACACACTGACTCC-TTGAGT-GTGGGC  947
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  AGGTTTTTTCTCCAGAAGCCTGTACACACTGACTCCTTTGAGTGGTGGGC  950

seq1  TTCTCTCTGTAATACTACTTTCTCTTAATCCTTTTCTTTGTCGCATCTCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
seq2  TTCTCTCTGTAATACTACTTTCTCTTAATCCCTTTC-TTGTCGCATCTCT  999

seq1  GAATTCTTTCTCAGATGGTG-CCAAGAGTTGGGAAACACTTGGTAGGGAG  1046
      || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  GACTTCTTTCTCAGATGGTGCCCAAGAG-TGGGAAACACTT-GTAGGGAG  1047

seq1  CAT-GTGGTTACTGGGCACTGCG-CTGTAAGCACCAG-ATACTCATTTCA  1093
      ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  CATGGTGGTAACTGGCCACTGCGCCTGTAAGCACCAGAATACTCAATTCA  1097

seq1  AAGCCTT--GCTGT-GGGAAGCTCATTAACATTGCTAAATGCTAGTTC--  1138
      | |||||   |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  
seq2  AGGCCTTTGCCTGTGGGGAAGCTCAT--ACA-TGCTAAATGCTAGGTCCA  1144

seq1  -CACACTGGATG-ATGTT  1154
       ||| ||||||| |||||
seq2  ACACCCTGGATGCATGTT  1162