BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302P19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 147,175,710 - 147,318,005
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdam8, Tubgcp2, Zfp511, Msx3, Drd1ip, Prap1, 1810014F10Rik, Echs1, Paox
Upstream gene6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2, Inpp5a, Nkx6-2, E030019B06Rik, 9330101J02Rik, LOC100043472, EG434253, EG664869, Gpr123, LOC244229, Kndc1, Utf1, LOC100039095, 6430531B16Rik
Downstream geneMtg1, Sprn, Olfr522, Olfr523, Olfr524, E430002D04Rik, 5830411N06Rik, EG622335, Olfr525, Olfr527, GA_x5J8B7W72BC-152913-152037, Olfr60, GA_x5J8B7W72BC-125691-125311, Olfr530, LOC622973, Olfr531, Olfr532, Olfr533, Olfr534-ps1, Olfr535, Olfr536, Olfr537-ps1, Olfr1523-ps1, Olfr538, Olfr1553-ps1, Olfr46, Olfr61, Olfr53, Olfr539, GA_x5J8B7W3EKE-4574231-4574913, Olfr45, Olfr541, GA_x5J8B7W3EKE-4522784-4521912, Cyp2e1, Syce1, LOC100043529, BC066028, 1190003J15Rik, Scgb1c1, Odf3, Bet1l, Ric8, Sirt3, Psmd13, LOC100043546, Cox8b, Nlrp6, Athl1, Ifitm5, Ifitm2, Ifitm1, LOC665143, Ifitm3, Ifitm6, B4galnt4, Pkp3, Sigirr, Trp53i5, Ptdss2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302P19.bB6Ng01-302P19.g
ACCGA096898GA096899
length902792
definitionB6Ng01-302P19.b B6Ng01-302P19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,317,113 - 147,318,005)(147,175,710 - 147,176,528)
sequence
gaattccttctctgctacaagtttacttcctttttagagattggccaata
agatatatagctgggggctggagagatggctcagtggttaagatcacaga
ctgctcttccagaggtcctaagttcaattcccagtgaccatatggtggct
cacaaacatctataatatgatagatgctcttttctggcatggaggtgtac
atgcagataaatacttgtatacataaaataaacaaataggatataaaaaa
taaaataaaaaatgaggaatacagaatatatatatgtatatatatatgtg
tgtgtatatatatacatacatacatatatatagtggaggtggagtacctg
tcactctccggagtacttgggttagagacagaagcacttcttcatctgac
agagtctccataaactccgactccagcccagcaataaacccacagagcac
atgtgaagacctatataagcataagatgggaaatcggtctgctggccaca
caaacactatgccaggaccgccacaggcccccagagctctcctagagtct
tagctctcgaagtatctggctattttcacaaccctaaagcagcctgtgcc
gtttccaccttgtcactagtaccaaatgtgcaagagcagagcaggaaact
gtccctcagaggatggaggtaccaacaagccagaccagtaggcatcctgt
tcttcaccaccacgcacacaggggggtggggggggcgggcatcgggggat
gctgatttcacttgataagatccttaatgaaatagtaaagtttactgatt
tggggagctggagagatggcttcattggttaagagcattgactgctcttc
cagaggtcctgagtttcacttcccagcactccattgttggtggctctcaa
cc
gaattctcatgccaaggcccccttttcactgcctcagtttacccttcttt
aaaatggggcttcctgcctgggtctacagtacatacctgaggccagcaca
ggtgctaatactggcagctgagccctcgtacccttccacatggccttggt
agaggcaatggtcctaaggaagcgagagagggtcatgagccttgccacct
tgattccgctggcccagggaaggctggccaggcaccatacctgctcctgc
agttgctctgtcacctcagagccattggcagctgagtaggtctctgtgta
gcttgagcccagcaggtccctggaagacaaccattgacgttccctgattc
tgcctcacacggagcagccaccataagatgcctgggccaggattctggca
cacaggagcctacacttcccactggactcagagatctacccaaggaccag
aatcggcttacctgttctttcgaaggtgcagggtgaaaacgtgcccgctg
gtcccaagagcatagctcagactctctgggtactggccctggatggggat
tctcagcttaaggccagggatttgcatagcagaaagccccaagcagagac
cccctagaccctgaggattcgttagtttcagggagggaagtagatggctg
ggagcaggctgacagggaaagcaactctcccaggtgaagcagaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaagagtttgatggctccttgagccatttcctcaatctat
tcccaaggatgatggtgatgatgacggtgaaggtgatggtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_147317113_147318005
seq2: B6Ng01-302P19.b_48_949 (reverse)

seq1  GGTTGTGAGCCACCA--CATGG-GTGCTGGGAATTG-AACTCAGGACCTC  46
      ||||| |||||||||   |||| |||||||||| || |||||||||||||
seq2  GGTTGAGAGCCACCAACAATGGAGTGCTGGGAAGTGAAACTCAGGACCTC  50

seq1  TGGAAGAGCAGTCAATGCTCTTAACCACTG-AGCCATCTCTCCAGCTCCC  95
      ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGAGCAGTCAATGCTCTTAACCAATGAAGCCATCTCTCCAGCTCCC  100

seq1  CAAATCAGT-AACTTTACTATTTCATTAAGGATCTTATCAAGTGAAATCA  144
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCAGTAAACTTTACTATTTCATTAAGGATCTTATCAAGTGAAATCA  150

seq1  GCAT-CCCCGATGCC--GCCCCCCCACCCCCCTGTGTGCGTGGTGGTGAA  191
      |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCCCGATGCCCGCCCCCCCCACCCCCCTGTGTGCGTGGTGGTGAA  200

seq1  GAACAGGATGCCTACTGGTCTGGCTTGTTGGTACCTCCATCCTCTGAGGG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGGATGCCTACTGGTCTGGCTTGTTGGTACCTCCATCCTCTGAGGG  250

seq1  ACAGTTTCCTGCTCTGCTCTTGCACATTTGGTACTAGTGACAAGGTGGAA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTTCCTGCTCTGCTCTTGCACATTTGGTACTAGTGACAAGGTGGAA  300

seq1  ACGGCACAGGCTGCTTTAGGGTTGTGAAAATAGCCAGATACTTCGAGAGC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCACAGGCTGCTTTAGGGTTGTGAAAATAGCCAGATACTTCGAGAGC  350

seq1  TAAGACTCTAGGAGAGCTCTGGGGGCCTGTGGCGGTCCTGGCATAGTGTT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACTCTAGGAGAGCTCTGGGGGCCTGTGGCGGTCCTGGCATAGTGTT  400

seq1  TGTGTGGCCAGCAGACCGATTTCCCATCTTATGCTTATATAGGTCTTCAC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGCCAGCAGACCGATTTCCCATCTTATGCTTATATAGGTCTTCAC  450

seq1  ATGTGCTCTGTGGGTTTATTGCTGGGCTGGAGTCGGAGTTTATGGAGACT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTCTGTGGGTTTATTGCTGGGCTGGAGTCGGAGTTTATGGAGACT  500

seq1  CTGTCAGATGAAGAAGTGCTTCTGTCTCTAACCCAAGTACTCCGGAGAGT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGATGAAGAAGTGCTTCTGTCTCTAACCCAAGTACTCCGGAGAGT  550

seq1  GACAGGTACTCCACCTCCACTATATATATGTATGTATGTATATATATACA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGTACTCCACCTCCACTATATATATGTATGTATGTATATATATACA  600

seq1  CACACATATATATATACATATATATATTCTGTATTCCTCATTTTTTATTT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATATATATATACATATATATATTCTGTATTCCTCATTTTTTATTT  650

seq1  TATTTTTTATATCCTATTTGTTTATTTTATGTATACAAGTATTTATCTGC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTATATCCTATTTGTTTATTTTATGTATACAAGTATTTATCTGC  700

seq1  ATGTACACCTCCATGCCAGAAAAGAGCATCTATCATATTATAGATGTTTG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACACCTCCATGCCAGAAAAGAGCATCTATCATATTATAGATGTTTG  750

seq1  TGAGCCACCATATGGTCACTGGGAATTGAACTTAGGACCTCTGGAAGAGC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCACCATATGGTCACTGGGAATTGAACTTAGGACCTCTGGAAGAGC  800

seq1  AGTCTGTGATCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCAGCTATATAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTGATCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCAGCTATATAT  850

seq1  CTTATTGGCCAATCTCTAAAAAGGAAGTAAACTTGTAGCAGAGAAGGAAT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTGGCCAATCTCTAAAAAGGAAGTAAACTTGTAGCAGAGAAGGAAT  900

seq1  TC  893
      ||
seq2  TC  902

seq1: chr7_147175710_147176528
seq2: B6Ng01-302P19.g_65_856

seq1  GAATTCTCATGCCAAGGCCCCCTTTTCACTGCCTCAGTTTACCCTTCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATGCCAAGGCCCCCTTTTCACTGCCTCAGTTTACCCTTCTTT  50

seq1  AAAATGGGGCTTCCTGCCTGGGTCTACAGTACATACCTGAGGCCAGCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGGGCTTCCTGCCTGGGTCTACAGTACATACCTGAGGCCAGCACA  100

seq1  GGTGCTAATACTGGCAGCTGAGCCCTCGTACCCTTCCACATGGCCTTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTAATACTGGCAGCTGAGCCCTCGTACCCTTCCACATGGCCTTGGT  150

seq1  AGAGGCAATGGTCCTAAGGAAGCGAGAGAGGGTCATGAGCCTTGCCACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAATGGTCCTAAGGAAGCGAGAGAGGGTCATGAGCCTTGCCACCT  200

seq1  TGATTCCGCTGGCCCAGGGAAGGCTGGCCAGGCACCATACCTGCTCCTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCGCTGGCCCAGGGAAGGCTGGCCAGGCACCATACCTGCTCCTGC  250

seq1  AGTTGCTCTGTCACCTCAGAGCCATTGGCAGCTGAGTAGGTCTCTGTGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCTCTGTCACCTCAGAGCCATTGGCAGCTGAGTAGGTCTCTGTGTA  300

seq1  GCTTGAGCCCAGCAGGTCCCTGGAAGACAACCATTGACGTTCCCTGATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGCCCAGCAGGTCCCTGGAAGACAACCATTGACGTTCCCTGATTC  350

seq1  TGCCTCACACGGAGCAGCCACCATAAGATGCCTGGGCCAGGATTCTGGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCACACGGAGCAGCCACCATAAGATGCCTGGGCCAGGATTCTGGCA  400

seq1  CACAGGAGCCTACACTTCCCACTGGACTCAGAGATCTACCCAAGGACCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGAGCCTACACTTCCCACTGGACTCAGAGATCTACCCAAGGACCAG  450

seq1  AATCGGCTTACCTGTTCTTTCGAAGGTGCAGGGTGAAAACGTGCCCGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGGCTTACCTGTTCTTTCGAAGGTGCAGGGTGAAAACGTGCCCGCTG  500

seq1  GTCCCAAGAGCATAGCTCAGACTCTCTGGGTACTGGCCCTGGATGGGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAGAGCATAGCTCAGACTCTCTGGGTACTGGCCCTGGATGGGGAT  550

seq1  TCTCAGCTTAAGGCCAGGGATTTGCATAGCAGAAAGCCCCAAGCAGAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCTTAAGGCCAGGGATTTGCATAGCAGAAAGCCCCAAGCAGAGAC  600

seq1  CCCCTAGACCCTGAGGATTCGTTAGTTTCAGGGAGGGAAGTAGATGGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTAGACCCTGAGGATTCGTTAGTTTCAGGGAGGGAAGTAGATGGCTG  650

seq1  GGAGCAGGCTGACAGGGAAAGCAACTCTCCCAGGTGAAGCAGAAAAAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  GGAGCAGGCTGACAGGGAAAGCAACTCTCCCAGGTGAAGCAG---AAAAA  697

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGATGGCTCCTTGAGCCATTTCCTCAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGATGGCTCCTTGAGCCATTTCCTCAATC  747

seq1  TATTCCCAAGGATGATGGTGATGATGACGGTGAAGGTGATGGTGATGGTG  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
seq2  TATTCCCAAGGATGATGGTGATGATGACGGTGAAGGTGATGGTGA-----  792

seq1  AAGGTGAAGGTGATGGTGA  819
                         
seq2  -------------------  792