BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-303G09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,207,045 - 151,380,554
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneR74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498
Downstream geneShank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-303G09.bB6Ng01-303G09.g
ACCGA097208GA097209
length812894
definitionB6Ng01-303G09.b B6Ng01-303G09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,207,045 - 151,207,855)(151,379,673 - 151,380,554)
sequence
gaattcaccattattgaatcaggactgactgtactatatttgatttactt
gggttttgtggtgctggggctagaacccagacaggcactctaccactgag
ccttcttgcgtctgtccaaagtcctttaaccacccatcgaaagagtttta
tccaagtcatgtgaccaggcccagggagtaggactcccacaaatgaatct
gaaaaggcacaccgttcagcctattcactccatagaccactggacatcag
cttatggacctcctaagattttagagttgatctccaaaacttttagctgt
tgcctggcagtttttgtctgtcttgaatgatgtcctggatgagtgagcag
gtggggtggggttggcatgcttaggcagcagggcaaatatctcactagag
tcttgctcagtgggggggacacatcctgtgttggttattttcacctttgc
tgggaccaaatgcctgatgagaagcattttaataaaggaaaggtttgctt
aggtttgtaaggatgctatctgtcatagcacggcgggcagtcagcagtgg
gagaccacatggcagtccagaacctaagcgcatggatggttctgcccacg
gttagggtgtgtctttccatctcagtaaacctaatctaggaagtccctct
tacacttgctcagaagtttgtctccatcaagttggccctcaagatggacc
atggcacagccacacacagggtttcattcagctgtacccatggtgctctg
gtggggcaggtagagcgggctgcttctctggagaattcgggggggcagtg
gggtggaggggt
gaattctatacagcacggggatggacactaatttgtcagcttttaggatt
ttaagaggcacaaggataggtaacttaactctttctcctgtgctcagtaa
gacctggaggcagcggtgctcaggaacaggtgacacataagacatcactg
ctctgccactgctcttgacagctggggcagagtgtcaggatccagtctgt
gcttccaggctgctcagaatgtgaggatgggccccagaagaaccttggag
ccagcaccaactcaagtacacaacattcactgtgtggatgggagtgggat
catggagccccacaaggaatctcatcattactcctaaaggtgcctgccac
agggcgagtattggtctgtcaggctccactgccaatggggggggggcaaa
gaagctgtaatctcccccaagatctacaggaaagtagggtgagctgcact
tcacctaagccacgattccacaagatggagaaagcaggatgacccactga
cccctcatgcatcacccccggggctgacctgtttgggtgtggcttacaga
gcatttccaatggaaagcagaggtttggggagacccagttgctttgaaga
taagaatgggaggggaggaagtgacattcccattccaaaggtgaagacag
gaagcagagcagccttagataaagcctctggaagccaagaaagcagaaac
cagatcttccctccccagagggaagctggggccagacccagagctggaag
ggggttaagtgttaggacagaccagttgatacctggtgactagtgttcct
catccagcaaaaactgggcttctagcatcccactaacctcacctgcccat
ctggctagacttctaccacaactactttccaaccctgtcctttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151207045_151207855
seq2: B6Ng01-303G09.b_46_857

seq1  GAATTCACCATTATTGAATCAGGACTGACTGTACTATATTTGATTTACTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCATTATTGAATCAGGACTGACTGTACTATATTTGATTTACTT  50

seq1  GGGTTTTGTGGTGCTGGGGCTAGAACCCAGACAGGCACTCTACCACTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTTGTGGTGCTGGGGCTAGAACCCAGACAGGCACTCTACCACTGAG  100

seq1  CCTTCTTGCGTCTGTCCAAAGTCCTTTAACCACCCATCGAAAGAGTTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTGCGTCTGTCCAAAGTCCTTTAACCACCCATCGAAAGAGTTTTA  150

seq1  TCCAAGTCATGTGACCAGGCCCAGGGAGTAGGACTCCCACAAATGAATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGTCATGTGACCAGGCCCAGGGAGTAGGACTCCCACAAATGAATCT  200

seq1  GAAAAGGCACACCGTTCAGCCTATTCACTCCATAGACCACTGGACATCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGCACACCGTTCAGCCTATTCACTCCATAGACCACTGGACATCAG  250

seq1  CTTATGGACCTCCTAAGATTTTAGAGTTGATCTCCAAAACTTTTAGCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGGACCTCCTAAGATTTTAGAGTTGATCTCCAAAACTTTTAGCTGT  300

seq1  TGCCTGGCAGTTTTTGTCTGTCTTGAATGATGTCCTGGATGAGTGAGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGCAGTTTTTGTCTGTCTTGAATGATGTCCTGGATGAGTGAGCAG  350

seq1  GTGGGGTGGGGTTGGCATGCTTAGGCAGCAGGGCAAATATCTCACTAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGTGGGGTTGGCATGCTTAGGCAGCAGGGCAAATATCTCACTAGAG  400

seq1  TCTTGCTCAGTGGGGGGGACACATCCTGTGTTGGTTATTTTCACCTTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCTCAGTGGGGGGGACACATCCTGTGTTGGTTATTTTCACCTTTGC  450

seq1  TGGGACCAAATGCCTGATGAGAAGCATTTTAATAAAGGAAAGGTTTGCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACCAAATGCCTGATGAGAAGCATTTTAATAAAGGAAAGGTTTGCTT  500

seq1  AGGTTTGTAAGGATGCTATCTGTCATAGCACGGCGGGCAGTCAGCAGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTGTAAGGATGCTATCTGTCATAGCACGGCGGGCAGTCAGCAGTGG  550

seq1  GAGACCACATGGCAGTCCAGAACCTAAGCGCATGGATGGTTCTGCCCACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCACATGGCAGTCCAGAACCTAAGCGCATGGATGGTTCTGCCCACG  600

seq1  GTTAGGGTGTGTCTTTCCATCTCAGTAAACCTAATCTAGGAAGTCCCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGGTGTGTCTTTCCATCTCAGTAAACCTAATCTAGGAAGTCCCTCT  650

seq1  TACACTTGCTCAGAAGTTTGTCTCCATCAAGTTGGCCCTCAAGATGGACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTGCTCAGAAGTTTGTCTCCATCAAGTTGGCCCTCAAGATGGACC  700

seq1  ATGGCACAGCCACACACAGGGTTTCATTCAGCTGTACCCATGGTGCTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCACAGCCACACACAGGGTTTCATTCAGCTGTACCCATGGTGCTCTG  750

seq1  GTGGGGCAGGTAGAGCGGGCTGCTTCTCTGGAGAATTC-GGGGGGCAGTG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTGGGGCAGGTAGAGCGGGCTGCTTCTCTGGAGAATTCGGGGGGGCAGTG  800

seq1  GGGTGGAGGGGT  811
      ||||||||||||
seq2  GGGTGGAGGGGT  812

seq1: chr7_151379673_151380554
seq2: B6Ng01-303G09.g_62_955 (reverse)

seq1  GAAA-GACAGGGTTGG-AAGT-GGTGTGGTAG-AGTCT-GGCAGATGGGC  45
      |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||| | |||||||||
seq2  GAAAGGACAGGGTTGGAAAGTAGTTGTGGTAGAAGTCTAGCCAGATGGGC  50

seq1  A-GTG-GGTTAGTGGG-TGCTAGAAG-CCAG-TTTTGCTGGATGAGGAAC  90
      | ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGGTTAGTGGGATGCTAGAAGCCCAGTTTTTGCTGGATGAGGAAC  100

seq1  ACTAGTCACCAGGTATCAACTGGTCTGTCCTAACACTTAACCCCCTTCCA  140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTCACCAGGTATCAACTGGTCTGTCCTAACACTTAACCCCCTTCCA  150

seq1  GCTCT-GGTCTGGCCCCAGCTTCCCTCTGGGGAGGGAAGATCTGGTTTCT  189
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGGGTCTGGCCCCAGCTTCCCTCTGGGGAGGGAAGATCTGGTTTCT  200

seq1  GCTTTCTTGGCTTCCAGAGGCTTTATCTAAGGCTGCTCTGCTTCCTGTCT  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTTGGCTTCCAGAGGCTTTATCTAAGGCTGCTCTGCTTCCTGTCT  250

seq1  TCACCTTTGGAATGGGAATGTCACTTCCTCCCCTCCCATTCTTATCTTCA  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTTGGAATGGGAATGTCACTTCCTCCCCTCCCATTCTTATCTTCA  300

seq1  AAGCAACTGGGTCTCCCC-AACCTCTGCTTTCCATTGGAAATGCTCTGTA  338
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAACTGGGTCTCCCCAAACCTCTGCTTTCCATTGGAAATGCTCTGTA  350

seq1  AGCCACACCCAAACAGGTCAGCCCCGGGGGTGATGCATGAGGGGTCAGTG  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACACCCAAACAGGTCAGCCCCGGGGGTGATGCATGAGGGGTCAGTG  400

seq1  GGTCATCCTGCTTTCTCCATCTTGTGGAATCGTGGCTTAGGTGAAGTGCA  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATCCTGCTTTCTCCATCTTGTGGAATCGTGGCTTAGGTGAAGTGCA  450

seq1  GCTCACCCTACTTTCCTGTAGATCTTGGGGGAGATTACAGCTTCTTTGCC  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACCCTACTTTCCTGTAGATCTTGGGGGAGATTACAGCTTCTTTGCC  500

seq1  CCCCCCCCATTGGCAGTGGAGCCTGACAGACCAATACTCGCCCTGTGGCA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCATTGGCAGTGGAGCCTGACAGACCAATACTCGCCCTGTGGCA  550

seq1  GGCACCTTTAGGAGTAATGATGAGATTCCTTGTGGGGCTCCATGATCCCA  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTTTAGGAGTAATGATGAGATTCCTTGTGGGGCTCCATGATCCCA  600

seq1  CTCCCATCCACACAGTGAATGTTGTGTACTTGAGTTGGTGCTGGCTCCAA  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCATCCACACAGTGAATGTTGTGTACTTGAGTTGGTGCTGGCTCCAA  650

seq1  GGTTCTTCTGGGGCCCATCCTCACATTCTGAGCAGCCTGGAAGCACAGAC  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTTCTGGGGCCCATCCTCACATTCTGAGCAGCCTGGAAGCACAGAC  700

seq1  TGGATCCTGACACTCTGCCCCAGCTGTCAAGAGCAGTGGCAGAGCAGTGA  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCTGACACTCTGCCCCAGCTGTCAAGAGCAGTGGCAGAGCAGTGA  750

seq1  TGTCTTATGTGTCACCTGTTCCTGAGCACCGCTGCCTCCAGGTCTTACTG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTATGTGTCACCTGTTCCTGAGCACCGCTGCCTCCAGGTCTTACTG  800

seq1  AGCACAGGAGAAAGAGTTAAGTTACCTATCCTTGTGCCTCTTAAAATCCT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGAGAAAGAGTTAAGTTACCTATCCTTGTGCCTCTTAAAATCCT  850

seq1  AAAAGCTGACAAATTAGTGTCCATCCCCGTGCTGTATAGAATTC  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCTGACAAATTAGTGTCCATCCCCGTGCTGTATAGAATTC  894