BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-304J03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 34,679,171 - 34,782,503
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAbpg, LOC100043864
Upstream geneEG668411, LOC100043850, LOC100043386, LOC668416, EG668526, LOC100043388, LOC270234, EG668419, EG668422, EG546954, LOC100043856, LOC100043857, EG545947, EG434676, EG668431, Abpd, EG545948, LOC435963, LOC435962, EG626970, LOC100043859, LOC627004, LOC100043398, LOC100043401, Scgb2b1, LOC668440, Abpz, LOC100043860, LOC627079, LOC635803
Downstream geneLOC100043865, Abpb, Abpa, LOC100043866, LOC100043867, LOC100043868, Wtip, Sae2, LOC100043410, Pdcd2l, Gpi1, 4931406P16Rik, EG619734, Lsm14a, LOC668460, LOC668464, Kctd15, Chst8, Pepd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-304J03.bB6Ng01-304J03.g
ACCGA098094GA098095
length1,0921,096
definitionB6Ng01-304J03.b B6Ng01-304J03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(34,781,410 - 34,782,503)(34,679,171 - 34,680,104)
sequence
gaattctctgattccaaacaagggtgtttatatagctaaagaattgctca
tgtatgccatagttaaaaggtttgaactcgctatgaattttctgatgttg
ctttgtggaaaatatctcctgaatctactgaattcataaagacttactgt
gctgtggatttcatgatgccaacaactctgcacgccctgctaaaggcttt
ctcatatccactgcatgtataatgctctggggtaatgtgacacctgtggt
gttcagcaaggtcagaataatgattaaagcattccccacagggcaatgtc
cactgtgtccactggcacttgctctactctggtgaaaaataaggccagag
ctttggctgcagaactaggctgcaggatgctctggtgctggataagccta
tttctgtggctaaaaatttccccatattcactgcatctataatgtccatc
tccactgtgaaaagtaagctgttgtacaagtggaccatgccaccagtaga
agaacttagaagactgaagcaggttcaaaaccctagaaatctcagaattg
attcctccctcatcctgggctcagccatccccttcctgctactggtacca
gaaagaatgtgtccatacaactgctgttctggattgacaatctgtgtctg
accagactgcaggtctaatagtcagaaataaaggcaagttagtcctagcc
taatttctagttaacataggagtgggatatatatggccaggtgacatgag
atcccctcggctggtctctgcttagctcaacagtgtctctgaagctatga
agcttccatgtggaaggagtaactttgtgagagaatttgctgcagatacc
tgatcatactgtgaacccggatagggtgaattggaaaaaatcctgtttct
tgttttggtgtggctcagccctagcacacaccctttaacccaagagcttt
ctgcaagcaagagctaaataaaagccatttcaatcagtcaagtggcagta
agagcaacatttgccagtgagtgagcataagaataaaagtgaggaaagag
gaagggtgtctttgagttgatggtaattagagagcatgggga
gaattcaagaccacccagtaccttccccctttgaaaaggaatttccaagc
tgtactagcaggccaagtgcagagccagataagaaagctggctgactaaa
caaatgtaaaaacataattttagcagtcaaaatgactgagcctacaagct
gccaaaacaatattagctgttctcagagaaataactataagaagacagaa
gctcccagagaaatccccctactctgccccacactgaattctgaaaaaga
ccacaaaccaccctgaccttgtcgctagaattcccctgacattaatagat
gtgacattaatagctgatccataagtttaaaatgtactattactttgctg
accaaatcataataacccaccatggggcaatcaaagtgagtcactaggcc
aaagggttacttagtcactataaaaaccaaccaatgcctgaaagggttac
ttgctacaccaaagagaaccctgttgctcaaatctgccccttacaaaggt
ataaaaagtgtgttctttctttgttctgggtctctcctctggcctgcatg
ctgcgaggggagtccccaacatgttggatcaataaaaatcctcatgcatt
ttgcagcaatagtggtggtctctgtggtccttgtgagtaagagtcttttg
acgaactccaacagtaggttgttgctcttaggaggttgtcaacacaagct
aactatgatttgcatagggctctagcaagggcatgattttatcaactgca
gatagtttatgtgattgtgtgatattttgaattctgggaactcttcagaa
ggtatatgaacactagggcttcaagaggtagcgccttaaacaaacgttag
ttggtagctgttttgagtgatgtattcttaagtagtcatgctcaaagaaa
aaaacaagaataaaaaattctatatcctgatgatgtagatcaaatatgcc
cccaaaagtcaacatcttaatcagaaaaaaagtagtcaattatatttacc
aacacttgccagccctggcttaattcatggggtctctatgttcctgtcta
gtataggaaacttaaaacggtgcagaaagaggtggagaaggattga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_34781410_34782503
seq2: B6Ng01-304J03.b_46_1137 (reverse)

seq1  TCCCCATGCTCTCTTAAATCCCCTTCAACTCAAAGACACCCCTTCCTCTT  50
      ||||||||||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCCCCATGCTCTCT--AATTACCATCAACTCAAAGACA-CCCTTCCTCTT  47

seq1  TCCTCACTTTTA-TCTTATGCTCACTCACTGGCAAATGTTGCTCTTACTG  99
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACTTTTATTCTTATGCTCACTCACTGGCAAATGTTGCTCTTACTG  97

seq1  CCACTTGACCTGATTGAATTGGC-TTTATTTAGCTCTTGCTTGCAGAAAG  148
      |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGA-CTGATTGAAATGGCTTTTATTTAGCTCTTGCTTGCAGAAAG  146

seq1  CTCTTGGGTTAAA-GGTGTGTGCTAGGGCTGAGCCACACCAAAACAAGAA  197
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGGGTTAAAGGGTGTGTGCTAGGGCTGAGCCACACCAAAACAAGAA  196

seq1  ACAGGATTTTTTCCAATTCACCCTATCCGGGTTCACAGTATGATCAGGTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGATTTTTTCCAATTCACCCTATCCGGGTTCACAGTATGATCAGGTA  246

seq1  TCCTGCAGCAAATTCTCTCACAAAGTTACTCCTTCCACATGGAAGCTTCA  297
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-CTGCAGCAAATTCTCTCACAAAGTTACTCCTTCCACATGGAAGCTTCA  295

seq1  TAGCTTCAGAGACACTGTTGAGCTAAGCAGAGACCAGCCGAGGGGATCTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCAGAGACACTGTTGAGCTAAGCAGAGACCAGCCGAGGGGATCTC  345

seq1  ATGTCACCTGGCCATATATATCCCACTCCTATGTTAACTAGAAATTAGGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACCTGGCCATATATATCCCACTCCTATGTTAACTAGAAATTAGGC  395

seq1  TAGGACTAACTTGCCTTTATTTCTGACTATTAGACCTGCAGTCTGGTCAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACTAACTTGCCTTTATTTCTGACTATTAGACCTGCAGTCTGGTCAG  445

seq1  ACACAGATTGTCAATCCAGAACAGCAGTTGTATGGACACATTCTTTCTGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGATTGTCAATCCAGAACAGCAGTTGTATGGACACATTCTTTCTGG  495

seq1  TACCAGTAGCAGGAAGGGGATGGCTGAGCCCAGGATGAGGGAGGAATCAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGTAGCAGGAAGGGGATGGCTGAGCCCAGGATGAGGGAGGAATCAA  545

seq1  TTCTGAGATTTCTAGGGTTTTGAACCTGCTTCAGTCTTCTAAGTTCTTCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGATTTCTAGGGTTTTGAACCTGCTTCAGTCTTCTAAGTTCTTCT  595

seq1  ACTGGTGGCATGGTCCACTTGTACAACAGCTTACTTTTCACAGTGGAGAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTGGCATGGTCCACTTGTACAACAGCTTACTTTTCACAGTGGAGAT  645

seq1  GGACATTATAGATGCAGTGAATATGGGGAAATTTTTAGCCACAGAAATAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATTATAGATGCAGTGAATATGGGGAAATTTTTAGCCACAGAAATAG  695

seq1  GCTTATCCAGCACCAGAGCATCCTGCAGCCTAGTTCTGCAGCCAAAGCTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATCCAGCACCAGAGCATCCTGCAGCCTAGTTCTGCAGCCAAAGCTC  745

seq1  TGGCCTTATTTTTCACCAGAGTAGAGCAAGTGCCAGTGGACACAGTGGAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTATTTTTCACCAGAGTAGAGCAAGTGCCAGTGGACACAGTGGAC  795

seq1  ATTGCCCTGTGGGGAATGCTTTAATCATTATTCTGACCTTGCTGAACACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCCTGTGGGGAATGCTTTAATCATTATTCTGACCTTGCTGAACACC  845

seq1  ACAGGTGTCACATTACCCCAGAGCATTATACATGCAGTGGATATGAGAAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTGTCACATTACCCCAGAGCATTATACATGCAGTGGATATGAGAAA  895

seq1  GCCTTTAGCAGGGCGTGCAGAGTTGTTGGCATCATGAAATCCACAGCACA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTAGCAGGGCGTGCAGAGTTGTTGGCATCATGAAATCCACAGCACA  945

seq1  GTAAGTCTTTATGAATTCAGTAGATTCAGGAGATATTTTCCACAAAGCAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTCTTTATGAATTCAGTAGATTCAGGAGATATTTTCCACAAAGCAA  995

seq1  CATCAGAAAATTCATAGCGAGTTCAAACCTTTTAACTATGGCATACATGA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGAAAATTCATAGCGAGTTCAAACCTTTTAACTATGGCATACATGA  1045

seq1  GCAATTCTTTAGCTATATAAACACCCTTGTTTGGAATCAGAGAATTC  1094
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTCTTTAGCTATATAAACACCCTTGTTTGGAATCAGAGAATTC  1092

seq1: chr7_34679171_34680104
seq2: B6Ng01-304J03.g_230_1159

seq1  CTGTTCTCAGAGAAATAACTATAAGAAGACAGAAGCTCCCAGAGAAATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTCAGAGAAATAACTATAAGAAGACAGAAGCTCCCAGAGAAATCC  50

seq1  CCCTACTCTGCCCCACACTGAATTCTGAAAAAGACCACAAACCACCCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTACTCTGCCCCACACTGAATTCTGAAAAAGACCACAAACCACCCTGA  100

seq1  CCTTGTCGCTAGAATTCCCCTGACATTAATAGATGTGACATTAATAGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCGCTAGAATTCCCCTGACATTAATAGATGTGACATTAATAGCTG  150

seq1  ATCCATAAGTTTAAAATGTACTATTACTTTGCTGACCAAATCATAATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATAAGTTTAAAATGTACTATTACTTTGCTGACCAAATCATAATAAC  200

seq1  CCACCATGGGGCAATCAAAGTGAGTCACTAGGCCAAAGGGTTACTTAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATGGGGCAATCAAAGTGAGTCACTAGGCCAAAGGGTTACTTAGTC  250

seq1  ACTATAAAAACCAACCAATGCCTGAAAGGGTTACTTGCTACACCAAAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAAAAACCAACCAATGCCTGAAAGGGTTACTTGCTACACCAAAGAG  300

seq1  AACCCTGTTGCTCAAATCTGCCCCTTACAAAGGTATAAAAAGTGTGTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGTTGCTCAAATCTGCCCCTTACAAAGGTATAAAAAGTGTGTTCT  350

seq1  TTCTTTGTTCTGGGTCTCTCCTCTGGCCTGCATGCTGCGAGGGGAGTCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGTTCTGGGTCTCTCCTCTGGCCTGCATGCTGCGAGGGGAGTCCC  400

seq1  CAACATGTTGGATCAATAAAAATCCTCATGCATTTTGCAGCAATAGTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGTTGGATCAATAAAAATCCTCATGCATTTTGCAGCAATAGTGGT  450

seq1  GGTCTCTGTGGTCCTTGTGAGTAAGAGTCTTTTGACGAACTCCAACAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCTGTGGTCCTTGTGAGTAAGAGTCTTTTGACGAACTCCAACAGTA  500

seq1  GGTTGTTGCTCTTAGGAGGTTGTCAACACAAGCTAACTATGATTTGCATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTTGCTCTTAGGAGGTTGTCAACACAAGCTAACTATGATTTGCATA  550

seq1  GGGCTCTAGCAAGGGCATGATTTTATCAACTGCAGATAGTTTATGTGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTAGCAAGGGCATGATTTTATCAACTGCAGATAGTTTATGTGATT  600

seq1  GTGTGATATTTTGAATTCTGGGAACTCTTCAGAAGGTATATGAACACTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGATATTTTGAATTCTGGGAACTCTTCAGAAGGTATATGAACACTAG  650

seq1  GGCTTCAAGAGGTAGCGCCTTAAACAAACGTTAGTTGGTAGCTGTTTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAAGAGGTAGCGCCTTAAACAAACGTTAGTTGGTAGCTGTTTTGA  700

seq1  GTGATGTATTCTTAAGTAGTCATGCTCAAAGAAAAAAACAAGAATAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGTATTCTTAAGTAGTCATGCTCAAAGAAAAAAACAAGAATAAAAA  750

seq1  ATTCTATATCCTGATGATGTAGATCAAATATGCCCCCAAAAGTCAACAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATTCTATATCCTGATGATGTAGATCAAATATGCCCCCAAAAGTCAAC-AT  799

seq1  CTTAATCAG-AAAAAAGTAGTCAAATTATATTACCAAACACTTTGCCAGC  849
      ||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||
seq2  CTTAATCAGAAAAAAAGTAGTC-AATTATATTTACCAACAC-TTGCCAGC  847

seq1  CCTGGCTTAATTCAT-GGGTCTCTATGTTCCCTGTCTAGTATTAGGAACT  898
      ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||
seq2  CCTGGCTTAATTCATGGGGTCTCTATGTT-CCTGTCTAGTATAGGAAACT  896

seq1  TAAAAGGGTGGAAGAAAAGAGGTGGAGAAGGATTGA  934
      ||||| |||| |   |||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACGGTGCA--GAAAGAGGTGGAGAAGGATTGA  930