BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307M24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 141,468,055 - 141,590,985
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933400E14Rik
Upstream geneLOC668747, 4930404H21Rik, LOC100043237, 2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, Dhx32, LOC100043695, Fank1, Adam12, A130023I24Rik
Downstream geneLOC100043248, LOC100043699, LOC668750, Dock1, B830028B13Rik, EG668693, LOC100043254
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307M24.bB6Ng01-307M24.g
ACCGA100483GA100484
length1,1561,109
definitionB6Ng01-307M24.b B6Ng01-307M24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,468,055 - 141,469,220)(141,589,876 - 141,590,985)
sequence
gaattctagacttgaattacagctgtctgcctgcctcctttccccaaagt
ggcataagcttccaagacaaggagggtctcttttctatccatctatactg
cccaggtcagcacccctttccctccctgtccacactctacacctctaacg
ggaaaacataagatgccccaggttgatacttcctgcctagcccagcaagg
gacaaagggatcaagcaattatcattagttccctctaaaagccagaggga
ttaccaaagaggactagcctaaagagtgccaaggacacatgggtccatga
accacatttacagaaaccccattaactagtgttggcaacaacagagggtg
ccaaactaaaccagatcactatttgcattgagcctaggaggcccaaagta
aactccaaagggtgtcaacatccaaagaaaactatatgcctgttgtcccc
tggagcttctacaatgtttaggaaatagaatgaactccacttggaagatg
ggctgtttcactgggccttaaaatttaatgacctccaattcttaatgacc
taactcaacaagacagggaatcctatataaaggtaatataagcatgcata
aattaaatattatgcttttatgatgtacacagggtcatttgtttgtcttg
tgagtctgatagctaagtctaacttgtactggatccatgttactgtggca
gaaggtagtgtgaaggataagaaacaagtcaagttcacctgtgggcttca
cagcgttgagacaggaatgccagaccaaggatgctcaattgaattggcac
ttacaatgaataacaaagcccttatagacatcttagatgctgcatggaaa
cctaatcatttgaggagtttactgtggttcatctgaaacgccactccaag
atagataatgtgagagttaagtattgatccagactgcagatgcatgtgac
cagctactccagctctacacatgccccacaccccgacataatggctgcac
tcctagactgatgagctgtcttctgagcttctttctcgtgtattgatcac
agaatgagaaagtatcagaaccaccagtatcaacatttcatagctggatc
agaaggctgtgcgttgcgtgatcatggaaagctcttgatgccaatgacaa
acacag
gaattcaggtcctcaggagtcacagcaagcacagcgccatctcaccagcc
ccctcccatatttctgcctcaacactaggaggactggaaaggatgcctgt
gtgcccgctgactcttctccccctagcatctgccttatatagacaatttg
gaaactggagggggtggggacagaaagaggtgtcctgagtagtgagaagg
gcctgtctgcggttccaagtgttagcctggatgaatctcaaaacactgag
catcaaaagtgaagccttacagaatgtgatagatgggtaatcttaacaac
aggctaagcaatgcctggtattgctaagagctgcacacttatacaatagg
gccatgggaagcataaacttgagttctgatgaggtttgctcaggggaaga
tataactcaggaaaggatcagaaattcatattttggtaacatcaggctgg
gtggggtgcctgtacacttctctgtgcacattcctcccatatgtcttaaa
tatcacatgatttcattccattctgtgctggcgatccctaggacctcctg
tatgccaggcaagctttcatcactagcactcccttctgcttttttttatg
aaccaggaccttgctgagctgcccagggtagccttgaattcacactgtag
tccaggaaggctttgaagtcacaatctacctgactcagcctcccgagttg
ctggtattatatgtatccctctccaagcccagctgattttttcaaacatg
tcataacaattgcatcccctgagatgatcatttgaacacatttcctagaa
gtagcctttttctgtgtaaaggcctcatagaggtccccagatgtaactct
gcccttggactcagagttatgattcttccttgcgttatctggggttgcag
tggggtgtacatagatgctcatgggcatttaacatcccggctcctttctt
ttcagacctcaaaggatagcgactgagaatcctgactccatccccctgga
atgaaccttgaaggatgtccccacccttaagatacctctttccctctccc
tgaagcctggtcttccagctagcaatagctgcttgcacattgcgctgtgc
tcttgttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_141468055_141469220
seq2: B6Ng01-307M24.b_47_1202

seq1  GAATTCTAGACTTGAATTACAGCTGTCTGCCTGCCTCCTTTCCCCAAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGACTTGAATTACAGCTGTCTGCCTGCCTCCTTTCCCCAAAGT  50

seq1  GGCATAAGCTTCCAAGACAAGGAGGGTCTCTTTTCTATCCATCTATACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATAAGCTTCCAAGACAAGGAGGGTCTCTTTTCTATCCATCTATACTG  100

seq1  CCCAGGTCAGCACCCCTTTCCCTCCCTGTCCACACTCTACACCTCTAACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTCAGCACCCCTTTCCCTCCCTGTCCACACTCTACACCTCTAACG  150

seq1  GGAAAACATAAGATGCCCCAGGTTGATACTTCCTGCCTAGCCCAGCAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAACATAAGATGCCCCAGGTTGATACTTCCTGCCTAGCCCAGCAAGG  200

seq1  GACAAAGGGATCAAGCAATTATCATTAGTTCCCTCTAAAAGCCAGAGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAGGGATCAAGCAATTATCATTAGTTCCCTCTAAAAGCCAGAGGGA  250

seq1  TTACCAAAGAGGACTAGCCTAAAGAGTGCCAAGGACACATGGGTCCATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAAAGAGGACTAGCCTAAAGAGTGCCAAGGACACATGGGTCCATGA  300

seq1  ACCACATTTACAGAAACCCCATTAACTAGTGTTGGCAACAACAGAGGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACATTTACAGAAACCCCATTAACTAGTGTTGGCAACAACAGAGGGTG  350

seq1  CCAAACTAAACCAGATCACTATTTGCATTGAGCCTAGGAGGCCCAAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTAAACCAGATCACTATTTGCATTGAGCCTAGGAGGCCCAAAGTA  400

seq1  AACTCCAAAGGGTGTCAACATCCAAAGAAAACTATATGCCTGTTGTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAAAGGGTGTCAACATCCAAAGAAAACTATATGCCTGTTGTCCCC  450

seq1  TGGAGCTTCTACAATGTTTAGGAAATAGAATGAACTCCACTTGGAAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTTCTACAATGTTTAGGAAATAGAATGAACTCCACTTGGAAGATG  500

seq1  GGCTGTTTCACTGGGCCTTAAAATTTAATGACCTCCAATTCTTAATGACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTTTCACTGGGCCTTAAAATTTAATGACCTCCAATTCTTAATGACC  550

seq1  TAACTCAACAAGACAGGGAATCCTATATAAAGGTAATATAAGCATGCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCAACAAGACAGGGAATCCTATATAAAGGTAATATAAGCATGCATA  600

seq1  AATTAAATATTATGCTTTTATGATGTACACAGGGTCATTTGTTTGTCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATATTATGCTTTTATGATGTACACAGGGTCATTTGTTTGTCTTG  650

seq1  TGAGTCTGATAGCTAAGTCTAACTTGTACTGGATCCATGTTACTGTGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTGATAGCTAAGTCTAACTTGTACTGGATCCATGTTACTGTGGCA  700

seq1  GAAGGTAGTGTGAAGGATAAGAAACAAGTCAAGTTCACCTGTGGGCTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTAGTGTGAAGGATAAGAAACAAGTCAAGTTCACCTGTGGGCTTCA  750

seq1  CAGCGTTGAGACAGGAATGCCAGACCAAGGATGCTCAATTGAATTGGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTTGAGACAGGAATGCCAGACCAAGGATGCTCAATTGAATTGGCAC  800

seq1  TTACAATGAATAACAAAGCCCTTATAGACATCTTAGATGCTGCATGG-AA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTACAATGAATAACAAAGCCCTTATAGACATCTTAGATGCTGCATGGAAA  850

seq1  CCTAATCATTTGAGGAGTTTACTGTGGTTCATCTGAAACGCCACTCCAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATCATTTGAGGAGTTTACTGTGGTTCATCTGAAACGCCACTCCAAG  900

seq1  ATAGATAATGTGAGAGTTAAGTATTGATCCAGACTGCAGATGCAATGTGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATAGATAATGTGAGAGTTAAGTATTGATCCAGACTGCAGATGC-ATGTGA  949

seq1  CCAGCTACCTCCAGCTCTACCACCATGCCCCACACCCCGACATAATGGCT  999
      ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTA-CTCCAGCTCTAC--ACATGCCCCACACCCCGACATAATGGCT  996

seq1  GCACTCCTAGACTGATGAGCCTGTCCTTCCTGGAGCTTCTTTTCTCGTGT  1049
      ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||||||
seq2  GCACTCCTAGACTGATGAG-CTGT-CTTC--TGAGCTTC-TTTCTCGTGT  1041

seq1  ATTTGATCACAGGAATGAGGAAAGTATCAGACACACCAGTATTCAACATT  1099
      | ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||
seq2  A-TTGATCACA-GAATGA-GAAAGTATCAGAACCACCAGTA-TCAACATT  1087

seq1  TCCATTAGCTGAATCAGAA-GCTGTGCTTTGTGTGATCATGG-AAGCTCT  1147
      ||   |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||
seq2  TC--ATAGCTGGATCAGAAGGCTGTGCGTTGCGTGATCATGGAAAGCTCT  1135

seq1  TGATGCC-ATGAC-AACACAG  1166
      ||||||| ||||| |||||||
seq2  TGATGCCAATGACAAACACAG  1156

seq1: chr7_141589876_141590985
seq2: B6Ng01-307M24.g_66_1174 (reverse)

seq1  CCAAC-AGAGCACAGCCGCAATGTGCCAGCAGCCTATTGCTAGCTGGAAG  49
      ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  CCAACAAGAGCACAG-CGCAATGTGCAAGCAG-CTATTGCTAGCTGGAAG  48

seq1  ACCAGGCTTCAGGGAGAGGG-AAGAAGTAACCCTTTAAGGGT-GGGACAT  97
      |||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||| |||||||
seq2  ACCAGGCTTCAGGGAGAGGGAAAGAGGTATC---TTAAGGGTGGGGACAT  95

seq1  TCTTCAA-GTTCATTCCAGGGGGATGGAGTCAGGATTCTCAGTCGCTATT  146
       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCTTCAAGGTTCATTCCAGGGGGATGGAGTCAGGATTCTCAGTCGCTA-T  144

seq1  CCTTTGAGGTCTGAAAAG-AAGGAGCCGGGATGTTAAATGCCCATGAGCA  195
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGAGGTCTGAAAAGAAAGGAGCCGGGATGTTAAATGCCCATGAGCA  194

seq1  TCTATGTACACCCCACTGCAACCCCAGATAACGCAAGGAAGAATCATAAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGTACACCCCACTGCAACCCCAGATAACGCAAGGAAGAATCATAAC  244

seq1  TCTGAGTCCAAGGGCAGAGTTACATCTGGGGACCTCTATGAGGCCTTTAC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTCCAAGGGCAGAGTTACATCTGGGGACCTCTATGAGGCCTTTAC  294

seq1  ACAGAAAAAGGCTACTTCTAGGAAATGTGTTCAAATGATCATCTCAGGGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAAAGGCTACTTCTAGGAAATGTGTTCAAATGATCATCTCAGGGG  344

seq1  ATGCAATTGTTATGACATGTTTGAAAAAATCAGCTGGGCTTGGAGAGGGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATTGTTATGACATGTTTGAAAAAATCAGCTGGGCTTGGAGAGGGA  394

seq1  TACATATAATACCAGCAACTCGGGAGGCTGAGTCAGGTAGATTGTGACTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATAATACCAGCAACTCGGGAGGCTGAGTCAGGTAGATTGTGACTT  444

seq1  CAAAGCCTTCCTGGACTACAGTGTGAATTCAAGGCTACCCTGGGCAGCTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTTCCTGGACTACAGTGTGAATTCAAGGCTACCCTGGGCAGCTC  494

seq1  AGCAAGGTCCTGGTTCATAAAAAAAAGCAGAAGGGAGTGCTAGTGATGAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGGTCCTGGTTCATAAAAAAAAGCAGAAGGGAGTGCTAGTGATGAA  544

seq1  AGCTTGCCTGGCATACAGGAGGTCCTAGGGATCGCCAGCACAGAATGGAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCCTGGCATACAGGAGGTCCTAGGGATCGCCAGCACAGAATGGAA  594

seq1  TGAAATCATGTGATATTTAAGACATATGGGAGGAATGTGCACAGAGAAGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCATGTGATATTTAAGACATATGGGAGGAATGTGCACAGAGAAGT  644

seq1  GTACAGGCACCCCACCCAGCCTGATGTTACCAAAATATGAATTTCTGATC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGGCACCCCACCCAGCCTGATGTTACCAAAATATGAATTTCTGATC  694

seq1  CTTTCCTGAGTTATATCTTCCCCTGAGCAAACCTCATCAGAACTCAAGTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTGAGTTATATCTTCCCCTGAGCAAACCTCATCAGAACTCAAGTT  744

seq1  TATGCTTCCCATGGCCCTATTGTATAAGTGTGCAGCTCTTAGCAATACCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTCCCATGGCCCTATTGTATAAGTGTGCAGCTCTTAGCAATACCA  794

seq1  GGCATTGCTTAGCCTGTTGTTAAGATTACCCATCTATCACATTCTGTAAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTGCTTAGCCTGTTGTTAAGATTACCCATCTATCACATTCTGTAAG  844

seq1  GCTTCACTTTTGATGCTCAGTGTTTTGAGATTCATCCAGGCTAACACTTG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACTTTTGATGCTCAGTGTTTTGAGATTCATCCAGGCTAACACTTG  894

seq1  GAACCGCAGACAGGCCCTTCTCACTACTCAGGACACCTCTTTCTGTCCCC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCGCAGACAGGCCCTTCTCACTACTCAGGACACCTCTTTCTGTCCCC  944

seq1  ACCCCCTCCAGTTTCCAAATTGTCTATATAAGGCAGATGCTAGGGGGAGA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCTCCAGTTTCCAAATTGTCTATATAAGGCAGATGCTAGGGGGAGA  994

seq1  AGAGTCAGCGGGCACACAGGCATCCTTTCCAGTCCTCCTAGTGTTGAGGC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAGCGGGCACACAGGCATCCTTTCCAGTCCTCCTAGTGTTGAGGC  1044

seq1  AGAAATATGGGAGGGGGCTGGTGAGATGGCGCTGTGCTTGCTGTGACTCC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATATGGGAGGGGGCTGGTGAGATGGCGCTGTGCTTGCTGTGACTCC  1094

seq1  TGAGGACCTGAATTC  1110
      |||||||||||||||
seq2  TGAGGACCTGAATTC  1109