BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-308P08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 128,136,629 - 128,263,558
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa
Upstream geneDnahc3, Tmem159, Zp2, Anks4b, Crym, Abca14, Abca15, Abca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2
Downstream geneLOC668556, Hs3st2, Usp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-308P08.bB6Ng01-308P08.g
ACCGA101321GA101322
length7941,033
definitionB6Ng01-308P08.b B6Ng01-308P08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,262,765 - 128,263,558)(128,136,629 - 128,137,642)
sequence
gaattctgtgtgaaaaactgctgtggaatcactggtggctttaccaagat
tttcttttactaacattctaatattatgattcgaatttataaattaaaaa
aaaaaatgatctgagccgagtgtggtggcgcacatctttaatcccagcac
tcaggaggcagaggcaggtggatttctgagttcgagaccagcctggtcta
cagagtgagttccaggacagccagggctacacagagaaaccctgactcga
aaaaccaaaaaaagatctgaaacgtgaatgagaaaaaaatagaaataaaa
aggctaggtacagtaacacgtgcttgaagtcccagcactcaggtgactga
ggcaggaggattgcaaactagaagccagccaggggtgtataaccaaactt
tactcaaaaactaaaatagacggagagagaaagggatggaggcagccatc
tgtatttgctaatttgaccagaaacaagtctaggagctcagtagataaca
gacactcacccagggctcctcccatccttcccatgctgggatcagctgaa
gaccttcccttttacatccatccatccatccattcattcacatccatcca
ttcattcaccaagagctgggtcgctcatgtgccatggcccataagcacag
tcaggggaccactttcagaagccagctctctcctgctaccatgtgcttct
gggggtcagatttgggttgtcagcttggcccctgccttggtgactggttg
ttttgtttggttggttggttgttttttgtttgggtttttttttt
gaattccaggccagcctagtctatggactgaaaactaatctaaaaaaaaa
aaaaaaaaaaagcgcgtatgtggtcttcctcccgtacaggtcctaaccag
gcccaacagagctgagcttttgggatcctggaatccagtgtgtgcagaag
gtgtggctgaggaaatcaagtcttttctctaatagctgtttaagaattca
gtcagtcatcatgcgcccttaaaagaagcagattagtaacatctaagagt
agagctttggaatctctcaagggagaatgtggctcccctattcaactatg
cgatcccgagggagtcactgaattctctgtgtctcattatcttcatttat
aaaattaaaataaaaatggggtgggtctcccacagtcaccatgtgaacga
ctaaagggcagcacactggtgatgggagagggttcccagcacacaggtca
cccccccccccccggaagtgccggctcttgctctctcacgtgactggctc
aagctagacaccaagctacaacactgcctttctcgctctgggtggcttta
gattctgtgggtgactttgccaacactcaggtgggatatgctgtttgaag
actccagctcaggtggacatataaaaaggaagccagactctgcctataga
agtctttacttttagacataagtctttctcttctgttatcatgaactttt
gtagtaacatccttggctcatatctctgtacatattagacgcaagaataa
tagctgcacattatcaagtgtcttatatgttgagtatggacttaaatagg
agaagggggaatgatagttaattgctcatcgggtagagtgcccgtaaaat
agagcaaaaaaattggagaggggagaggagaggaggatatagactataga
aaaatgtctcgtaagggtgaagtcgcttggactttgagctacacaggcac
tctcaaagtgggcagtttgaaaatcagatgtaagggctctgaatttccta
tagcttggcaccttcgacactctgtgtcccaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_128262765_128263558
seq2: B6Ng01-308P08.b_48_841 (reverse)

seq1  AAAAAAAAAACCCAAACAAAAAACAACCAACCAACCAAACAAAACAACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAACCCAAACAAAAAACAACCAACCAACCAAACAAAACAACCA  50

seq1  GTCACCAAGGCAGGGGCCAAGCTGACAACCCAAATCTGACCCCCAGAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCAAGGCAGGGGCCAAGCTGACAACCCAAATCTGACCCCCAGAAGC  100

seq1  ACATGGTAGCAGGAGAGAGCTGGCTTCTGAAAGTGGTCCCCTGACTGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTAGCAGGAGAGAGCTGGCTTCTGAAAGTGGTCCCCTGACTGTGC  150

seq1  TTATGGGCCATGGCACATGAGCGACCCAGCTCTTGGTGAATGAATGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGCCATGGCACATGAGCGACCCAGCTCTTGGTGAATGAATGGATG  200

seq1  GATGTGAATGAATGGATGGATGGATGGATGTAAAAGGGAAGGTCTTCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGAATGAATGGATGGATGGATGGATGTAAAAGGGAAGGTCTTCAGC  250

seq1  TGATCCCAGCATGGGAAGGATGGGAGGAGCCCTGGGTGAGTGTCTGTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCCAGCATGGGAAGGATGGGAGGAGCCCTGGGTGAGTGTCTGTTAT  300

seq1  CTACTGAGCTCCTAGACTTGTTTCTGGTCAAATTAGCAAATACAGATGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAGCTCCTAGACTTGTTTCTGGTCAAATTAGCAAATACAGATGGC  350

seq1  TGCCTCCATCCCTTTCTCTCTCCGTCTATTTTAGTTTTTGAGTAAAGTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCATCCCTTTCTCTCTCCGTCTATTTTAGTTTTTGAGTAAAGTTT  400

seq1  GGTTATACACCCCTGGCTGGCTTCTAGTTTGCAATCCTCCTGCCTCAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATACACCCCTGGCTGGCTTCTAGTTTGCAATCCTCCTGCCTCAGTC  450

seq1  ACCTGAGTGCTGGGACTTCAAGCACGTGTTACTGTACCTAGCCTTTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGAGTGCTGGGACTTCAAGCACGTGTTACTGTACCTAGCCTTTTTAT  500

seq1  TTCTATTTTTTTCTCATTCACGTTTCAGATCTTTTTTTGGTTTTTCGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTTTTTTCTCATTCACGTTTCAGATCTTTTTTTGGTTTTTCGAGT  550

seq1  CAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACC  600

seq1  AGGCTGGTCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGTCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTG  650

seq1  GGATTAAAGATGTGCGCCACCACACTCGGCTCAGATCATTTTTTTTTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAAAGATGTGCGCCACCACACTCGGCTCAGATCATTTTTTTTTTTA  700

seq1  ATTTATAAATTCGAATCATAATATTAGAATGTTAGTAAAAGAAAATCTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATAAATTCGAATCATAATATTAGAATGTTAGTAAAAGAAAATCTTG  750

seq1  GTAAAGCCACCAGTGATTCCACAGCAGTTTTTCACACAGAATTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGCCACCAGTGATTCCACAGCAGTTTTTCACACAGAATTC  794

seq1: chr7_128136629_128137642
seq2: B6Ng01-308P08.g_69_1101

seq1  GAATTCCAGGCCAGCCTAGTCTATGGACTGAAAACTAATCTAAAAAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCCAGCCTAGTCTATGGACTGAAAACTAATCTAAAAAAAAA  50

seq1  AAAAAAAAAAAGCGCGTATGTGGTCTTCCTCCCGTACAGGTCCTAACCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAGCGCGTATGTGGTCTTCCTCCCGTACAGGTCCTAACCAG  100

seq1  GCCCAACAGAGCTGAGCTTTTGGGATCCTGGAATCCAGTGTGTGCAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAACAGAGCTGAGCTTTTGGGATCCTGGAATCCAGTGTGTGCAGAAG  150

seq1  GTGTGGCTGAGGAAATCAAGTCTTTTCTCTAATAGCTGTTTAAGAATTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGCTGAGGAAATCAAGTCTTTTCTCTAATAGCTGTTTAAGAATTCA  200

seq1  GTCAGTCATCATGCGCCCTTAAAAGAAGCAGATTAGTAACATCTAAGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTCATCATGCGCCCTTAAAAGAAGCAGATTAGTAACATCTAAGAGT  250

seq1  AGAGCTTTGGAATCTCTCAAGGGAGAATGTGGCTCCCCTATTCAACTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTTGGAATCTCTCAAGGGAGAATGTGGCTCCCCTATTCAACTATG  300

seq1  CGATCCCGAGGGAGTCACTGAATTCTCTGTGTCTCATTATCTTCATTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCCCGAGGGAGTCACTGAATTCTCTGTGTCTCATTATCTTCATTTAT  350

seq1  AAAATTAAAATAAAAATGGGGTGGGTCTCCCACAGTCACCATGTGAACGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAAAATAAAAATGGGGTGGGTCTCCCACAGTCACCATGTGAACGA  400

seq1  CTAAAGGGCAGCACACTGGTGATGGGAGAGGGTTCCCAGCACACAGGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGGCAGCACACTGGTGATGGGAGAGGGTTCCCAGCACACAGGTCA  450

seq1  CCCCCCCCCCCCCGGAAGTGCCGGCTCTTGCTCTCTCACGTGACTGGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCCCCCGGAAGTGCCGGCTCTTGCTCTCTCACGTGACTGGCTC  500

seq1  AAGCTAGACACCAAGCTACAACACTGCCTTTCTCGCTCTGGGTGGCTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGACACCAAGCTACAACACTGCCTTTCTCGCTCTGGGTGGCTTTA  550

seq1  GATTCTGTGGGTGACTTTGCCAACACTCAGGTGGGATATGCTGTTTGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGTGGGTGACTTTGCCAACACTCAGGTGGGATATGCTGTTTGAAG  600

seq1  ACTCCAGCTCAGGTGGACATATAAAAAGGAAGCCAGACTCTGCCTATAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGCTCAGGTGGACATATAAAAAGGAAGCCAGACTCTGCCTATAGA  650

seq1  AGTCTTTACTTTTAGACATAAGTCTTTCTCTTCTGTTATCATGAACTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTACTTTTAGACATAAGTCTTTCTCTTCTGTTATCATGAACTTTT  700

seq1  GTAGTAACATCCTTGGCTCATATCTCTGTACATATTAGACGCAAGAATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTAACATCCTTGGCTCATATCTCTGTACATATTAGACGCAAGAATAA  750

seq1  TAGCTGCACATTATCAAGTGTCTTATATGTTGAGTATGGACTTAAATAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGCACATTATCAAGTGTCTTATATGTTGAGTATGGACTTAAATAGG  800

seq1  AGAAGGGGGAATGATAGTT-ATTGCTCATC-GGTAGAGTG-CCGTAAAAT  847
      ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  AGAAGGGGGAATGATAGTTAATTGCTCATCGGGTAGAGTGCCCGTAAAAT  850

seq1  AGAGCAAAAAAATT-GAGAGGGGAGAGGAGA-GAGGATATAGACATTAG-  894
      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| 
seq2  AGAGCAAAAAAATTGGAGAGGGGAGAGGAGAGGAGGATATAGACTATAGA  900

seq1  AAAATGTCTCGTA--GGTGAAGTCGCTT-GACTTTGAGC-ACACAGGCA-  939
      |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| 
seq2  AAAATGTCTCGTAAGGGTGAAGTCGCTTGGACTTTGAGCTACACAGGCAC  950

seq1  -CTCAAAGTGGCCAAGTTGGAATTCAGATGTAAGGTCTCTG-ATTTCC-A  986
       |||||||||| ||  ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |
seq2  TCTCAAAGTGGGCAGTTTGAAAATCAGATGTAAGGGCTCTGAATTTCCTA  1000

seq1  AAGCTT-GCA-CTTCG-CACTC--TGTCCCAGA  1014
       ||||| ||| ||||| |||||  |||||||||
seq2  TAGCTTGGCACCTTCGACACTCTGTGTCCCAGA  1033