seq1: chr3_133427726_133427788
seq2: B6Ng01-315M06.b_55_112 (reverse)
seq1 CAAAACAAAACAAAACAAAACAAATATCAAAAAACCAAATAAACAAACAA 50
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||
seq2 CAAAACAAAACAAAACAAAACAAA----ACAAAACAAAATA---AAACAA 43
seq1 AACAAGAA--AAACC 63
|||||||| |||||
seq2 AACAAGAACTAAACC 58
| seq1: chr7_110920016_110920687
seq2: B6Ng01-315M06.g_349_1032 (reverse)
seq1 CAACTCCCC--AAAGAACAAAATCCTAAGCCCATAAACTTACCTGGAGCC 48
||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| | ||||
seq2 CAACTCCCCCAAAGGATCAAAATCATAAGCCCATAAATTTACTCGTAGCC 50
seq1 A-TTTAGTGAGATGTACACAG-AGCTC-ATGAA-TAGGATCTTTGTGGT- 93
| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||
seq2 ATTTTAGTGAGATGTACACAGAAGCTCAATGAATTAGAATCTTTGTGGTA 100
seq1 AATTCAGTCAGG-AAAGGACTACTGT-TTTATATCAT-AATGTGTCTCTG 140
|||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
seq2 AATTCAGTCAGGAAAAGGACTACTGTATTAATATCATAAATGTGTCTCTG 150
seq1 TGGAAATGAGA-TTCCTAGTCCCTGTAGAATCTGAAAAGTGAAAAGAGCG 189
||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||
seq2 TGGAAATGAGATTTCCTAGTCCCTGTAGTATCTG-AAAGTG-AAAGAGCG 198
seq1 TATAGCACAGCTGGCAGGTGTCTCTGTGGTGGAGACCT--GTGTGTTATT 237
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||
seq2 TATAGCACAGCT-GCAGGTGTCT-TATGGTGGAGACCTTGTTGTGTTATT 246
seq1 TGTGAAGTCACTATGTTCATAGTGG-CCATATTTGTGATAGCCAG-AAAC 285
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2 TGTGAAGTCA-TATGTTCATAGTGGCCCATATTTGTGATAGCCAGAAAAC 295
seq1 TAGAAACAAACCATATGTCCTAAAAC-AAACGAATGTATATAAAAATGTG 334
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2 TTGAAACAAACCATATGTCCTAAAACAAAACGAATGTATATAAAAATGTG 345
seq1 GTCCATTTACACAATGGAATACTATCTAATGATGCAGAACAAGGATATCA 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCCATTTACACAATGGAATACTATCTAATGATGCAGAACAAGGATATCA 395
seq1 TGAG-TTTTGCAGTCAAATAAGTGGAACTAGAAAATATCATTCTCAGTGA 433
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGTTTTTGCAGTCAAATAAGTGGAACTAGAAAATATCATTCTCAGTGA 445
seq1 GGTAACTCAGACCCAAAAGGATATGCATGCTATGTACTCACTAATAAGTG 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTAACTCAGACCCAAAAGGATATGCATGCTATGTACTCACTAATAAGTG 495
seq1 GATATTAGCCAAAAATGTACAGGATACCTACAATACAATCCACAGAACAC 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATATTAGCCAAAAATGTACAGGATACCTACAATACAATCCACAGAACAC 545
seq1 AAGAAGGATAACAAGCAGAAGAGCCCAAGTGAGGAAGCTTCAATTCCACT 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAAGGATAACAAGCAGAAGAGCCCAAGTGAGGAAGCTTCAATTCCACT 595
seq1 TGGGAGGGAGAAGAAAACAATCACTGGAGGCAGAGGGAGAGACCTGGGTG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2 TGGGAGGGAGAAGAAAACAATCACTGGAGGCAGAGGGAGAGACATGGGTG 645
seq1 GGAGAGGGGAGATACAAAGAGAAGGGGAACATGATCAGG 672
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAGAGGGGAGATACAAAGAGAAGGGGAACATGATCAGG 684
|
