BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-316N22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 98,979,694 - 99,178,266
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream genenone
Downstream geneCcdc90b, Ankrd42, Pcf11, LOC676240, LOC100040007, 4632427E13Rik, Rab30, 4632434I11Rik, Prcp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-316N22.bB6Ng01-316N22.g
ACCGA107158GA107159
length1891,109
definitionB6Ng01-316N22.b B6Ng01-316N22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,178,078 - 99,178,266)(98,979,694 - 98,980,809)
sequence
accacaccacgagaaactgaattaaaagatcatggcattaggaagggcgg
gaaccgttgatgaacatgcatctattagaaatcatcacccatctaagaag
ttctacctttgtttttttttttttgtttttttgtttttttttttttttta
gagacagggtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

gaattcactcttctgaatgatttttgtccagacctgggtggatagtcggt
agggaacccacaaatagagaagatgactgttttctggaaatctgaagttt
gttgttaaattcattccttgtattaccttttgaatcctccttacaatttt
ctgaagttattattattgtatttgctttccaaatgaggctgtgagcggtt
ggatttcaagaagatacacagttcagaattggggaagcagaactttgaac
tgagactggctcaaacgaaagtttcccaaggactggcctgccttatggtt
tggtgtttgtctgcttactgtcaatgctgtgggctgtttcatataattgt
ctaactctccctatggaaaaattgtccctcaaatagctaatatggggatt
ctttgctcggagttccaagagaatgcttcccaacgtgaacacaatctaca
tttgtgctcaatggggaacaaatgtaacagcattaaaatacaggcagggc
ttgctgtaaaatcagctttttaattctcagggctcttaactaataagtta
ggcttagatagttgtgtatcactcttggaaccccaagcatggcaattaat
tattaacccagttcacatttatatgtacaacttatagccctgtgcagact
gagccatatagtggaaatagatttttattctttcagccaattttatggta
agtgtccacataaacaagttgactaagggacacgtcttatgtgatcaaaa
taataaaatatgtgttgataattaccttgagaacaaattggtgctttcca
agcttatcttagctttgaaaatggtgtcaactgtaattatgagcacgtga
tatacagagagcactctacaaacactataatcttgtcctgtcccctgaga
acctataccctccagcttatctggaaacctcatgtacagagaactgtgct
tcttattcaacacatgggctactttcctctttccttttaatggttgtgag
tcttcagagtacagaaaagattactaacatactttaggtggttcatatga
gcattatcaaggctgcatagcttcaaacctcagaagaaggtcaagctcct
accatttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_99178078_99178266
seq2: B6Ng01-316N22.b_52_240 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACAAACCCTGTCTCTAAAAAAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACAAACCCTGTCTCTAAAAAAAAAA  50

seq1  AAAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAGGTAGAACTTCTTAGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAGGTAGAACTTCTTAGATG  100

seq1  GGTGATGATTTCTAATAGATGCATGTTCATCAACGGTTCCCGCCCTTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATGATTTCTAATAGATGCATGTTCATCAACGGTTCCCGCCCTTCCT  150

seq1  AATGCCATGATCTTTTAATTCAGTTTCTCGTGGTGTGGT  189
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCATGATCTTTTAATTCAGTTTCTCGTGGTGTGGT  189


seq1: chr7_98979694_98980809
seq2: B6Ng01-316N22.g_69_1177

seq1  GAATTCACTCTTCTGAATGATTTTTGTCCAGACCTGGGTGGATAGTCGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTTCTGAATGATTTTTGTCCAGACCTGGGTGGATAGTCGGT  50

seq1  AGGGAACCCACAAATAGAGAAGATGACTGTTTTCTGGAAATCTGAAGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAACCCACAAATAGAGAAGATGACTGTTTTCTGGAAATCTGAAGTTT  100

seq1  GTTGTTAAATTCATTCCTTGTATTACCTTTTGAATCCTCCTTACAATTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTAAATTCATTCCTTGTATTACCTTTTGAATCCTCCTTACAATTTT  150

seq1  CTGAAGTTATTATTATTGTATTTGCTTTCCAAATGAGGCTGTGAGCGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTTATTATTATTGTATTTGCTTTCCAAATGAGGCTGTGAGCGGTT  200

seq1  GGATTTCAAGAAGATACACAGTTCAGAATTGGGGAAGCAGAACTTTGAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCAAGAAGATACACAGTTCAGAATTGGGGAAGCAGAACTTTGAAC  250

seq1  TGAGACTGGCTCAAACGAAAGTTTCCCAAGGACTGGCCTGCCTTATGGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTGGCTCAAACGAAAGTTTCCCAAGGACTGGCCTGCCTTATGGTT  300

seq1  TGGTGTTTGTCTGCTTACTGTCAATGCTGTGGGCTGTTTCATATAATTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTTGTCTGCTTACTGTCAATGCTGTGGGCTGTTTCATATAATTGT  350

seq1  CTAACTCTCCCTATGGAAAAATTGTCCCTCAAATAGCTAATATGGGGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTCTCCCTATGGAAAAATTGTCCCTCAAATAGCTAATATGGGGATT  400

seq1  CTTTGCTCGGAGTTCCAAGAGAATGCTTCCCAACGTGAACACAATCTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTCGGAGTTCCAAGAGAATGCTTCCCAACGTGAACACAATCTACA  450

seq1  TTTGTGCTCAATGGGGAACAAATGTAACAGCATTAAAATACAGGCAGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCTCAATGGGGAACAAATGTAACAGCATTAAAATACAGGCAGGGC  500

seq1  TTGCTGTAAAATCAGCTTTTTAATTCTCAGGGCTCTTAACTAATAAGTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTAAAATCAGCTTTTTAATTCTCAGGGCTCTTAACTAATAAGTTA  550

seq1  GGCTTAGATAGTTGTGTATCACTCTTGGAACCCCAAGCATGGCAATTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAGATAGTTGTGTATCACTCTTGGAACCCCAAGCATGGCAATTAAT  600

seq1  TATTAACCCAGTTCACATTTATATGTACAACTTATAGCCCTGTGCAGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAACCCAGTTCACATTTATATGTACAACTTATAGCCCTGTGCAGACT  650

seq1  GAGCCATATAGTGGAAATAGATTTTTATTCTTTCAGCCAATTTTATGGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATATAGTGGAAATAGATTTTTATTCTTTCAGCCAATTTTATGGTA  700

seq1  AGTGTCCACATAAACAAGTTGACTAAGGGACACGTCTTATGTGATCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCCACATAAACAAGTTGACTAAGGGACACGTCTTATGTGATCAAAA  750

seq1  TAATAAAATATGTGTTGATAATTACCTTGAGAACAAATTGGTGCTTTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAATATGTGTTGATAATTACCTTGAGAACAAATTGGTGCTTTCCA  800

seq1  AGCTTATCTTAGCTTTGAAAATGGTGTCAACTGTAATTATGAGCACGTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTATCTTAGCTTTGAAAATGGTGTCAACTGTAATTATGAGCACGTGA  850

seq1  TATACAGAGAGCACTCTACAAACACTATAATCTTGTCCTGTCCCCTGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGAGAGCACTCTACAAACACTATAATCTTGTCCTGTCCCCTGAGA  900

seq1  ACCTATACCCTCCAGCTTATCTGGAAACCTCATGTACAGAGAACTGTGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATACCCTCCAGCTTATCTGGAAACCTCATGTACAGAGAACTGTGCT  950

seq1  TCTTATTCAACACATGGGCTACTTTCCTCTTTCCTTTTAATGGTTGTGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTCAACACATGGGCTACTTTCCTCTTTCCTTTTAATGGTTGTGAG  1000

seq1  TTCTTCAGAGTACAGGAAAAGATTAACTAACCATAC-TTAGGTGGTTTCA  1049
       ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||
seq2  -TCTTCAGAGTACA-GAAAAGATT-ACTAA-CATACTTTAGGTGG-TTCA  1045

seq1  TATGAAGCA-TATCAAAGCTGCATAGCTTTAAAACCTCAAGAAGAA-GTC  1097
      |||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||
seq2  TATG-AGCATTATCAAGGCTGCATAGC-TTCAAACCTC-AGAAGAAGGTC  1092

seq1  AAGCCTCCTAACCATTTAT  1116
      ||| ||||| |||||||||
seq2  AAG-CTCCT-ACCATTTAT  1109


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |