BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-318G06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 6,654,602 - 6,764,704
singlet/doubletdoublet
Overlap genePeg3, Usp29, LOC627961
Upstream geneLOC100041637, V1rd1, LOC100041647, V1rd11, LOC100041666, V1rd6, EG384525, EG269859, Nlrp4c, Zfp787, Zfp444, Galp, Zfp371, EG627821, Zfp667, Zfp583, LOC100042467, LOC100042459, Zfp78, Zfp28, LOC100042450, Olfr1344, GA_x5J8B7W3DQU-679632-679375, Olfr1336, Olfr1346, Olfr5, Olfr1347, Olfr1348, Olfr1349, LOC665328, Olfr1350, Zim2, Zim1
Downstream geneAurkc, LOC628030, LOC100041822, 5730403M16Rik, 2810409K11Rik, Vmn2r-ps35, Zfp418, BC023179, 6430701C03Rik, Clcn4-2, V2r15, LOC100041866, LOC100042577, Vmn2r31, Vmn2r-ps36, V2r5, LOC100041883, EG628117, Vmn2r33, LOC665470, EG665474, EG628368, LOC100042636, LOC665485, EG625353
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-318G06.bB6Ng01-318G06.g
ACCGA108290GA108291
length1,0861,051
definitionB6Ng01-318G06.b B6Ng01-318G06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(6,763,612 - 6,764,704)(6,654,602 - 6,655,656)
sequence
tgcctcaatggagcttcccagtcaatctctgttggctcttccaatggcct
ggcttgatggtgctttgttttgctctctgtctctcatcaactcaatactt
attctttaattttggcttgctatatatttaataagttcactcagatgaaa
atagaaaatattttgtagatcactctctggacttcacctaatccactact
gaaatttttatttgtaaactcattgactaccatatttaattaagtctatt
actattgctgttgttagttttttgggggtaggggtctgttcagggtccga
ttactctaagctggcttagaaaagctctatagccaaggatgaccctgaac
tcctgatcctcctgcctccacctcgaagggactgggattacagacactca
tcttggttaaccctttaaaaagaagttaaaagagagctggaggtatagct
cagttgatagagtacttgcccagtgttcacaaagctccgagttaaatatc
cagtatcaccaggtgtggtgtggtgggggcacacctgtaatcatgtaata
acagcattcagaaagtgggggcaggaagctcaaaagctcaaaatgatcac
agactgtggagtaaattttaggccagaccttttctcaaagagagagagag
agagaggaacaaatatctaacaaaccccccaaaattataccaccaaaatg
cattcacttacacacattttagactagtgcaatccaacaggaagaacact
tcaatcacaaaatcatgccatcagcgcaatccttgcaactaaagcaatag
gcagcccctgtaacttgtcctctgacctccacatgtgcattatggagaca
aaaatccttctgcatacacaaaataaattaattttatctattaaaatttt
tgatacaaaaacacagaaatttaaaaacagaaccatacacagacttgatc
aataagaaaattatgggcaaccatttcaaaccaaagtttttgtaatacac
ttcacctctagtgtatgtgctctgatggagacacactttctgttccagca
gcatattcaagtggccagtagtcatgatggccagtg
gaattcagagacatttgtactcttctctctgtagagcaatgtgcactctg
gtggttgagcagaaaaagtggagtgacttggccatcacttttgatagtta
tgggatcagagatgaagcagccatggattcatgtcgcatttccactgagg
tcaccagcagggatctagttaggtactgagcttaaaatgtgtggtcatta
ttgttaggtttcaaaccctgggacaaatggcagaggtgcttatttagcat
attaaagtggatgctgccaggttctctcagcatcccttagtccctaccag
ttacagggccctcctgacgggcataccccattcccccgaccctaaacttc
tccagcccagggtcttggatgcccttcccccagccacccttccctatata
atccaaccattttgcttacctgattctttttgttttctcccctccacccc
ctccctcctggttggtactcttggtgttcctttctccctctctcttcctc
tgccactctccccccacgtcccaaggtcatatccactctggactctccca
aatgtccttgcctctttctatgctctcccacatatctataataaactttc
tcttccaccattacctaggagcagacatgaatttctctctctctcttaat
ttggtgctgaaatccaggaccggtcatgttccatgttccttccctttata
tttcttctttctttcccattcaattatgaagctacaagaatgcttaataa
ttacttctcaaaaggtgggggaggggtagccctattggtttaatacttgc
cattcaaacatgaggacatgggtttaatactcagaactcacataaaaatc
caggtgtggtggcacacacttgtaatcccagcacttgggctactggtttg
gggaagtaagaggaacccctcctggctgtgtaccctgccccctacctaac
ttccccagccctactggactgcctttcctagctgcccttctctatatatc
cagcaattttggatgtgtgctagcatggcttcagtgtgtgattaccatac
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_6763612_6764704
seq2: B6Ng01-318G06.b_57_1142 (reverse)

seq1  CACTGGCCACTCATGGCTTACTGGCCACTTGAATATTGGCTGCTTTGAAC  50
      ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||| | ||||
seq2  CACTGGCCA-TCATGAC-TACTGGCCACTTGAATAT--GCTGC-TGGAAC  45

seq1  AG-AAGTGTGTCTCCATCAGAGCACATACACTAGAGGTTGAGGTGTTATT  99
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||
seq2  AGAAAGTGTGTCTCCATCAGAGCACATACACTAGAGG-TGAAGTG-TATT  93

seq1  AC-AAAACTTGGTTTTGAAATGGTTG-CCATAATTTTCTTATTGATCAAG  147
      || ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAACTTTGGTTTGAAATGGTTGCCCATAATTTTCTTATTGATCAAG  143

seq1  TCTGTGTATGGTTTCTGTTTTTAATTTTCTGTGTTTTTTGTATCAAAAAT  197
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTATGG-TTCTGTTTTTAAATTTCTGTG-TTTTTGTATCAAAAAT  191

seq1  TTTAAATAGATAAAATTAATTTATTTTGTGTATGCAGAAGGATTTTTGTC  247
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTT-AATAGATAAAATTAATTTATTTTGTGTATGCAGAAGGATTTTTGTC  240

seq1  TCCATAATGCACATGTGGAGGTCAGAGGACAAGTTACAGGGGCTGCCTAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAATGCACATGTGGAGGTCAGAGGACAAGTTACAGGGGCTGCCTAT  290

seq1  TGCTTTAGTTGCAAGGATTGCGCTGATGGCATGATTTTGTGATTGAAGTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAGTTGCAAGGATTGCGCTGATGGCATGATTTTGTGATTGAAGTG  340

seq1  TTCTTCCTGTTGGATTGCACTAGTCTAAAATGTGTGTAAGTGAATGCATT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCTGTTGGATTGCACTAGTCTAAAATGTGTGTAAGTGAATGCATT  390

seq1  TTGGTGGTATAATTTTGGGGGGTTTGTTAGATATTTGTTCCTCTCTCTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGGTATAATTTTGGGGGGTTTGTTAGATATTTGTTCCTCTCTCTCT  440

seq1  CTCTCTCTTTGAGAAAAGGTCTGGCCTAAAATTTACTCCACAGTCTGTGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTTTGAGAAAAGGTCTGGCCTAAAATTTACTCCACAGTCTGTGA  490

seq1  TCATTTTGAGCTTTTGAGCTTCCTGCCCCCACTTTCTGAATGCTGTTATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTGAGCTTTTGAGCTTCCTGCCCCCACTTTCTGAATGCTGTTATT  540

seq1  ACATGATTACAGGTGTGCCCCCACCACACCACACCTGGTGATACTGGATA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGATTACAGGTGTGCCCCCACCACACCACACCTGGTGATACTGGATA  590

seq1  TTTAACTCGGAGCTTTGTGAACACTGGGCAAGTACTCTATCAACTGAGCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTCGGAGCTTTGTGAACACTGGGCAAGTACTCTATCAACTGAGCT  640

seq1  ATACCTCCAGCTCTCTTTTAACTTCTTTTTAAAGGGTTAACCAAGATGAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTCCAGCTCTCTTTTAACTTCTTTTTAAAGGGTTAACCAAGATGAG  690

seq1  TGTCTGTAATCCCAGTCCCTTCGAGGTGGAGGCAGGAGGATCAGGAGTTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTAATCCCAGTCCCTTCGAGGTGGAGGCAGGAGGATCAGGAGTTC  740

seq1  AGGGTCATCCTTGGCTATAGAGCTTTTCTAAGCCAGCTTAGAGTAATCGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCATCCTTGGCTATAGAGCTTTTCTAAGCCAGCTTAGAGTAATCGG  790

seq1  ACCCTGAACAGACCCCTACCCCCAAAAAACTAACAACAGCAATAGTAATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGAACAGACCCCTACCCCCAAAAAACTAACAACAGCAATAGTAATA  840

seq1  GACTTAATTAAATATGGTAGTCAATGAGTTTACAAATAAAAATTTCAGTA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTAATTAAATATGGTAGTCAATGAGTTTACAAATAAAAATTTCAGTA  890

seq1  GTGGATTAGGTGAAGTCCAGAGAGTGATCTACAAAATATTTTCTATTTTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATTAGGTGAAGTCCAGAGAGTGATCTACAAAATATTTTCTATTTTC  940

seq1  ATCTGAGTGAACTTATTAAATATATAGCAAGCCAAAATTAAAGAATAAGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGAGTGAACTTATTAAATATATAGCAAGCCAAAATTAAAGAATAAGT  990

seq1  ATTGAGTTGATGAGAGACAGAGAGCAAAACAAAGCACCATCAAGCCAGGC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTTGATGAGAGACAGAGAGCAAAACAAAGCACCATCAAGCCAGGC  1040

seq1  CATTGGAAGAGCCAACAGAGATTGACTGGGAAGCTCCATTGAGGCA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGAAGAGCCAACAGAGATTGACTGGGAAGCTCCATTGAGGCA  1086

seq1: chr7_6654602_6655656
seq2: B6Ng01-318G06.g_65_1115

seq1  GAATTCAGAGACATTTGTACTCTTCTCTCTGTAGAGCAATGTGCACTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGACATTTGTACTCTTCTCTCTGTAGAGCAATGTGCACTCTG  50

seq1  GTGGTTGAGCAGAAAAAGTGGAGTGACTTGGCCATCACTTTTGATAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTGAGCAGAAAAAGTGGAGTGACTTGGCCATCACTTTTGATAGTTA  100

seq1  TGGGATCAGAGATGAAGCAGCCATGGATTCATGTCGCATTTCCACTGAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATCAGAGATGAAGCAGCCATGGATTCATGTCGCATTTCCACTGAGG  150

seq1  TCACCAGCAGGGATCTAGTTAGGTACTGAGCTTAAAATGTGTGGTCATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGCAGGGATCTAGTTAGGTACTGAGCTTAAAATGTGTGGTCATTA  200

seq1  TTGTTAGGTTTCAAACCCTGGGACAAATGGCAGAGGTGCTTATTTAGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAGGTTTCAAACCCTGGGACAAATGGCAGAGGTGCTTATTTAGCAT  250

seq1  ATTAAAGTGGATGCTGCCAGGTTCTCTCAGCATCCCTTAGTCCCTACCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGTGGATGCTGCCAGGTTCTCTCAGCATCCCTTAGTCCCTACCAG  300

seq1  TTACAGGGCCCTCCTGACGGGCATACCCCATTCCCCCGACCCTAAACTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGGCCCTCCTGACGGGCATACCCCATTCCCCCGACCCTAAACTTC  350

seq1  TCCAGCCCAGGGTCTTGGATGCCCTTCCCCCAGCCACCCTTCCCTATATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCCAGGGTCTTGGATGCCCTTCCCCCAGCCACCCTTCCCTATATA  400

seq1  ATCCAACCATTTTGCTTACCTGATTCTTTTTGTTTTCTCCCCTCCACCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAACCATTTTGCTTACCTGATTCTTTTTGTTTTCTCCCCTCCACCCC  450

seq1  CTCCCTCCTGGTTGGTACTCTTGGTGTTCCTTTCTCCCTCTCTCTTCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCCTGGTTGGTACTCTTGGTGTTCCTTTCTCCCTCTCTCTTCCTC  500

seq1  TGCCACTCTCCCCCCACGTCCCAAGGTCATATCCACTCTGGACTCTCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTCTCCCCCCACGTCCCAAGGTCATATCCACTCTGGACTCTCCCA  550

seq1  AATGTCCTTGCCTCTTTCTATGCTCTCCCACATATCTATAATAAACTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCCTTGCCTCTTTCTATGCTCTCCCACATATCTATAATAAACTTTC  600

seq1  TCTTCCACCATTACCTAGGAGCAGACATGAATTTCTCTCTCTCTCTTAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCACCATTACCTAGGAGCAGACATGAATTTCTCTCTCTCTCTTAAT  650

seq1  TTGGTGCTGAAATCCAGGACCGGTCATGTTCCATGTTCCTTCCCTTTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGCTGAAATCCAGGACCGGTCATGTTCCATGTTCCTTCCCTTTATA  700

seq1  TTTCTTCTTTCTTTCCCATTCAATTATGAAGCTACAAGAATGCTTAATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTTTCTTTCCCATTCAATTATGAAGCTACAAGAATGCTTAATAA  750

seq1  TTACTTCTCAAAAGGTGGGGGAGGGGTAGCCCTATTGGTTTAATACTTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTCTCAAAAGGTGGGGGAGGGGTAGCCCTATTGGTTTAATACTTGC  800

seq1  CATTCAAACATGAGGACATGGGTTTAATACTCAGAACTCACATAAAAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAAACATGAGGACATGGGTTTAATACTCAGAACTCACATAAAAATC  850

seq1  CAGGTGTGGTGGCACACACTTGTAATCCCAGCACTT-GGCTACTGG-TTG  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  CAGGTGTGGTGGCACACACTTGTAATCCCAGCACTTGGGCTACTGGTTTG  900

seq1  GGGAAGTAAGAGGAA-CCCTCCTGGCTGTTGTACCCTGCCCCCTACCCTA  947
      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   
seq2  GGGAAGTAAGAGGAACCCCTCCTGGCTG-TGTACCCTGCCCCCTACC--T  947

seq1  AACTTCCCCAGCCCCTACTGGACTGCCCTTTCCCTAGCTGCCCTTCTCTA  997
      ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||
seq2  AACTTCCCCAG-CCCTACTGGACTGCC--TTTCCTAGCTGCCCTTCTCTA  994

seq1  TATAATCCAACCATTTTGGATTGTGTGCTAGCATGGCTCCAGTGTGTGAA  1047
      ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TAT-ATCCAGCAATTTTGGA-TGTGTGCTAGCATGGCTTCAGTGTGTGAT  1042

seq1  TA-CATACT  1055
      || ||||||
seq2  TACCATACT  1051