BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321G21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 107,180,827 - 107,312,113
singlet/doubletdoublet
Overlap geneChrdl2, Pold3, 2610209A20Rik
Upstream geneUvrag, Dgat2, Mogat2, Mtap6, Serpinh1, Gdpd5, 2810406K13Rik, Rps3, Rnu15-b, EG449630, Arrb1, EG245190, Slco2b1, Olfr520, Olfr521, Neu3, Spcs2, Xrra1, EG330602
Downstream geneKcne3, LOC631577, Pgm2l1, Gpx2-ps1, P4ha3, Ppme1, AU020772, Ucp3, Ucp2, Dnajb13, LOC667112, Chchd8, Mrpl48, LOC100041155, Rab6, LOC100041167, Plekhb1, B930006L02Rik, LOC100041204, Tnfrsf19l, Arhgef17, P2ry6, P2ry2, LOC100049539, EG435996, Fchsd2, EG622673
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321G21.bB6Ng01-321G21.g
ACCGA110536GA110537
length1,1821,163
definitionB6Ng01-321G21.b B6Ng01-321G21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,310,917 - 107,312,113)(107,180,827 - 107,181,981)
sequence
gaattccacaaggctttacataggacccatcaaattaaaggtcaatataa
actgtcatgtctaaaatggcttgagtcagagctgaccaccaggcagcact
tcctgcaagtgtgtatgacctcattatagtttttgtgtttttcctttata
gactggcattgagaaatgttcatcgctgtagcctcacctcacgaattctg
agctatggcgctgatcgatcagtatgaaggtatatataccccaacatgta
cctaaagggacacataagagctggcgctggtgcacaggtgggcagcatga
gagactgtgagtgcaatcttgtgtctgtaagcatgagtgtgtgcatttgt
gtgtgtgttaacattcgtgtgtcgtggtatgtgtgtggagatcagaggac
aacacagtccatcttagatctttttggttttgttttttaaagatttattt
attattttacgtatatgagtacactgtagctatacagatggttgtgagcc
atcatgtggtggctgggaattgaactcaggacctctgctcaatccggccc
aaagatttatttattgttatatgtaagtacactgtagctgtctttagaca
caccagaagagggtgtcagatttcattacagatggttgtgagccaccatg
tgctgggatttgaactcagaaccttcagaagagcagtcagtactcttaac
tgctgagccatctctctagccccatcttatatcttttgttgtcttcacta
cattagccaggccagttgaccctgcaggtttatggtctctcctgtctctg
catctcatattaccacgggaactctgggtttaacagatgtgcacttctta
gggtttctattgctgcagtgaaacaccatgaccccaagaagctgtgaaga
gagagtttatttggcttacacttttatattgtaggtcatcactgaacgga
gtcagagcaggactcaaacagggcaggacctggaggcagagctgatgcag
aggcgatgtagggtgctgatgctgctgcctcccatgctgctcagcctgct
tgctttttacgacccaaggacatcagctcacagaatagcatctgaaatgt
tgcctccccacaactccaaccatcacctattacgaaaacatccctaaggc
ctttctgcaactgatcttaaggcatttctcat
gaattccaagtctgggaaagaatttggcaaagtcatggtgacagtgccat
aggaaagggtgtgtctggtctaggaagacagctcggttggtaaagcgctt
tcctcaaagcctgagaacctgagttcagcccccccaccccccgaggccat
gtgaaaagcctgggcactgtggcatatgcttgcaatcacagccctagaga
agagcagccagactagcctgcctcatgagctccaggccagtgaaagaccc
tgtcacaaaggaaaggggcaaccttagtgaggatggtacccaaggttgtc
tgtctgtcctctgtcttccatagtcacacacacatatgtgaacacacatt
taaaagaggaagggtaaaagataaacagaacctagtgtgatcagtcctgt
ggagaggaggctgtggtcaccttcaagctgggtcaggaagccatcccact
gaggctgagtgggcgggtcactcacttgctgaccacagaaagcaagagca
gaaggactggcatttgcaaaagcttggtttcctcctgggacctcaagttt
tagctagggatgggccatgctcaagacacaaaagctcctgttcaatgatg
tctgaataaacacggctctggatttttatcatatgttgtaggctagagaa
aagcttgaatggtctacatgggtcagccttctcttctttattttcccttt
tatctctccccctcctttctttcctcccttttccctcccccttccttccc
tccctgtttccctccttccctccctcctcccctcctttccttcctccttt
cctcctcccttccctattcccctccttccttccctcccttctcccttcct
ttccttcctcttttccctcctcccctctctactcccctcctttcttcctt
ctgtctctccttccttctctctctccttccctccctccctacccttccat
cctttccctccctcccttctcccctccatccttctttccctacatgtggg
cagaatatgaggattgttgctggtgacaggggcagcagcagaggaggagc
ctaaaggaacaggttttttacttacttgtggaggtgacagtggttagaag
aaagccagaaacattcaaatggttccacatttaaggaattatggttagaa
gaccatggctctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_107310917_107312113
seq2: B6Ng01-321G21.b_44_1225 (reverse)

seq1  ATGAGAAAATGCCTCTTTAAGATCAGGCTGCAGGAAAGCCTGTAGGG-TG  49
      ||||| |||||||   ||||||||| | ||||| || |||| ||||| ||
seq2  ATGAG-AAATGCC---TTAAGATCA-GTTGCAGAAAGGCCT-TAGGGATG  44

seq1  TTTTCGTAATTAGTGATGGTTGGGGTTGTGGGG-GGCACATTTTCAGATG  98
      ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||
seq2  TTTTCGTAATAGGTGATGGTTGGAGTTGTGGGGAGGCAACATTTCAGATG  94

seq1  CTA-TCTGTGGGCTGGTGGTCCTGGGGTCTGTAAAAAAGCAAGCAGGCTG  147
      ||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||
seq2  CTATTCTGTGAGCTGAT-GTCCTTGGGTC-GT-AAAAAGCAAGCAGGCTG  141

seq1  AGCAAGCCATGGGGAGCAAGCCAGCACTCAGCACCCCTACATCGCCTCTG  197
      ||||   ||||||  |||   ||||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  AGCA--GCATGGGAGGCA--GCAGCA-TCAGCA-CCCTACATCGCCTCTG  185

seq1  CATCAGCTCCTGCCTCCAGGTCCCTGCCCTGTTTGAGTCCCTGCTCTGAC  247
      |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CATCAGCT-CTGCCTCCAGGT-CCTGCCCTGTTTGAGT-CCTGCTCTGAC  232

seq1  TCCCTTCAGTGATGACCTACAATATAAAAGTGTAAGCCAAATAAACTCTC  297
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTTCAGTGATGACCTACAATATAAAAGTGTAAGCCAAATAAACTCTC  282

seq1  TCTTCACAGCTTCTTGGGGTCATGGTGTTTCACTGCAGCAATAGAAACCC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACAGCTTCTTGGGGTCATGGTGTTTCACTGCAGCAATAGAAACCC  332

seq1  TAAGAAGTGCACATCTGTTAAACCCAGAGTTCCCGTGGTAATATGAGATG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGTGCACATCTGTTAAACCCAGAGTTCCCGTGGTAATATGAGATG  382

seq1  CAGAGACAGGAGAGACCATAAACCTGCAGGGTCAACTGGCCTGGCTAATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACAGGAGAGACCATAAACCTGCAGGGTCAACTGGCCTGGCTAATG  432

seq1  TAGTGAAGACAACAAAAGATATAAGATGGGGCTAGAGAGATGGCTCAGCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAAGACAACAAAAGATATAAGATGGGGCTAGAGAGATGGCTCAGCA  482

seq1  GTTAAGAGTACTGACTGCTCTTCTGAAGGTTCTGAGTTCAAATCCCAGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGAGTACTGACTGCTCTTCTGAAGGTTCTGAGTTCAAATCCCAGCA  532

seq1  CATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGAAATCTGACACCCTCTTCTGGTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGAAATCTGACACCCTCTTCTGGTG  582

seq1  TGTCTAAAGACAGCTACAGTGTACTTACATATAACAATAAATAAATCTTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAAAGACAGCTACAGTGTACTTACATATAACAATAAATAAATCTTT  632

seq1  GGGCCGGATTGAGCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCCACCACATGAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCGGATTGAGCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCCACCACATGAT  682

seq1  GGCTCACAACCATCTGTATAGCTACAGTGTACTCATATACGTAAAATAAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCACAACCATCTGTATAGCTACAGTGTACTCATATACGTAAAATAAT  732

seq1  AAATAAATCTTTAAAAAACAAAACCAAAAAGATCTAAGATGGACTGTGTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATCTTTAAAAAACAAAACCAAAAAGATCTAAGATGGACTGTGTT  782

seq1  GTCCTCTGATCTCCACACACATACCACGACACACGAATGTTAACACACAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTGATCTCCACACACATACCACGACACACGAATGTTAACACACAC  832

seq1  ACAAATGCACACACTCATGCTTACAGACACAAGATTGCACTCACAGTCTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGCACACACTCATGCTTACAGACACAAGATTGCACTCACAGTCTC  882

seq1  TCATGCTGCCCACCTGTGCACCAGCGCCAGCTCTTATGTGTCCCTTTAGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCTGCCCACCTGTGCACCAGCGCCAGCTCTTATGTGTCCCTTTAGG  932

seq1  TACATGTTGGGGTATATATACCTTCATACTGATCGATCAGCGCCATAGCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTTGGGGTATATATACCTTCATACTGATCGATCAGCGCCATAGCT  982

seq1  CAGAATTCGTGAGGTGAGGCTACAGCGATGAACATTTCTCAATGCCAGTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTCGTGAGGTGAGGCTACAGCGATGAACATTTCTCAATGCCAGTC  1032

seq1  TATAAAGGAAAAACACAAAAACTATAATGAGGTCATACACACTTGCAGGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAGGAAAAACACAAAAACTATAATGAGGTCATACACACTTGCAGGA  1082

seq1  AGTGCTGCCTGGTGGTCAGCTCTGACTCAAGCCATTTTAGACATGACAGT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGCCTGGTGGTCAGCTCTGACTCAAGCCATTTTAGACATGACAGT  1132

seq1  TTATATTGACCTTTAATTTGATGGGTCCTATGTAAAGCCTTGTGGAATTC  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATTGACCTTTAATTTGATGGGTCCTATGTAAAGCCTTGTGGAATTC  1182

seq1: chr7_107180827_107181981
seq2: B6Ng01-321G21.g_64_1226

seq1  GAATTCCAAGTCTGGGAAAGAATTTGGCAAAGTCATGGTGACAGTGCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGTCTGGGAAAGAATTTGGCAAAGTCATGGTGACAGTGCCAT  50

seq1  AGGAAAGGGTGTGTCTGGTCTAGGAAGACAGCTCGGTTGGTAAAGCGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGGTGTGTCTGGTCTAGGAAGACAGCTCGGTTGGTAAAGCGCTT  100

seq1  TCCTCAAAGCCTGAGAACCTGAGTTCAGCCCCCCCACCCCCCGAGGCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAAAGCCTGAGAACCTGAGTTCAGCCCCCCCACCCCCCGAGGCCAT  150

seq1  GTGAAAAGCCTGGGCACTGTGGCATATGCTTGCAATCACAGCCCTAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAAGCCTGGGCACTGTGGCATATGCTTGCAATCACAGCCCTAGAGA  200

seq1  AGAGCAGCCAGACTAGCCTGCCTCATGAGCTCCAGGCCAGTGAAAGACCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGCCAGACTAGCCTGCCTCATGAGCTCCAGGCCAGTGAAAGACCC  250

seq1  TGTCACAAAGGAAAGGGGCAACCTTAGTGAGGATGGTACCCAAGGTTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACAAAGGAAAGGGGCAACCTTAGTGAGGATGGTACCCAAGGTTGTC  300

seq1  TGTCTGTCCTCTGTCTTCCATAGTCACACACACATATGTGAACACACATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTCCTCTGTCTTCCATAGTCACACACACATATGTGAACACACATT  350

seq1  TAAAAGAGGAAGGGTAAAAGATAAACAGAACCTAGTGTGATCAGTCCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGAGGAAGGGTAAAAGATAAACAGAACCTAGTGTGATCAGTCCTGT  400

seq1  GGAGAGGAGGCTGTGGTCACCTTCAAGCTGGGTCAGGAAGCCATCCCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGGAGGCTGTGGTCACCTTCAAGCTGGGTCAGGAAGCCATCCCACT  450

seq1  GAGGCTGAGTGGGCGGGTCACTCACTTGCTGACCACAGAAAGCAAGAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGAGTGGGCGGGTCACTCACTTGCTGACCACAGAAAGCAAGAGCA  500

seq1  GAAGGACTGGCATTTGCAAAAGCTTGGTTTCCTCCTGGGACCTCAAGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGACTGGCATTTGCAAAAGCTTGGTTTCCTCCTGGGACCTCAAGTTT  550

seq1  TAGCTAGGGATGGGCCATGCTCAAGACACAAAAGCTCCTGTTCAATGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAGGGATGGGCCATGCTCAAGACACAAAAGCTCCTGTTCAATGATG  600

seq1  TCTGAATAAACACGGCTCTGGATTTTTATCATATGTTGTAGGCTAGAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAATAAACACGGCTCTGGATTTTTATCATATGTTGTAGGCTAGAGAA  650

seq1  AAGCTTGAATGGTCTACATGGGTCAGCCTTCTCTTCTTTATTTTCCCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTGAATGGTCTACATGGGTCAGCCTTCTCTTCTTTATTTTCCCTTT  700

seq1  TATCTCTCCCCCTCCTTTCTTTCCTCCCTTTTCCCTCCCCCTTCCTTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCTCCCCCTCCTTTCTTTCCTCCCTTTTCCCTCCCCCTTCCTTCCC  750

seq1  TCCCTGTTTCCCTCCTTCCCTCCCTCCTCCCCTCCTTTCCTTCCTCCTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTTTCCCTCCTTCCCTCCCTCCTCCCCTCCTTTCCTTCCTCCTTT  800

seq1  CCTCCTCCCTTCCCTATTCCCCTCCTTCCTTCCCTCCCTTCTCCCTTCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTCCCTTCCCTATTCCCCTCCTTCCTTCCCTCCCTTCTCCCTTCCT  850

seq1  TTCCTTCCTCTTTTCCCTCCTCCCCTCTCTCCTCCCCTCCTTTCTTCCTT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCCTCTTTTCCCTCCTCCCCTCTCTACTCCCCTCCTTTCTTCCTT  900

seq1  CTGTCTCTCCTTCCTTCTCTCTCTCCTTCCCTCCCTCCCTACCCTTCCCT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTGTCTCTCCTTCCTTCTCTCTCTCCTTCCCTCCCTCCCTACCCTTCCAT  950

seq1  CCTTTCCCTCCCTCCCTTCTCCCCTCCATCCTTCTTTCCCTACATGTGGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCCTCCCTCCCTTCTCCCCTCCATCCTTCTTTCCCTACATGTGGG  1000

seq1  CAG-ATATGAGGA-TGTTGCTGGTGACAGGGGCAGCAGCAGAGGAGGAGG  1048
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAGAATATGAGGATTGTTGCTGGTGACAGGGGCAGCAGCAGAGGAGGAGC  1050

seq1  CTAAAGGAACAGG--TTTTACTTAC-TGTGGAGGTGACAGGTGGTCAGA-  1094
      |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| 
seq2  CTAAAGGAACAGGTTTTTTACTTACTTGTGGAGGTGACA-GTGGTTAGAA  1099

seq1  -GAAGCCAG-AACATTTCAATGGT--CACCATTA--GGATTATGGTTTAA  1138
        ||||||| ||||||  ||||||  |||  |||  | |||||||||  |
seq2  GAAAGCCAGAAACATTCAAATGGTTCCACATTTAAGGAATTATGGTT--A  1147

seq1  GAAGGACCAGGGCTCTG  1155
      ||| ||||| |||||||
seq2  GAA-GACCATGGCTCTG  1163