BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322B12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 152,011,759 - 152,139,634
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1
Upstream geneDhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315
Downstream gene1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2, Mrgprf, Mrgprd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322B12.bB6Ng01-322B12.g
ACCGA111028GA111029
length1,168951
definitionB6Ng01-322B12.b B6Ng01-322B12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(152,011,759 - 152,012,901)(152,138,896 - 152,139,634)
sequence
gaattctctctatcagctcacataatccctggcgacaaggtgccaggttc
caaagtacctttgtcactggtccttgggcagagtcttggtggagttttaa
aaaatgaccatatggtctttgatcctcttctcagggagaagtggctttgt
ccccctcccctcaagctctggtggctgtgttttgcttgtaactaaagtga
ctgggtggcagcagaggcacctcctcccagaagtccctctggctcctgct
ttgttttctagtgaggcttgctccagggctacagtccccacctccaacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
tatgccccagagtccaactctttggccccacccccagctggtcaagtccg
acgcagcacatgggagctaaggcacctcctcaccttctgtttccatctaa
tgttctgttctctcagctttcctgtctttccagctgagaccaagcagcct
gagggagctgacatgtggcatcatccctggtccttcctaactggtgggat
cagagagtgaagagctgaactatctgtcactttgagtcccaagctggctt
gttagcagctctgggggacaagacaccatgtttcccagaggctgcttaac
aatcactcagacagttcatacaatggcccagatactcaaggtgagcaggg
tccactcaggaggaagcaggccatgtagtcagcagttcagggatgtgcca
gactccactgtgtgaacctcttaaattgctcatgatggataactttaatt
gtcaccttgacataacctaggctgacgagcatcacagtgaaggactgtct
agttcaggctggcttgtgggctcatctataaagggatatttctaggttaa
ctgaggtgggaaagacacatccctgagtgtgggatggcacccactccctg
ggttctcctagactgaaggaagatattgaaaaactgctaagaacatgcaa
ctgtccggctcgtttctctcttgccctgtgagtgtgggtgtgatgtcatc
agcctgcttcagttctgcctccccttgagtttccagccaatggacagaac
caatgagctgggaaagtatgaagcctaaggccaaggccctgccttgatgg
caacttaccatcactgtg
gaattcaaacccaggaacccagatggtagaaaaagaatcattctacaagt
tgtcttccagcctccacatggacaatgcacacacaaataaatgaaaaaaa
aataaaaataaatgaaaagagactgagccagttggagctgttcacagcaa
agctagaatctaaggacctgggtagttgttggttttaatggacctcaaac
aaactcgacctggatccgattagactcactgcagggggcctctacaaagt
ataattatgtgatgttttcagatcctcagatgaaaggagaccataaacac
agaatgttccagaatttcatcagtcgtctgcctctctataataaatgctg
cgggccatatcagaactgtcctctccacagcagacgactctgaggccagg
gtcctctctacttgctctcacgcctctagggtcccttgcatgcctgtgca
ttttaccttgttcaaaagcaatttataatccaggttaagtctatcattgt
ggggaagtcaaggcaggaacttcaaacagctagtcacttcacatccacag
tggagagcttagagaagtgaatgcagacatagtcccttgcttgcttgtac
tcaggtctatttctccattcttatgtagtccaggagcttctgcctaggga
atggtgctgcccatagtgggctttgccttcccatatctgctaatgtaatc
aggacaatcccccaactgggtggtagtggctcattcctttaatcccagta
cttagtaggcagcgacagaggagtatattttgagtttgaggcctgcctgg
tcaagctccagaacagacaaaggctacacagtaagatgttgtctcaaaag
ttaaaaaaaaaaaaaaaaacccacatatatatacatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatatatcaccctaccacatgcattgttatg
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_152011759_152012901
seq2: B6Ng01-322B12.b_50_1217

seq1  GAATTCTCTCTATCAGCTCACATAATCCCTGGCGACAAGGTGCCAGGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCTATCAGCTCACATAATCCCTGGCGACAAGGTGCCAGGTTC  50

seq1  CAAAGTACCTTTGTCACTGGTCCTTGGGCAGAGTCTTGGTGGAGTTTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTACCTTTGTCACTGGTCCTTGGGCAGAGTCTTGGTGGAGTTTTAA  100

seq1  AAAATGACCATATGGTCTTTGATCCTCTTCTCAGGGAGAAGTGGCTTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGACCATATGGTCTTTGATCCTCTTCTCAGGGAGAAGTGGCTTTGT  150

seq1  CCCCCTCCCCTCAAGCTCTGGTGGCTGTGTTTTGCTTGTAACTAAAGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCCCCTCAAGCTCTGGTGGCTGTGTTTTGCTTGTAACTAAAGTGA  200

seq1  CTGGGTGGCAGCAGAGGCACCTCCTCCCAGAAGTCCCTCTGGCTCCTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGGCAGCAGAGGCACCTCCTCCCAGAAGTCCCTCTGGCTCCTGCT  250

seq1  TTGTTTTCTAGTGAGGCTTGCTCCAGGGCTACAGTCCCCACCTCCAACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTCTAGTGAGGCTTGCTCCAGGGCTACAGTCCCCACCTCCAACAC  300

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  350

seq1  TATGCCCCAGAGTCCAACTCTTTGGCCCCACCCCCAGCTGGTCAAGTCCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCCCAGAGTCCAACTCTTTGGCCCCACCCCCAGCTGGTCAAGTCCG  400

seq1  ACGCAGCACATGGGAGCTAAGGCACCTCCTCACCTTCTGTTTCCATCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCAGCACATGGGAGCTAAGGCACCTCCTCACCTTCTGTTTCCATCTAA  450

seq1  TGTTCTGTTCTCTCAGCTTTCCTGTCTTTCCAGCTGAGACCAAGCAGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTGTTCTCTCAGCTTTCCTGTCTTTCCAGCTGAGACCAAGCAGCCT  500

seq1  GAGGGAGCTGACATGTGGCATCATCCCTGGTCCTTCCTAACTGGTGGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAGCTGACATGTGGCATCATCCCTGGTCCTTCCTAACTGGTGGGAT  550

seq1  CAGAGAGTGAAGAGCTGAACTATCTGTCACTTTGAGTCCCAAGCTGGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGTGAAGAGCTGAACTATCTGTCACTTTGAGTCCCAAGCTGGCTT  600

seq1  GTTAGCAGCTCTGGGGGACAAGACACCATGTTTCCCAGAGGCTGCTTAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCAGCTCTGGGGGACAAGACACCATGTTTCCCAGAGGCTGCTTAAC  650

seq1  AATCACTCAGACAGTTCATACAATGGCCCAGATACTCAAGGTGAGCAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTCAGACAGTTCATACAATGGCCCAGATACTCAAGGTGAGCAGGG  700

seq1  TCCACTCAGGAGGAAGCAGGCCATGTAGTCAGCAGTTCAGGGATGTGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTCAGGAGGAAGCAGGCCATGTAGTCAGCAGTTCAGGGATGTGCCA  750

seq1  GACTCCACTGTGTGAACCTCTTAAATTGCTCATGATGGATAACTTTAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCACTGTGTGAACCTCTTAAATTGCTCATGATGGATAACTTTAATT  800

seq1  GTCACCTTGACATAACCTAGGCTGACGAGCATCACAGTGAAGGACTGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTTGACATAACCTAGGCTGACGAGCATCACAGTGAAGGACTGTCT  850

seq1  AGTTCAGGCTGGCTTGTGGGCTCATCTAT-AAGGGATATTTCTAGGTTAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAGGCTGGCTTGTGGGCTCATCTATAAAGGGATATTTCTAGGTTAA  900

seq1  CTGAGGTGGG-AAGACACAT-CCTGAGTGT-GGATGGCA-CCACTCCCTG  945
      |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  CTGAGGTGGGAAAGACACATCCCTGAGTGTGGGATGGCACCCACTCCCTG  950

seq1  GGTTCTCCTAGACTG-AGGAAGA-ATTGAAAAACTGCT-AGAACATGCAA  992
      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  GGTTCTCCTAGACTGAAGGAAGATATTGAAAAACTGCTAAGAACATGCAA  1000

seq1  CTGT-CGGCTCGTTTCTCTCT--GCCTGTGAGTGTGGGTGTGATGTCATC  1039
      |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCGGCTCGTTTCTCTCTTGCCCTGTGAGTGTGGGTGTGATGTCATC  1050

seq1  AG-CTGCTTCAGGTTCTGC--TCCCTTGAGTTTCC-GGCAAT-GACAGA-  1083
      || |||||||| |||||||   ||||||||||||| | |||| |||||| 
seq2  AGCCTGCTTCA-GTTCTGCCTCCCCTTGAGTTTCCAGCCAATGGACAGAA  1099

seq1  -CCATGAGCTGG--AAGTATGA--GCTAAAGC--AAGCCCTGCCTTG-TG  1125
       | |||||||||  ||||||||   |||| ||  | ||||||||||| ||
seq2  CCAATGAGCTGGGAAAGTATGAAGCCTAAGGCCAAGGCCCTGCCTTGATG  1149

seq1  GGAA-TTACTATCACTGTG  1143
      | || |||| |||||||||
seq2  GCAACTTACCATCACTGTG  1168

seq1: chr7_152138896_152139634
seq2: B6Ng01-322B12.g_67_805 (reverse)

seq1  AAGGAATGAGCCACTACCACCCAGTTGGGGGATTGTCCTGATTACATTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATGAGCCACTACCACCCAGTTGGGGGATTGTCCTGATTACATTAG  50

seq1  CAGATATGGGAAGGCAAAGCCCACTATGGGCAGCACCATTCCCTAGGCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATGGGAAGGCAAAGCCCACTATGGGCAGCACCATTCCCTAGGCAG  100

seq1  AAGCTCCTGGACTACATAAGAATGGAGAAATAGACCTGAGTACAAGCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCTGGACTACATAAGAATGGAGAAATAGACCTGAGTACAAGCAAG  150

seq1  CAAGGGACTATGTCTGCATTCACTTCTCTAAGCTCTCCACTGTGGATGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGACTATGTCTGCATTCACTTCTCTAAGCTCTCCACTGTGGATGTG  200

seq1  AAGTGACTAGCTGTTTGAAGTTCCTGCCTTGACTTCCCCACAATGATAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGACTAGCTGTTTGAAGTTCCTGCCTTGACTTCCCCACAATGATAGA  250

seq1  CTTAACCTGGATTATAAATTGCTTTTGAACAAGGTAAAATGCACAGGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACCTGGATTATAAATTGCTTTTGAACAAGGTAAAATGCACAGGCAT  300

seq1  GCAAGGGACCCTAGAGGCGTGAGAGCAAGTAGAGAGGACCCTGGCCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGGACCCTAGAGGCGTGAGAGCAAGTAGAGAGGACCCTGGCCTCAG  350

seq1  AGTCGTCTGCTGTGGAGAGGACAGTTCTGATATGGCCCGCAGCATTTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCGTCTGCTGTGGAGAGGACAGTTCTGATATGGCCCGCAGCATTTATT  400

seq1  ATAGAGAGGCAGACGACTGATGAAATTCTGGAACATTCTGTGTTTATGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGAGGCAGACGACTGATGAAATTCTGGAACATTCTGTGTTTATGGT  450

seq1  CTCCTTTCATCTGAGGATCTGAAAACATCACATAATTATACTTTGTAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTTCATCTGAGGATCTGAAAACATCACATAATTATACTTTGTAGAG  500

seq1  GCCCCCTGCAGTGAGTCTAATCGGATCCAGGTCGAGTTTGTTTGAGGTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTGCAGTGAGTCTAATCGGATCCAGGTCGAGTTTGTTTGAGGTCC  550

seq1  ATTAAAACCAACAACTACCCAGGTCCTTAGATTCTAGCTTTGCTGTGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAACCAACAACTACCCAGGTCCTTAGATTCTAGCTTTGCTGTGAAC  600

seq1  AGCTCCAACTGGCTCAGTCTCTTTTCATTTATTTTTATTTTTTTTTCATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCAACTGGCTCAGTCTCTTTTCATTTATTTTTATTTTTTTTTCATT  650

seq1  TATTTGTGTGTGCATTGTCCATGTGGAGGCTGGAAGACAACTTGTAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTGTGTGCATTGTCCATGTGGAGGCTGGAAGACAACTTGTAGAAT  700

seq1  GATTCTTTTTCTACCATCTGGGTTCCTGGGTTTGAATTC  739
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTTTTCTACCATCTGGGTTCCTGGGTTTGAATTC  739