BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322B19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 118,315,116 - 118,487,975
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042658
Upstream geneSwap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221
Downstream geneLOC384658, Galntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322B19.bB6Ng01-322B19.g
ACCGA111042GA111043
length1,1691,127
definitionB6Ng01-322B19.b B6Ng01-322B19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,315,116 - 118,316,293)(118,486,849 - 118,487,975)
sequence
gaattccctggaactggagtaacaggcagctgtagacatccatgtgggtt
ctgggaaccgggttgggttctttagcaagagcagccagtgtttgtaacta
ttgagctgttgctcaagtatctgcctttttatttttttatttttattttt
gaaattattactatgaccacccgatagtcctctgagggacatgccactgc
tttcctgtctctcgatagccttgtgaagacaggctgtcctgggaaggcac
cactgcaacagatatcagcgtggacccgtgcggctagttagttcttcagc
gtgcactcagcagtggtttttccacccttgcaaggccagtctatggtatt
tgagctttaaaatagcagctggagagctggcagaaaagtctagcatgcta
acccttctctacggaacattgagcatctagcggtttcctgggaaaggtct
ccaggaagacaactgagctgatcttaaaaaggcattgggcagtctgattt
tctacttatttcttcatctaagaggcaaaaagacccatttcccttgatgg
ttattgctggtttgttttagagtcatatcaggccattagtcatggatgac
catggttgggggtgggtcccttactgaggctgggaaaagactcagagtga
aaactagggcagactttctgaaagaggcggggcttgattggtgtgatgat
taatctcgaatgccaacttgatgggatctaaatgacctagaagacaaact
ctgagcatgcctaatggaggctaggttaacctagattcttgcttcagaca
aggacttatgtttctcagattggtgggggatttgctatgtaattgaggat
gcccttgatcttctgatttcccagcttccaggatcacagatatgtaccac
caagtatgtgctactggggatcgaactcagggctctgggtgtactagtca
agcctcactcaattgatctatacttccaggtccctaaattctttttctga
tgttatgagctggattcttaggacatgactggggccagttttgggaatag
tctttggtacatttagtttctcgggaaggcatccgcgtgagcttgcaagt
ttttttttccaatgccatcgcactgggtgttttgggagtgcaggatagat
atcctggggctggacatgg
gaattccacgtgctttttcttgacccttgagtccatcctgtgaggtagat
gtcagcacttctactgtggagacacaagaaggttaaaacttactaaatgg
cacatgacaatttaatggaatggaaaaatgaaggattcaggactgacaga
cattgaggccctcacgtctggttattgtagagaagagacgtgcttgtttt
gtgtatttctactgatactctgtagatagatgttccattatcaataaata
tatgaggtcagttataaggagactaatacactaaaccaaacttcttcccc
tgggtggagaactgttccgtggcgattgagacgctctatggtgtctataa
cacactcatggggtcaaatcctcctggaacaaagtcacctaatgagtaag
ttttcaataaaatagctgaatctgatgctactaggggccaaggcccactt
ctaagaacttaatttgttataaatccacttaactagccctatgaggaaga
cagcgttataatcatctagttgagatatggagaaactgaggcacaataag
gagcagagtctgacagtctgtttccccaatgtccccagaagaatccttcc
gggactatcagttacaatgctagagttcccaggacagcctgggacttaac
aggtctccatccctctgaatttaacccagacaccagcaccccaacatctg
attatttttatggaactcttgaatctcagttcctaacatggcttttctgc
ctggcgccaccttcaccagctcctgagatgctcatacctgcacctcagca
ttccctgcaccccagaccttgcctaagtctgtaccctgacctacctcaca
gctcaacacccaagtacctgagtttctgcccactgacacgctgctcccag
ggcaaagccagctacaaagacaatgccacatctgcaaggcatattgctca
aaaagtcagggcagacttgtttaagctgaaaatggtgtctatcctaggga
cattgtctgaagacacactgctcctagcaatacagagcaagaagagcact
gcagttcaagaagattaaaagataggtgcatgccaatgaacacctcaagg
ccagcactttagaaccagtatactacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_118315116_118316293
seq2: B6Ng01-322B19.b_46_1214

seq1  GAATTCCCTGGAACTGGAGTAACAGGCAGCTGTAGACATCCATGTGGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGGAACTGGAGTAACAGGCAGCTGTAGACATCCATGTGGGTT  50

seq1  CTGGGAACCGGGTTGGGTTCTTTAGCAAGAGCAGCCAGTGTTTGTAACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAACCGGGTTGGGTTCTTTAGCAAGAGCAGCCAGTGTTTGTAACTA  100

seq1  TTGAGCTGTTGCTCAAGTATCTGCCTTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCTGTTGCTCAAGTATCTGCCTTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTT  150

seq1  GAAATTATTACTATGACCACCCGATAGTCCTCTGAGGGACATGCCACTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTATTACTATGACCACCCGATAGTCCTCTGAGGGACATGCCACTGC  200

seq1  TTTCCTGTCTCTCGATAGCCTTGTGAAGACAGGCTGTCCTGGGAAGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGTCTCTCGATAGCCTTGTGAAGACAGGCTGTCCTGGGAAGGCAC  250

seq1  CACTGCAACAGATATCAGCGTGGACCCGTGCGGCTAGTTAGTTCTTCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCAACAGATATCAGCGTGGACCCGTGCGGCTAGTTAGTTCTTCAGC  300

seq1  GTGCACTCAGCAGTGGTTTTTCCACCCTTGCAAGGCCAGTCTATGGTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACTCAGCAGTGGTTTTTCCACCCTTGCAAGGCCAGTCTATGGTATT  350

seq1  TGAGCTTTAAAATAGCAGCTGGAGAGCTGGCAGAAAAGTCTAGCATGCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTTTAAAATAGCAGCTGGAGAGCTGGCAGAAAAGTCTAGCATGCTA  400

seq1  ACCCTTCTCTACGGAACATTGAGCATCTAGCGGTTTCCTGGGAAAGGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTCTCTACGGAACATTGAGCATCTAGCGGTTTCCTGGGAAAGGTCT  450

seq1  CCAGGAAGACAACTGAGCTGATCTTAAAAAGGCATTGGGCAGTCTGATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAGACAACTGAGCTGATCTTAAAAAGGCATTGGGCAGTCTGATTT  500

seq1  TCTACTTATTTCTTCATCTAAGAGGCAAAAAGACCCATTTCCCTTGATGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTTATTTCTTCATCTAAGAGGCAAAAAGACCCATTTCCCTTGATGG  550

seq1  TTATTGCTGGTTTGTTTTAGAGTCATATCAGGCCATTAGTCATGGATGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGCTGGTTTGTTTTAGAGTCATATCAGGCCATTAGTCATGGATGAC  600

seq1  CATGGTTGGGGGTGGGTCCCTTACTGAGGCTGGGAAAAGACTCAGAGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTGGGGGTGGGTCCCTTACTGAGGCTGGGAAAAGACTCAGAGTGA  650

seq1  AAACTAGGGCAGACTTTCTGAAAGAGGCGGGGCTTGATTGGTGTGATGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAGGGCAGACTTTCTGAAAGAGGCGGGGCTTGATTGGTGTGATGAT  700

seq1  TAATCTCGAATGCCAACTTGATGGGATCTAAATGACCTAGAAGACAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTCGAATGCCAACTTGATGGGATCTAAATGACCTAGAAGACAAACT  750

seq1  CTGAGCATGCCTAATGGAGGCTAGGTTAACCTAGATTCTTGCTTCAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCATGCCTAATGGAGGCTAGGTTAACCTAGATTCTTGCTTCAGACA  800

seq1  AGGACTTATGTTTCTCAGATTGGTGGGGGATTTGCTATGTAATTGAGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTTATGTTTCTCAGATTGGTGGGGGATTTGCTATGTAATTGAGGAT  850

seq1  GCCCTTGATCTTCTGATTTCCCAGCTTCCAGGATCACAGATATGTACCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGATCTTCTGATTTCCCAGCTTCCAGGATCACAGATATGTACCAC  900

seq1  CAAGTATGTGCTACTGGGGATCGAACCCAGGGCTCTGGGTGTACTAGTCA  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTATGTGCTACTGGGGATCGAACTCAGGGCTCTGGGTGTACTAGTCA  950

seq1  AGCCCTCACTCAATTGATCTATACTTCCAGGTCCCTAAATTCTTTTTCTG  1000
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AG-CCTCACTCAATTGATCTATACTTCCAGGTCCCTAAATTCTTTTTCTG  999

seq1  ATGTTATGAGCTGGATTCTTTAGGACATGAACTGGGGCCCAGTTTTGGGA  1050
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  ATGTTATGAGCTGGATTC-TTAGGACATG-ACTGGGG-CCAGTTTTGGGA  1046

seq1  ATAGTCTTTGGTACCTTTAGTCTCTCGGGAA-GCATCCGGGGTGAGC-TG  1098
      |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||
seq2  ATAGTCTTTGGTACATTTAGTTTCTCGGGAAGGCATCC-GCGTGAGCTTG  1095

seq1  CAGGTTTTTTTTTTTCCAATTGCCATCGCCACTGGGTTGTTTTGGAAGTT  1148
      || |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |
seq2  CAAG--TTTTTTTTTCCAA-TGCCATCG-CACTGGG-TGTTTTGGGAG-T  1139

seq1  GCAGGATTTAGTATTCCTGGGCTGG-CATGG  1178
      |||||||  | ||| |  ||||||| |||||
seq2  GCAGGATAGA-TATCCTGGGGCTGGACATGG  1169

seq1: chr7_118486849_118487975
seq2: B6Ng01-322B19.g_70_1196 (reverse)

seq1  GGTAGTATCCCTGGTCTAAGTGGCTGGCTTTGA-GTGTTCATTTGCATGC  49
      |||||||| |  | |||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||
seq2  GGTAGTATACTGGTTCTAAAGTGCTGGCCTTGAGGTGTTCATTGGCATGC  50

seq1  A-CTATCTTTTAATC-TCTTGAAACTGCAGTGCTCTTCTTGCTTCTGTAT  97
      | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACCTATCTTTTAATCTTCTTG-AACTGCAGTGCTCTTCTTGC-TCTGTAT  98

seq1  TGCTAGGAGCAGTGTGTCTTCAGACAATGTCCCTAGGATAGACACCATTT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGGAGCAGTGTGTCTTCAGACAATGTCCCTAGGATAGACACCATTT  148

seq1  TCAGCCTTAAACAAGTCTGCCCTGACTTTTTGAGCAATATGCCTTGCAGA  197
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAG-CTTAAACAAGTCTGCCCTGACTTTTTGAGCAATATGCCTTGCAGA  197

seq1  TGTGGCATTGTCTTTGTAGCTGGCTTTGCCCTGGGAGCAGCGTGTCAGTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCATTGTCTTTGTAGCTGGCTTTGCCCTGGGAGCAGCGTGTCAGTG  247

seq1  GGCAGAAACTCAGGTACTTGGGTGTTGAGCTGTGAGGTAGGTCAGGGTAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAAACTCAGGTACTTGGGTGTTGAGCTGTGAGGTAGGTCAGGGTAC  297

seq1  AGACTTAGGCAAGGTCTGGGGTGCAGGGAATGCTGAGGTGCAGGTATGAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTAGGCAAGGTCTGGGGTGCAGGGAATGCTGAGGTGCAGGTATGAG  347

seq1  CATCTCAGGAGCTGGTGAAGGTGGCGCCAGGCAGAAAAGCCATGTTAGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAGGAGCTGGTGAAGGTGGCGCCAGGCAGAAAAGCCATGTTAGGA  397

seq1  ACTGAGATTCAAGAGTTCCATAAAAATAATCAGATGTTGGGGTGCTGGTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGATTCAAGAGTTCCATAAAAATAATCAGATGTTGGGGTGCTGGTG  447

seq1  TCTGGGTTAAATTCAGAGGGATGGAGACCTGTTAAGTCCCAGGCTGTCCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGTTAAATTCAGAGGGATGGAGACCTGTTAAGTCCCAGGCTGTCCT  497

seq1  GGGAACTCTAGCATTGTAACTGATAGTCCCGGAAGGATTCTTCTGGGGAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACTCTAGCATTGTAACTGATAGTCCCGGAAGGATTCTTCTGGGGAC  547

seq1  ATTGGGGAAACAGACTGTCAGACTCTGCTCCTTATTGTGCCTCAGTTTCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGGAAACAGACTGTCAGACTCTGCTCCTTATTGTGCCTCAGTTTCT  597

seq1  CCATATCTCAACTAGATGATTATAACGCTGTCTTCCTCATAGGGCTAGTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCTCAACTAGATGATTATAACGCTGTCTTCCTCATAGGGCTAGTT  647

seq1  AAGTGGATTTATAACAAATTAAGTTCTTAGAAGTGGGCCTTGGCCCCTAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGATTTATAACAAATTAAGTTCTTAGAAGTGGGCCTTGGCCCCTAG  697

seq1  TAGCATCAGATTCAGCTATTTTATTGAAAACTTACTCATTAGGTGACTTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATCAGATTCAGCTATTTTATTGAAAACTTACTCATTAGGTGACTTT  747

seq1  GTTCCAGGAGGATTTGACCCCATGAGTGTGTTATAGACACCATAGAGCGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAGGAGGATTTGACCCCATGAGTGTGTTATAGACACCATAGAGCGT  797

seq1  CTCAATCGCCACGGAACAGTTCTCCACCCAGGGGAAGAAGTTTGGTTTAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATCGCCACGGAACAGTTCTCCACCCAGGGGAAGAAGTTTGGTTTAG  847

seq1  TGTATTAGTCTCCTTATAACTGACCTCATATATTTATTGATAATGGAACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTAGTCTCCTTATAACTGACCTCATATATTTATTGATAATGGAACA  897

seq1  TCTATCTACAGAGTATCAGTAGAAATACACAAAACAAGCACGTCTCTTCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTACAGAGTATCAGTAGAAATACACAAAACAAGCACGTCTCTTCT  947

seq1  CTACAATAACCAGACGTGAGGGCCTCAATGTCTGTCAGTCCTGAATCCTT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATAACCAGACGTGAGGGCCTCAATGTCTGTCAGTCCTGAATCCTT  997

seq1  CATTTTTCCATTCCATTAAATTGTCATGTGCCATTTAGTAAGTTTTAACC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTTCCATTCCATTAAATTGTCATGTGCCATTTAGTAAGTTTTAACC  1047

seq1  TTCTTGTGTCTCCACAGTAGAAGTGCTGACATCTACCTCACAGGATGGAC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTGTCTCCACAGTAGAAGTGCTGACATCTACCTCACAGGATGGAC  1097

seq1  TCAAGGGTCAAGAAAAAGCACGTGGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGGTCAAGAAAAAGCACGTGGAATTC  1127