BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-323M01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 75,973,084 - 76,053,793
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC665319, LOC100041771, Igf1r, C330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639, Arrdc4
Downstream geneLOC384741, EG665410
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-323M01.bB6Ng01-323M01.g
ACCGA112252GA112253
length1,1081,016
definitionB6Ng01-323M01.b B6Ng01-323M01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,052,678 - 76,053,793)(75,973,084 - 75,974,089)
sequence
gaattctctgttcctctcaattgcccattggaaactttggaataaataga
atcactgtgtgcatcaaaaagccccaagccccacctttcacaaccctctg
ccagttttaggtgcctatgctctgtgagcaaaaccaagctgtgactcatc
accactgttttataactccaggggtcctcctccgtactaagggcctatat
acactaacagcttgagtttaatctatctttgtatctgtggtccctggcag
atgtacacactctgaacatatgtgctgcatacaggcacaaatgatgggta
aatacaagtgagaaagcactctgcagctgaacaagggaatgcctcttttt
tttttttttttttctcacacttcagcttgtcctgggctagacactgctgg
gcctctcaaatggctgctttgtctcaggtccctagagaaccctttactcc
acccatacaaaatgccatgtgatcctgtgtgatgccaaaggcacctgaat
ggcttcagtgtcacaacaatgagcatccgttatcccaatagtagcagaga
acagatgcaaaagttaatagagttttctggatgacagaatgctaggtaaa
tgaatctatgcttcattatatatatagagagagattccaaaatgtggaga
gatgaagagaggtctgagctaagctgtgacagtcagaatctggggagcca
cacatcagagccaatctccctgatcactaccctgatcacaggaataagaa
ttcactgctcagcagtgacactcattccaaattgagataccaagagatgg
ccatacaaacacgcaattagcattccagaacacactaggggagtttcaaa
gagcctggcactgtcgtaccattacaaggagagaaatcttgtgccagcca
gcttctttcattatctagtggtgggtaataccctccacgaggtactggaa
gcgctcgacctcctatgcaccggagtctgttttctgctagagtctcccag
gactcctctgctttctgttttaaactctcgtctagatcttcccattttca
ttgtacaaggggtaattttttattatacacttattagttatattttatgg
aaaatgag
gaattcagtttctcttgtttgcaaggcaggcatcttactgagtgagcgat
ttgttcagtagttctggatgataggcaatgaagtcctggcccctggccct
ggtcctgaacacaataggtaaactgtatgcctatggttggtactgtgaca
tcaggagtggataatatgcactaattcattcagtgtgaggttgtaatgat
gatgaccaggtcctgtccaagagtctccagtggagccatagtaagcgacc
tgtgagagcctcatgtgccctaccaggtaggaaaagggcaatgctgggtg
gagacagagctaccaagagcagccgtgcttaaacatgctttctctgcact
gcagggcaaagagctttattcattcctcattatttttatgtgactaataa
attacaaataattctggtgcatcttcctaatagcaattagaataaacaaa
aggcatcacttcagctgcttggcaattaaggttctaatgactgcggtgga
ggcccgatgacggggatttggacaattcattagttggaagcataagcact
taaaacacaactaatgaagtatttagctaaattattcaaaacaaaacaaa
aaaaattaggcgggagggacagatgctacaaagaggccatattcttcaca
tccgagggaaaacgtgtcgagacgaatcttcttgaaggatgtgaacatag
taggcgagctgtttgcaagcctagctctgctataaagctttttcagctct
gtgaatatttccacatctccacacatgggtgtctattctcacttaagtag
agctattccagaaagttttttgtcttttgtaccagatgcatctcatggag
cccaatatccacaccgctttattgctaatagagttatttgcattatttgc
aaatttcgtttgctctctcttattaagttatgctcatgtgtgcatgccat
gaatgcatatgtggagtgtgggcaatcataggggcccagagagtttcttg
cccctccccttccctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_76052678_76053793
seq2: B6Ng01-323M01.b_46_1153 (reverse)

seq1  CTCATTTTTCATAAAAATATAAATTAATAAGTTGTATAAT-AAAAATTAC  49
      |||||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||
seq2  CTCATTTTCCAT-AAAATAT-AACTAATAAG-TGTATAATAAAAAATTAC  47

seq1  CCCTTGTAC-ATGAAAATGGGGAAGATTCTTAGAACGAGAGTTTTAAAAC  98
      ||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||||
seq2  CCCTTGTACAATGAAAAT-GGGAAGAT--CTAG-ACGAGAG-TTTAAAAC  92

seq1  AGAAAGCAGAGGAGTCCTGGGAGACTCTAGCAGAAAACAGACTCCGGTGC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCAGAGGAGTCCTGGGAGACTCTAGCAGAAAACAGACTCCGGTGC  142

seq1  ATAGGAAGGTCGAGCGCTTCCCAGTACCTCGTGGAGGGTATTACCCACCA  198
      ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGG-AGGTCGAGCGCTT-CCAGTACCTCGTGGAGGGTATTACCCACCA  190

seq1  CTAGATAATGAAAGAAGCTGGCTGGCACAAGATTTCTCTCCTTGTAATGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATAATGAAAGAAGCTGGCTGGCACAAGATTTCTCTCCTTGTAATGG  240

seq1  TACGACAGTGCCAGGCTCTTTGAAACTCCCCTAGTGTGTTCTGGAATGCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGACAGTGCCAGGCTCTTTGAAACTCCCCTAGTGTGTTCTGGAATGCT  290

seq1  AATTGCGTGTTTGTATGGCCATCTCTTGGTATCTCAATTTGGAATGAGTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCGTGTTTGTATGGCCATCTCTTGGTATCTCAATTTGGAATGAGTG  340

seq1  TCACTGCTGAGCAGTGAATTCTTATTCCTGTGATCAGGGTAGTGATCAGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCTGAGCAGTGAATTCTTATTCCTGTGATCAGGGTAGTGATCAGG  390

seq1  GAGATTGGCTCTGATGTGTGGCTCCCCAGATTCTGACTGTCACAGCTTAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTGGCTCTGATGTGTGGCTCCCCAGATTCTGACTGTCACAGCTTAG  440

seq1  CTCAGACCTCTCTTCATCTCTCCACATTTTGGAATCTCTCTCTATATATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGACCTCTCTTCATCTCTCCACATTTTGGAATCTCTCTCTATATATA  490

seq1  TAATGAAGCATAGATTCATTTACCTAGCATTCTGTCATCCAGAAAACTCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAAGCATAGATTCATTTACCTAGCATTCTGTCATCCAGAAAACTCT  540

seq1  ATTAACTTTTGCATCTGTTCTCTGCTACTATTGGGATAACGGATGCTCAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTTTTGCATCTGTTCTCTGCTACTATTGGGATAACGGATGCTCAT  590

seq1  TGTTGTGACACTGAAGCCATTCAGGTGCCTTTGGCATCACACAGGATCAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTGACACTGAAGCCATTCAGGTGCCTTTGGCATCACACAGGATCAC  640

seq1  ATGGCATTTTGTATGGGTGGAGTAAAGGGTTCTCTAGGGACCTGAGACAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATTTTGTATGGGTGGAGTAAAGGGTTCTCTAGGGACCTGAGACAA  690

seq1  AGCAGCCATTTGAGAGGCCCAGCAGTGTCTAGCCCAGGACAAGCTGAAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCATTTGAGAGGCCCAGCAGTGTCTAGCCCAGGACAAGCTGAAGT  740

seq1  GTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGCATTCCCTTGTTCAGCTGCAGAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGCATTCCCTTGTTCAGCTGCAGAG  790

seq1  TGCTTTCTCACTTGTATTTACCCATCATTTGTGCCTGTATGCAGCACATA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCTCACTTGTATTTACCCATCATTTGTGCCTGTATGCAGCACATA  840

seq1  TGTTCAGAGTGTGTACATCTGCCAGGGACCACAGATACAAAGATAGATTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGAGTGTGTACATCTGCCAGGGACCACAGATACAAAGATAGATTA  890

seq1  AACTCAAGCTGTTAGTGTATATAGGCCCTTAGTACGGAGGAGGACCCCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAAGCTGTTAGTGTATATAGGCCCTTAGTACGGAGGAGGACCCCTG  940

seq1  GAGTTATAAAACAGTGGTGATGAGTCACAGCTTGGTTTTGCTCACAGAGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTATAAAACAGTGGTGATGAGTCACAGCTTGGTTTTGCTCACAGAGC  990

seq1  ATAGGCACCTAAAACTGGCAGAGGGTTGTGAAAGGTGGGGCTTGGGGCTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCACCTAAAACTGGCAGAGGGTTGTGAAAGGTGGGGCTTGGGGCTT  1040

seq1  TTTGATGCACACAGTGATTCTATTTATTCCAAAGTTTCCAATGGGCAATT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGCACACAGTGATTCTATTTATTCCAAAGTTTCCAATGGGCAATT  1090

seq1  GAGAGGAACAGAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAACAGAGAATTC  1108

seq1: chr7_75973084_75974089
seq2: B6Ng01-323M01.g_63_1077

seq1  GAATTCAGTTTCTCTTGTTTGCAAGGCAGGCATCTTACTGAGTGAGCGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTCTCTTGTTTGCAAGGCAGGCATCTTACTGAGTGAGCGAT  50

seq1  TTGTTCAGTAGTTCTGGATGATAGGCAATGAAGTCCTGGCCCCTGGCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCAGTAGTTCTGGATGATAGGCAATGAAGTCCTGGCCCCTGGCCCT  100

seq1  GGTCCTGAACACAATAGGTAAACTGTATGCCTATGGTTGGTACTGTGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGAACACAATAGGTAAACTGTATGCCTATGGTTGGTACTGTGACA  150

seq1  TCAGGAGTGGATAATATGCACTAATTCATTCAGTGTGAGGTTGTAATGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGTGGATAATATGCACTAATTCATTCAGTGTGAGGTTGTAATGAT  200

seq1  GATGACCAGGTCCTGTCCAAGAGTCTCCAGTGGAGCCATAGTAAGCGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACCAGGTCCTGTCCAAGAGTCTCCAGTGGAGCCATAGTAAGCGACC  250

seq1  TGTGAGAGCCTCATGTGCCCTACCAGGTAGGAAAAGGGCAATGCTGGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAGCCTCATGTGCCCTACCAGGTAGGAAAAGGGCAATGCTGGGTG  300

seq1  GAGACAGAGCTACCAAGAGCAGCCGTGCTTAAACATGCTTTCTCTGCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGAGCTACCAAGAGCAGCCGTGCTTAAACATGCTTTCTCTGCACT  350

seq1  GCAGGGCAAAGAGCTTTATTCATTCCTCATTATTTTTATGTGACTAATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGCAAAGAGCTTTATTCATTCCTCATTATTTTTATGTGACTAATAA  400

seq1  ATTACAAATAATTCTGGTGCATCTTCCTAATAGCAATTAGAATAAACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAAATAATTCTGGTGCATCTTCCTAATAGCAATTAGAATAAACAAA  450

seq1  AGGCATCACTTCAGCTGCTTGGCAATTAAGGTTCTAATGACTGCGGTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCACTTCAGCTGCTTGGCAATTAAGGTTCTAATGACTGCGGTGGA  500

seq1  GGCCCGATGACGGGGATTTGGACAATTCATTAGTTGGAAGCATAAGCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCGATGACGGGGATTTGGACAATTCATTAGTTGGAAGCATAAGCACT  550

seq1  TAAAACACAACTAATGAAGTATTTAGCTAAATTATTCAAAACAAAACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACACAACTAATGAAGTATTTAGCTAAATTATTCAAAACAAAACAAA  600

seq1  AAAAATTAGGCGGGAGGGACAGATGCTACAAAGAGGCCATATTCTTCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAGGCGGGAGGGACAGATGCTACAAAGAGGCCATATTCTTCACA  650

seq1  TCCGAGGGAAAACGTGTCGAGACGAATCTTCTTGAAGGATGTGAACATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGGGAAAACGTGTCGAGACGAATCTTCTTGAAGGATGTGAACATAG  700

seq1  TAGGCGAGCTGTTTGCAAGCCTAGCTCTGCTATAAAGCTTTTTCAGCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCGAGCTGTTTGCAAGCCTAGCTCTGCTATAAAGCTTTTTCAGCTCT  750

seq1  GTGAATATTTCCACATCTCCACACATGGGTGTCTATTCTCACTTAAGTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATATTTCCACATCTCCACACATGGGTGTCTATTCTCACTTAAGTAG  800

seq1  AGCTATTCCAGAAAGTTTTTTGTCTTTTGTACCAGATGCATCTCATGGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTCCAGAAAGTTTTTTGTCTTTTGTACCAGATGCATCTCATGGAG  850

seq1  CCCAATATCCACACCGCTTTATTGCTAATAGAGTTATTTGCATTATTTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATATCCACACCGCTTTATTGCTAATAGAGTTATTTGCATTATTTGC  900

seq1  AAATTTCGTTTGCTCTCTCTTATTAAGTTATGCTCATGTGTGCATGCCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCGTTTGCTCTCTCTTATTAAGTTATGCTCATGTGTGCATGCCAT  950

seq1  GAATGCATATGT-GAGTGTGGGCAATCATAGGGGCC---AGAG-TTCT--  993
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||  
seq2  GAATGCATATGTGGAGTGTGGGCAATCATAGGGGCCCAGAGAGTTTCTTG  1000

seq1  GCCCTCCC--TCCCT  1006
       |||||||  |||||
seq2  CCCCTCCCCTTCCCT  1015