BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325O13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,212,222 - 151,335,422
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneR74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498
Downstream geneShank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325O13.bB6Ng01-325O13.g
ACCGA113848GA113849
length1,0731,052
definitionB6Ng01-325O13.b B6Ng01-325O13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,334,345 - 151,335,422)(151,212,222 - 151,213,272)
sequence
gaattcaatcaaaattctcatcagaaatcttatttggtgagaagcaggct
ttttagactgaaattggtgttaaaaaaatctgcaaataagcatcacagac
ttaattgcaccaagccggcctcctttccaagccagttaaccctctgtggc
tcagagccacagtgtgcaaacccagctcccatgctcacccggtaggtttg
ggatctgtgcagcctgtgttttgccatgtcctagcaggagaataatcaag
gctgcaagtggtctgcatgggggatgccatgtgtccttctatccaaaaag
acgagtttagctgaggcttactatgggccaggcccaggagatggtgtggc
aggggacaagccagatatggctcctgacctctaaggagggcaaagttagg
gtgtaagtaatcatagcagtaagtaggtagctggccccaagcatgaagct
gaggatctgggatgagccaggccctccaaatgggccaccactggtatgct
gctttgtcccctggaatgtccccaggagcctctaacctgctatgtatcaa
gagtcactggggctgggaatgcacagtctatcttcccctcacaggtgtca
tatggacactctgtctctggcagccagagttgtcaccatataaagatgag
ttgtgggatcccctcaattatcagaagcactacaggctaaactgtctctc
cctgaaaaacaaacaaacgaacaacccaaaaaccaaaccaaacccccaaa
tccctcctgtgttggagtcctcaccttcatgttttataatgtgactttat
ttatggaaaaggtcatcaaatgggttaaactgaggccctaatgtagtaca
aagggtggagatgcagccctatgagagaattagtggtgggggatgaagtc
accatccacagctaaggacaggcatacaaaggagctaccgtgccacactt
gtgtttctgacctccagaactaggaagctataagactccccaatttacgg
tactttgacttggcagtgcaagcagatctagtaagggggctgagcaagtc
gtcacctcaagtcacttactgaa
gaattcatcgtcagacctgagtcccctccacaagatggttcattatgtat
gtgcacatattttcaaactgcaagccgtctggcatccctggggatgcagg
attcttatcttgtgatactgtcacatcaggtttgaatacagacccttgtt
aactccacacgggtgaatgaggggctggtgagctggcttagcagttaaga
gcatgctcttccagaaaacagatttctgtccctgttgctcacagcctcct
ggaactccagctccagggactctgatgccctcttctggcctccacgggta
cctgcactcctgtggcatgtactcacacaggcacaagtgataaagataag
tctaaaaagaggatagtgcatgcatgaacaagtgaatgctaaaagttact
ttgaagccggtgcctaaccaagatggacagggagggctgagtccttcaac
cccaaaccttgggtgccttgctggatctttgtgtggctgagaagatgctg
atagaaatcatgaatgtgttcggctagtgaatacaggaaggctcactagt
cctgagatagcagattaattaattagttacttttgagacacaatctcact
atgtagaccaggctacctggaagttacagagatcaatctatgtctacttc
ccaaatgctgggattaaaagtgtgttctgccatgcctgccctgccctgag
attttaactgagtaccacatagagtaaatttttacttaacaaaaacttcc
tggctgtaaggggggtcattgctggggctgtgcctgcaggtggggctgga
caaaaagaaacagtgccaggtccattgggaagatcctactgaagaacttc
atggggaggggtgtcatcaggtgacctgggatttctgagggtctctgagg
accctgtggggcttctgggcgctaggaagaggggccactagcttctactc
tttgatgtcctaggtcaggatggatcccttacaattgggataaagccagg
tgtcttggggttttgttatgatatcctctgatcagtgggcacttcttttc
at
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151334345_151335422
seq2: B6Ng01-325O13.b_46_1118 (reverse)

seq1  TTCAGTAAGTGACTGGGGGTGGCGACCCTGCTCAAGCCCCCTTACCTAGA  50
      |||||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||||| |||||
seq2  TTCAGTAAGTGACTTGAGGTGACGA-CTTGCTC-AGCCCCCTTA-CTAGA  47

seq1  TCTGCTTGCACTGCCAAGTCAAAGTACCGTAAATTGGGGAGTCTTATAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTGCACTGCCAAGTCAAAGTACCGTAAATTGGGGAGTCTTATAGC  97

seq1  CTCCTAGTTCTGGAGGTCAGAAACACAAGTGTGGCACGGTGGCTCCTTTG  150
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTCCTAGTTCTGGAGGTCAGAAACACAAGTGTGGCACGGTAGCTCCTTTG  147

seq1  TATGCCTGTCCTTAGCTGTGGATGGTGACTTCATCCCCCACCACCTAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATGCCTGTCCTTAGCTGTGGATGGTGACTTCATCCCCCACCA-CTAATT  196

seq1  CTCTCATAGGGCCTGCATCTCCACCCTTTGTACTACATTAGGGCCTCAGT  250
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCATAGGG-CTGCATCTCCACCCTTTGTACTACATTAGGGCCTCAGT  245

seq1  TTAACCCATTTGATGACCTTTTCCATAAATAAAGTCACATTATAAAACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCCATTTGATGACCTTTTCCATAAATAAAGTCACATTATAAAACAT  295

seq1  GAAGGTGAGGACTCCAACACAGGAGGGATTTGGGGGTTTGGTTTGGTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTGAGGACTCCAACACAGGAGGGATTTGGGGGTTTGGTTTGGTTTT  345

seq1  TGGGTTGTTCGTTTGTTTGTTTTTCAGGGAGAGACAGTTTAGCCTGTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTGTTCGTTTGTTTGTTTTTCAGGGAGAGACAGTTTAGCCTGTAGT  395

seq1  GCTTCTGATAATTGAGGGGATCCCACAACTCATCTTTATATGGTGACAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGATAATTGAGGGGATCCCACAACTCATCTTTATATGGTGACAAC  445

seq1  TCTGGCTGCCAGAGACAGAGTGTCCATATGACACCTGTGAGGGGAAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTGCCAGAGACAGAGTGTCCATATGACACCTGTGAGGGGAAGATA  495

seq1  GACTGTGCATTCCCAGCCCCAGTGACTCTTGATACATAGCAGGTTAGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGCATTCCCAGCCCCAGTGACTCTTGATACATAGCAGGTTAGAGG  545

seq1  CTCCTGGGGACATTCCAGGGGACAAAGCAGCATACCAGTGGTGGCCCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGGGGACATTCCAGGGGACAAAGCAGCATACCAGTGGTGGCCCATT  595

seq1  TGGAGGGCCTGGCTCATCCCAGATCCTCAGCTTCATGCTTGGGGCCAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGGCCTGGCTCATCCCAGATCCTCAGCTTCATGCTTGGGGCCAGCT  645

seq1  ACCTACTTACTGCTATGATTACTTACACCCTAACTTTGCCCTCCTTAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTTACTGCTATGATTACTTACACCCTAACTTTGCCCTCCTTAGAG  695

seq1  GTCAGGAGCCATATCTGGCTTGTCCCCTGCCACACCATCTCCTGGGCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGAGCCATATCTGGCTTGTCCCCTGCCACACCATCTCCTGGGCCTG  745

seq1  GCCCATAGTAAGCCTCAGCTAAACTCGTCTTTTTGGATAGAAGGACACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATAGTAAGCCTCAGCTAAACTCGTCTTTTTGGATAGAAGGACACAT  795

seq1  GGCATCCCCCATGCAGACCACTTGCAGCCTTGATTATTCTCCTGCTAGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCCCCCATGCAGACCACTTGCAGCCTTGATTATTCTCCTGCTAGGA  845

seq1  CATGGCAAAACACAGGCTGCACAGATCCCAAACCTACCGGGTGAGCATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAAAACACAGGCTGCACAGATCCCAAACCTACCGGGTGAGCATGG  895

seq1  GAGCTGGGTTTGCACACTGTGGCTCTGAGCCACAGAGGGTTAACTGGCTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGGTTTGCACACTGTGGCTCTGAGCCACAGAGGGTTAACTGGCTT  945

seq1  GGAAAGGAGGCCGGCTTGGTGCAATTAAGTCTGTGATGCTTATTTGCAGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGAGGCCGGCTTGGTGCAATTAAGTCTGTGATGCTTATTTGCAGA  995

seq1  TTTTTTTAACACCAATTTCAGTCTAAAAAGCCTGCTTCTCACCAAATAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTAACACCAATTTCAGTCTAAAAAGCCTGCTTCTCACCAAATAAG  1045

seq1  ATTTCTGATGAGAATTTTGATTGAATTC  1078
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTGATGAGAATTTTGATTGAATTC  1073

seq1: chr7_151212222_151213272
seq2: B6Ng01-325O13.g_68_1119

seq1  GAATTCATCGTCAGACCTGAGTCCCCTCCACAAGATGGTTCATTATGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCGTCAGACCTGAGTCCCCTCCACAAGATGGTTCATTATGTAT  50

seq1  GTGCACATATTTTCAAACTGCAAGCCGTCTGGCATCCCTGGGGATGCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACATATTTTCAAACTGCAAGCCGTCTGGCATCCCTGGGGATGCAGG  100

seq1  ATTCTTATCTTGTGATACTGTCACATCAGGTTTGAATACAGACCCTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTATCTTGTGATACTGTCACATCAGGTTTGAATACAGACCCTTGTT  150

seq1  AACTCCACACGGGTGAATGAGGGGCTGGTGAGCTGGCTTAGCAGTTAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCACACGGGTGAATGAGGGGCTGGTGAGCTGGCTTAGCAGTTAAGA  200

seq1  GCATGCTCTTCCAGAAAACAGATTTCTGTCCCTGTTGCTCACAGCCTCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCTCTTCCAGAAAACAGATTTCTGTCCCTGTTGCTCACAGCCTCCT  250

seq1  GGAACTCCAGCTCCAGGGACTCTGATGCCCTCTTCTGGCCTCCACGGGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTCCAGCTCCAGGGACTCTGATGCCCTCTTCTGGCCTCCACGGGTA  300

seq1  CCTGCACTCCTGTGGCATGTACTCACACAGGCACAAGTGATAAAGATAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACTCCTGTGGCATGTACTCACACAGGCACAAGTGATAAAGATAAG  350

seq1  TCTAAAAAGAGGATAGTGCATGCATGAACAAGTGAATGCTAAAAGTTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAAGAGGATAGTGCATGCATGAACAAGTGAATGCTAAAAGTTACT  400

seq1  TTGAAGCCGGTGCCTAACCAAGATGGACAGGGAGGGCTGAGTCCTTCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCCGGTGCCTAACCAAGATGGACAGGGAGGGCTGAGTCCTTCAAC  450

seq1  CCCAAACCTTGGGTGCCTTGCTGGATCTTTGTGTGGCTGAGAAGATGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACCTTGGGTGCCTTGCTGGATCTTTGTGTGGCTGAGAAGATGCTG  500

seq1  ATAGAAATCATGAATGTGTTCGGCTAGTGAATACAGGAAGGCTCACTAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAATCATGAATGTGTTCGGCTAGTGAATACAGGAAGGCTCACTAGT  550

seq1  CCTGAGATAGCAGATTAATTAATTAGTTACTTTTGAGACACAATCTCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGATAGCAGATTAATTAATTAGTTACTTTTGAGACACAATCTCACT  600

seq1  ATGTAGACCAGGCTACCTGGAAGTTACAGAGATCAATCTATGTCTACTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGACCAGGCTACCTGGAAGTTACAGAGATCAATCTATGTCTACTTC  650

seq1  CCAAATGCTGGGATTAAAAGTGTGTTCTGCCATGCCTGCCCTGCCCTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATGCTGGGATTAAAAGTGTGTTCTGCCATGCCTGCCCTGCCCTGAG  700

seq1  ATTTTAACTGAGTACCACATAGAGTAAATTTTTACTTAAC-AAAACTTCC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ATTTTAACTGAGTACCACATAGAGTAAATTTTTACTTAACAAAAACTTCC  750

seq1  TGGCTGTAAGGGGGGTCATTGCTGGGGCTGTGCCTGCAGGTGGGGCTGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTAAGGGGGGTCATTGCTGGGGCTGTGCCTGCAGGTGGGGCTGGA  800

seq1  CAAAAAGAAACAGTGCCAGGTCCATTGGGAAGATCCTACTGAAGAACTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGAAACAGTGCCAGGTCCATTGGGAAGATCCTACTGAAGAACTTC  850

seq1  ATGGGGAGGGGTGTCATCAGGTGACCTGGGATTTCTGAGGGTCTCTGAGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAGGGGTGTCATCAGGTGACCTGGGATTTCTGAGGGTCTCTGAGG  900

seq1  ACCCTGTGGGGCTTCTGGGCGCTAGGAAGAGGGGCCACTAGCTTCTACTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTGGGGCTTCTGGGCGCTAGGAAGAGGGGCCACTAGCTTCTACTC  950

seq1  TTTGATGTCCTAGGTCAGGGATGGATCCCTTACAATTGGGATAAAGCCAG  999
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGTCCTAGGTCA-GGATGGATCCCTTACAATTGGGATAAAGCCAG  999

seq1  GTGTC-TGGGGTTTTGTTATGATAT-CTCTGGATCAGTGGGCACTTCTTT  1047
      ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTGGGGTTTTGTTATGATATCCTCT-GATCAGTGGGCACTTCTTT  1048

seq1  TCAT  1051
      ||||
seq2  TCAT  1052