BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-327G13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 90,595,123 - 90,769,427
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666160, Tmc3
Upstream geneAdamtsl3, 1700129I04Rik, Eftud1, LOC100038986, LOC619808, Rkhd3, LOC619909, A530021J07Rik
Downstream geneStard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik, Arnt2, LOC100039239, Fah, Zfand6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-327G13.bB6Ng01-327G13.g
ACCGA114965GA114966
length5941,051
definitionB6Ng01-327G13.b B6Ng01-327G13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,595,123 - 90,595,722)(90,768,371 - 90,769,427)
sequence
ttttgttttatttgagcaccatttcaacaggctgtggcagtgggttacca
tctcctctccccaactcttgtacattcaatgtccttaagtgaatgttttt
tctttttactgttgctttaccaaattgattctattatgtggtatgagaaa
gtggctttctttacctcagcttaatctactgccttaatttgggactcacc
agctcttctgatttctttttaacatgttgcatatttgactgtagtttgag
atacacttaggaagtaacctcccacgctatgtgttgatttgtcacttgag
ctgtgattattagtttacactatgtatactacagcttggttggggtcctt
ggaggaagccaacctgtcagggaagaatcccatgagatggcagaaaatta
acccaataagtcccaggtgaacaaacataaatgacctatctcaggcatgt
cacacatttttgcttcatattctacttgtgagaagccaattattttagct
aaaaattacacagcctctcttggtggaccatttcttataaaagttcagag
aaattctagggggtattttggttggttttttgtttgtttgtttg
gaattctgagttcaaggccagcctggtctaataaagtaagttccaggaca
gctagggctatacagagaaaccctgtctcgaaaaaaccaagtgggcaggg
ggaggaaaaagaaaaaaaataaacatttgcacataattaacttcaacccc
accgaagtcttttgtatgactattgtaaacaaacaaacaaacaaacaaca
acgacaagaacaatgagctgtgactgttaagcttgctctccagtgcactt
cagttttccttctgagcgtatctctctttcaattaaccctgctgcttaag
cccgaattaaaatgcctttactaacctcagctctacttcctaaactggct
agtcctgatcttcatccctggatgaatcagatccaagtttggtctgaatc
gtgtttgtaaaagtctcgggaaactccccaggctattgagggtgtcctgg
ggagctgtaccttctacttctgcaccctaaaatgctgacttgggacatct
tactttcccaggctacagaaatatgtatattaggctgtgaggaaggtgtg
cttatagatgatacgataatgtaggtttcaaagctcttgacctcccctcc
ccacaccactttcacattctcaggtccccgcactccctgccttcccactc
cttcagtgggcagtcctggaatttaaggacctcagcctcctaatggttct
ggtccaccactggcatctcattcaagaagcctgctttccttttgtgccag
agttcaccctcacctgttggtgtcctgctctggccttgacctagatccat
ctagaagaggagagcaggggtccctggacccttgtccaggactctgtggc
agggaccttgtgattgcctccatcctgaggctcttgctactcagagagtc
gaagttaagcatatgggccattgtttggggatgttgccatatacactgag
gacagctggctgataggtcgctgtcctttagaagcctcttgctgcttctc
atgagtctgatcagctgtgggtagaggaaagagcagttgacatgtcaggt
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_90595123_90595722
seq2: B6Ng01-327G13.b_43_642

seq1  GAATTCTTTTGTTTTATTTGAGCACCATTTCAACAGGCTGTGGCAGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTTTTATTTGAGCACCATTTCAACAGGCTGTGGCAGTGGG  50

seq1  TTACCATCTCCTCTCCCCAACTCTTGTACATTCAATGTCCTTAAGTGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCATCTCCTCTCCCCAACTCTTGTACATTCAATGTCCTTAAGTGAAT  100

seq1  GTTTTTTCTTTTTACTGTTGCTTTACCAAATTGATTCTATTATGTGGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTTCTTTTTACTGTTGCTTTACCAAATTGATTCTATTATGTGGTAT  150

seq1  GAGAAAGTGGCTTTCTTTACCTCAGCTTAATCTACTGCCTTAATTTGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGTGGCTTTCTTTACCTCAGCTTAATCTACTGCCTTAATTTGGGA  200

seq1  CTCACCAGCTCTTCTGATTTCTTTTTAACATGTTGCATATTTGACTGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCAGCTCTTCTGATTTCTTTTTAACATGTTGCATATTTGACTGTAG  250

seq1  TTTGAGATACACTTAGGAAGTAACCTCCCACGCTATGTGTTGATTTGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGATACACTTAGGAAGTAACCTCCCACGCTATGTGTTGATTTGTCA  300

seq1  CTTGAGCTGTGATTATTAGTTTACACTATGTATACTACAGCTTGGTTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGCTGTGATTATTAGTTTACACTATGTATACTACAGCTTGGTTGGG  350

seq1  GTCCTTGGAGGAAGCCAACCTGTCAGGGAAGAATCCCATGAGATGGCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGGAGGAAGCCAACCTGTCAGGGAAGAATCCCATGAGATGGCAGA  400

seq1  AAATTAACCCAATAAGTCCCAGGTGAACAAACATAAATGACCTATCTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAACCCAATAAGTCCCAGGTGAACAAACATAAATGACCTATCTCAG  450

seq1  GCATGTCACACATTTTTGCTTCATATTCTACTTGTGAGAAGCCAATTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTCACACATTTTTGCTTCATATTCTACTTGTGAGAAGCCAATTATT  500

seq1  TTAGCTAAAAATTACACAGCCTCTCTTGGTGGACCATTTCTTATAAAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTAAAAATTACACAGCCTCTCTTGGTGGACCATTTCTTATAAAAGT  550

seq1  TCAGAGAAATTCTAGGGGGTATTTTGGTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAAATTCTAGGGGGTATTTTGGTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTG  600

seq1: chr7_90768371_90769427
seq2: B6Ng01-327G13.g_66_1116 (reverse)

seq1  AACCTGGACATGTCACCTGCTCTTTCCTCTACCCACAGCTCGAATCCAGA  50
      ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||
seq2  AACCT-GACATGTCAACTGCTCTTTCCTCTACCCACAGCT-GA--TCAGA  46

seq1  CTCATGAGGAAAGCAGCAAGAGGCTTCTAAAGGACAGCGACCTTATCAGC  100
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTCATGAG--AAGCAGCAAGAGGCTTCTAAAGGACAGCGACC-TATCAGC  93

seq1  CAGCTGTCCTCAGTGTATATGGCAACATCCCCAAACAATGG-CCATATGC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGCTGTCCTCAGTGTATATGGCAACATCCCCAAACAATGGCCCATATGC  143

seq1  TTAACTTCGACTCTCTGAGTAGCAAGAGCCTCAGGATGGAGGCAATCACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTTCGACTCTCTGAGTAGCAAGAGCCTCAGGATGGAGGCAATCACA  193

seq1  AGGTCCCTGCCACAGAGTCCTGGACAAGGGTCCAGGGACCCCTGCTCTCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCCTGCCACAGAGTCCTGGACAAGGGTCCAGGGACCCCTGCTCTCC  243

seq1  TCTTCTAGATGGATCTAGGTCAAGGCCAGAGCAGGACACCAACAGGTGAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTAGATGGATCTAGGTCAAGGCCAGAGCAGGACACCAACAGGTGAG  293

seq1  GGTGAACTCTGGCACAAAAGGAAAGCAGGCTTCTTGAATGAGATGCCAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAACTCTGGCACAAAAGGAAAGCAGGCTTCTTGAATGAGATGCCAGT  343

seq1  GGTGGACCAGAACCATTAGGAGGCTGAGGTCCTTAAATTCCAGGACTGCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGACCAGAACCATTAGGAGGCTGAGGTCCTTAAATTCCAGGACTGCC  393

seq1  CACTGAAGGAGTGGGAAGGCAGGGAGTGCGGGGACCTGAGAATGTGAAAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAAGGAGTGGGAAGGCAGGGAGTGCGGGGACCTGAGAATGTGAAAG  443

seq1  TGGTGTGGGGAGGGGAGGTCAAGAGCTTTGAAACCTACATTATCGTATCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTGGGGAGGGGAGGTCAAGAGCTTTGAAACCTACATTATCGTATCA  493

seq1  TCTATAAGCACACCTTCCTCACAGCCTAATATACATATTTCTGTAGCCTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAAGCACACCTTCCTCACAGCCTAATATACATATTTCTGTAGCCTG  543

seq1  GGAAAGTAAGATGTCCCAAGTCAGCATTTTAGGGTGCAGAAGTAGAAGGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTAAGATGTCCCAAGTCAGCATTTTAGGGTGCAGAAGTAGAAGGT  593

seq1  ACAGCTCCCCAGGACACCCTCAATAGCCTGGGGAGTTTCCCGAGACTTTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTCCCCAGGACACCCTCAATAGCCTGGGGAGTTTCCCGAGACTTTT  643

seq1  ACAAACACGATTCAGACCAAACTTGGATCTGATTCATCCAGGGATGAAGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACGATTCAGACCAAACTTGGATCTGATTCATCCAGGGATGAAGA  693

seq1  TCAGGACTAGCCAGTTTAGGAAGTAGAGCTGAGGTTAGTAAAGGCATTTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGACTAGCCAGTTTAGGAAGTAGAGCTGAGGTTAGTAAAGGCATTTT  743

seq1  AATTCGGGCTTAAGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAGAGATACGCTCAGAAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCGGGCTTAAGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAGAGATACGCTCAGAAG  793

seq1  GAAAACTGAAGTGCACTGGAGAGCAAGCTTAACAGTCACAGCTCATTGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTGAAGTGCACTGGAGAGCAAGCTTAACAGTCACAGCTCATTGTT  843

seq1  CTTGTCGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTACAATAGTCATACAAAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTACAATAGTCATACAAAAG  893

seq1  ACTTCGGTGGGGTTGAAGTTAATTATGTGCAAATGTTTATTTTTTTTCTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCGGTGGGGTTGAAGTTAATTATGTGCAAATGTTTATTTTTTTTCTT  943

seq1  TTTCCTCCCCCTGCCCACTTGGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCCCCCTGCCCACTTGGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATA  993

seq1  GCCCTAGCTGTCCTGGAACTTACTTTATTAGACCAGGCTGGCCTTGAACT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTAGCTGTCCTGGAACTTACTTTATTAGACCAGGCTGGCCTTGAACT  1043

seq1  CAGAATTC  1057
      ||||||||
seq2  CAGAATTC  1051