BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328G11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 127,078,748 - 127,176,101
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDnahc3
Upstream geneIqck, Gprc5b, Gpr139, LOC100042871, Gp2, Umod, 1700007B13Rik, C730027J19Rik, Acsm2, Acsm1, BC048390, Thumpd1, EG434233, Acsm3, Exod1, 2610020H08Rik, Dcun1d3, LOC100043399, LOC100043396, Lyrm1
Downstream geneTmem159, Zp2, Anks4b, Crym, Abca14, Abca15, Abca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328G11.bB6Ng01-328G11.g
ACCGA115678GA115679
length1,0041,131
definitionB6Ng01-328G11.b B6Ng01-328G11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,078,748 - 127,079,746)(127,174,973 - 127,176,101)
sequence
gaattcttccatattgtggacttgtatttattgggtgatcagggtaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcaaccattcccactg
gaagacctcatgttgaaaatactcttctgccctccctactctcctcttcc
ttctttttgtaaatctactactgagccctcatgtccaactcttcttaaaa
cttctagaagttttccaggattgtctaacccctactctgagatgtaatca
tggtgttgcctttctgttttagaaatgtttctctttctgaaaatgtttaa
gaattcttactttgtgctcatggatgttctgcccacatgtatgtctatgc
accatgtgtgtccagtgccagaggaggccagaagaaggcattggatccct
ggaacaggagttacagacaggcattagccaccatgtgggtgctggaaaac
aaacccaggtcctttggaagtgagaatccattcaagcatcaaaggacccg
catgagaaggaaacttggttcagcatgacttagtgggtgctgcttcaaac
ttctctagtccgactccaggtcagtttattttagacatatttaaatccag
tacaatttggggggaaaaagtttcccattaacaacaatcccatgagcaca
ataaagcttcaggcgttaaaacgcttttgcagagtatatgtgacctctac
catgaagatgggttttataactatgggtctaagatctggtgtggtctggg
acagagatagcatggaggtcactgggctataaagtacacttggcatctcc
tctattgaccaaaagacaaagataaagataaaataaagataaagataaag
ataaagatgaagataaaggtgaagacaaagataaaattctaggaagggac
agtctgagagaaacattttagggtgttggagtgtggtctggctctacagg
tagcaaaggtcaccaggttattaacaacatcactcttagcttcaaggtag
aaac
gaattcaggaaggaaaggcactgggcaggaaggtcatgggatcttgggtt
ccttactctctctgtttcaaactcacatttcagaagtttgctcttagtcg
ttagcactaactacaaaggggtatggaattggctggaaatggcaacccag
tgggaatcccagtatggactaatgtattggaaccggttagcagaacactg
gtgtgtaagtgagatagtcacgtggtgcttaagcagaaaagtcagcaata
acaaaactcaaggtggtaccagaagagtccgtggacataggatagaccac
aaaggtcaagacacaggcaagcaaggccggggacgtggctatgagggaga
gggtttgactagcaagcaggctaggcctggggttccattcccaacactgc
aagaaaataaaaccaataaccccagtctaatagaggcaagtagattctct
tagccagtgcttggccacattcctttcaattcctagtattaggtccctgt
gttttgttaactttccaatgttgttaatgcttggatttttctttgctttt
gcaattttccttatagtacagattacagactattacttcaaagtattatt
ctttaagattctttaaaatttttcaatcatgtgttttcttttgattaaca
catattaattatagaatacaataggttttgttatattttcatacaagaat
atactatgtttatgaacaccttgtcttgttgttccaacaacctcttctga
gccctctcttcctaagtagtcccttttctacttaaatgtctaaattccac
acacaggagaaaacatggtatttgttctctctgaatctggtttacattgc
ataacatgatagtttccagttcctttaattttcctaccaataacaaaacc
ttattcttacttatggccaaataaaattctgttttgttatatataccaca
tatttttaatctactcatctattggtggacatcaaggctgatttctaact
atgttctataaatagtatcatggtaaacatgggatgtgcaaatatctctg
agcacatagactttcagtttccaatattgtacaaatgttaaattcctcta
ttccttccacaatagtccctgctagcatttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_127078748_127079746
seq2: B6Ng01-328G11.b_47_1042

seq1  GAATTCTTCCATATTGTGGACTTGTATTTATTGGGTGATCAGGGTAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GAATTCTTCCATATTGTGGACTTGTATTTATTGGGTGATCAGGGT-AAAA  49

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAACCATTCCCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAACCATTCCCACT  99

seq1  GGAAGACCTCATGTTGAAAATACTCTTCTGCCCTCCCTACTCTCCTCTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGACCTCATGTTGAAAATACTCTTCTGCCCTCCCTACTCTCCTCTTC  149

seq1  CTTCTTTTTGTAAATCTACTACTGAGCCCTCATGTCCAACTCTTCTTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTTTGTAAATCTACTACTGAGCCCTCATGTCCAACTCTTCTTAAA  199

seq1  ACTTCTAGAAGTTTTCCAGGATTGTCTAACCCCTACTCTGAGATGTAATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTAGAAGTTTTCCAGGATTGTCTAACCCCTACTCTGAGATGTAATC  249

seq1  ATGGTGTTGCCTTTCTGTTTTAGAAATGTTTCTCTTTCTGAAAATGTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGTTGCCTTTCTGTTTTAGAAATGTTTCTCTTTCTGAAAATGTTTA  299

seq1  AGAATTCTTACTTTGTGCTCATGGATGTTCTGCCCACATGTATGTCTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCTTACTTTGTGCTCATGGATGTTCTGCCCACATGTATGTCTATG  349

seq1  CACCATGTGTGTCCAGTGCCAGAGGAGGCCAGAAGAAGGCATTGGATCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGTGTGTCCAGTGCCAGAGGAGGCCAGAAGAAGGCATTGGATCCC  399

seq1  TGGAACAGGAGTTACAGACAGGCATTAGCCACCATGTGGGTGCTGGAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACAGGAGTTACAGACAGGCATTAGCCACCATGTGGGTGCTGGAAAA  449

seq1  CAAACCCAGGTCCTTTGGAAGTGAGAATCCATTCAAGCATCAAAGGACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCAGGTCCTTTGGAAGTGAGAATCCATTCAAGCATCAAAGGACCC  499

seq1  GCATGAGAAGGAAACTTGGTTCAGCATGACTTAGTGGGTGCTGCTTCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAGAAGGAAACTTGGTTCAGCATGACTTAGTGGGTGCTGCTTCAAA  549

seq1  CTTCTCTAGTCCGACTCCAGGTCAGTTTATTTTAGACATATTTAAATCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTAGTCCGACTCCAGGTCAGTTTATTTTAGACATATTTAAATCCA  599

seq1  GTACAATTTGGGGGGAAAAAGTTTCCCATTAACAACAATCCCATGAGCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATTTGGGGGGAAAAAGTTTCCCATTAACAACAATCCCATGAGCAC  649

seq1  AATAAAGCTTCAGGCGTTAAAACGCTTTTGCAGAGTATATGTGACCTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGCTTCAGGCGTTAAAACGCTTTTGCAGAGTATATGTGACCTCTA  699

seq1  CCATGAAGATGGGTTTTATAACTATGGGTCTAAGATCTGGTGTGGTCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAAGATGGGTTTTATAACTATGGGTCTAAGATCTGGTGTGGTCTGG  749

seq1  GACAGAGATAGCATGGAGGTCACTGGGCTATAAAGTACACTTGGCATCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGATAGCATGGAGGTCACTGGGCTATAAAGTACACTTGGCATCTC  799

seq1  CTCTATTGACCAAAAGACAAAGATAAAGATAAAATAAAGATAAAGATAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATTGACCAAAAGACAAAGATAAAGATAAAATAAAGATAAAGATAAA  849

seq1  GATAAAGATGAAGATAAAGGTGAAGACAAAGATAAAATTCTAGGAAGGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGATGAAGATAAAGGTGAAGACAAAGATAAAATTCTAGGAAGGGA  899

seq1  CAGTCTGAGAGAAACATTTTAGGGTGTTGGAGTGTGGTCTGGCTCTACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGAGAGAAACATTTTAGGGTGTTGGAGTGTGGTCTGGCTCTACAG  949

seq1  GTAGCAAAGGTCACCAGGTTATTAACAACATCCACTCTTAGCCTTCAGG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
seq2  GTAGCAAAGGTCACCAGGTTATTAACAACAT-CACTCTTAG-CTTCAAG  996

seq1: chr7_127174973_127176101
seq2: B6Ng01-328G11.g_65_1195 (reverse)

seq1  CAAATGCTAGCAGGGACTAATGTGGAAGG-ATAGGAGAATTTAACATTTG  49
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||
seq2  CAAATGCTAGCAGGGACTATTGTGGAAGGAATAGAGGAATTTAACATTTG  50

seq1  TACAATATTGG-AACTG-AAGTCTATGTGCCTCAGAGATATTTGCACAT-  96
      ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TACAATATTGGAAACTGAAAGTCTATGTG-CTCAGAGATATTTGCACATC  99

seq1  CCATGTTTACCATGATACTATTTATAGAACATAGTTAGAAATCAGCCTTG  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTTACCATGATACTATTTATAGAACATAGTTAGAAATCAGCCTTG  149

seq1  ATGTCCACCAATAGATGAGTAGATTAAAAAATATGTGGTATATATAACAA  196
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCACCAATAGATGAGTAGATT-AAAAATATGTGGTATATATAACAA  198

seq1  AACAGAATTTTATTTGGCCATAAGTAAGAATAAGGTTTTGTTATTGGTAG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAATTTTATTTGGCCATAAGTAAGAATAAGGTTTTGTTATTGGTAG  248

seq1  GAAAATTAAAGGAACTGGAAACTATCATGTTATGCAATGTAAACCAGATT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTAAAGGAACTGGAAACTATCATGTTATGCAATGTAAACCAGATT  298

seq1  CAGAGAGAACAAATACCATGTTTTCTCCTGTGTGTGGAATTTAGACATTT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGAACAAATACCATGTTTTCTCCTGTGTGTGGAATTTAGACATTT  348

seq1  AAGTAGAAAAGGGACTACTTAGGAAGAGAGGGCTCAGAAGAGGTTGTTGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGAAAAGGGACTACTTAGGAAGAGAGGGCTCAGAAGAGGTTGTTGG  398

seq1  AACAACAAGACAAGGTGTTCATAAACATAGTATATTCTTGTATGAAAATA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAAGACAAGGTGTTCATAAACATAGTATATTCTTGTATGAAAATA  448

seq1  TAACAAAACCTATTGTATTCTATAATTAATATGTGTTAATCAAAAGAAAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAAACCTATTGTATTCTATAATTAATATGTGTTAATCAAAAGAAAA  498

seq1  CACATGATTGAAAAATTTTAAAGAATCTTAAAGAATAATACTTTGAAGTA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGATTGAAAAATTTTAAAGAATCTTAAAGAATAATACTTTGAAGTA  548

seq1  ATAGTCTGTAATCTGTACTATAAGGAAAATTGCAAAAGCAAAGAAAAATC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTGTAATCTGTACTATAAGGAAAATTGCAAAAGCAAAGAAAAATC  598

seq1  CAAGCATTAACAACATTGGAAAGTTAACAAAACACAGGGACCTAATACTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATTAACAACATTGGAAAGTTAACAAAACACAGGGACCTAATACTA  648

seq1  GGAATTGAAAGGAATGTGGCCAAGCACTGGCTAAGAGAATCTACTTGCCT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGAAAGGAATGTGGCCAAGCACTGGCTAAGAGAATCTACTTGCCT  698

seq1  CTATTAGACTGGGGTTATTGGTTTTATTTTCTTGCAGTGTTGGGAATGGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAGACTGGGGTTATTGGTTTTATTTTCTTGCAGTGTTGGGAATGGA  748

seq1  ACCCCAGGCCTAGCCTGCTTGCTAGTCAAACCCTCTCCCTCATAGCCACG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAGGCCTAGCCTGCTTGCTAGTCAAACCCTCTCCCTCATAGCCACG  798

seq1  TCCCCGGCCTTGCTTGCCTGTGTCTTGACCTTTGTGGTCTATCCTATGTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCGGCCTTGCTTGCCTGTGTCTTGACCTTTGTGGTCTATCCTATGTC  848

seq1  CACGGACTCTTCTGGTACCACCTTGAGTTTTGTTATTGCTGACTTTTCTG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGACTCTTCTGGTACCACCTTGAGTTTTGTTATTGCTGACTTTTCTG  898

seq1  CTTAAGCACCACGTGACTATCTCACTTACACACCAGTGTTCTGCTAACCG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGCACCACGTGACTATCTCACTTACACACCAGTGTTCTGCTAACCG  948

seq1  GTTCCAATACATTAGTCCATACTGGGATTCCCACTGGGTTGCCATTTCCA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAATACATTAGTCCATACTGGGATTCCCACTGGGTTGCCATTTCCA  998

seq1  GCCAATTCCATACCCCTTTGTAGTTAGTGCTAACGACTAAGAGCAAACTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATTCCATACCCCTTTGTAGTTAGTGCTAACGACTAAGAGCAAACTT  1048

seq1  CTGAAATGTGAGTTTGAAACAGAGAGAGTAAGGAACCCAAGATCCCATGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATGTGAGTTTGAAACAGAGAGAGTAAGGAACCCAAGATCCCATGA  1098

seq1  CCTTCCTGCCCAGTGCCTTTCCTTCCTGAATTC  1129
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTGCCCAGTGCCTTTCCTTCCTGAATTC  1131