BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-331J24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 116,576,017 - 116,787,983
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStk33, 1700095J03Rik, Trim66, Rpl27a, St5
Upstream geneOlfr498, Olfr499-ps1, Olfr500-ps1, Olfr501-ps1, Olfr502, LOC269980, Olfr503, Olfr504, Olfr505-ps1, Olfr506, Olfr507, Olfr508, Olfr509, Olfr510, Olfr511-ps1, Olfr512, Olfr513, Olfr514, Olfr515-ps1, Olfr516, Olfr517, Olfr518, Olfr519, Nlrp10, Eif3s5, BC049265, Tub, Ric3, Lmo1, EG668320
Downstream geneLOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143, Wee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-331J24.bB6Ng01-331J24.g
ACCGA117941GA117942
length8741,076
definitionB6Ng01-331J24.b B6Ng01-331J24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,787,112 - 116,787,983)(116,576,017 - 116,577,096)
sequence
gaattctctctggtgacatggttgtcattaaagaaaagtggttataattt
tgaaatcaaattttactctgtgccagtaaaggactttaaaattattatta
ttatcataaatgttatgtgtatgagtgttttgcctgcatgtatgtctgtt
tgtcgtgcacatgcagtgctcatggaggccagaagaggatgttggttccc
actgactcatctctctagcccctagtaaaggactttttatttcagtttgc
atatttatctacatgagaagccttaacagaattataaaactggaatcaaa
ttttactcagtgtatttgtaaaacaattccagtcgtaagttcttggagat
cctagaacaggtaggctatgtagttgaactgccctggcctgtctgtgaca
ctcagtttccctgttatgttgcagaagtgttataaggtaaggtgtttgtg
acccagagacaatggacggcactttgctctatgcatttgaacacttgctc
agtagcgtgatgagcctgaacagtgcttgcgtagagcacattgaaccaaa
cccaggaggaagcctccagcgagctgattcagtaccacacaagagcacgg
ggcagttagatgagcaccttttccatactgtcacactttccagggtgaca
ctgtcagccttgcccttagagaaccccgagccacctaacactgttccagc
ttgcaagggggaagtgctgaattttaccactaagtagatgtgaggaggaa
cacaaaaggaactgagagcagccatagagatgtgatcagcatggtgaaga
acattgtaccacttttgatttgttgtggggaaaatgtattttagagcttt
tgtgtatatatgtgtgtgtgtgtg
gaattccatgaaaacattcaaaaatatgaactctctccacagaatctcag
gcagtaaagttccctaagactcatggaagtcatcctaagtaagacttgct
cacagcaaacaaactggagagaattcaagccagcctcaggaacctcacag
gtctcacagctaggtaggtgggaactgactaccacacaatgcccagcacc
tcaggggccaccagccttccagattcaatgcattttctgtagtgcttttg
ttatgaatctatgaactaatagttatgggttgagatgaccagttttcaca
ataactaccagctcatgttaaaatactgagctacaagcaaactttttgca
catgcaatgcaaatgtgaagacatagttcaatattctagaaacatcatta
gcacccatcaaacacttgttgaataaatatttataatagtttacattgct
ttctaaagagttcatgtccaaaaataagacaatagtaacaatttttgaga
caagtccaggctggcctcaaactttcaatcctcctgcctcggcttctcaa
gtgttgtgattacaggtgtgcagtaccacaccaaactttgttagcagtat
caaatctatcttcataagtagaaacacacaaaaaacttggagtttttttt
ttcttattttattcctaatttattactcatcctacctggaattcaaagtg
ataacatcaatggttttgttttggttttgttcattctctggtgattgtaa
gagcaatgttttccttctgatggtttcacacatgttcacttacgttcatt
tgccccacactcatcactttccctgtcctcctcagcctctcattggccct
gttccccctcccccccagtagtcttgcctctattgccatgtcaatatcag
tgattattttaaaaggtaattctatgtagtcttcaacacttagaaaggat
attttaattagttattaaaatttatactgtcactttaataaattgtcttt
aaaaacaacattgagcattaaacccacaaaagaacttagagttgttcatt
tcttatgcactgtaccatttaagtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_116787112_116787983
seq2: B6Ng01-331J24.b_52_925 (reverse)

seq1  CACACACACACACATATATACACAAAAGCTCTTAAATACATTTT-CCCAC  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  CACACACACACACATATATACACAAAAGCTCTAAAATACATTTTCCCCAC  50

seq1  AACAAATC-AAAGTGGTACAATGTTCTTCACCATGCTGATCACATCTCTA  98
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATCAAAAGTGGTACAATGTTCTTCACCATGCTGATCACATCTCTA  100

seq1  TGGCTGCTCTCAGTTCCTTTTGTGTTCCTCCTCACATCTACTTAGTGGTA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGCTCTCAGTTCCTTTTGTGTTCCTCCTCACATCTACTTAGTGGTA  150

seq1  AAATTCAGCACTTCCCCCTTGCAAGCTGGAACAGTGTTAGGTGGCTCGGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAGCACTTCCCCCTTGCAAGCTGGAACAGTGTTAGGTGGCTCGGG  200

seq1  GTTCTCTAAGGGCAAGGCTGACAGTGTCACCCTGGAAAGTGTGACAGTAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTCTAAGGGCAAGGCTGACAGTGTCACCCTGGAAAGTGTGACAGTAT  250

seq1  GGAAAAGGTGCTCATCTAACTGCCCCGTGCTCTTGTGTGGTACTGAATCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGGTGCTCATCTAACTGCCCCGTGCTCTTGTGTGGTACTGAATCA  300

seq1  GCTCGCTGGAGGCTTCCTCCTGGGTTTGGTTCAATGTGCTCTACGCAAGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGCTGGAGGCTTCCTCCTGGGTTTGGTTCAATGTGCTCTACGCAAGC  350

seq1  ACTGTTCAGGCTCATCACGCTACTGAGCAAGTGTTCAAATGCATAGAGCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTCAGGCTCATCACGCTACTGAGCAAGTGTTCAAATGCATAGAGCA  400

seq1  AAGTGCCGTCCATTGTCTCTGGGTCACAAACACCTTACCTTATAACACTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCGTCCATTGTCTCTGGGTCACAAACACCTTACCTTATAACACTT  450

seq1  CTGCAACATAACAGGGAAACTGAGTGTCACAGACAGGCCAGGGCAGTTCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAACATAACAGGGAAACTGAGTGTCACAGACAGGCCAGGGCAGTTCA  500

seq1  ACTACATAGCCTACCTGTTCTAGGATCTCCAAGAACTTACGACTGGAATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACATAGCCTACCTGTTCTAGGATCTCCAAGAACTTACGACTGGAATT  550

seq1  GTTTTACAAATACACTGAGTAAAATTTGATTCCAGTTTTATAATTCTGTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTACAAATACACTGAGTAAAATTTGATTCCAGTTTTATAATTCTGTT  600

seq1  AAGGCTTCTCATGTAGATAAATATGCAAACTGAAATAAAAAGTCCTTTAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTCTCATGTAGATAAATATGCAAACTGAAATAAAAAGTCCTTTAC  650

seq1  TAGGGGCTAGAGAGATGAGTCAGTGGGAACCAACATCCTCTTCTGGCCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGCTAGAGAGATGAGTCAGTGGGAACCAACATCCTCTTCTGGCCTC  700

seq1  CATGAGCACTGCATGTGCACGACAAACAGACATACATGCAGGCAAAACAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGCACTGCATGTGCACGACAAACAGACATACATGCAGGCAAAACAC  750

seq1  TCATACACATAACATTTATGATAATAATAATAATTTTAAAGTCCTTTACT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACACATAACATTTATGATAATAATAATAATTTTAAAGTCCTTTACT  800

seq1  GGCACAGAGTAAAATTTGATTTCAAAATTATAACCACTTTTCTTTAATGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGAGTAAAATTTGATTTCAAAATTATAACCACTTTTCTTTAATGA  850

seq1  CAACCATGTCACCAGAGAGAATTC  872
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATGTCACCAGAGAGAATTC  874

seq1: chr7_116576017_116577096
seq2: B6Ng01-331J24.g_68_1143

seq1  GAATTCCATGAAAACATTCAAAAATATGAACTCTCTCCACAGAATCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGAAAACATTCAAAAATATGAACTCTCTCCACAGAATCTCAG  50

seq1  GCAGTAAAGTTCCCTAAGACTCATGGAAGTCATCCTAAGTAAGACTTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTAAAGTTCCCTAAGACTCATGGAAGTCATCCTAAGTAAGACTTGCT  100

seq1  CACAGCAAACAAACTGGAGAGAATTCAAGCCAGCCTCAGGAACCTCACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAAACAAACTGGAGAGAATTCAAGCCAGCCTCAGGAACCTCACAG  150

seq1  GTCTCACAGCTAGGTAGGTGGGAACTGACTACCACACAATGCCCAGCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCACAGCTAGGTAGGTGGGAACTGACTACCACACAATGCCCAGCACC  200

seq1  TCAGGGGCCACCAGCCTTCCAGATTCAATGCATTTTCTGTAGTGCTTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGGCCACCAGCCTTCCAGATTCAATGCATTTTCTGTAGTGCTTTTG  250

seq1  TTATGAATCTATGAACTAATAGTTATGGGTTGAGATGACCAGTTTTCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAATCTATGAACTAATAGTTATGGGTTGAGATGACCAGTTTTCACA  300

seq1  ATAACTACCAGCTCATGTTAAAATACTGAGCTACAAGCAAACTTTTTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTACCAGCTCATGTTAAAATACTGAGCTACAAGCAAACTTTTTGCA  350

seq1  CATGCAATGCAAATGTGAAGACATAGTTCAATATTCTAGAAACATCATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAATGCAAATGTGAAGACATAGTTCAATATTCTAGAAACATCATTA  400

seq1  GCACCCATCAAACACTTGTTGAATAAATATTTATAATAGTTTACATTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCATCAAACACTTGTTGAATAAATATTTATAATAGTTTACATTGCT  450

seq1  TTCTAAAGAGTTCATGTCCAAAAATAAGACAATAGTAACAATTTTTGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAGAGTTCATGTCCAAAAATAAGACAATAGTAACAATTTTTGAGA  500

seq1  CAAGTCCAGGCTGGCCTCAAACTTTCAATCCTCCTGCCTCGGCTTCTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCAGGCTGGCCTCAAACTTTCAATCCTCCTGCCTCGGCTTCTCAA  550

seq1  GTGTTGTGATTACAGGTGTGCAGTACCACACCAAACTTTGTTAGCAGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGTGATTACAGGTGTGCAGTACCACACCAAACTTTGTTAGCAGTAT  600

seq1  CAAATCTATCTTCATAAGTAGAAACACACAAAAAACTTGGAGTTTTTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCTATCTTCATAAGTAGAAACACACAAAAAACTTGGAGTTTTTTTT  650

seq1  TTCTTATTTTATTCCTAATTTATTACTCATCCTACCTGGAATTCAAAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATTTTATTCCTAATTTATTACTCATCCTACCTGGAATTCAAAGTG  700

seq1  ATAACATCAATGGTTTTGTTTTGGTTTTGTTCATTCTCTGGTGATTGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATCAATGGTTTTGTTTTGGTTTTGTTCATTCTCTGGTGATTGTAA  750

seq1  GAGCAATGTTTTCCTTCTGATGGTTTCACACATGTTCACTTACGTTCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAATGTTTTCCTTCTGATGGTTTCACACATGTTCACTTACGTTCATT  800

seq1  TGCCCCACACTCATCACTTTCCCTGTCCTCCTCAGCCTCTCATTGGCCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCACACTCATCACTTTCCCTGTCCTCCTCAGCCTCTCATTGGCCCT  850

seq1  GTTCCCCCTCCCCCCCCAGTAGTCTTGCCTCTATTGCCATGTCAATATCA  900
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCCCT-CCCCCCCAGTAGTCTTGCCTCTATTGCCATGTCAATATCA  899

seq1  GTGATTATTTTAAAAGGTAATTCTATGTAGTCTTCAACACTTAGAAAGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTATTTTAAAAGGTAATTCTATGTAGTCTTCAACACTTAGAAAGGA  949

seq1  TATTTTAATTAGTTATTAAAATTATTACTGTCACTTT-ATAAA-TGTCTT  998
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||
seq2  TATTTTAATTAGTTATTAAAATTTATACTGTCACTTTAATAAATTGTCTT  999

seq1  TAAAAACAACATTGAGCCATTAAAACCCACAAA--GACTTAGGAGGTGGT  1046
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||   || ||
seq2  TAAAAACAACATTGAG-CATT-AAACCCACAAAAGAACTTAG--AGTTGT  1045

seq1  TCATTTCTTATGCACTGTACAATTTAGTTAGTAA  1080
      |||||||||||||||||||| |||||   |||||
seq2  TCATTTCTTATGCACTGTACCATTTA---AGTAA  1076