BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-333B08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 109,497,444 - 109,651,657
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStim1, Rrm1, Olfr543, Olfr544, Olfr545
Upstream geneCentd2, Pde2a, Art2a, EG630138, Art2b, Clpb, Phox2a, Inppl1, Folr2, Folr1, 3200002M19Rik, F930017I19Rik, 2400001E08Rik, Lrrc51, LOC667222, Numa1, Il18bp, Rnf121, Trpc2, Art5, Art1, Chrna10, Nup98, Frag1, Rhog
Downstream geneLOC667284, Olfr547, Olfr548-ps1, Olfr549, Trim21, LOC384699, Olfr550, Olfr551, Olfr552, Olfr553, Olfr554, LOC100040840, Olfr555, Olfr556, Trim68, Olfr557, Olfr558, Olfr33, Olfr559, Olfr78, Olfr560, Olfr561, Olfr562-ps1, Olfr563-ps1, Olfr564, Olfr565-ps1, Olfr566, GA_x5J8B7W5P47-379997-380552, Olfr567-ps1, Olfr568, Olfr569, Olfr570, Olfr571, Olfr572, Olfr573-ps1, Olfr574, Olfr575, Olfr576, Olfr577, Olfr578, Olfr1527-ps1, Olfr579-ps1, Olfr580-ps1, Olfr581-ps1, Olfr582, Olfr583, Olfr584, Olfr585, Olfr586, Olfr587-ps1, Olfr588-ps1, Olfr589, Olfr590-ps1, Olfr591, Olfr592, Olfr593, Olfr594, Olfr595-ps1, Usp17, Dub2a, LOC100041187, Olfr597, GA_x5J8B7TU1BB-380-666, Olfr598, Olfr599, Olfr600, Olfr601, Olfr602-ps1, Olfr604, Olfr596-ps1, Dub2, Olfr605, Olfr606, EG546989, Olfr608, Olfr609
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-333B08.bB6Ng01-333B08.g
ACCGA118996GA118997
length1,1881,080
definitionB6Ng01-333B08.b B6Ng01-333B08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,650,453 - 109,651,657)(109,497,444 - 109,498,536)
sequence
gaattcaagagaagaacttggaagcaggacctgaagcagagaccatggag
gaacactgcttactggttcactcccaggctcacattcagttgccttccct
gcacctcacaggaccatctgccaacggctggcattgcccagacttagtta
gacccttccacgtcaatcaacaaacaaacaaaaacaaaaaacatcacata
cacatgcctacaggccaatctgatgaagttttttttcctctctctctgag
ggtccctctctctagtttgtatctgattactaaagattaaatgatacacc
ccaccagaagagacagacagaggatttgacacacctgaccatctccactg
agagagatcaggggaggaaagcttaggacaggacactttggagacctaga
aggaggaaagagaagagggatggtggacacagggctgcccaaagtcctgg
ggtagagtaaggactactgagggattgacaagccaggtgggctgcccagt
gcccctctgcaatgatggtgcacagtggtggcgccagccactaaacccct
tctgctgaaagattcaggggactgtgacaaaggtcggcaaggaggcttcc
agagatggtggtacctgctgctcagcaccagccgggtgaggcttgggaag
aaagggcccgtcaggcagaggagtaggcatagcatgagcagggagcaggg
aggtttgctctccggaagagtggcagggggtaagccttgaatgcaagtca
agtgtctagacttgctggggttgatatcgagagcctctctcggcaggact
ttattaggtgctaaggggctggaaaatatgaagtggccggaagggcagac
ctgcaggagacctggagatgacctgcaggctgcaaaggaagctggaagta
agactggcagcatttggtacatggaaagagccaaggaacccagcacagcc
acggcagacttccagaaagacatggaaaagaaaagctggcaggcataggg
tagtaaaaggagcagcccggtgtgactgcactgccctgagatgctgtacc
cactttctgtctccttcccagctgactgacatgagacctcagaccctccc
cctgcactctgcagctcagcatctcacattctcatggacatgcatctgca
gagatctcccactctggaaaggatgctcacctgcctgg
gaattcctgcctcctgctgagaagaactgggtctcttcttggacacgagg
acatggtgttctaataagtgcaggaacatctctcaaattggctggattgt
acacatcccagtgacctgatctttctccttggtgactagacttgctatgt
ctttcactggggacctttcccctctcaacactaaatctgtatctatagtc
ttcatatctctagtcagtccactcatctactctgccttgctcatctccac
tttagtttccttgtaactttgtctctgaaacttctgtttcttgaccagat
ctgagagtcttcccagggttaatattctcagtctgaaacttttgatctct
ttctgagggcaagggtttatctcttcattcagttagccagccagcatttg
ctgatttttgcttgacatggagaatgttagcagtgatgacagactgaact
ctcgggaataaaatgagttaaacttggttcttgcccttttctggatgtgg
catgtgaacaacgcgggacatgaaaattcatacgctggaactatgtacaa
agtgctttgaagcatgggacagtgagcagtaaatgactaactctgccttg
gggagagaactttgaatttcctctggaatagtaagaatagtaagaggctg
cttatgtcttaaaggactcggctctctcattccatcatgtgagctccaga
tgtctaactctgaattccctcctgaaggttgaggagtgagactgaaagtc
tcttaaccttggcttggcctttctatgaccagctcccctcctgaatgctg
cttagaggttgcattaggatatgccaccagcagagaaagatacccttatc
attttgaaaaattacaaggattctaggagatatatgtctgaaaatagcaa
tggagattatatgtatgcacatatgtaaatacatgctgtgctcaagggac
ataataaagctctgctcatggagagactgatgtatctgagaaacgcacag
aaaggcatcagaaccctcggacatgggtataaaaagatgctctgagcacc
agggagtgctgaggtcaactcagtcctctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_109650453_109651657
seq2: B6Ng01-333B08.b_51_1238 (reverse)

seq1  CCAGGCAGGGTGAGCATCCTCTCTCAGA--TGGAGATCTTCCTGCAGATT  48
      ||||||| |||||||||||| || ||||   ||||||||  |||||||| 
seq2  CCAGGCA-GGTGAGCATCCTTTC-CAGAGTGGGAGATCT--CTGCAGAT-  45

seq1  GGCAATGTCCAATGAGATGGTGAGATGCTGAGGCTGCAGAGTGCAGGGGG  98
       || |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  -GC-ATGTCC-ATGAGAATGTGAGATGCTGA-GCTGCAGAGTGCAGGGGG  91

seq1  AGGGTCCTGAGGTCTCCATGTCAGGTCAGCTGGGAAGAGAACAGAAAGTG  148
      ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||
seq2  AGGGT-CTGAGGTCT-CATGTCA-GTCAGCTGGGAAGGAGACAGAAAGTG  138

seq1  GGTACAGGCATCTCCAGGGCAGTGCAGTCACACCGGGCCTGCTCCTTTTA  198
      |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGTACA-GCATCT-CAGGGCAGTGCAGTCACACCGGG-CTGCTCCTTTTA  185

seq1  CCTACCCTTATGCCTGCCAGCTTTTCTTTTCCATTGTCTTTCTTGGAAGT  248
       |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
seq2  -CTACCC-TATGCCTGCCAGCTTTTCTTTTCCA-TGTCTTTC-TGGAAGT  231

seq1  CTGCCGTGGCTGTGCTGGGTTCCTTGGCTCTTTCCATGTACCAAATGCTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCGTGGCTGTGCTGGGTTCCTTGGCTCTTTCCATGTACCAAATGCTG  281

seq1  CCAGTCTTACTTCCAGCTTCCTTTGCAGCCTGCAGGTCATCTCCAGGTCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCTTACTTCCAGCTTCCTTTGCAGCCTGCAGGTCATCTCCAGGTCT  331

seq1  CCTGCAGGTCTGCCCTTCCGGCCACTTCATATTTTCCAGCCCCTTAGCAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGGTCTGCCCTTCCGGCCACTTCATATTTTCCAGCCCCTTAGCAC  381

seq1  CTAATAAAGTCCTGCCGAGAGAGGCTCTCGATATCAACCCCAGCAAGTCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAAGTCCTGCCGAGAGAGGCTCTCGATATCAACCCCAGCAAGTCT  431

seq1  AGACACTTGACTTGCATTCAAGGCTTACCCCCTGCCACTCTTCCGGAGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTTGACTTGCATTCAAGGCTTACCCCCTGCCACTCTTCCGGAGAG  481

seq1  CAAACCTCCCTGCTCCCTGCTCATGCTATGCCTACTCCTCTGCCTGACGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCTCCCTGCTCCCTGCTCATGCTATGCCTACTCCTCTGCCTGACGG  531

seq1  GCCCTTTCTTCCCAAGCCTCACCCGGCTGGTGCTGAGCAGCAGGTACCAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTTCTTCCCAAGCCTCACCCGGCTGGTGCTGAGCAGCAGGTACCAC  581

seq1  CATCTCTGGAAGCCTCCTTGCCGACCTTTGTCACAGTCCCCTGAATCTTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTGGAAGCCTCCTTGCCGACCTTTGTCACAGTCCCCTGAATCTTT  631

seq1  CAGCAGAAGGGGTTTAGTGGCTGGCGCCACCACTGTGCACCATCATTGCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAAGGGGTTTAGTGGCTGGCGCCACCACTGTGCACCATCATTGCA  681

seq1  GAGGGGCACTGGGCAGCCCACCTGGCTTGTCAATCCCTCAGTAGTCCTTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGCACTGGGCAGCCCACCTGGCTTGTCAATCCCTCAGTAGTCCTTA  731

seq1  CTCTACCCCAGGACTTTGGGCAGCCCTGTGTCCACCATCCCTCTTCTCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCCCAGGACTTTGGGCAGCCCTGTGTCCACCATCCCTCTTCTCTT  781

seq1  TCCTCCTTCTAGGTCTCCAAAGTGTCCTGTCCTAAGCTTTCCTCCCCTGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTTCTAGGTCTCCAAAGTGTCCTGTCCTAAGCTTTCCTCCCCTGA  831

seq1  TCTCTCTCAGTGGAGATGGTCAGGTGTGTCAAATCCTCTGTCTGTCTCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCAGTGGAGATGGTCAGGTGTGTCAAATCCTCTGTCTGTCTCTT  881

seq1  CTGGTGGGGTGTATCATTTAATCTTTAGTAATCAGATACAAACTAGAGAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGGGGTGTATCATTTAATCTTTAGTAATCAGATACAAACTAGAGAG  931

seq1  AGGGACCCTCAGAGAGAGAGGAAAAAAAACTTCATCAGATTGGCCTGTAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACCCTCAGAGAGAGAGGAAAAAAAACTTCATCAGATTGGCCTGTAG  981

seq1  GCATGTGTATGTGATGTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTGATTGACGTGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTATGTGATGTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTGATTGACGTGG  1031

seq1  AAGGGTCTAACTAAGTCTGGGCAATGCCAGCCGTTGGCAGATGGTCCTGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCTAACTAAGTCTGGGCAATGCCAGCCGTTGGCAGATGGTCCTGT  1081

seq1  GAGGTGCAGGGAAGGCAACTGAATGTGAGCCTGGGAGTGAACCAGTAAGC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGCAGGGAAGGCAACTGAATGTGAGCCTGGGAGTGAACCAGTAAGC  1131

seq1  AGTGTTCCTCCATGGTCTCTGCTTCAGGTCCTGCTTCCAAGTTCTTCTCT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTCCTCCATGGTCTCTGCTTCAGGTCCTGCTTCCAAGTTCTTCTCT  1181

seq1  TGAATTC  1205
      |||||||
seq2  TGAATTC  1188

seq1: chr7_109497444_109498536
seq2: B6Ng01-333B08.g_69_1148

seq1  GAATTCCTGCCTCCTGCTGAGAAGAACTGGGTCTCTTCTTGGACACGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCCTCCTGCTGAGAAGAACTGGGTCTCTTCTTGGACACGAGG  50

seq1  ACATGGTGTTCTAATAAGTGCAGGAACATCTCTCAAATTGGCTGGATTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTGTTCTAATAAGTGCAGGAACATCTCTCAAATTGGCTGGATTGT  100

seq1  ACACATCCCAGTGACCTGATCTTTCTCCTTGGTGACTAGACTTGCTATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATCCCAGTGACCTGATCTTTCTCCTTGGTGACTAGACTTGCTATGT  150

seq1  CTTTCACTGGGGACCTTTCCCCTCTCAACACTAAATCTGTATCTATAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCACTGGGGACCTTTCCCCTCTCAACACTAAATCTGTATCTATAGTC  200

seq1  TTCATATCTCTAGTCAGTCCACTCATCTACTCTGCCTTGCTCATCTCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATATCTCTAGTCAGTCCACTCATCTACTCTGCCTTGCTCATCTCCAC  250

seq1  TTTAGTTTCCTTGTAACTTTGTCTCTGAAACTTCTGTTTCTTGACCAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTTCCTTGTAACTTTGTCTCTGAAACTTCTGTTTCTTGACCAGAT  300

seq1  CTGAGAGTCTTCCCAGGGTTAATATTCTCAGTCTGAAACTTTTGATCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGTCTTCCCAGGGTTAATATTCTCAGTCTGAAACTTTTGATCTCT  350

seq1  TTCTGAGGGCAAGGGTTTATCTCTTCATTCAGTTAGCCAGCCAGCATTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGGGCAAGGGTTTATCTCTTCATTCAGTTAGCCAGCCAGCATTTG  400

seq1  CTGATTTTTGCTTGACATGGAGAATGTTAGCAGTGATGACAGACTGAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTTTGCTTGACATGGAGAATGTTAGCAGTGATGACAGACTGAACT  450

seq1  CTCGGGAATAAAATGAGTTAAACTTGGTTCTTGCCCTTTTCTGGATGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGGGAATAAAATGAGTTAAACTTGGTTCTTGCCCTTTTCTGGATGTGG  500

seq1  CATGTGAACAACGCGGGACATGAAAATTCATACGCTGGAACTATGTACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGAACAACGCGGGACATGAAAATTCATACGCTGGAACTATGTACAA  550

seq1  AGTGCTTTGAAGCATGGGACAGTGAGCAGTAAATGACTAACTCTGCCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTTTGAAGCATGGGACAGTGAGCAGTAAATGACTAACTCTGCCTTG  600

seq1  GGGAGAGAACTTTGAATTTCCTCTGGAATAGTAAGAATAGTAAGAGGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAGAACTTTGAATTTCCTCTGGAATAGTAAGAATAGTAAGAGGCTG  650

seq1  CTTATGTCTTAAAGGACTCGGCTCTCTCATTCCATCATGTGAGCTCCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGTCTTAAAGGACTCGGCTCTCTCATTCCATCATGTGAGCTCCAGA  700

seq1  TGTCTAACTCTGAATTCCCTCCTGAAGGTTGAGGAGTGAGACTGAAAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAACTCTGAATTCCCTCCTGAAGGTTGAGGAGTGAGACTGAAAGTC  750

seq1  TCTTAACCTTGGCTTGGCCTTTCTATGACCAGCTCCCCTCCTG-ATGCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCTTAACCTTGGCTTGGCCTTTCTATGACCAGCTCCCCTCCTGAATGCTG  800

seq1  CTTAGAGGTTGCATTAGGATATGCCACCAGCAGAGAAAGATACCCTTATC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGGTTGCATTAGGATATGCCACCAGCAGAGAAAGATACCCTTATC  850

seq1  ATTTTGAAAAATTACAAGGATTCTAGGAGATATATGTCTGAAAATAGCAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAAAAATTACAAGGATTCTAGGAGATATATGTCTGAAAATAGCAA  900

seq1  TGGAGATTAATATGTATGCACATATGTAAATACATGCTGTGCTCAAGGGA  949
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATT-ATATGTATGCACATATGTAAATACATGCTGTGCTCAAGGGA  949

seq1  CATAATAAAGCTCTGCTTCATGGAGAAGACTGATGGTTATCTGAAGGAAA  999
      |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  ||||
seq2  CATAATAAAGCTCTGC-TCATGGAG-AGACTGATG--TATCTGA--GAAA  993

seq1  CGCACCAGAAAGGGCATCAGAACCCCTGGAACTGGAGTTAACAAATAGTT  1049
      |||| |||||| |||||||||||||  |||  |||   ||| ||   | |
seq2  CGCA-CAGAAA-GGCATCAGAACCCTCGGACATGGGTATAAAAAGATGCT  1041

seq1  CTTAGTACCCATGGAGGTGCTGAGAGTCAAACCTCAGTCCTCTG  1093
      || || | ||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||
seq2  CTGAGCA-CCAGGGA-GTGCTGAG-GTCAA--CTCAGTCCTCTG  1080