BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-335F15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 74,937,785 - 75,105,747
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665319, LOC100041771, Igf1r
Upstream geneLass3, Adamts17, Lysmd4, Mef2a, EG665304, Lrrc28, Ttc23, Dmn
Downstream geneC330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639, Arrdc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-335F15.bB6Ng01-335F15.g
ACCGA120610GA120611
length1,0561,074
definitionB6Ng01-335F15.b B6Ng01-335F15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,937,785 - 74,938,842)(75,104,676 - 75,105,747)
sequence
gaattctgtgaggagggaaaaagaactagatggatgtggaggtagagcaa
ggaagagagactcatccagtggggaagaaagagagatgcaggcaacccaa
acagcctaggcaaaggcttggcagacagatggagaaattgctctttcaat
gccagaatctgataggttgtggaaagagaggtgaggagacaggccctcct
cctaacccacagaaatgtggtccttaagtagagatgcatggatccctaag
gagcacccatgtcccgggcaggtcagccctccaccacctttcctggatgt
ttcgacaactctgctgtcgtttgataggaccccagcctctgaagttcagt
tagatcacaaggcttactttgggcagacgtgctaagctgccctccccagg
aaagggtacaacactaacaacactaacggtgagagctgccctcttctcct
ctctgccacagcaatggtcacgagggtgcaattctgtcaggagcaccagg
atgaccctagctagctctcggtcatctcgtgacataaggcagatagatat
aaaagcctgctgtttgcatccattgggagttgaggggttctgttgtactg
cggtccagcccattccgcagaataaacctattaaagctgcttcaggaaag
ccacacagaagcaggactgctgcctggttagctacactccctgcagggcc
ccacactccctgctgggacccacggagttcctttgactcctagcctctgt
cacttcctacagaggtgctgggtctcactcctgctttttttttcatcgag
aaaaatagcaatgactgtattcactgtgaaaattacataggttaattcat
ggaagaagcttggaaagttgccaggcacggagtaagtgctcaattaatat
tagctttattattaatattctccgaaaacaaacaacagttgggtgccgca
gttgcctggatccctccttaaggaaacatattatccagagaaaagtcccc
ttgcatctgcctggggagaaggtattgttgtcaatgtacgcaagctcaac
cgtact
gaattcatgccaagtcacagaaagagggcaaaagctggagtgggggatca
tcagagcccactcatgctgaactctggggatcaatgtggatcctgacagg
aggtctttatgaggatctactacagcccaatacgaggggccttggacttc
acattaagactggggactcgcctgcggtacacagcgaggaagcaggcttg
gtaagcaagcccagggatctttatggcacttagaagtatctcaaaggcca
gtaagtatgccctgtctactcaaagggttgggatgcaggtctggactgga
tgggggtggagccaggatggggcaaatctgcatgatttcaagtgactcag
tgaagttgagaggaaacattcaattaagcactctcttcagaaaagggcag
gaagcagagctgaggttaactagaccttccatcgcagccaatcttggtga
ctgaaaagctcactggtgagcgtgctagaagaaatggggagaatacagca
tccaaccaagaaaggccgctcttagcaacggaagtctctaggatccagct
cttctacattgtggctcaacagacatcacgaagccagtaacgccccaaag
tggacaccagaaccatcggcggggcgtccctgtgcgttccctcagtacag
tgatgcccagggagaactgtcggagagaatgaacaccgtaagacacagct
aggcatgatgaactggtgaagaattcactgactgtctaaacagagtggac
ggctagtgactcagaatggtcttgtcaatgtccagtcaaccggacagacg
gctgttacctgaaatctgcacaggtgctacttatttcttttcagctactt
atcaaaggttactaaaataattcaaattgggagaaaaatacctgtacact
aactcactgctatctaatatcatcaggcttctgtgccttacggtacgtgt
ctcatttactcgatctgacacactccccaattatcaacttattagataag
caaaatacctcaggacctttcaagtttctgatcttgtaaaacaattaagg
ctttcaatacctataaacatgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_74937785_74938842
seq2: B6Ng01-335F15.b_41_1096

seq1  GAATTCTGTGAGGAGGGAAAAAGAACTAGATGGATGTGGAGGTAGAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGAGGAGGGAAAAAGAACTAGATGGATGTGGAGGTAGAGCAA  50

seq1  GGAAGAGAGACTCAGCCAGTGGGGAAGAAAGAGAGATGCAGGCAACCCAA  100
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGAGACTCATCCAGTGGGGAAGAAAGAGAGATGCAGGCAACCCAA  100

seq1  ACAGCCTAGGCAAAGGCTTGGCAGACAGATGGAGAAATTGCTCTTTCAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCTAGGCAAAGGCTTGGCAGACAGATGGAGAAATTGCTCTTTCAAT  150

seq1  GCCAGAATCTGATAGGTTGTGGAAAGAGAGGTGAGGAGACAGGCCCTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAATCTGATAGGTTGTGGAAAGAGAGGTGAGGAGACAGGCCCTCCT  200

seq1  CCTAACCCACAGAAATGTGGTCCTTAAGTAGAGATGCATGGATCCCTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACCCACAGAAATGTGGTCCTTAAGTAGAGATGCATGGATCCCTAAG  250

seq1  GAGCACCCATGTCCCGGGCAGGTCAGCCCTCCACCACCTTTCCTGGATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACCCATGTCCCGGGCAGGTCAGCCCTCCACCACCTTTCCTGGATGT  300

seq1  TTCGACAACTCTGCTGTCGTTTGATAGGACCCCAGCCTCTGAAGTTCAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGACAACTCTGCTGTCGTTTGATAGGACCCCAGCCTCTGAAGTTCAGT  350

seq1  TAGATCACAAGGCTTACTTTGGGCAGACATGCTAAGCTGCCCTCCCCAGG  400
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCACAAGGCTTACTTTGGGCAGACGTGCTAAGCTGCCCTCCCCAGG  400

seq1  AAAGGGTACAACACTAACAACACTAACGGTGAGAGCTGCCCTCTTCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGTACAACACTAACAACACTAACGGTGAGAGCTGCCCTCTTCTCCT  450

seq1  CTCTGCCACAGCAATGGTCACGAGGGTGCAATTCTGTCAGGAGCACCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCACAGCAATGGTCACGAGGGTGCAATTCTGTCAGGAGCACCAGG  500

seq1  ATGACCCTAGCTAGCTCTCGGTCATCTCGTGACATAAGGCAGATAGATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCCTAGCTAGCTCTCGGTCATCTCGTGACATAAGGCAGATAGATAT  550

seq1  AAAAGCCTGCTGTTTGCATCCATTGGGAGTTGAGGGGTTCTGTTGTACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCTGCTGTTTGCATCCATTGGGAGTTGAGGGGTTCTGTTGTACTG  600

seq1  CGGTCCAGCCCATTCCGCAGAATAAACCTATTAAAGCTGCTTCAGGAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTCCAGCCCATTCCGCAGAATAAACCTATTAAAGCTGCTTCAGGAAAG  650

seq1  CCACACAGAAGCAGGACTGCTGCCTGGTTAGCTACACTCCCTGCAGGGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAGAAGCAGGACTGCTGCCTGGTTAGCTACACTCCCTGCAGGGCC  700

seq1  CCACACTCCCTGCTGGGACCCACGGAGTTCCTTTGACTCCTAGCCTCTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACTCCCTGCTGGGACCCACGGAGTTCCTTTGACTCCTAGCCTCTGT  750

seq1  CACTTCCTACAGAGGTGCTGGGTCTCACTCCTGC-TTTTTTTTCATCGAG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CACTTCCTACAGAGGTGCTGGGTCTCACTCCTGCTTTTTTTTTCATCGAG  800

seq1  AAAAATAGCAATGACTGTATTCACTGTGAAAATTACATAGGTTAATTCAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGCAATGACTGTATTCACTGTGAAAATTACATAGGTTAATTCAT  850

seq1  GGAAGAAGCTTGGAAAGTTGCCAGGCACGGAGTAAGTGCTCAATAAATAT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGAAGAAGCTTGGAAAGTTGCCAGGCACGGAGTAAGTGCTCAATTAATAT  900

seq1  TAGCTTTATTATTAATATTTCTCCGAAAACAAACAACAGTTGGGTGCCGC  949
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTATTATTAATA-TTCTCCGAAAACAAACAACAGTTGGGTGCCGC  949

seq1  AGGTGGCCTGGATCCCTCCTT-AGGAAACATATTATCCAGAGAAAAGTCC  998
      | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GTTGCCTGGATCCCTCCTTAAGGAAACATATTATCCAGAGAAAAGTCC  998

seq1  CCCTGCATCTGCCTTGGGGGAGAAGGGTATTG-TGTCAAGGGACGCAAGC  1047
      || |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||
seq2  CCTTGCATCTGCCT--GGGGAGAA-GGTATTGTTGTCAATGTACGCAAGC  1045

seq1  TCAAACGTACT  1058
      |||| ||||||
seq2  TCAACCGTACT  1056

seq1: chr7_75104676_75105747
seq2: B6Ng01-335F15.g_66_1139 (reverse)

seq1  ACACATGTTTTATGGTATTG-AAGCCTAAATTGTTTTAC-AGATCAG-AA  47
      ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||
seq2  ACACATGTTTATAGGTATTGAAAGCCTTAATTGTTTTACAAGATCAGAAA  50

seq1  CTTGAAAGTTCCTGAGGTATTTTGCTTATCT-ATAAGTTGATTATTGGGG  96
      |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||
seq2  CTTGAAAGGTCCTGAGGTATTTTGCTTATCTAATAAGTTGATAATT-GGG  99

seq1  GAGTGTGTCAGATCGAGTAAATGAGACACGTACCGTAAGGCACAGAAGCC  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGTCAGATCGAGTAAATGAGACACGTACCGTAAGGCACAGAAGCC  149

seq1  TGATGATATTAGATAGCAGTGAGTTAGTGTACAGGTATTTTTCTCCCAAT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATATTAGATAGCAGTGAGTTAGTGTACAGGTATTTTTCTCCCAAT  199

seq1  TTGAATTATTTTAGTAACCTTTGATAAGTAGCTG-AAAGAAATAAGTAGC  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTGAATTATTTTAGTAACCTTTGATAAGTAGCTGAAAAGAAATAAGTAGC  249

seq1  ACCTGTGCAGATTTCAGGTAACAGCCGTCTGTCCGGTTGACTGGACATTT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACCTGTGCAGATTTCAGGTAACAGCCGTCTGTCCGGTTGACTGGACA-TT  298

seq1  GACAAGACCATTCTGAGTCACTAGCCGTCCACTCTGTTTAGACAGTCAGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGACCATTCTGAGTCACTAGCCGTCCACTCTGTTTAGACAGTCAGT  348

seq1  GAATTCTTCACCAGTTCATCATGCCTAGCTGTGTCTTACGGTGTTCATTC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCACCAGTTCATCATGCCTAGCTGTGTCTTACGGTGTTCATTC  398

seq1  TCTCCGACAGTTCTCCCTGGGCATCACTGTACTGAGGGAACGCACAGGGA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCGACAGTTCTCCCTGGGCATCACTGTACTGAGGGAACGCACAGGGA  448

seq1  CGCCCCGCCGATGGTTCTGGTGTCCACTTTGGGGCGTTACTGGCTTCGTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCCGCCGATGGTTCTGGTGTCCACTTTGGGGCGTTACTGGCTTCGTG  498

seq1  ATGTCTGTTGAGCCACAATGTAGAAGAGCTGGATCCTAGAGACTTCCGTT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGTTGAGCCACAATGTAGAAGAGCTGGATCCTAGAGACTTCCGTT  548

seq1  GCTAAGAGCGGCCTTTCTTGGTTGGATGCTGTATTCTCCCCATTTCTTCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGAGCGGCCTTTCTTGGTTGGATGCTGTATTCTCCCCATTTCTTCT  598

seq1  AGCACGCTCACCAGTGAGCTTTTCAGTCACCAAGATTGGCTGCGATGGAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACGCTCACCAGTGAGCTTTTCAGTCACCAAGATTGGCTGCGATGGAA  648

seq1  GGTCTAGTTAACCTCAGCTCTGCTTCCTGCCCTTTTCTGAAGAGAGTGCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTAGTTAACCTCAGCTCTGCTTCCTGCCCTTTTCTGAAGAGAGTGCT  698

seq1  TAATTGAATGTTTCCTCTCAACTTCACTGAGTCACTTGAAATCATGCAGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGAATGTTTCCTCTCAACTTCACTGAGTCACTTGAAATCATGCAGA  748

seq1  TTTGCCCCATCCTGGCTCCACCCCCATCCAGTCCAGACCTGCATCCCAAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCCCATCCTGGCTCCACCCCCATCCAGTCCAGACCTGCATCCCAAC  798

seq1  CCTTTGAGTAGACAGGGCATACTTACTGGCCTTTGAGATACTTCTAAGTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGAGTAGACAGGGCATACTTACTGGCCTTTGAGATACTTCTAAGTG  848

seq1  CCATAAAGATCCCTGGGCTTGCTTACCAAGCCTGCTTCCTCGCTGTGTAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAAGATCCCTGGGCTTGCTTACCAAGCCTGCTTCCTCGCTGTGTAC  898

seq1  CGCAGGCGAGTCCCCAGTCTTAATGTGAAGTCCAAGGCCCCTCGTATTGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGGCGAGTCCCCAGTCTTAATGTGAAGTCCAAGGCCCCTCGTATTGG  948

seq1  GCTGTAGTAGATCCTCATAAAGACCTCGCTGTCAGGATCCACATTGATCC  995
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAGTAGATCCTCATAAAGACCTC-CTGTCAGGATCCACATTGATCC  997

seq1  CCAGAGTTCTGCATGAGTGGGCTCTGATGATCCCCCACTCCAGCTTTTGC  1045
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTTCAGCATGAGTGGGCTCTGATGATCCCCCACTCCAGCTTTTGC  1047

seq1  CCTCTTTCTGTGACTTGGCATGAATTC  1072
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTTCTGTGACTTGGCATGAATTC  1074