BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-342G09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 33,332,211 - 33,443,070
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668398, EG384596, LOC100043370, LOC434161
Upstream geneLOC546947, LOC677233, LOC100043337, LOC546949, LOC100043836, EG626305, EG668342, EG626330, LOC100043340, LOC100043343, EG626358, LOC668351, EG384593, LOC100043351, LOC100043352, LOC100043353, EG384594, LOC100043838, EG668361, LOC668362, EG624584, LOC100043355, LOC546951, EG626740, EG668371, EG668377, LOC100043842, LOC634929, EG668379, EG668381, LOC668386, LOC626373, EG384589, EG668393, EG330689, LOC100043362, LOC100043365, EG384591
Downstream geneEG270499, LOC100043845, LOC100043373, LOC668410, EG624439, LOC100043376, LOC100043379, LOC100043383, EG668411, LOC100043850, LOC100043386, LOC668416, EG668526, LOC100043388, LOC270234, EG668419, EG668422, EG546954, LOC100043856, LOC100043857, EG545947, EG434676, EG668431, Abpd, EG545948, LOC435963, LOC435962, EG626970, LOC100043859, LOC627004, LOC100043398, LOC100043401, Scgb2b1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-342G09.bB6Ng01-342G09.g
ACCGA125496GA125497
length1,1851,172
definitionB6Ng01-342G09.b B6Ng01-342G09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,332,211 - 33,333,407)(33,441,886 - 33,443,070)
sequence
gaattcagtaattctcttatttacccatgaacttattatctactagccta
agtgcagatctccacattccacccagggtcaccacaacagtatgtggaat
attcacaggtatagggtcctgcctcacagtcacctgcttcgcagtccctg
ttacctacctcccattcacctgtctcagagtcacctacctcacaggccct
gtcacctgccctgcttaacagtcaccttcctcacagttagttccctgcct
cagactcactgtcatctacctcacagttaccttcatcacaatccctgtca
gctgcctcacagtcgcctgccatacagttagtcacctgcctcagactcac
tgtcatctacctcacaattatcttcatcacagttcctgtcacttgcctca
catttagtcacattcctcccatttagtcaccctcctcacagttatttacc
tgcctcccagtcagtcacctgcatcattgccaccaacctttatgactgtt
ctgattcatatccaacccaatgtgtgtctcttggcagccctggtctcttg
ccaaacattgttctaacacatttacatgacaaaacatcatctttctttgt
gacagccatctcattttgagagataagtcccgtgttattaagcggaccaa
ccccttccttacaattagcaccactgccacaatcctctgaatgtttcctt
ccctaagaataaccaacttatacttccatcctcatatacatcaccaaaat
acctagttggtcttcatttggaatcttgttcctgaatttttccagacttg
tgtccagacatacactcaaggccttcaacacacttctctaggacatctca
gattcaacaaagctccaaacctccttcttaacattccctatgaaaaatta
tgcaactgatctgtccacatcagcagacaacattttcttctgtttagcta
tagacatcaaaagcctcagtggccttgtgtccctctttgctctaatccca
ttggactctcccagacaaacataagatattcttttttctgtgcctgaaat
cacatgatgatccttcagagcctggactttgtcttcactgcactgtccag
aagctactggtttagctattctctgctctccacctcttatggcagtgaat
atggtctgttccactctgtcacctaatagtggtgg
gaattcttgttcttagacacctggagggaagggctatagcttgctgcatc
tgtatgggtgagcaggcaaatggtttccttgagagtaaagttgtagccat
cgacatagcagcctgtcttctattttttcctgcaaacagaaggcaaagtg
agtctttgggggtgaagcagacctaatgccacactgatcattcactgaga
cacctcctagaaagacctgcagccaattagcaattgcttttatatctgac
caggaccagggagccttttccccaacctgttgagacaagctctgtaaaga
gccccaaatccagccagatgggagaagccaccttgggagacaacatagtc
ccagtgggtctgaatggggaggagcggacagagacccatgtgagactctg
ggcagctggggccccacaagcaaactgactcctgtcacatgttgatgatg
accctcaaatatcttcagctaaaggcagggctgtaacatacctgctctag
ggacatgagggggttcactttaattctacccttgaatattcacatgtgga
ctccacaacgtggtcttcaaagttcagagaacaggataacatatgacttt
tttggagctggagtgatagccttgaaaattgaagataaaagacctaggct
agagaagggtgccaggtgccaagcttctgcagctagacttggaaggctgt
gtcaggaagtctgagggaggccaaactcaggcagggtttctatggtggct
ttgctgagctgagcagccagggccagctcagcagtcctagagctccttcc
tgccccatccttctgacattctcaatcaggattgtcacatatctggattc
tcagtgaagcttcagtggtgtgcaagagcacaagcctagcccttaccaga
catatagagactcaggatgaaagcagttgcatgtgccttgtctttctctg
tcaatgtgctatcacacattgcttgattttttcagtattttccagtattt
caggtcatttttgtattgttcacgtactcacatacttcttctgaagttca
tttaaaagagacaacaatctctttttatagctgggcaatgcacaatctga
accaaaagaacaaggtgaccctcacttggatgactgcatcagtaatccaa
ggaatagagggttggagcctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_33332211_33333407
seq2: B6Ng01-342G09.b_47_1231

seq1  GAATTCAGTAATTCTCTTATTTACCCATGAACTTATTATCTACTAGCCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTAATTCTCTTATTTACCCATGAACTTATTATCTACTAGCCTA  50

seq1  AGTGCAGATCTCCACATTCCACCCAGGGTCACCACAACAGTATGTGGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCAGATCTCCACATTCCACCCAGGGTCACCACAACAGTATGTGGAAT  100

seq1  ATTCACAGGTATAGGGTCCTGCCTCACAGTCACCTGCTTCGCAGTCCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACAGGTATAGGGTCCTGCCTCACAGTCACCTGCTTCGCAGTCCCTG  150

seq1  TTACCTACCTCCCATTCACCTGTCTCAGAGTCACCTACCTCACAGGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTACCTCCCATTCACCTGTCTCAGAGTCACCTACCTCACAGGCCCT  200

seq1  GTCACCTGCCCTGCTTAACAGTCACCTTCCTCACAGTTAGTTCCCTGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTGCCCTGCTTAACAGTCACCTTCCTCACAGTTAGTTCCCTGCCT  250

seq1  CAGACTCACTGTCATCTACCTCACAGTTACCTTCATCACAATCCCTGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCACTGTCATCTACCTCACAGTTACCTTCATCACAATCCCTGTCA  300

seq1  GCTGCCTCACAGTCGCCTGCCATACAGTTAGTCACCTGCCTCAGACTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCTCACAGTCGCCTGCCATACAGTTAGTCACCTGCCTCAGACTCAC  350

seq1  TGTCATCTACCTCACAATTATCTTCATCACAGTTCCTGTCACTTGCCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATCTACCTCACAATTATCTTCATCACAGTTCCTGTCACTTGCCTCA  400

seq1  CATTTAGTCACATTCCTCCCATTTAGTCACCCTCCTCACAGTTATTTACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAGTCACATTCCTCCCATTTAGTCACCCTCCTCACAGTTATTTACC  450

seq1  TGCCTCCCAGTCAGTCACCTGCATCATTGCCACCAACCTTTATGACTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCCAGTCAGTCACCTGCATCATTGCCACCAACCTTTATGACTGTT  500

seq1  CTGATTCATATCCAACCCAATGTGTGTCTCTTGGCAGCCCTGGTCTCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTCATATCCAACCCAATGTGTGTCTCTTGGCAGCCCTGGTCTCTTG  550

seq1  CCAAACATTGTTCTAACACATTTACATGACAAAACATCATCTTTCTTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACATTGTTCTAACACATTTACATGACAAAACATCATCTTTCTTTGT  600

seq1  GACAGCCATCTCATTTTGAGAGATAAGTCCCGTGTTATTAAGCGGACCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCCATCTCATTTTGAGAGATAAGTCCCGTGTTATTAAGCGGACCAA  650

seq1  CCCCTTCCTTACAATTAGCACCACTGCCACAATCCTCTGAATGTTTCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTCCTTACAATTAGCACCACTGCCACAATCCTCTGAATGTTTCCTT  700

seq1  CCCTAAGAATAACCAACTTATACTTCCATCCTCATATACATCACCAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAAGAATAACCAACTTATACTTCCATCCTCATATACATCACCAAAAT  750

seq1  ACCTAGTTGGTCTTCATTTGGAATCTTGTTCCTGAATTTTTCCAGACTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGTTGGTCTTCATTTGGAATCTTGTTCCTGAATTTTTCCAGACTTG  800

seq1  TGTCCAGACATACACTCAAGGCCTTCAACACACTTCTCTAGGACATCTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAGACATACACTCAAGGCCTTCAACACACTTCTCTAGGACATCTCA  850

seq1  GATTCAACAAAGCTCCAAACCTCCTTCTTAACATTCCTTATGAAAAATTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GATTCAACAAAGCTCCAAACCTCCTTCTTAACATTCCCTATGAAAAATTA  900

seq1  TGCAACTGATCTGTCCATATCAGCAGACAACATTTTCTTCTGTTTAGCTA  950
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTGATCTGTCCACATCAGCAGACAACATTTTCTTCTGTTTAGCTA  950

seq1  TAGACATCAAAAGCCTCAGGTGGCCTTGTGTCCCCTCTTTGCCTCTAATC  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TAGACATCAAAAGCCTCA-GTGGCCTTGTGT-CCCTCTTTG-CTCTAATC  997

seq1  CCATTGGACTCTCCCAGACAAACATAAGATATTCCTTTTTTCTGTGCCTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCATTGGACTCTCCCAGACAAACATAAGATATT-CTTTTTTCTGTGCCTG  1046

seq1  AAATCACAATGATGATCCCTCCAGAGCCCTGGACTTTGGCCTTCACTGGC  1100
      ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||
seq2  AAATCAC-ATGATGAT-CCTTCAGAG-CCTGGACTTT-GTCTTCACT-GC  1091

seq1  ACTGTCCCAGAAGCTACTGTTTTAAGCCTATCTTCTGCTCTCCA-CTCCT  1149
      ||||| ||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| ||| |
seq2  ACTGT-CCAGAAGCTACTGGTTTA--GCTATTCTCTGCTCTCCACCTCTT  1138

seq1  ATGCCAGTGAAAATGTGCTGCTTCCACTCTGTTCACCT-ATAGTGGTGG  1197
      ||| ||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  ATGGCAGTGAATATGGTCTG-TTCCACTCTG-TCACCTAATAGTGGTGG  1185

seq1: chr7_33441886_33443070
seq2: B6Ng01-342G09.g_68_1239 (reverse)

seq1  TTAGGCTCTCACACCCTCTATCCCCTGGGATATACTGATGCAGGTCATTC  50
      |||||||| || |||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||| |
seq2  TTAGGCTC-CA-ACCCTCTAT-TCCTTGGAT-TACTGATGCA-GTCATCC  45

seq1  AAGTGAGGGTCACCTTGTCTTTGTGTTCCAGATTGTGGCATTTGCCCAGC  100
      ||||||||||||||||||  || || | |||||||| ||| |||||||||
seq2  AAGTGAGGGTCACCTTGTTCTTTTGGTTCAGATTGT-GCA-TTGCCCAGC  93

seq1  TATAAAAGAGGATGTTTGTCTCTTTTTAAATGGAACCTCAGAAG-AGTAT  149
      |||||||   |||  ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||
seq2  TATAAAAAGAGATTGTTGTCTC-TTTTAAAT-GAACTTCAGAAGAAGTAT  141

seq1  GTTGAGTACGTGAAACAATACAAAAATGACCCTGAAATACTGGAAAATAC  199
      | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  G-TGAGTACGTG-AACAATACAAAAATGA-CCTGAAATACTGGAAAATAC  188

seq1  TGAAAAAATCAAGCAATGTGTTGATAGCACATTGACAGAGAAAGACAAGG  249
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAAATCAAGCAATGTG-TGATAGCACATTGACAGAGAAAGACAAGG  237

seq1  CACATGCAACTGCTTTCATCCTGAGTCTCTATATGTCTGGTTAGGGGCTA  299
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
seq2  CACATGCAACTGCTTTCATCCTGAGTCTCTATATGTCTGG-TAAGGGCTA  286

seq1  TGCTTGTGCTCTTGCACACCACTGAAGCTTCACTGAGAATCCAGATATGT  349
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTGCTCTTGCACACCACTGAAGCTTCACTGAGAATCCAGATATGT  336

seq1  GACAATCCTGATTGAGAATGTCAGAAGGATGGGGCAGGAAGGAGCTCTAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATCCTGATTGAGAATGTCAGAAGGATGGGGCAGGAAGGAGCTCTAG  386

seq1  GACTGCCTGAGCTGGCCCTGGCTGCTCAGCTCAGCAAAGCCACCATAG-A  448
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GACTG-CTGAGCTGGCCCTGGCTGCTCAGCTCAGCAAAGCCACCATAGAA  435

seq1  ACCCTGCCTGAGTTTGGCCTCCCTCAGACTTCCTGACACAGCCTTCCAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGCCTGAGTTTGGCCTCCCTCAGACTTCCTGACACAGCCTTCCAAG  485

seq1  TCTAGCTGCAGAAGCTTGGCACCTGGCACCCTTCTCTAGCCTAGGTCTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCTGCAGAAGCTTGGCACCTGGCACCCTTCTCTAGCCTAGGTCTTT  535

seq1  TATCTTCAATTTTCAAGGCTATCACTCCAGCTCCAAAAAAGTCATATGTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCAATTTTCAAGGCTATCACTCCAGCTCCAAAAAAGTCATATGTT  585

seq1  ATCCTGTTCTCTGAACTTTGAAGACCACGTTGTGGAGTCCACATGTGAAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTTCTCTGAACTTTGAAGACCACGTTGTGGAGTCCACATGTGAAT  635

seq1  ATTCAAGGGTAGAATTAAAGTGAACCCCCTCATGTCCCTAGAGCAGGTAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGGGTAGAATTAAAGTGAACCCCCTCATGTCCCTAGAGCAGGTAT  685

seq1  GTTACAGCCCTGCCTTTAGCTGAAGATATTTGAGGGTCATCATCAACATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGCCCTGCCTTTAGCTGAAGATATTTGAGGGTCATCATCAACATG  735

seq1  TGACAGGAGTCAGTTTGCTTGTGGGGCCCCAGCTGCCCAGAGGCTCACAT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGACAGGAGTCAGTTTGCTTGTGGGGCCCCAGCTGCCCAGAGTCTCACAT  785

seq1  GGGTCTCTGTCTGCTCCTCCCCATTCAGACCCACTGGGACTATGTTGTCT  848
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTCTGTCCGCTCCTCCCCATTCAGACCCACTGGGACTATGTTGTCT  835

seq1  CCCAAGGTGGCTTCTCCCATCTGGCTGGATTTGGGGCTCTTTACAGAGCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGGTGGCTTCTCCCATCTGGCTGGATTTGGGGCTCTTTACAGAGCT  885

seq1  TGTCTCAACAGGTTGGGGAAAAGGCTCCCTGGTCCTGGTCAGATATAAGA  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTCTCAACAGGTTGGGGAAAAGGCTCCCTGGTCCTGGTCAGATATAAAA  935

seq1  GCAATTGCAAATTGGCTGCAGGTCTTTCTAGGAGGTGTCTCAGTGCATGA  998
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCAATTGCTAATTGGCTGCAGGTCTTTCTAGGAGGTGTCTCAGTGAATGA  985

seq1  TCAGTGTGGCATTAGGTCTGCTTCACCCCCAAAGACTCACTTTGCCTTCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTGGCATTAGGTCTGCTTCACCCCCAAAGACTCACTTTGCCTTCT  1035

seq1  GTTTGCAGGAAAAAATAGAAGACAGGCTGCTATGTCGATGGCTACAACTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCAGGAAAAAATAGAAGACAGGCTGCTATGTCGATGGCTACAACTT  1085

seq1  TACTCTCAAGGAAACCATTTGCCTGCTCACCCATACAGATGCAGCAAGCT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTCAAGGAAACCATTTGCCTGCTCACCCATACAGATGCAGCAAGCT  1135

seq1  ATAGCCCTTCCCTCCAGGTGTCTAAGAACAAGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCCTTCCCTCCAGGTGTCTAAGAACAAGAATTC  1172