BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-343G04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 82,376,663 - 82,510,731
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1500012K07Rik
Upstream geneLOC546979, Slco3a1, EG665308, EG665641, 0610006L08Rik, Sv2b
Downstream geneLOC100042171, Akap13, Klhl25, LOC100042210, LOC434200
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-343G04.bB6Ng01-343G04.g
ACCGA126177GA126178
length1,0791,082
definitionB6Ng01-343G04.b B6Ng01-343G04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,509,648 - 82,510,731)(82,376,663 - 82,377,731)
sequence
gaattcttgtcctgacttcctttgatggtaaactgtgatatgaaagtgta
agtcaaataagccctttcctccccaagttgctttggtcatgtttctaaat
cgtggaaggcactactgctatttaagtctaactacaacttgcccacagct
gaggtttagttctggcctcttgtgcaattactctgagcttcccgttctca
ttcagagctctgtgataggggaggggagagtgactagtgacaaccatgct
caagtaattgacattcttctttctggctattgatttgctggttcttgcca
cagaggctattatggaagagccagcactgacaaaggcttggaagcgctct
tctgggtggctggtctgcatatatgagtgctttggagcctggagctttct
ttttgtactcctgtgatggcatcgagttcagaagcagtaagcgctggagg
actgttggagaatcatcaattgtgtcctattacctgtttctcaagccaga
acggtcttcaaaggttagttaagaacaactgcagacaagcatggtggtac
acacttgtaattccaatagtcagggatttgaggcaaaaggaacttgagtt
taaaaataacctagacaatataacaagaccttttttcaaaaaaccaaggg
tgtgcgcacttgaacgcacatgcaccccctcgccccccaccaatgggtag
gaaggacacaaagaggtacttgagataaatagcttaatcgggaaaacaaa
ctgccaagctagatgtttaactgtataccacacgactctgtttcagctac
tttttgcttaggcttctctcttgtctgagttgagttagatgcttcgtaaa
tgtcacacgtgagatagcagtcccataggattatattagcactggaaagt
tttagcgcttagtgcgatagtcgtgtttgtgatgctgctggtgtaaaagc
cctactgtgctgccagtcattaaaaaaaacatagcacacacagtatacac
acacataacacttgattatgatatagtaatgaacagtgctgttggttcat
cctttactgtgctatgctgattttctttg
gaattctttggcaggaaattaactactagataaaaactgtataataagaa
atcattatcaactatgtactgtagcagttttactctggtgggtaactgag
gtgtttggggtgatctgtcagtgcatgcatagggaaggatggaaggagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agcgcttctgggagaagaataaaaaatgcacaaagacacgagaaactgct
tgtgttaaatgaggactacataggagcatgaggtgaatccagaacaagag
agacaggggctgtgttgtgtagacaattgacagaggatcccccatggaca
cagaaacatttgagtgaacaagaggagctgagtcatgtagatattcaaag
gcatatggtgttctctaatacaatatgtcttatataaaacatattacaca
cacgcacatacacacacatacacacgcacatacacacatagacacacaca
cacacacacacacacacacacacacaggcctcaaacagtcactattcctg
aaccctatatcttcctttctgataattccaggaaaatgtgctcaaaagtc
atcaacagaacaatgatgtttacatttattttcattacctctgaacattt
caaggccatgtgttccaataacataactatcctaacctctcactgcatct
tgctttcctaatatttctagcgaaagaaatacatttcaaaggtcaaactc
ttgactccagcagagcaatgctgcctgctttctataggagcagtatctgc
aaaagacgaaagtcagaactaagcatcaggtgggcttccacagaaacaat
aatctctcggtgaattaatcaagtatcagaccataacaattaagggaagc
tttgaattgtcaagaatcaaggtatttcctgcgcttttctatgaacctgg
aatatacaaactgtggacagtcttgagtcaactagtagaagaatgtcaag
aaaaaggcaaactctgagtctatggagagttgcctggttcttgccagcca
gcattggaaaaactcaatcctatttcctatct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_82509648_82510731
seq2: B6Ng01-343G04.b_48_1126 (reverse)

seq1  CAAAGAAAAACAAGCATAGCACAGTAAAGGATGAACCAACAGCACTGTCA  50
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CAAAGAAAATC-AGCATAGCACAGTAAAGGATGAACCAACAGCACTGTTC  49

seq1  TTTACTTATTATCATAATCAAGTGTTATGTGGTGTGTATAACTGTGTGTG  100
       |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  ATTACT--ATATCATAATCAAGTGTTATGT-GTGTGTAT-ACTGTGTGTG  95

seq1  CTATGTTTTTTTTAATGACTGGCAGCACAGTAGGGCTTTTACACCAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTTTTTTTAATGACTGGCAGCACAGTAGGGCTTTTACACCAGCAG  145

seq1  CATCACAAACACGACTATCGCACTAAGCGCTAAAACTTTCCAGTGCTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACAAACACGACTATCGCACTAAGCGCTAAAACTTTCCAGTGCTAAT  195

seq1  ATAATCCTATGGGACTGCTATCTCACGTGTGACATTTACGAAGCATCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCCTATGGGACTGCTATCTCACGTGTGACATTTACGAAGCATCTAA  245

seq1  CTCAACTCAGACAAGAGAGAAGCCTAAGCAAAAAGTAGCTGAAACAGAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACTCAGACAAGAGAGAAGCCTAAGCAAAAAGTAGCTGAAACAGAGT  295

seq1  CGTGTGGTATACAGTTAAACATCTAGCTTGGCAGTTTGTTTTCCCGATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGGTATACAGTTAAACATCTAGCTTGGCAGTTTGTTTTCCCGATTA  345

seq1  AGCTATTTATCTCAAGTACCTCTTTGTGTCCTTCCTACCCATTGGTGGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTTATCTCAAGTACCTCTTTGTGTCCTTCCTACCCATTGGTGGGG  395

seq1  GGCGAGGGGGTGCATGTGCGTTCAAGTGCGCACACCCTTGGTTTTTTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAGGGGGTGCATGTGCGTTCAAGTGCGCACACCCTTGGTTTTTTGAA  445

seq1  AAAAGGTCTTGTTATATTGTCTAGGTTATTTTTAAACTCAAGTTCCTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTCTTGTTATATTGTCTAGGTTATTTTTAAACTCAAGTTCCTTTT  495

seq1  GCCTCAAATCCCTGACTATTGGAATTACAAGTGTGTACCACCATGCTTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAATCCCTGACTATTGGAATTACAAGTGTGTACCACCATGCTTGT  545

seq1  CTGCAGTTGTTCTTAACTAACCTTTGAAGACCGTTCTGGCTTGAGAAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTTGTTCTTAACTAACCTTTGAAGACCGTTCTGGCTTGAGAAACA  595

seq1  GGTAATAGGACACAATTGATGATTCTCCAACAGTCCTCCAGCGCTTACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATAGGACACAATTGATGATTCTCCAACAGTCCTCCAGCGCTTACTG  645

seq1  CTTCTGAACTCGATGCCATCACAGGAGTACAAAAAGAAAGCTCCAGGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGAACTCGATGCCATCACAGGAGTACAAAAAGAAAGCTCCAGGCTC  695

seq1  CAAAGCACTCATATATGCAGACCAGCCACCCAGAAGAGCGCTTCCAAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCACTCATATATGCAGACCAGCCACCCAGAAGAGCGCTTCCAAGCC  745

seq1  TTTGTCAGTGCTGGCTCTTCCATAATAGCCTCTGTGGCAAGAACCAGCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCAGTGCTGGCTCTTCCATAATAGCCTCTGTGGCAAGAACCAGCAA  795

seq1  ATCAATAGCCAGAAAGAAGAATGTCAATTACTTGAGCATGGTTGTCACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATAGCCAGAAAGAAGAATGTCAATTACTTGAGCATGGTTGTCACTA  845

seq1  GTCACTCTCCCCTCCCCTATCACAGAGCTCTGAATGAGAACGGGAAGCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTCTCCCCTCCCCTATCACAGAGCTCTGAATGAGAACGGGAAGCTC  895

seq1  AGAGTAATTGCACAAGAGGCCAGAACTAAACCTCAGCTGTGGGCAAGTTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAATTGCACAAGAGGCCAGAACTAAACCTCAGCTGTGGGCAAGTTG  945

seq1  TAGTTAGACTTAAATAGCAGTAGTGCCTTCCACGATTTAGAAACATGACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAGACTTAAATAGCAGTAGTGCCTTCCACGATTTAGAAACATGACC  995

seq1  AAAGCAACTTGGGGAGGAAAGGGCTTATTTGACTTACACTTTCATATCAC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAACTTGGGGAGGAAAGGGCTTATTTGACTTACACTTTCATATCAC  1045

seq1  AGTTTACCATCAAAGGAAGTCAGGACAAGAATTC  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTACCATCAAAGGAAGTCAGGACAAGAATTC  1079

seq1: chr7_82376663_82377731
seq2: B6Ng01-343G04.g_67_1148

seq1  GAATTCTTTGGCAGGAAATTAACTACTAGATAAAAACTGTATAATAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGCAGGAAATTAACTACTAGATAAAAACTGTATAATAAGAA  50

seq1  ATCATTATCAACTATGTACTGTAGCAGTTTTACTCTGGTGGGTAACTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTATCAACTATGTACTGTAGCAGTTTTACTCTGGTGGGTAACTGAG  100

seq1  GTGTTTGGGGTGATCTGTCAGTGCATGCATAGGGAAGGATGGAAGGAGAG  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  GTGTTTGGGGTGATCTGTCAGTGCATGCATAGGGAAGGATGGAAG--GAG  148

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  198

seq1  AGAGCGCTTCTGGGAGAAGAATAAAAAATGCACAAAGACACGAGAAACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCGCTTCTGGGAGAAGAATAAAAAATGCACAAAGACACGAGAAACTG  248

seq1  CTTGTGTTAAATGAGGACTACATAGGAGCATGAGGTGAATCCAGAACAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTTAAATGAGGACTACATAGGAGCATGAGGTGAATCCAGAACAAG  298

seq1  AGAGACAGGGGCTGTGTTGTGTAGACAATTGACAGAGGATCCCCCATGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGGGGCTGTGTTGTGTAGACAATTGACAGAGGATCCCCCATGGA  348

seq1  CACAGAAACATTTGAGTGAACAAGAGGAGCTGAGTCATGTAGATATTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAACATTTGAGTGAACAAGAGGAGCTGAGTCATGTAGATATTCAA  398

seq1  AGGCATATGGTGTTCTCTAATACAATATGTCTTATATAAAACATATTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATATGGTGTTCTCTAATACAATATGTCTTATATAAAACATATTACA  448

seq1  CACACGCACATACACACACATACACACGCACATACACACATAGACACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACGCACATACACACACATACACACGCACATACACACATAGACACACA  498

seq1  CACACACACACACACACACACACACACAGGCCTCAAACAGTCACTATTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACAGGCCTCAAACAGTCACTATTCC  548

seq1  TGAACCCTATATCTTCCTTTCTGATAATTCCAGGAAAATGTGCTCAAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCCTATATCTTCCTTTCTGATAATTCCAGGAAAATGTGCTCAAAAG  598

seq1  TCATCAACAGAACAATGATGTTTACATTTATTTTCATTACCTCTGAACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAACAGAACAATGATGTTTACATTTATTTTCATTACCTCTGAACAT  648

seq1  TTCAAGGCCATGTGTTCCAATAACATAACTATCCTAACCTCTCACTGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGGCCATGTGTTCCAATAACATAACTATCCTAACCTCTCACTGCAT  698

seq1  CTTGC-TTCCTAATATTTCTAGCG-AAGAAATACATTTCAAAGGTCAAAC  748
      ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTTCCTAATATTTCTAGCGAAAGAAATACATTTCAAAGGTCAAAC  748

seq1  TCTTGACTCCAGCAGAGCAATGCTGCCTGCATTCTATAGGAGCAGTATCT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACTCCAGCAGAGCAATGCTGCCTGCTTTCTATAGGAGCAGTATCT  798

seq1  GC-AAAGACGAAAGTCAGAACTAAGCATCAGGT-GGCCTCCACAGAAAC-  845
      || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| 
seq2  GCAAAAGACGAAAGTCAGAACTAAGCATCAGGTGGGCTTCCACAGAAACA  848

seq1  ATAATCTCTCGGTGAATT-ATCAAGTATCAGACCATAAACAATAAGGGAA  894
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||
seq2  ATAATCTCTCGGTGAATTAATCAAGTATCAGACCATAACAATTAAGGGAA  898

seq1  GCTTGAAATTGTCCAAGATCAAGGTATTTCCTGCGCTTTCTAATGAACCT  944
      ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||   ||||||||
seq2  GCTTTGAATTGTCAAGAATCAAGGTATTTCCTGCGCTTTTCTATGAACCT  948

seq1  TGGATATACAAAC-GTGGACAGTC-TGAGTCAAC-AGTAGAAG-ATGTCA  990
       | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||
seq2  GGAATATACAAACTGTGGACAGTCTTGAGTCAACTAGTAGAAGAATGTCA  998

seq1  AGAAAAAAGCAAACCCCTGAG-CTATGGGAGAG-TGCCTG--TCTTGCCA  1036
      ||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||
seq2  AGAAAAAGGCAAA-CTCTGAGTCTAT-GGAGAGTTGCCTGGTTCTTGCCA  1046

seq1  GCCAGCCATTGAAAAACT--ATTCTA-TTCCTATCT  1069
      ||||||  | ||||||||  || ||| |||||||||
seq2  GCCAGCATTGGAAAAACTCAATCCTATTTCCTATCT  1082