BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-343P22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 84,033,449 - 84,175,232
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042210, LOC434200, EG244071
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-343P22.bB6Ng01-343P22.g
ACCGA126615GA126616
length1,212518
definitionB6Ng01-343P22.b B6Ng01-343P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,174,013 - 84,175,232)(84,033,449 - 84,033,972)
sequence
gaattcattgtatattcacaatgtcctctcaataaaacactatgtcatca
atggaggacagtgatataacatataatcaatatgtacaaatacatataat
gtatatattttatatatatgtatatatatatgcatatatatatatatgaa
atatatatcacatctatatgatttcatggatcttatagtttctgtcctta
gtggcctcatgttccttggcttgctgttctttcttttttcttctttgtac
ttacatattgtttgagattcttactaagcttataaaatgatatcaataaa
ccatgcatatattttaaaagctgcacagtaaacaccagatgctaaatcag
ttgatggtatcagcaatatcatcaacataatagtgtaggtcaatgctcca
ctatgataatttactttctaatggcagggtctgtggtccaccacatccat
ttgtcttttgaaagccaggcatattcaatggatataggaagaagaccact
tcctctgtataattaaagtcttcaatggtaagcttcttcaatgttcctat
tattgcttgtgatttaatgtcttgtctgggaaggcaagacgattttaaag
aatccttctgccacttcatctatgctaattaaccattcaagacacaatca
aataagcatgttagctttacatattctctggacctgtctgagataagatt
gagccaaagtctatttaatagctgaattttctatacaaattattccattg
gagactgggggctttgtgagacccttgtgctaatgttatatgggaaaatc
cactaacagtctgcaaatagtttgagtgtttcctggagttcatgtataac
tctggcacagatccctctgggaataatcaagatctttaccttgtcaactt
atgatggtattgaagggttcttctctgtgggccagacttaactttcaatc
aaggcaccttcatcacacaaatttctatagagtgatggaggtaatcaaga
catggggattgctttgccagccttcctactcattacagtacttacatcag
acacagcttccttgcttctgggtgatagactgcactttccctcagtctga
aatctcagcaccaccattttaacctaagaagctacttttcaacttaatga
ctttccatgtaatcagctacagcaaacagctgcacctaagttctcataat
tctctaaacctg

attttatgttggccacctactactaagcctcaagcacgccctggattgtt
gttggcatatccagtgactttccattggagaaggttgctgctctcttcca
gtaggtattgactgcaaatggcttcttgtttatgagtgggacttggtgtc
tactgcaatttttcagtgttgggattctgtctttttttttttttcctcaa
caaaacaaagccagaaagaaacgcactaaccaacatggaatcctagaaat
ttacccagtacaaggactttatactttatacaaataccacgcataatact
cacatggagtggggctggaggtgaaggtagtttagggacaggaatcttgg
ggtgtgctagctggccagcctagcctatgtggtaaattccaggccaagga
gagatgctatctcaaaataatatgaaatgcttgtcaacagctctccatat
gttttctttttattactttctcatttaaaataattttatgtatgtatgta
tgtatgtatgtatgtatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_84174013_84175232
seq2: B6Ng01-343P22.b_50_1261 (reverse)

seq1  CAGGTTT-GAGAATT-TGAGAAACTTAGTGGCAGCTGTTTGCTGTAGGCT  48
      ||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| |||
seq2  CAGGTTTAGAGAATTATGAG-AACTTAGGTGCAGCTGTTTGCTGTA-GCT  48

seq1  GGGTATTCACAGTGAAAGACATTAGTGTGAAAAGTAGCTCTTTAGTATAA  98
      |   ||| |||  ||||| |||||   ||||||||||||  ||||  |||
seq2  G---ATT-ACATGGAAAGTCATTAAGTTGAAAAGTAGCTTCTTAGGTTAA  94

seq1  AATGGTGGTGCTGAGATTTCAGACTGAGGGAAGGTGGCAGTTCTTAATCA  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||
seq2  AATGGTGGTGCTGAGATTTCAGACTGAGGGAAAGT-GCAG-TCT--ATCA  140

seq1  -CCAGAAGCAAGGAAGCTGTGTCTGATGTAAGTACTGTAATGAGTAGGAA  197
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAAGCAAGGAAGCTGTGTCTGATGTAAGTACTGTAATGAGTAGGAA  190

seq1  GGCTGGCAAGGCAATCCCCATGTCTTGATTACCTCCATCACTCTATAGAA  247
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGCAAAGCAATCCCCATGTCTTGATTACCTCCATCACTCTATAGAA  240

seq1  ATTTGTGTGATGAAGGTGCCTTTGATTGAAAGTTAAGTCTGGCCCACAGA  297
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGTGATGAAGGTGCC-TTGATTGAAAGTTAAGTCTGGCCCACAGA  289

seq1  GAAGAACCCTTCAATACCATCATAAGTTGACAAGGTAAAGATCTTGATTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACCCTTCAATACCATCATAAGTTGACAAGGTAAAGATCTTGATTA  339

seq1  TTCCCAGAGGGATCTGTGCCAGAGTTATACATGAACTCCAGGAAACACTC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGAGGGATCTGTGCCAGAGTTATACATGAACTCCAGGAAACACTC  389

seq1  AAACTATTTGCAGACTGTTAGTGGATTTTCCCATATAACATTAGCACAAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTATTTGCAGACTGTTAGTGGATTTTCCCATATAACATTAGCACAAG  439

seq1  GGTCTCACAAAGCCCCCAGTCTCCAATGGAATAATTTGTATAGAAAATTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCACAAAGCCCCCAGTCTCCAATGGAATAATTTGTATAGAAAATTC  489

seq1  AGCTATTAAATAGACTTTGGCTCAATCTTATCTCAGACAGGTCCAGAGAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTAAATAGACTTTGGCTCAATCTTATCTCAGACAGGTCCAGAGAA  539

seq1  TATGTAAAGCTAACATGCTTATTTGATTGTGTCTTGAATGGTTAATTAGC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAAAGCTAACATGCTTATTTGATTGTGTCTTGAATGGTTAATTAGC  589

seq1  ATAGATGAAGTGGCAGAAGGATTCTTTAAAATCGTCTTGCCTTCCCAGAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGAAGTGGCAGAAGGATTCTTTAAAATCGTCTTGCCTTCCCAGAC  639

seq1  AAGACATTAAATCACAAGCAATAATAGGAACATTGAAGAAGCTTACCATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATTAAATCACAAGCAATAATAGGAACATTGAAGAAGCTTACCATT  689

seq1  GAAGACTTTAATTATACAGAGGAAGTGGTCTTCTTCCTATATCCATTGAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACTTTAATTATACAGAGGAAGTGGTCTTCTTCCTATATCCATTGAA  739

seq1  TATGCCTGGCTTTCAAAAGACAAATGGATGTGGTGGACCACAGACCCTGC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCTGGCTTTCAAAAGACAAATGGATGTGGTGGACCACAGACCCTGC  789

seq1  CATTAGAAAGTAAATTATCATAGTGGAGCATTGACCTACACTATTATGTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGAAAGTAAATTATCATAGTGGAGCATTGACCTACACTATTATGTT  839

seq1  GATGATATTGCTGATACCATCAACTGATTTAGCATCTGGTGTTTACTGTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATATTGCTGATACCATCAACTGATTTAGCATCTGGTGTTTACTGTG  889

seq1  CAGCTTTTAAAATATATGCATGGTTTATTGATATCATTTTATAAGCTTAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTTAAAATATATGCATGGTTTATTGATATCATTTTATAAGCTTAG  939

seq1  TAAGAATCTCAAACAATATGTAAGTACAAAGAAGAAAAAAGAAAGAACAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAATCTCAAACAATATGTAAGTACAAAGAAGAAAAAAGAAAGAACAG  989

seq1  CAAGCCAAGGAACATGAGGCCACTAAGGACAGAAACTATAAGATCCATGA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAAGGAACATGAGGCCACTAAGGACAGAAACTATAAGATCCATGA  1039

seq1  AATCATATAGATGTGATATATATTTCATATATATATATATGCATATATAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATATAGATGTGATATATATTTCATATATATATATATGCATATATAT  1089

seq1  ATACATATATATAAAATATATACATTATATGTATTTGTACATATTGATTA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATATATAAAATATATACATTATATGTATTTGTACATATTGATTA  1139

seq1  TATGTTATATCACTGTCCTCCATTGATGACATAGTGTTTTATTGAGAGGA  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTATATCACTGTCCTCCATTGATGACATAGTGTTTTATTGAGAGGA  1189

seq1  CATTGTGAATATACAATGAATTC  1220
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGAATATACAATGAATTC  1212


seq1: chr7_84033449_84033972
seq2: B6Ng01-343P22.g_69_592

seq1  GAATTCATTTTATGTTGGCCACCTACTACTAAGCCTCAAGCACGCCCTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTATGTTGGCCACCTACTACTAAGCCTCAAGCACGCCCTGG  50

seq1  ATTGTTGTTGGCATATCCAGTGACTTTCCATTGGAGAAGGTTGCTGCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTGTTGGCATATCCAGTGACTTTCCATTGGAGAAGGTTGCTGCTCT  100

seq1  CTTCCAGTAGGTATTGACTGCAAATGGCTTCTTGTTTATGAGTGGGACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGTAGGTATTGACTGCAAATGGCTTCTTGTTTATGAGTGGGACTT  150

seq1  GGTGTCTACTGCAATTTTTCAGTGTTGGGATTCTGTCTTTTTTTTTTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTACTGCAATTTTTCAGTGTTGGGATTCTGTCTTTTTTTTTTTTT  200

seq1  CCTCAACAAAACAAAGCCAGAAAGAAACGCACTAACCAACATGGAATCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAACAAAACAAAGCCAGAAAGAAACGCACTAACCAACATGGAATCCT  250

seq1  AGAAATTTACCCAGTACAAGGACTTTATACTTTATACAAATACCACGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTTACCCAGTACAAGGACTTTATACTTTATACAAATACCACGCAT  300

seq1  AATACTCACATGGAGTGGGGCTGGAGGTGAAGGTAGTTTAGGGACAGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTCACATGGAGTGGGGCTGGAGGTGAAGGTAGTTTAGGGACAGGAA  350

seq1  TCTTGGGGTGTGCTAGCTGGCCAGCCTAGCCTATGTGGTAAATTCCAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGGGTGTGCTAGCTGGCCAGCCTAGCCTATGTGGTAAATTCCAGGC  400

seq1  CAAGGAGAGATGCTATCTCAAAATAATATGAAATGCTTGTCAACAGCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAGAGATGCTATCTCAAAATAATATGAAATGCTTGTCAACAGCTCT  450

seq1  CCATATGTTTTCTTTTTATTACTTTCTCATTTAAAATAATTTTATGTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATGTTTTCTTTTTATTACTTTCTCATTTAAAATAATTTTATGTATG  500

seq1  TATGTATGTATGTATGTATGTATG  524
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGTATGTATGTATGTATG  524


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |