BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344D01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 120,407,339 - 120,504,585
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArntl, Btbd10
Upstream geneMical2, Micalcl, Parva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227, A630005I04Rik
Downstream genePth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228, Spon1, Rras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344D01.bB6Ng01-344D01.g
ACCGA126757GA126758
length1,0271,143
definitionB6Ng01-344D01.b B6Ng01-344D01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,503,560 - 120,504,585)(120,407,339 - 120,408,488)
sequence
gaattctttgcctttgaaagattgttgttagctttttttaaagacttact
ttaattatgtgtgtctgcatgtttctgtgtctcttgagtgtatgtataca
tggctgtgcactgatacacatatatgcacatggaggacagaagagggcac
cccattcttttgagctggacttaagggtgattgttggatgcctggcttat
gtgggtgctgggatccaaatggattgtatggttaagtacttttaaccagg
gagccatctctttaactcccaaggcttagaaggtttttgtttgtttgttt
gtttgtttgttttaaatgtgaatcttagtggttttggtttttattctgaa
aatcagtgtttactcattgtttttccttttttaatgttctactctgaaca
ttttgatttctggaatcttaggaaagcaagtccttagctctgttttagaa
ttttatttgtcatctttttctctctcactgttttgaaatgtcactacttt
gtattagctgagtctgacattttgatgagttgtgtattaagtctgagaga
tggtatagtatagttgaaaaattaccaaatttgactgtagaggcatggat
catagctttaattgggtatgtaataggtgctaaagcaaattttactgaac
tcaatcttaataaatgtctttgagtataaaaaattgtttattctcaaaat
gcaacattgcccagattcctaagttatgaagatatctagagagtgttttc
ctgttatcatgtattttgtcccaagtcaacttttggattgttaaaatgaa
gaggaaaacataacttcttttatgaaaaaggctgtaatatttttgcttct
gtactggcaaatctagtagctaccagccttcctggtcatttacagctgct
caacttcaagaacttgatgccattgtcaaccccaagaaataagctattaa
cataggcacatgtggctatttaattttaagagagagtaaaattcactttc
atttaggtatagttgcctaggtctgga
gaattctgtaactgccaaccctctgatgagcttccagatttttctggtcc
ccacttgccttcagggcctcctgtccgtgcttcacacaagctcaggggag
tttgaaaagtctatgtttttcttggtgtgccccgtgtttggaatactgtt
gtaaagagctgacctgctccaggttcctgtttccagccttcccacagttg
tccccacctgctcctgcctggtttcttgacctaatctcttctgctttaag
agccacatgtcccctatctttccatcctccctatgagcctctttctgaag
tctccagtgtgggtctgcattatggcaagtgtctccgcctctgtgctctt
gaactcagccccagtccctccccttctgctgaagaaggtagccagatgtg
cccagtgctcttcttatgttaaacccagctagccacagagggggagcacc
ctcccacccaggagaggaaccacacccctagtgaccactagggcagtggc
agaggtgagacttttttctatttatttttgagccagtctttctatgtgta
ggcctggctgacctggactcctctgcctttgaactcagagatgcctcccg
attgctgggattaaaggtgcctgacatgccaccatgcttgacagtcagag
gtgggcactgcccaccatcctgtcctcactcactcagcatcttgtgaccc
tgtacccatcccttcctacagtggtctagttcagaggggcccactgttct
cccacttgctgaggcgttagaagaagggccagccctggatgcatggttgt
atcctgctgtcccaggggactttctgctttgcagtcttccccaaacctct
tgtcagtctgtcctcagagcccccttacacactttgtatgtggtggaaag
tggcaggttgtgtcacagaagtctgttctgctgagtgtcccttggatgtg
gtctcacaggaggcgagtgccttgtcttcatctaagtctcagcatttgat
agaccatccctgcccacctgccggctagcagtcacttgttagagacccag
aagagctcaagcttgtctcttgctctcctcatgctagcattcctctcctc
agccaccaataacaaagttcattctttggtttctgacaagatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120503560_120504585
seq2: B6Ng01-344D01.b_48_1074 (reverse)

seq1  TCCAGACCTAGGCAACTATACCTAAATG-AAGTGGATTTTTAACTCTCTC  49
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||
seq2  TCCAGACCTAGGCAACTATACCTAAATGAAAGTGAATTTT--ACTCTCTC  48

seq1  TTAAAATTAAATAGCCACATGTGCCTATGTT-ATAGC-TATTTCTTTGGG  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||
seq2  TTAAAATTAAATAGCCACATGTGCCTATGTTAATAGCTTATTTCTT--GG  96

seq1  GTTTGAC-ATGGCATCAAGTTCTTGAAGTTGAGCAGCTGT-AATGACCAG  145
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGTTGACAATGGCATCAAGTTCTTGAAGTTGAGCAGCTGTAAATGACCAG  146

seq1  GAAGGCTGGTAGCTACTAGATTTGCCAGTACAGAAGC-AAAATATTACAG  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAAGGCTGGTAGCTACTAGATTTGCCAGTACAGAAGCAAAAATATTACAG  196

seq1  CCTTTTTCATAAAAGAAGTTATGTTTTCCTCTTCATTTTAAACAATCCAA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCTTTTTCATAAAAGAAGTTATGTTTTCCTCTTCATTTT-AACAATCCAA  245

seq1  AAGTTGACTTGGGACAAAATACATGATAACAGGAAAACACTCTCTAGATA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGACTTGGGACAAAATACATGATAACAGGAAAACACTCTCTAGATA  295

seq1  TCTTCATAACTTAGGAATCTGGGCAATGTTGCATTTTGAGAATAAACAAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATAACTTAGGAATCTGGGCAATGTTGCATTTTGAGAATAAACAAT  345

seq1  TTTTTATACTCAAAGACATTTATTAAGATTGAGTTCAGTAAAATTTGCTT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATACTCAAAGACATTTATTAAGATTGAGTTCAGTAAAATTTGCTT  395

seq1  TAGCACCTATTACATACCCAATTAAAGCTATGATCCATGCCTCTACAGTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACCTATTACATACCCAATTAAAGCTATGATCCATGCCTCTACAGTC  445

seq1  AAATTTGGTAATTTTTCAACTATACTATACCATCTCTCAGACTTAATACA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGGTAATTTTTCAACTATACTATACCATCTCTCAGACTTAATACA  495

seq1  CAACTCATCAAAATGTCAGACTCAGCTAATACAAAGTAGTGACATTTCAA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCATCAAAATGTCAGACTCAGCTAATACAAAGTAGTGACATTTCAA  545

seq1  AACAGTGAGAGAGAAAAAGATGACAAATAAAATTCTAAAACAGAGCTAAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTGAGAGAGAAAAAGATGACAAATAAAATTCTAAAACAGAGCTAAG  595

seq1  GACTTGCTTTCCTAAGATTCCAGAAATCAAAATGTTCAGAGTAGAACATT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGCTTTCCTAAGATTCCAGAAATCAAAATGTTCAGAGTAGAACATT  645

seq1  AAAAAAGGAAAAACAATGAGTAAACACTGATTTTCAGAATAAAAACCAAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGGAAAAACAATGAGTAAACACTGATTTTCAGAATAAAAACCAAA  695

seq1  ACCACTAAGATTCACATTTAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTAAGATTCACATTTAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAC  745

seq1  CTTCTAAGCCTTGGGAGTTAAAGAGATGGCTCCCTGGTTAAAAGTACTTA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAAGCCTTGGGAGTTAAAGAGATGGCTCCCTGGTTAAAAGTACTTA  795

seq1  ACCATACAATCCATTTGGATCCCAGCACCCACATAAGCCAGGCATCCAAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATACAATCCATTTGGATCCCAGCACCCACATAAGCCAGGCATCCAAC  845

seq1  AATCACCCTTAAGTCCAGCTCAAAAGAATGGGGTGCCCTCTTCTGTCCTC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACCCTTAAGTCCAGCTCAAAAGAATGGGGTGCCCTCTTCTGTCCTC  895

seq1  CATGTGCATATATGTGTATCAGTGCACAGCCATGTATACATACACTCAAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCATATATGTGTATCAGTGCACAGCCATGTATACATACACTCAAG  945

seq1  AGACACAGAAACATGCAGACACACATAATTAAAGTAAGTCTTTAAAAAAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGAAACATGCAGACACACATAATTAAAGTAAGTCTTTAAAAAAA  995

seq1  GCTAACAACAATCTTTCAAAGGCAAAGAATTC  1026
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACAACAATCTTTCAAAGGCAAAGAATTC  1027

seq1: chr7_120407339_120408488
seq2: B6Ng01-344D01.g_66_1208

seq1  GAATTCTGTAACTGCCAACCCTCTGATGAGCTTCCAGATTTTTCTGGTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTAACTGCCAACCCTCTGATGAGCTTCCAGATTTTTCTGGTCC  50

seq1  CCACTTGCCTTCAGGGCCTCCTGTCCGTGCTTCACACAAGCTCAGGGGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGCCTTCAGGGCCTCCTGTCCGTGCTTCACACAAGCTCAGGGGAG  100

seq1  TTTGAAAAGTCTATGTTTTTCTTGGTGTGCCCCGTGTTTGGAATACTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAAGTCTATGTTTTTCTTGGTGTGCCCCGTGTTTGGAATACTGTT  150

seq1  GTAAAGAGCTGACCTGCTCCAGGTTCCTGTTTCCAGCCTTCCCACAGTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGAGCTGACCTGCTCCAGGTTCCTGTTTCCAGCCTTCCCACAGTTG  200

seq1  TCCCCACCTGCTCCTGCCTGGTTTCTTGACCTAATCTCTTCTGCTTTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACCTGCTCCTGCCTGGTTTCTTGACCTAATCTCTTCTGCTTTAAG  250

seq1  AGCCACATGTCCCCTATCTTTCCATCCTCCCTATGAGCCTCTTTCTGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACATGTCCCCTATCTTTCCATCCTCCCTATGAGCCTCTTTCTGAAG  300

seq1  TCTCCAGTGTGGGTCTGCATTATGGCAAGTGTCTCCGCCTCTGTGCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGTGTGGGTCTGCATTATGGCAAGTGTCTCCGCCTCTGTGCTCTT  350

seq1  GAACTCAGCCCCAGTCCCTCCCCTTCTGCTGAAGAAGGTAGCCAGATGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCAGCCCCAGTCCCTCCCCTTCTGCTGAAGAAGGTAGCCAGATGTG  400

seq1  CCCAGTGCTCTTCTTATGTTAAACCCAGCTAGCCACAGAGGGGGAGCACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGCTCTTCTTATGTTAAACCCAGCTAGCCACAGAGGGGGAGCACC  450

seq1  CTCCCACCCAGGAGAGGAACCACACCCCTAGTGACCACTAGGGCAGTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACCCAGGAGAGGAACCACACCCCTAGTGACCACTAGGGCAGTGGC  500

seq1  AGAGGTGAGACTTTTTTCTATTTATTTTTGAGCCAGTCTTTCTATGTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGAGACTTTTTTCTATTTATTTTTGAGCCAGTCTTTCTATGTGTA  550

seq1  GGCCTGGCTGACCTGGACTCCTCTGCCTTTGAACTCAGAGATGCCTCCCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGGCTGACCTGGACTCCTCTGCCTTTGAACTCAGAGATGCCTCCCG  600

seq1  ATTGCTGGGATTAAAGGTGCCTGACATGCCACCATGCTTGACAGTCAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGGGATTAAAGGTGCCTGACATGCCACCATGCTTGACAGTCAGAG  650

seq1  GTGGGCACTGCCCACCATCCTGTCCTCACTCACTCAGCATCTTGTGACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCACTGCCCACCATCCTGTCCTCACTCACTCAGCATCTTGTGACCC  700

seq1  TGTACCCATCCCTTCCTACAGTGGTCTAGTTCAGAGGGGCCCACTGTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCCATCCCTTCCTACAGTGGTCTAGTTCAGAGGGGCCCACTGTTCT  750

seq1  CCCACTTGCTGAGGCGTTAGAAGAAGGGCCAGCCCTGGATGCATGGTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTTGCTGAGGCGTTAGAAGAAGGGCCAGCCCTGGATGCATGGTTGT  800

seq1  ATCCTGCTGTCCCAGGGGACTTTCTGCTTTGCAGTCTTCCCCAAACCTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGCTGTCCCAGGGGACTTTCTGCTTTGCAGTCTTCCCCAAACCTCT  850

seq1  TGTCAGTCTGTCCTCAGAGCCCCCTTACACACTTTGTATGTGGTGGAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTCTGTCCTCAGAGCCCCCTTACACACTTTGTATGTGGTGGAAAG  900

seq1  TGGCAGGTTGTGTCACAGAAGTCTGTTCTGCTGAGTGTCCCTTGGATGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGTTGTGTCACAGAAGTCTGTTCTGCTGAGTGTCCCTTGGATGTG  950

seq1  GTCCTCACAGGAGGCGAGTGCCTTGTC-TCATCTAAGTCTCAGCATTTGA  999
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GT-CTCACAGGAGGCGAGTGCCTTGTCTTCATCTAAGTCTCAGCATTTGA  999

seq1  TAGACCCATCCCTGCCCACCTGCCGGCTAGCAGTCACTGGTCAGAGACAC  1049
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
seq2  TAGA-CCATCCCTGCCCACCTGCCGGCTAGCAGTCACTTGTTAGAGACCC  1048

seq1  AG-AGAGCCTCAGGCTTGTCCTCTTGCTCTCCCTCATGCTAGCAT--CTC  1096
      || |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||
seq2  AGAAGAG-CTCAAGCTTGT-CTCTTGCTCT-CCTCATGCTAGCATTCCTC  1095

seq1  TCCTCAGCCACCCAATAACAACAGTGCATTCTTTTGTTTCCTTAGAACAA  1146
      |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||      ||||
seq2  TCCTCAGCCA-CCAATAACAA-AGTTCATTCTTTGGTTTC----TGACAA  1139

seq1  GATG  1150
      ||||
seq2  GATG  1143