BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344H15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 140,771,006 - 140,815,067
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930404H21Rik, LOC100043237
Upstream geneNkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1, Ctbp2, LOC668747
Downstream gene2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, Dhx32, LOC100043695, Fank1, Adam12, A130023I24Rik, 4933400E14Rik, LOC100043248, LOC100043699
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344H15.bB6Ng01-344H15.g
ACCGA126953GA126954
length7401,053
definitionB6Ng01-344H15.b B6Ng01-344H15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(140,771,006 - 140,771,744)(140,814,015 - 140,815,067)
sequence
gaattcccaccctccgagcactgcaatcagcagcatgaaccaccatggcc
agctagtccttggagggccaggcgtatgtctcctgtgaggaacttcttgc
tactacccttttagaaactcatcaatatttgctagaggaggattgggtac
tgcactcccagctgatgtcagtcttgggatctcagaaaaagtactttgta
atactacattacggtggtttcttttctagccaaaggaatagctgccttct
cccctagggaaagctgttcctgccataggcatcgtctatgatcctgcacg
tggatgggctccatgtgggtagtgagtggagttgctcttcccctttggag
atagggctgcccctggtggatgctgctggtgctgtgagatcagtgtccgg
ggaagcacttacatgatcttggagaggagacaggacaagggcagggtcca
ctcgtttgtgcctgtgctacctgactccagaacttgtggatctgtttgac
tttgattaggagacagaataatgaggtaattcccgttcctctgcagaaat
tacacgctgtggttaattcagcgctttcagacggcctccatgagggctat
gagtcagctctcttcgttacatttatttggtgagtcaggccctggcagag
gcctgatttgttgtttaatattttggggggattatttttggtatgctggg
atcacgttagctgaggtatggggtgttaaaaaagatgttt
gaattccaggcgctcacagaggtgggggcaggagggagagtggaaggggg
aggcttcagcaaagtcccagaagcagaatggggcatcctgggtgaagggc
caccagtgaggctggaatgcaagcagcagccaggctgggaaggactggac
atgcaggcggggacagagcagcaaagacctctgtggcaggtttaagaaac
gtgtgtcctctgcatgagacacttccatcaagggtcctcatggccagggt
agatgaggctagtccaaacagtgggggcagccctggcttgacacaatcct
tctctagaccagaggggaatggacgggtggggagaggaaagcgggcatca
ggtgactagggtttgggggagccactggatctgaagtgtggaaagatgag
taataaggtcaggatgaggtgcataaagcaggggcgctgagtgggggctc
agcttgaggcagtggcaggccacagtctggggacacttgttatggctttg
gaacatttaagcaggtagcaaggaggcaggggattaccagcccagctgtg
aaaggaaggggaagaggatgctagatgggagccctgtctgtgagcctggt
gggaggagatgcagaggtgacactggggtgagacctcctacttgctgtca
gagtggaacaatccaagctctctcaggcaacagatttcaacataagtcac
atgagcagtgagctaaaatgagaatggaggtgttagagatagctcagatg
ctcagcctaccctagaactcacagagaacgacctgtctctgcctcccaag
ggactggaattaaaggtgtgcacctccaccatagcctaaagtgtttaatt
ttgaaagtacaaaaacctgaaacttgatctcagagctcatggggggaaaa
cgaataggtcaggcatgctggtgacctttgtaatcctagcactaagaaga
cagttgagtccttggggctcactggtcagacagctaaaatcacttgctga
gtatgcatcagcgtagaatctatgcctcaaaaacaaaatagaagtgatga
ctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_140771006_140771744
seq2: B6Ng01-344H15.b_43_782

seq1  GAATTCCCACCCTCCGAGCACTGCAATCAGCAGCATGAACCACCATGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCACCCTCCGAGCACTGCAATCAGCAGCATGAACCACCATGGCC  50

seq1  AGCTAGTCCTTGGAGGGCCAGGCGTATGTCTCCTGTGAGGAACTTCTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGTCCTTGGAGGGCCAGGCGTATGTCTCCTGTGAGGAACTTCTTGC  100

seq1  TACTACCCTTTTAGAAACTCATCAATATTTGCTAGAGGAGGATTGGGTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACCCTTTTAGAAACTCATCAATATTTGCTAGAGGAGGATTGGGTAC  150

seq1  TGCACTCCCAGCTGATGTCAGTCTTGGGATCTCAGAAAAAGTACTTTGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTCCCAGCTGATGTCAGTCTTGGGATCTCAGAAAAAGTACTTTGTA  200

seq1  ATACTACATTACGGTGGTTTCTTTTCTAGCCAAAGGAATAGCTGCCTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTACATTACGGTGGTTTCTTTTCTAGCCAAAGGAATAGCTGCCTTCT  250

seq1  CCCCTAGGGAAAGCTGTTCCTGCCATAGGCATCGTCTATGATCCTGCACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTAGGGAAAGCTGTTCCTGCCATAGGCATCGTCTATGATCCTGCACG  300

seq1  TGGATGGGCTCCATGTGGGTAGTGAGTGGAGTTGCTCTTCCCCTTTGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGGGCTCCATGTGGGTAGTGAGTGGAGTTGCTCTTCCCCTTTGGAG  350

seq1  ATAGGGCTGCCCCTGGTGGATGCTGCTGGTGCTGTGAGATCAGTGTCCGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGCTGCCCCTGGTGGATGCTGCTGGTGCTGTGAGATCAGTGTCCGG  400

seq1  GGAAGCACTTACATGATCTTGGAGAGGAGACAGGACAAGGGCAGGGTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCACTTACATGATCTTGGAGAGGAGACAGGACAAGGGCAGGGTCCA  450

seq1  CTCGTTTGTGCCTGTGCTACCTGACTCCAGAACTTGTGGATCTGTTTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGTTTGTGCCTGTGCTACCTGACTCCAGAACTTGTGGATCTGTTTGAC  500

seq1  TTTGATTAGGAGACAGAATAATGAGGTAATTCCCGTTCCTCTGCAGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTAGGAGACAGAATAATGAGGTAATTCCCGTTCCTCTGCAGAAAT  550

seq1  TACACGCTGTGGTTAATTCAGCGCTTTCAGACGGCCTCCATGAGGGCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGCTGTGGTTAATTCAGCGCTTTCAGACGGCCTCCATGAGGGCTAT  600

seq1  GAGTCAGCTCTCTTCGTTACATTTATTTGGTGAGTCAGGCCCTGGCAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGCTCTCTTCGTTACATTTATTTGGTGAGTCAGGCCCTGGCAGAG  650

seq1  GCCTGATTTGTTGTTTAATATTTTGGGGGGATTA-TTTTGGTATGCTGGG  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCCTGATTTGTTGTTTAATATTTTGGGGGGATTATTTTTGGTATGCTGGG  700

seq1  AACATGTTTGCTGAAATATGGGGTGTTAAACAAGATGTTT  739
      | || ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||
seq2  ATCACGTTAGCTGAGGTATGGGGTGTTAAAAAAGATGTTT  740

seq1: chr7_140814015_140815067
seq2: B6Ng01-344H15.g_63_1115 (reverse)

seq1  GAGTCATTCCACCTTCTATTTTGTTTTTGAGGCATAGATTCT-CACTGGA  49
      |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
seq2  GAGTCAT--CA-CTTCTATTTTGTTTTTGAGGCATAGATTCTACGCT-GA  46

seq1  TGCAATACTCAGCAAGTGATCTAAGCTGTCTGGCCAGTGAGCCCCAAGGA  99
      ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGC-ATACTCAGCAAGTGATTTTAGCTGTCTGACCAGTGAGCCCCAAGGA  95

seq1  CTCACCTGTCTCCTTAGTGCTAGGATTAC-AAGGTCACCAGCATGCCTGA  148
      |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACTGTCTTCTTAGTGCTAGGATTACAAAGGTCACCAGCATGCCTGA  145

seq1  CCTTTTCGTTTTCCCCCCATGAGCTCTGAGATCAAG-TTCAGGTTTTTGT  197
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCTATTCGTTTTCCCCCCATGAGCTCTGAGATCAAGTTTCAGGTTTTTGT  195

seq1  ACTTTCAAAA-TAAACACTTTAGGCTATGGTGGAGGTGCACACCTTTAAT  246
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAAAATTAAACACTTTAGGCTATGGTGGAGGTGCACACCTTTAAT  245

seq1  TCCAGT-CCTTGGGAGGCAGAGACAGGTCGTTCTCTGTGAGTTCTAGGGT  295
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTCCCTTGGGAGGCAGAGACAGGTCGTTCTCTGTGAGTTCTAGGGT  295

seq1  AGGCTGAGCATCTGAGCTATCTCTAACACCTCCATTCTCATTTTAGCTCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAGCATCTGAGCTATCTCTAACACCTCCATTCTCATTTTAGCTCA  345

seq1  CTGCTCATGTGACTTATGTTGAAATCTGTTGCCTGAGAGAGCTTGGATTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCATGTGACTTATGTTGAAATCTGTTGCCTGAGAGAGCTTGGATTG  395

seq1  TTCCACTCTGACAGCAAGTAGGAGGTCTCACCCCAGTGTCACCTCTGCAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACTCTGACAGCAAGTAGGAGGTCTCACCCCAGTGTCACCTCTGCAT  445

seq1  CTCCTCCCACCAGGCTCACAGACAGGGCTCCCATCTAGCATCCTCTTCCC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCCACCAGGCTCACAGACAGGGCTCCCATCTAGCATCCTCTTCCC  495

seq1  CTTCCTTTCACAGCTGGGCTGGTAATCCCCTGCCTCCTTGCTACCTGCTT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTCACAGCTGGGCTGGTAATCCCCTGCCTCCTTGCTACCTGCTT  545

seq1  AAATGTTCCAAAGCCATAACAAGTGTCCCCAGACTGTGGCCTGCCACTGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTCCAAAGCCATAACAAGTGTCCCCAGACTGTGGCCTGCCACTGC  595

seq1  CTCAAGCTGAGCCCCCACTCAGCGCCCCTGCTTTATGCACCTCATCCTGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGCTGAGCCCCCACTCAGCGCCCCTGCTTTATGCACCTCATCCTGA  645

seq1  CCTTATTACTCATCTTTCCACACTTCAGATCCAGTGGCTCCCCCAAACCC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTACTCATCTTTCCACACTTCAGATCCAGTGGCTCCCCCAAACCC  695

seq1  TAGTCACCTGATGCCCGCTTTCCTCTCCCCACCCGTCCATTCCCCTCTGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCACCTGATGCCCGCTTTCCTCTCCCCACCCGTCCATTCCCCTCTGG  745

seq1  TCTAGAGAAGGATTGTGTCAAGCCAGGGCTGCCCCCACTGTTTGGACTAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGAAGGATTGTGTCAAGCCAGGGCTGCCCCCACTGTTTGGACTAG  795

seq1  CCTCATCTACCCTGGCCATGAGGACCCTTGATGGAAGTGTCTCATGCAGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATCTACCCTGGCCATGAGGACCCTTGATGGAAGTGTCTCATGCAGA  845

seq1  GGACACACGTTTCTTAAACCTGCCACAGAGGTCTTTGCTGCTCTGTCCCC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACACGTTTCTTAAACCTGCCACAGAGGTCTTTGCTGCTCTGTCCCC  895

seq1  GCCTGCATGTCCAGTCCTTCCCAGCCTGGCTGCTGCTTGCATTCCAGCCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCATGTCCAGTCCTTCCCAGCCTGGCTGCTGCTTGCATTCCAGCCT  945

seq1  CACTGGTGGCCCTTCACCCAGGATGCCCCATTCTGCTTCTGGGACTTTGC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGTGGCCCTTCACCCAGGATGCCCCATTCTGCTTCTGGGACTTTGC  995

seq1  TGAAGCCTCCCCCTTCCACTCTCCCTCCTGCCCCCACCTCTGTGAGCGCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCTCCCCCTTCCACTCTCCCTCCTGCCCCCACCTCTGTGAGCGCC  1045

seq1  TGGAATTC  1053
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  1053