BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-346D10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,813,095 - 136,955,687
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneInpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip, LOC210714, LOC100043144, Ppapdc1a, Brwd2
Downstream geneLOC100043150, Fgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a, Tacc2, LOC619876, Btbd16
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-346D10.bB6Ng01-346D10.g
ACCGA128172GA128173
length1,1901,073
definitionB6Ng01-346D10.b B6Ng01-346D10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,954,495 - 136,955,687)(136,813,095 - 136,814,174)
sequence
gaattcttgcagaaaatacctaattaattactggacaacctgctttagtt
aaaaatgagcaccagtgtcctttcctggatacaatgtggcctctctctcc
cacttcttcccacctgctctctattgctctgactctattgtaactctacc
cctttgttttgctgttaccccttctgcagggtcccaccaggtcttgggat
ctttccccagtctctcattattgatatcaccatgcatcccaggctgtacc
ggatgaagtctcacttaccaggactgtgtccctaatatagcctctatggt
cactccttcacaccaagatcatttctgattctttcacagctcaaagaaag
cagggcttgacttcttcaactctcatatgatgaccagggcatctttgtct
ttatcacgtgactgttcatagtaactgacacccaggggaagagggaggcc
ttcggatacccacaggcctggacttgagctgctgttgggaactatctgga
agactagcaccaagtagtgtttgtgcactccaagataattcatctattaa
atgaggtgagaccctaaacagtatcatgattcccctttaaaagagtgtga
cacaagctgccaaatatagccagtgtctcttgctttcaccttttgctctc
cactgtagccttatagactccctctacttctctgtcttgtccttcattta
ctctttacttactcttttctccttgcctgggtgatgtcagcctgttatct
tcccctggacatactcctgtgcaacaacttctacacctagttcacttacc
agctcctcagggtactctccatgatcatcctgttccctccagcatccagc
ttttgatgatctagtgggtcaatccttaaaacctgcttcatgagccgaac
tatattcatatacatattcacatccacattgtgaatgggttttctgtctt
cttctcctaacttataaacatctcaaaggcagcaatggggtcttctcctc
tgggttcctggtcccaacactccactagctcagctgttctcacttgcatt
aggtgaattacatagatcagactgagtagtacttcagtcttcacggggag
atctcttctgggtagaacctacaagtatggaacaaatggatccagaacca
gccagtcagccagagtactgccacccaagggattggaggg
gaattctctgagagaaagcactccttattttcactgttttgtttatccat
ggttgtggtgtgctttgcacagtgcatgcttaccgctgtctatctgtgga
gggtagaggacaacttgcaggagttggctctctctctccttctacagtgt
gagtcttagcgattgaagtcaggttcctaggcttaaccgcaagcaccttt
acctactgggccatctcactggtctcacctcatcccttaagacagagtct
ttcattgggacttgaggcttgctgtctaagctaggcagattggccaggga
tctgtctgcctctacttccccagagcgaggatgactactaatgcatgcct
ccttaccttgcttcttatgtgagtgctgggaatcaaactcagatctgcat
gtttgtatggtagccacttactgactgagctagatccccagccctcaatc
agactcttcagctgattaaaactctgggtgtacgggttttgcatgtaata
ctctgaagttgtatgctttaaggaaaggcatgaaaattctgtaatagaac
tatcccagaaatctgtacacagatattaatagtagtaatatttacaatcg
tgcccgaagtagaaaggacacaagtgtctgtcagctgatgaacgagatgc
tattcagccattaaataagtggcatattgatgatgttacgccatgatgga
gcattgaagatacaagtgggaatgatcagtcagaaaatggctcacactgc
atagttctagttgtactgaatgcctcaaatatgtcagtccagagagatgg
ggagtattaacagatggctgaatagccgggaggccacggagagtggagag
gctgtgaaacaagaactaatgggcagcggcttcctctgagggcaatcaag
tgtttgaagttagatatgagtaatgttgcacactgtctcgatataccaaa
ggccagtgacggttgcagccgaccgctttatgagatgtacatttatgtag
gttgtatactatgtgaactctgcttatatacagaaaaaccatctagggtg
ttggggacgaggagccaggaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136954495_136955687
seq2: B6Ng01-346D10.b_47_1236 (reverse)

seq1  CCCTCCA--TCCTTGGGGTGCAGTCCTCTGGCTGGCCTGGCTGGGTCTGG  48
      |||||||   |||||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||||
seq2  CCCTCCAATCCCTTGGGTGGCAGTACTCTGGCT-GACTGGCTGGTTCTGG  49

seq1  ATCCCCTTTGTTCCATACTTGTAGTGTCTCACCGGAAGAGGATCCTCCCC  98
      || || ||||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||   |||
seq2  AT-CCATTTGTTCCATACTTGTAGGTTCTACCCAGAAGA-GATC--TCCC  95

seq1  CGTG-AGACTGAAGTACTACTCAGTCTGATCTATGTAATTCACCTAAATG  147
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CGTGAAGACTGAAGTACTACTCAGTCTGATCTATGTAATTCACCT-AATG  144

seq1  CAAGTGAGAACAGCTGAGCTAGTGGAGTGTTGGGACCAGGAACCCAGGAG  197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CAAGTGAGAACAGCTGAGCTAGTGGAGTGTTGGGACCAGGAACCCA-GAG  193

seq1  GAGAAGACCCCATTGCTGCCTTTGAGATGTTTATAAGTTAGGAG-AGAAG  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAGAAGACCCCATTGCTGCCTTTGAGATGTTTATAAGTTAGGAGAAGAAG  243

seq1  ACAGAAAACCCATTCACAATGTGGATGTGAATATGTATATGAATATAGTT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAACCCATTCACAATGTGGATGTGAATATGTATATGAATATAGTT  293

seq1  CGGCTCATGAAGCAGGTTTTAAGGATTGACCCACTAGATCATCAAAAGCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTCATGAAGCAGGTTTTAAGGATTGACCCACTAGATCATCAAAAGCT  343

seq1  GGATGCTGGAGGGAACAGGATGATCATGGAGAGTACCCTGAGGAGCTGGT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGGAGGGAACAGGATGATCATGGAGAGTACCCTGAGGAGCTGGT  393

seq1  AAGTGAACTAGGTGTAGAAGTTGTTGCACAGGAGTATGTCCAGGGGAAGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAACTAGGTGTAGAAGTTGTTGCACAGGAGTATGTCCAGGGGAAGA  443

seq1  TAACAGGCTGACATCACCCAGGCAAGGAGAAAAGAGTAAGTAAAGAGTAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGCTGACATCACCCAGGCAAGGAGAAAAGAGTAAGTAAAGAGTAA  493

seq1  ATGAAGGACAAGACAGAGAAGTAGAGGGAGTCTATAAGGCTACAGTGGAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGACAAGACAGAGAAGTAGAGGGAGTCTATAAGGCTACAGTGGAG  543

seq1  AGCAAAAGGTGAAAGCAAGAGACACTGGCTATATTTGGCAGCTTGTGTCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAAGGTGAAAGCAAGAGACACTGGCTATATTTGGCAGCTTGTGTCA  593

seq1  CACTCTTTTAAAGGGGAATCATGATACTGTTTAGGGTCTCACCTCATTTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTTTTAAAGGGGAATCATGATACTGTTTAGGGTCTCACCTCATTTA  643

seq1  ATAGATGAATTATCTTGGAGTGCACAAACACTACTTGGTGCTAGTCTTCC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGAATTATCTTGGAGTGCACAAACACTACTTGGTGCTAGTCTTCC  693

seq1  AGATAGTTCCCAACAGCAGCTCAAGTCCAGGCCTGTGGGTATCCGAAGGC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGTTCCCAACAGCAGCTCAAGTCCAGGCCTGTGGGTATCCGAAGGC  743

seq1  CTCCCTCTTCCCCTGGGTGTCAGTTACTATGAACAGTCACGTGATAAAGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCTTCCCCTGGGTGTCAGTTACTATGAACAGTCACGTGATAAAGA  793

seq1  CAAAGATGCCCTGGTCATCATATGAGAGTTGAAGAAGTCAAGCCCTGCTT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATGCCCTGGTCATCATATGAGAGTTGAAGAAGTCAAGCCCTGCTT  843

seq1  TCTTTGAGCTGTGAAAGAATCAGAAATGATCTTGGTGTGAAGGAGTGACC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGAGCTGTGAAAGAATCAGAAATGATCTTGGTGTGAAGGAGTGACC  893

seq1  ATAGAGGCTATATTAGGGACACAGTCCTGGTAAGTGAGACTTCATCCGGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGCTATATTAGGGACACAGTCCTGGTAAGTGAGACTTCATCCGGT  943

seq1  ACAGCCTGGGATGCATGGTGATATCAATAATGAGAGACTGGGGAAAGATC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCTGGGATGCATGGTGATATCAATAATGAGAGACTGGGGAAAGATC  993

seq1  CCAAGACCTGGTGGGACCCTGCAGAAGGGGTAACAGCAAAACAAAGGGGT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGACCTGGTGGGACCCTGCAGAAGGGGTAACAGCAAAACAAAGGGGT  1043

seq1  AGAGTTACAATAGAGTCAGAGCAATAGAGAGCAGGTGGGAAGAAGTGGGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTACAATAGAGTCAGAGCAATAGAGAGCAGGTGGGAAGAAGTGGGA  1093

seq1  GAGAGAGGCCACATTGTATCCAGGAAAGGACACTGGTGCTCATTTTTAAC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGGCCACATTGTATCCAGGAAAGGACACTGGTGCTCATTTTTAAC  1143

seq1  TAAAGCAGGTTGTCCAGTAATTAATTAGGTATTTTCTGCAAGAATTC  1193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCAGGTTGTCCAGTAATTAATTAGGTATTTTCTGCAAGAATTC  1190

seq1: chr7_136813095_136814174
seq2: B6Ng01-346D10.g_71_1143

seq1  GAATTCTCTGAGAGAAAGCACTCCTTATTTTCACTGTTTTGTTTATCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGAGAGAAAGCACTCCTTATTTTCACTGTTTTGTTTATCCAT  50

seq1  GGTTGTGGTGTGCTTTGCACAGTGCATGCTTACCGCTGTCTATCTGTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTGGTGTGCTTTGCACAGTGCATGCTTACCGCTGTCTATCTGTGGA  100

seq1  GGGTAGAGGACAACTTGCAGGAGTTGGCTCTCTCTCTCCTTCTACAGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGAGGACAACTTGCAGGAGTTGGCTCTCTCTCTCCTTCTACAGTGT  150

seq1  GAGTCTTAGCGATTGAAGTCAGGTTCCTAGGCTTAACCGCAAGCACCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTAGCGATTGAAGTCAGGTTCCTAGGCTTAACCGCAAGCACCTTT  200

seq1  ACCTACTGGGCCATCTCACTGGTCTCACCTCATCCCTTAAGACAGAGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTGGGCCATCTCACTGGTCTCACCTCATCCCTTAAGACAGAGTCT  250

seq1  TTCATTGGGACTTGAGGCTTGCTGTCTAAGCTAGGCAGATTGGCCAGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTGGGACTTGAGGCTTGCTGTCTAAGCTAGGCAGATTGGCCAGGGA  300

seq1  TCTGTCTGCCTCTACTTCCCCAGAGCGAGGATGACTACTAATGCATGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGCCTCTACTTCCCCAGAGCGAGGATGACTACTAATGCATGCCT  350

seq1  CCTTACCTTGCTTCTTATGTGAGTGCTGGGAATCAAACTCAGATCTGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACCTTGCTTCTTATGTGAGTGCTGGGAATCAAACTCAGATCTGCAT  400

seq1  GTTTGTATGGTAGCCACTTACTGACTGAGCTAGATCCCCAGCCCTCAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTATGGTAGCCACTTACTGACTGAGCTAGATCCCCAGCCCTCAATC  450

seq1  AGACTCTTCAGCTGATTAAAACTCTGGGTGTACGGGTTTTGCATGTAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCTTCAGCTGATTAAAACTCTGGGTGTACGGGTTTTGCATGTAATA  500

seq1  CTCTGAAGTTGTATGCTTTAAGGAAAGGCATGAAAATTCTGTAATAGAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAGTTGTATGCTTTAAGGAAAGGCATGAAAATTCTGTAATAGAAC  550

seq1  TATCCCAGAAATCTGTACACAGATATTAATAGTAGTAATATTTACAATCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCAGAAATCTGTACACAGATATTAATAGTAGTAATATTTACAATCG  600

seq1  TGCCCGAAGTAGAAAGGACACAAGTGTCTGTCAGCTGATGAACGAGATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCGAAGTAGAAAGGACACAAGTGTCTGTCAGCTGATGAACGAGATGC  650

seq1  TATTCAGCCATTAAATAAGTGGCATATTGATGATGTTACGCCATGATGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCAGCCATTAAATAAGTGGCATATTGATGATGTTACGCCATGATGGA  700

seq1  GCATTGAAGATACAAGTGGGAATGATCAGTCAGAAAATGGCTCACACTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGAAGATACAAGTGGGAATGATCAGTCAGAAAATGGCTCACACTGC  750

seq1  ATAGTTCTAGTTGTACTGAATGCCTCAAATATGTCAGTCCAGAGAGATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTCTAGTTGTACTGAATGCCTCAAATATGTCAGTCCAGAGAGATGG  800

seq1  GGAGTATTAACAGATGGCTGAATAGCCGGGAGGCCACGGAGAGTGGAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTATTAACAGATGGCTGAATAGCCGGGAGGCCACGGAGAGTGGAGAG  850

seq1  GCTGTGAAACAAGAACTAATGGGCAGCGGCTTCCTCTGAGGGCAATCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCTGTGAAACAAGAACTAATGGGCAGCGGCTTCCTCTGAGGGCAATC-AA  899

seq1  GTGTTTGAAGTTAGATATGAGTAATGTTGCACAACTGTCTCGATATACCA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGAAGTTAGATATGAGTAATGTTGCAC-ACTGTCTCGATATACCA  948

seq1  AAGGCCAGTGACGGTTGCAGCCGACCGCTTTATGAGATGTACATTTAATG  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAGGCCAGTGACGGTTGCAGCCGACCGCTTTATGAGATGTACATTT-ATG  997

seq1  TAGGTTGTATACTATGTGAACTCTGCCTTAATATTACAGAAAACCCATCG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||| 
seq2  TAGGTTGTATACTATGTGAACTCTGC--TTATA-TACAGAAAAACCATCT  1044

seq1  AGGGGTGTTGGGGACGAGGAGCCAGGAGGG  1080
      | ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGGTGTTGGGGACGAGGAGCCAGGAGGG  1073