BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-348O13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 116,611,872 - 116,745,023
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrim66, Rpl27a, St5
Upstream geneOlfr499-ps1, Olfr500-ps1, Olfr501-ps1, Olfr502, LOC269980, Olfr503, Olfr504, Olfr505-ps1, Olfr506, Olfr507, Olfr508, Olfr509, Olfr510, Olfr511-ps1, Olfr512, Olfr513, Olfr514, Olfr515-ps1, Olfr516, Olfr517, Olfr518, Olfr519, Nlrp10, Eif3s5, BC049265, Tub, Ric3, Lmo1, Stk33, EG668320, 1700095J03Rik
Downstream geneLOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143, Wee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-348O13.bB6Ng01-348O13.g
ACCGA130053GA130054
length1,1341,005
definitionB6Ng01-348O13.b B6Ng01-348O13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,743,885 - 116,745,023)(116,611,872 - 116,612,875)
sequence
gaattctatgcttaaatatgttcactttttaaattggccccttatattga
tttgttaagaagttacacacatatatcaggtgtggaccacatgtattatt
ttttctcctttcccctcctttctcctgttgaacagattctttacataaaa
ttaataaagtttattttactcttgttttttttagtgagttgaggccccaa
cattcacattctcatagtatctgctatttatggtgtaccttagcagttaa
aagcattttgcaacactaacaaaggaacactttcaatccagtcagtgaaa
gtggctgattgacaaccacatttacaaaccacaagtctccccagttctgg
accctgcttattttctgctatcctagatggtgtactgatgcattcctttt
ctgtgtgtttggggataatcacatctgcccccttggaaaaacttcagaat
gagtcccaagtgcaactgtgtgactgccagtgacctagatattgtgacac
aaagctgctcccttacttcagatgtagttgaatgatctcattccggctga
gatggccaaaggtgggtattgacatcagtgacatagtggcagagtaagtg
ggccaaagttccagaaagcattaggctccagaaagggtgtggcttggcaa
gggagcagcaataaaacatgagcaaatgtgtctccttcagggactaataa
agagctgggtgttgtggctcaagcttgtacaactaacgcttcagagacag
aggcagccgagggggaagggccacaagatcaaggccagcctgacttgtct
ccaaaaaaagaaaaagtaatgagctagttcagtctttaccacacatgtaa
aaaataaagggagggaggccatggttcagatgcttattattcaaatgatg
aaatgctggggaggtaaagtcaggcatatctttgggggttcactgggtca
gcagcctagtgaactccgggaagagtgagaagaattgctgtttattgagg
attcatttggagaagaatgtgttattgagagtcactctgtccagaataca
aaacgaacggattcacttacttgttacttttaagcagctttcagtgcagt
cagccttagggttgctaatttaggtctaacccag
gaattcagtaggtctgcaatgaaagccagcagagtgaaactcacaaaacc
ttagaggctcgggtgagtctgctcaggctactggaggagactctcagcct
atgtgtgagcaagtgcctgtttccttgtggaccaggtgatgtgggcaaga
gtcaggcttggtctgtgaaggacttcacgagagaactaaagagagagagc
ttcttaaagagatagactcacatgcaaccgagaagtgtttggcttgactc
ctaaaggagagagcagattgtagcacagttctgcagctgccagccaggac
ctgggacactccctcggaaagcttcgccaggcccagggaacaacattctg
actactttcaggaccatcttttatgactatgagatcactgctgaggttga
atatccaggatctggtccacaacaattgattcagggatgtgaagacaaga
tgcattttctcacatatgccaggcttacagttctgtttaggtgagtcagt
tctcatctctgggctagaatgtcctcttccacaggctgatgtaaatctca
tggagccattataagaggtgttaagagttaggtgtctgggactggagaga
cagtgacaactggagcggtgtcagcaactaagagcactgactgctcttcc
agaggtcctgagttcaattcctagcaaccacatggtggctcacaactatc
tgtaatgggatctgatgccttcttttggtgtgtctgaagacagcgacagg
gtactcatatatataaaataaataaacatttttaaaaagagttcaggtgt
cagcatgctttggtaatggtatacctgctctctacctcagccattatcct
tcattcttccgcaaatctcaataatcacagggaaatacaacccagactcc
acttcagtctgtgagcagcactccagtgacctcaaagttcttttacagaa
gactggggctgcactctacgcagcagagagctcactggcagcaatgggag
actcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_116743885_116745023
seq2: B6Ng01-348O13.b_49_1182 (reverse)

seq1  CTGGGTTTAGGACCCTAGATTAGCAACCCT-AGGCTGACCCTGCACTGAA  49
      ||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||
seq2  CTGGG-TTAG--ACCTAAATTAGCAACCCTAAGGCTGA--CTGCACTGAA  45

seq1  AGCTGCCTTAAAAGT-ACAGTTAAGGTGAATCCGTTTCGTTTTGTATCTG  98
      ||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||   
seq2  AGCTG-CTTAAAAGTAACAAGTAA-GTGAATCCG-TTCGTTTTGTATTCT  92

seq1  GGACAGAGTGACTCTTCAATAAACAACATTCTTCCTCCAAATGAATCCTC  148
      |||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGACAGAGTGACTC-TCAATAA--CACATTCTT-CTCCAAATGAATCCTC  138

seq1  AATAAACAGC-ATTC-TCTCACTC-TCCCGGAGTTCACTAGGCTGCTGA-  194
      |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  AATAAACAGCAATTCTTCTCACTCTTCCCGGAGTTCACTAGGCTGCTGAC  188

seq1  CCAGTGAA-CCCCAAAGATATGCCCTGACTTTACCTCCCCAGCATTTCAT  243
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGAACCCCCAAAGATATG-CCTGACTTTACCTCCCCAGCATTTCAT  237

seq1  CATTTGAATAATAAGCATCTGAACCATGGCCTCCCTCCCTTTATTTTTTA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGAATAATAAGCATCTGAACCATGGCCTCCCTCCCTTTATTTTTTA  287

seq1  CATGTGTGGT-AAGACTGAACTAGCTCATTACTTTTTCTTTTTTTGGAGA  342
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGGTAAAGACTGAACTAGCTCATTACTTTTTCTTTTTTTGGAGA  337

seq1  CAAGTCAGGCTGGCCTTGATCTTGTGGCCCTTCCCCCTCGGCTGCCTCTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCAGGCTGGCCTTGATCTTGTGGCCCTTCCCCCTCGGCTGCCTCTG  387

seq1  TCTCTGAAGCGTTAGTTGTACAAGCTTGAGCCACAACACCCAGCTCTTTA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAAGCGTTAGTTGTACAAGCTTGAGCCACAACACCCAGCTCTTTA  437

seq1  TTAGTCCCTGAAGGAGACACATTTGCTCATGTTTTATTGCTGCTCCCTTG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCCTGAAGGAGACACATTTGCTCATGTTTTATTGCTGCTCCCTTG  487

seq1  CCAAGCCACACCCTTTCTGGAGCCTAATGCTTTCTGGAACTTTGGCCCAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCCACACCCTTTCTGGAGCCTAATGCTTTCTGGAACTTTGGCCCAC  537

seq1  TTACTCTGCCACTATGTCACTGATGTCAATACCCACCTTTGGCCATCTCA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCTGCCACTATGTCACTGATGTCAATACCCACCTTTGGCCATCTCA  587

seq1  GCCGGAATGAGATCATTCAACTACATCTGAAGTAAGGGAGCAGCTTTGTG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGAATGAGATCATTCAACTACATCTGAAGTAAGGGAGCAGCTTTGTG  637

seq1  TCACAATATCTAGGTCACTGGCAGTCACACAGTTGCACTTGGGACTCATT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAATATCTAGGTCACTGGCAGTCACACAGTTGCACTTGGGACTCATT  687

seq1  CTGAAGTTTTTCCAAGGGGGCAGATGTGATTATCCCCAAACACACAGAAA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTTTTTCCAAGGGGGCAGATGTGATTATCCCCAAACACACAGAAA  737

seq1  AGGAATGCATCAGTACACCATCTAGGATAGCAGAAAATAAGCAGGGTCCA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGCATCAGTACACCATCTAGGATAGCAGAAAATAAGCAGGGTCCA  787

seq1  GAACTGGGGAGACTTGTGGTTTGTAAATGTGGTTGTCAATCAGCCACTTT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGGGGAGACTTGTGGTTTGTAAATGTGGTTGTCAATCAGCCACTTT  837

seq1  CACTGACTGGATTGAAAGTGTTCCTTTGTTAGTGTTGCAAAATGCTTTTA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGACTGGATTGAAAGTGTTCCTTTGTTAGTGTTGCAAAATGCTTTTA  887

seq1  ACTGCTAAGGTACACCATAAATAGCAGATACTATGAGAATGTGAATGTTG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTAAGGTACACCATAAATAGCAGATACTATGAGAATGTGAATGTTG  937

seq1  GGGCCTCAACTCACTAAAAAAAACAAGAGTAAAATAAACTTTATTAATTT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTCAACTCACTAAAAAAAACAAGAGTAAAATAAACTTTATTAATTT  987

seq1  TATGTAAAGAATCTGTTCAACAGGAGAAAGGAGGGGAAAGGAGAAAAAAT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAAAGAATCTGTTCAACAGGAGAAAGGAGGGGAAAGGAGAAAAAAT  1037

seq1  AATACATGTGGTCCACACCTGATATATGTGTGTAACTTCTTAACAAATCA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATGTGGTCCACACCTGATATATGTGTGTAACTTCTTAACAAATCA  1087

seq1  ATATAAGGGGCCAATTTAAAAAGTGAACATATTTAAGCATAGAATTC  1139
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGGGGCCAATTTAAAAAGTGAACATATTTAAGCATAGAATTC  1134

seq1: chr7_116611872_116612875
seq2: B6Ng01-348O13.g_66_1070

seq1  GAATTCAGTAGGTCTGCAATGAAAGCCAGCAGAGTGAAACTCACAAAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTAGGTCTGCAATGAAAGCCAGCAGAGTGAAACTCACAAAACC  50

seq1  TTAGAGGCTCGGGTGAGTCTGCTCAGGCTACTGGAGGAGACTCTCAGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGGCTCGGGTGAGTCTGCTCAGGCTACTGGAGGAGACTCTCAGCCT  100

seq1  ATGTGTGAGCAAGTGCCTGTTTCCTTGTGGACCAGGTGATGTGGGCAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGAGCAAGTGCCTGTTTCCTTGTGGACCAGGTGATGTGGGCAAGA  150

seq1  GTCAGGCTTGGTCTGTGAAGGACTTCACGAGAGAACTAAAGAGAGAGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGCTTGGTCTGTGAAGGACTTCACGAGAGAACTAAAGAGAGAGAGC  200

seq1  TTCTTAAAGAGATAGACTCACATGCAACCGAGAAGTGTTTGGCTTGACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAAAGAGATAGACTCACATGCAACCGAGAAGTGTTTGGCTTGACTC  250

seq1  CTAAAGGAGAGAGCAGATTGTAGCACAGTTCTGCAGCTGCCAGCCAGGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGAGAGAGCAGATTGTAGCACAGTTCTGCAGCTGCCAGCCAGGAC  300

seq1  CTGGGACACTCCCTCGGAAAGCTTCGCCAGGCCCAGGGAACAACATTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGACACTCCCTCGGAAAGCTTCGCCAGGCCCAGGGAACAACATTCTG  350

seq1  ACTACTTTCAGGACCATCTTTTATGACTATGAGATCACTGCTGAGGTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTTCAGGACCATCTTTTATGACTATGAGATCACTGCTGAGGTTGA  400

seq1  ATATCCAGGATCTGGTCCACAACAATTGATTCAGGGATGTGAAGACAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCAGGATCTGGTCCACAACAATTGATTCAGGGATGTGAAGACAAGA  450

seq1  TGCATTTTCTCACATATGCCAGGCTTACAGTTCTGTTTAGGTGAGTCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTTCTCACATATGCCAGGCTTACAGTTCTGTTTAGGTGAGTCAGT  500

seq1  TCTCATCTCTGGGCTAGAATGTCCTCTTCCACAGGCTGATGTAAATCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCTCTGGGCTAGAATGTCCTCTTCCACAGGCTGATGTAAATCTCA  550

seq1  TGGAGCCATTATAAGAGGTGTTAAGAGTTAGGTGTCTGGGACTGGAGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCCATTATAAGAGGTGTTAAGAGTTAGGTGTCTGGGACTGGAGAGA  600

seq1  CAGTGACAACTGGAGCGGTGTCAGCAACTAAGAGCACTGACTGCTCTTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACAACTGGAGCGGTGTCAGCAACTAAGAGCACTGACTGCTCTTCC  650

seq1  AGAGGTCCTGAGTTCAATTCCTAGCAACCACATGGTGGCTCACAACTATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTCCTGAGTTCAATTCCTAGCAACCACATGGTGGCTCACAACTATC  700

seq1  TGTAATGGGATCTGATGCCTTCTTTTGGTGTGTCTGAAGACAGCGACAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATGGGATCTGATGCCTTCTTTTGGTGTGTCTGAAGACAGCGACAGG  750

seq1  GTACTCATATATATAAAATAAATAAACATTTTTAAAAAGAGTTCAGGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTCATATATATAAAATAAATAAACATTTTTAAAAAGAGTTCAGGTGT  800

seq1  CAGCATGCTTTGGTAATGGTATACCTGCTCTCTACCTCAGCCATTATCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATGCTTTGGTAATGGTATACCTGCTCTCTACCTCAGCCATTATCCT  850

seq1  TCATTCTTCCGCAAATCTCAATAATCACA-GGAAATACAACCCAGACTCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTTCCGCAAATCTCAATAATCACAGGGAAATACAACCCAGACTCC  900

seq1  ACTTCAG-CCGTGAGCAGCACCCCAGTGACCTCAAAG-TCCTTTACAGAA  947
      ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||
seq2  ACTTCAGTCTGTGAGCAGCACTCCAGTGACCTCAAAGTTCTTTTACAGAA  950

seq1  GAACTGGGGCTGCACTCTACGCAGCAGAGAGCTCACTGGCAGGCAATGGG  997
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  G-ACTGGGGCTGCACTCTACGCAGCAGAGAGCTCACTGGCA-GCAATGGG  998

seq1  AGACTCG  1004
      |||||||
seq2  AGACTCG  1005