| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049E13.T7 (MSMg01no049_e13.b1) | MSMg01-049E13.TJ (MSMg01no049_e13.g1) |
|---|
| ACC | AG278793 | AG278794 |
|---|
| length | 1,265 | 1,326 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 326 (73 - 398) | 516 (122 - 637) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_e13.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_e13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_e13.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_e13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:08 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CATTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTCTAT
TACAAGTTTAACCTTTTAATTTTGGTGAGATTTCAATAAAAGGGTAGTAA
GCACCCACATCCTCAAAAGAGAATACTGCCCCCCGCTGCAGCAATTATCC
ATTGCCATTGCTGTAGCTTTTCCATGCTCCAGTGGCTAGCCTCACACCAA
TGCTCATATGAGCAGCACTCGCTGGGCTTAGTGCATTACCAAAAAGAAAG
ATGAAGGACATGAAGTTGGGAAGAAGCTATGTTGCGAGTCATGAATGATG
GAAATAATAATGAGATGTAGATATGATCATATTTCATTATATACATGTGT
GAGCTTCTCAGAACATAACAAGAAAATAAGGATAAGTAGATGGAAAAATA
TATTATTGAATAAAAAACAACATTCCCCATTCCTCTAAGAGCCCAGAGAG
CTAGCTCAGTAGTCACAAGCACATACTGCTCTGCAGAGGACTCAAACTCA
GTTCCCAGTACCGACCCTCCTGTGTTCTATCATATTCTGTACTCTCCAGC
TCCAGAAGTGTCCAATGTACTCTTCTGTCTTCCACACCCATGTATGTATT
CTAACTAATATCTGCCTTGTGTATTCTTATGTGCATATGACTGTAGTCTC
CCCTTTATGCCTATTATTATCATTCAACTCTTTTTCTTTATTATATATCA
CTTCTTTACATATATTAAATAACCCAACAAGTATCTAAGAATATTTTTAA
AAACTTCTACTAATTTGTCTTTGTTTTTTAATATAATCAAATCATAAATT
ATTTAACTTTTATTCCTAATCTACTTTAAATTTAATCTAATAATTTTATT
ATTTCTTTTTATTAATCTTTTTTATTTTTATTTCTATTTTTTTTAGACCA
ATAAAATTCTCCTCATTCTATCTCTTTTATATCTATCTACTTATATTTCT
ATTATATTTATTACATTTTTCATCTTATCATTTATTTATATATACTTTTT
TTCATAAGATTCATTTATTTTTCTTTAATAATAATATAATAGTGGGCCCC
CCCCCCTTTATTTTTATATAATTTTATTATTTCTTTTAATAAATTTTTTA
TTCAATATTCTTAGATTTTTTTATTACTTATTCCTTTTTATTTTATTTAC
AATCAATCATTACAATTTATAAATTCTCTATCTCAACTTTTATCTGTACC
TTTCATTATTTTCGTTCTATTATTTCTATAATACCTAATCTATTAAATAA
CTTATATCATTGATA
| CCTTTCTTNTTNNAAGATGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAGTCTTTCTGTGGGAGCTA
TAGCTCAGCTCACCACCCGAGTATCAGAGTGCAGGGAAACCAGAAGAGGG
AGGATCGAATACTGAATTTTTACTTAGATAGAGCATATTAATTTCTACTG
CATTTCCTTGGTTAAGTCAGTCACATGACCAAGTCTGCCATCAATGACAG
TTGGGGATACATTCTTCTCCCAGAAAAAGAGTAGATGCCTGTGAGCATTA
ATATAACCTTAAAGCAATTTCATAGGGTGCTCTAAGATAACTGACTCTTT
GTTTTTATTCTCAGAGCAGTGGGCACTCTACTTTTTATCAGAGTTTTGAA
AGCCTGTGATTATCTCTTCTTTTAGGGAATATGAAGAATCACAGGTAGGG
GGACACATTGTTCCCTCTTCTTGCAGTGTGTGGGAAAGTACTTTGTCCCC
TGGATACTTGATGTTCCCTGAACAGCATCAGCTGCAGTTAGCCAATGTGC
CAGTTCGGATACAGTATTTGAAACTTGGAAATCCTGTGAAGGAATGAAAA
GACCTGTGTATCTGCTCAGTTTACAGTTTTATCTTCAGCATTTAGACAAC
CTTGGAATGTAGGGACTGCTTCTACTTTCATTTTCCATGTGAGAATGCTG
TGCCCAAGAAAACTTGTTAATGCTTGTCTTCATATTGATCTGAATCCTGA
CCTATTCTGAGTTCTTGTTAAGTCGTGCTTTTCTTCAATACTTTTTTCAT
AATCTATGGTATATATTCTTCTACCTTAGTGTGTATGATTCCTTATGCCT
ATATATATTTGATATGTCTGTCTTATTTTAGGATTCTTTTATATTTTTCT
TCCTTCTTCTTCATNTTTTTAATATTTACTTATTTTTCTTCTTTTATTNT
TTCTATTATTTATATCTTTATATTTTACTTTTATATATTTTTAGTATCTT
TCCTGTTATCTAATATTCTCTTCTTTTGTATATATTACTGTACCTATATA
CTTTCTCTTTACAGAGTTATCATTATTATAGTACTCATTTTCTAATTACT
TTCATTTCCTTTTTATCTTGCTATTATATTTGTTTTTTTTATTACTTTGA
TGTTATTATTATATCCTCACTTATATCTCCTATAAAATCGTTCTTTGCTC
TACTTGAATATTCATCTATCTGTACATTAAATATCCTTACCTATATTTAT
AATAGATATCTCACATCTGTTACGTCTATAATACATCTATTCATTTATCC
ATTATNTTCATCTCTTCGTAATCCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 9 9 11 11 11 12 14 20 19 14 13 10 8 8 8 8 8 8 8 9 15 15 19 23 29 33 36 36 36 36 36 36 36 36 36 47 43 40 30 28 28 42 42 53 53 53 53 53 53 35
26 12 11 10 23 23 33 33 28 19 10 7 7 7 7 13 22 22 14 14 20 22 23 19 25 34 34 48 48 48 59 57 57 53 50 50 50 50 53 53 39 39 30 30 30 30 30 32 39 25
25 10 12 11 16 14 17 28 34 34 33 33 33 33 33 48 48 47 59 59 48 41 41 37 37 33 28 32 25 25 27 34 39 28 28 25 31 26 33 50 59 48 48 47 47 53 50 50 43 50
50 47 47 48 48 48 57 57 57 48 46 43 43 44 54 54 54 57 54 54 68 54 54 54 48 47 48 47 50 50 47 42 42 43 36 36 39 42 57 57 57 57 57 68 68 59 59 54 54 54
57 57 57 57 57 57 57 54 42 42 42 42 43 44 44 48 57 57 57 50 50 35 32 24 38 38 47 50 50 35 35 35 50 50 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 52 52 52 52 52 54
54 57 57 52 52 43 43 35 43 43 57 44 52 45 45 43 43 44 43 52 43 43 43 52 52 52 57 57 57 57 52 38 32 15 13 13 18 38 43 52 57 57 59 59 59 54 54 43 44 23
23 23 44 43 44 44 31 31 31 43 38 43 43 44 47 57 32 32 20 20 20 41 41 59 59 57 59 54 54 54 54 54 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 39 44 42 39
35 32 32 32 37 42 48 32 32 20 10 21 24 24 33 26 21 28 20 20 20 24 28 33 28 35 32 28 20 23 20 24 23 23 20 18 18 17 17 25 30 25 25 25 32 30 23 18 10 10
10 11 10 17 11 11 11 23 16 24 17 27 26 37 28 28 26 24 19 10 14 26 23 21 20 20 15 21 19 28 22 22 28 29 33 25 28 15 18 11 12 12 24 28 14 13 13 13 13 21
24 27 17 17 17 19 28 15 12 12 11 11 11 21 10 10 13 13 15 16 29 25 35 42 32 30 30 28 42 40 57 57 40 30 24 12 12 12 12 12 28 19 23 23 23 23 22 16 21 16
16 16 23 12 12 12 10 9 19 12 13 19 19 15 11 11 11 10 9 10 8 8 8 8 8 11 11 11 10 10 10 13 10 8 8 6 6 8 8 8 6 7 10 8 12 13 21 13 14 14
15 21 21 13 15 12 11 11 12 13 10 10 10 11 13 9 11 10 10 10 10 10 12 21 17 17 16 11 10 10 18 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 9
9 9 15 13 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 12 12 9 9 10 10 16 15 11 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9
8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 8 8 8 10 10 10 12 13 9 9 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 13 10 9 9 9 11 10 10 9 9 9 8 8
10 8 8 8 8 10 12 8 6 6 6 6 8 11 10 10 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 8
8 8 8 8 8 11 12 9 8 8 8 8 8 12 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 12 10 9 9 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 8 8 8
10 8 8 8 10 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 7 6 8 8 10 12 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 12 10 10 11 8 8
8 9 10 10 11 10 7 7 8 8 9 9 8 8 6 6 10 8 10 11 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 7 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 10 8 8 8 10 8 10 10
8 8 8 8 7 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 10 9 9
9 9 11 10 10 8 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 11 12 15 8 9 9 9
9 9 21 21 16 11 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 13 7 7 8 8 10 8 8 8 11 10 8 9 10 9 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 13 11 8 8 7 7
8 8 10 9 10 9 9 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 9 9 9 8 10 7 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 11 13 13 11 12 12 12 15 11 11 8 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 9 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 10 10 10 10 9 9 9 11 11 11 10 10 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 7 7 7 8 10 10 7 7 6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 11 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 7 7 8 6 9 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 0 3 9 9 11 10 9 9 10 9 7 6 6 6 6 6 9 11 11 8 7 9 9 12 12 18 19 15 8 9 9 22 22 28 24 24 24 28
28 29 35 37 33 37 35 35 35 36 36 36 36 41 41 50 50 47 41 37 21 17 9 9 9 12 12 17 12 10 9 9 9 10 15 17 27 33 32 33 33 33 36 36 50 50 42 42 42 42
42 38 36 36 36 36 33 31 30 30 28 25 29 27 13 12 10 10 10 10 10 15 18 28 37 48 33 33 33 33 33 33 47 47 34 27 17 11 11 11 12 12 13 19 28 34 47 50 50 50
50 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 53 53 57 57 57 57 57 47 53 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 50 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54
54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 44 44 33 33 43 44 44 59 68 68 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 68 68 68 59 59 44 37 24 24 12 12 13 13 12 28 19 41 41 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 32 32 19 20 20 34 41 59 59 59 59 57
54 54 54 54 48 59 46 46 48 43 43 46 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 40 41 41 41 41 23 25 11 11 10 10 12 28 28 47 59 59 47 31 31 23 23 23
34 32 43 43 39 43 43 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 47 43 35 35 31 42 32 39 39 25 23 11 11 12 26 20 8 8 8 19 19 57 37 37 35 26 26 21 21 25 34 34
39 30 30 32 40 40 32 32 32 31 32 28 23 23 31 37 43 34 34 12 11 11 23 25 43 27 23 11 11 11 23 23 37 37 37 28 28 37 37 39 39 39 36 36 37 32 19 22 21 24
21 22 30 37 37 37 30 30 20 23 11 13 13 19 28 30 24 21 19 18 22 29 39 35 30 28 24 24 28 29 35 36 30 27 15 12 12 21 21 25 32 24 21 12 12 16 18 18 11 11
11 22 23 15 15 12 14 15 21 21 11 12 12 18 18 28 28 35 35 34 34 23 23 22 25 25 16 12 14 11 11 16 28 28 21 21 19 20 21 19 10 10 8 8 9 10 15 13 12 9
8 8 8 10 10 10 10 11 10 10 10 11 14 13 14 10 10 12 22 23 11 13 10 10 19 16 13 13 13 11 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 10 6 6 6 7 8 8 10 10
8 8 6 7 10 8 10 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 12 16 10 10 11 8 8 8 8 8 10 12 18 10 10 8 8 8 8
8 8 10 8 8 10 10 8 10 10 10 10 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 10 10 9 9 10 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 7 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 11 10 8 6 6 8 8 9 9 7 8 12 13 8 8 8 12 10 10 10 8 8 6 6
8 8 10 10 13 10 9 8 8 8 10 7 6 3 0 3 8 8 9 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 11 8 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 10 8 8 3 0 3
14 11 10 10 10 10 10 9 10 17 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 8 8 10 8 6 6 6 6 8 10 12 15 10 9 10 8 8 6 6 6 10
8 8 9 9 9 9 15 12 11 12 11 11 9 9 9 9 9 8 8 10 10 12 12 19 16 16 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 7 6 8 10 8 8 8 15 8 8 8 8
6 6 8 8 11 10 10 9 9 9 9 9 8 8 10 13 13 8 8 8 6 7 8 12 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 10 8 8 8 8 9 10
12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 12 8 10 8 10 10 8 6 6 10 6 7 8 9 11 15 11 8 10 8 8 8 8 10 11 11 14 9 8 8
7 8 8 11 13 8 7 7 7 6 7 8 6 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 10 12 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 7 6 8 6 6 11 8 10 10 8 8
6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 11 9 9 11 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 9 9 13 11 12 10 7 6 10 8 13 10
13 10 10 9 9 8 8 8 8 7 8 9 9 9 11 11 10 8 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 9 9 8 10 6 6 8 8 9
8 8 8 7 3 0 3 10 10 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 10 17 9 9 9 9 9 |
|---|
