BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050O16.T7 (MSMg01no050_o16.b1) | MSMg01-050O16.TJ (MSMg01no050_o16.g1) |
ACC | AG279846 | AG279847 |
length | 1,228 | 1,204 |
length of high quality (start - end) | 277 (111 - 387) | 270 (130 - 399) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_o16.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_o16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_o16.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_o16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:51 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (127,177,402 - 127,177,678) | (126,971,178 - 126,971,447) |
---|
sequence | CTATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCATTGG
ATACGTTCCCACCCTTTAGCAGGTTAAGATGATATCATTGTCCTAGGGTG
TCCCCTAAGCCTGGATGAGGCCCCAAAGGTCATATTGGAGATGTGTGAGC
ATTCAGGGTGACTATATTGCAAAGCCTTTGGGTCTGTCCCGCCCTTACCC
CCATGAGCTTCAGAATAGTTACATTAAGTCACATTTATATAATATTTTTA
TATGTTGGCAGTTGGCTCAGGTGCTGTCCTTCCCTCACACTCACTGTTTG
CCCAAACACACAGTTATATTTAGTCCTGGTCTTAGTTAAGGTTTCATTGC
TGTGACAAGACCAACTCTTAAAAAGGACAATTATTTAATTGGTGTTACTG
TTTCAGAGCTTTAGTCCATTAACATCATGGTGGGAACTGTGCCATTGTGC
AGGCAGACATGATGCTGGAGGACCGCAGAGTTCTATATCTTGATCTGAAG
GCAGCCATAAGGACACTGTCTTCTGCAGGCATCCAGTCATCAGGGTCTCT
TTCCACAGAGCATGGAGACCTCAAAGCCCCACCTCCACACCGACACTCTT
TCTTTATCAAAGTCACACCTCCTTCAATAATGCCATACCCCCTAATAGTG
CCACTTCCCATGGTCCATCCACATTCTAACCACCACAGTCCTCATAATCA
TTGCTGGTGATATAACATATTATATCTCTATCATCTGTCGACTCATACAC
AGTGTAAACTCAACTCTTTTACTATAATAAGTCCTTATTTCAATCCTATT
GTATTTCAATTTATTTTTTTTTTCCCTGCTTCCTTCATAAATACCTGTGT
TCAATCAATCTGAAATATTAGAAAATTGTCTTATTTCTGGTCCTCTCTGA
AAATTTTCAATATCCTCCTTTGTTGTTCTTACATTTACATTCCTTTATTA
ATGTTTTTATTTCCTTGTCCCCACTTTTACCCTTCCTTTTCCTATTAAAA
TTATTATTTTTTGTTTCTTCACCTTGTTCACTTAATCTTAAATATTTCTT
TTCCTTTTTCTAATAAAAAATTTTCAATCCTCTATGTTTTCTCGATCTCT
ATTTTCTCCTTATATATTTGATGTCTTCTTTTTCTCTCTCTTTTATTCAC
TTTCTTCTTTTTTCTCTCATACTTCACACTTTTTTCACTTATATGCTCTA
TAATATATTTCTCTCTTCTTCTCTGATT
| NNNTTTAGAAGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAGGACAGCCGAGCTATGCTGAGAAACTCG
GTCTTAGGCCTTAGAGGAGCAAATGACCACAATGTTAGATTTGTTGGTAT
TTTTAACTTAGAAGACTTAGCCTGTAGCTTTTGATGCATTGTCCAGATTG
GAGAAATACATACATGCTCAGAAAGGGTGTGATTTCAAAGAAAAATAAAT
GTGTCAAATCCTTAGACTGTTGCTTAAACCTTGATAGAAAGCTTTAGGTA
CATTCCTAAGACGAAGGGAAATTAGAGTAACATCTTGTAATTAGACTCTC
TGCAGTGATGAAAATATGCCAGATAGTGTAGCCACTAGTCACATGTGACT
ATTGTTGTTGATAAACTGAGCTTTGAACTTAAATTTATATAGCTAAATAT
TGTTTTTTCCCCCCCCCATTGAACAGAATTATACGCTCAAAAAAGAACTA
TCAAGTCATGATCTAAAAAATGACTATTCTTACCTTAATCTCCTTCACTT
CTTTACAGTGTTTTAAAATGCCTGGAGTCAATGGGTCAGAAACTCCTTTT
CTTGACCCAGGATATAAATGAGCTTTCTTCTTATAGAAATTGTCAAACTA
TTAAATGCTCTTCAACTAAAAAGGTGAATGACCTATTGTACCTTTGTAGT
ATGTATTCACAACAGAGGAGCATGCAGCACTTTTGTACAATCCATGGAAG
TGCCAAGAATTTTGCACCAGTAACCCTGGCTAAAATGAGCAAGTCTGACT
TCTGTTTCAAATCTATCATGGAGCACTTGTTTAGTCAGTTACCTCATTAC
CTTCAGACCTTGCCTGTTTGTCACCACCTGTTTTCATAAAATCAGTTAGG
TTGGGCCCTTGCACCCCCTCTTTATACTTGTCGTTTTCCTGGTAATTTGA
AAACTGTTTTGTTTTTTTAATCCTCTCTTGGTGTTCTTTTTTTTTATTTT
TTATCTGGCTTCTTTTTTCTTACTCTATCCTTTATTCACTTGAGTATTCC
TTTTTCTCTTTATCTTTCCTTAATTTTACCCATCACTCTCTTGTATTAAT
TTTTGTTTCTTCTTTTTGTTCTCTTTCTTTTGCTCATTTTTTTTTCTTTT
TTCATCTCCCTACAACTTCTTTTCTTCTCCATTTACTGTTCCCTTTCTTA
CTTA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 9 11 10 10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 10 15 12 10 10 11 15 16 24 26 22 22 22 28 28 29 28 28 29 29 30 22 31 26 15 15 20 16 18 22 22 24 19 23 20
24 31 33 33 33 39 36 26 23 18 11 9 9 13 7 7 6 6 6 6 10 15 16 27 28 28 24 24 34 34 48 50 53 53 53 37 43 28 33 30 30 28 29 31 20 14 14 18 14 17
14 23 10 8 8 8 10 8 10 16 22 26 30 30 28 37 37 35 35 35 39 59 59 48 48 48 48 43 42 36 36 39 42 43 42 42 32 30 40 26 27 33 33 36 37 36 37 35 32 32
28 28 36 28 28 37 37 43 37 37 37 37 47 48 48 48 57 42 39 35 35 35 30 35 35 42 42 42 34 27 18 18 18 30 34 44 57 54 50 50 43 43 43 57 57 57 50 54 54 57
57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 57 50 43 36 37 43 43 43 43 43 35 35 43 43 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 52 52 52 57 57
57 57 57 57 44 43 31 29 43 27 33 33 38 38 20 20 20 38 20 18 18 23 23 33 44 44 52 43 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 59 59 59 54
52 50 50 57 44 44 43 43 37 43 43 44 43 43 57 57 57 54 57 57 57 44 44 44 43 47 47 44 43 32 32 12 12 11 24 24 32 42 32 32 30 37 37 44 43 48 43 59 43 43
43 48 48 46 32 30 17 14 24 24 31 30 34 30 35 32 43 40 37 25 28 30 30 33 37 40 39 36 36 36 43 43 48 30 30 13 13 13 28 21 21 10 9 9 10 11 11 11 12 15
15 28 25 28 23 28 28 15 15 20 25 25 35 28 28 28 31 37 40 34 28 14 14 18 28 34 34 30 25 20 24 15 12 11 11 15 12 11 18 20 12 12 12 21 24 44 59 39 31 41
20 15 15 15 12 14 14 21 29 36 47 42 32 24 12 12 11 19 19 15 15 20 19 24 16 16 11 17 17 32 43 43 44 57 59 43 43 35 41 37 50 43 44 43 52 43 44 42 38 41
43 32 24 12 12 10 13 13 14 14 12 10 10 13 12 19 24 27 23 23 38 43 43 36 12 9 9 9 9 13 13 12 12 11 11 11 11 13 10 9 9 9 11 12 12 14 32 30 37 30
32 19 14 10 11 15 18 12 8 8 8 12 15 10 15 15 12 11 15 15 22 15 12 12 15 21 21 23 28 17 19 12 13 10 9 9 19 19 12 13 18 18 19 16 12 12 18 28 32 32
15 14 14 21 15 10 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 11 29 23 18 13 14 9 9 12 23 23 30 19 15 15 19 21 22 31 31 37 33 25 28 28 16 17 11 10 10 12 15
21 22 23 19 19 22 18 17 11 11 12 13 13 13 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 15 19 20 20 22 22 18 15 9 12 9 9 9 16 24 19 17 16 15 11 11 11
12 15 13 7 6 8 8 9 9 10 10 10 10 16 11 12 13 15 10 9 9 13 13 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 10 10
9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 10 8 10 16 8 8 8 9 11 12 15 16 12 12 12
12 11 13 15 15 9 10 10 10 10 9 9 19 22 22 21 11 11 12 19 19 10 10 11 11 10 13 12 13 10 10 11 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 10 9 8 8 8 8
8 8 8 6 7 10 8 8 9 9 8 10 8 9 8 8 6 7 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 14 16 19 16 11 9 9 9 8 8 8 10 11 8 8 9 10 11
8 8 10 8 8 13 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 15 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11
10 10 10 10 16 12 16 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 7 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 12 14 9 10 9 13
10 9 9 9 12 12 15 13 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 12 11 11 9 9 10 8 8 10 8 10 7 7 8 6 7 10 8 11 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 18 12 12 12 12 10 8 11 8 8 6 6 7 9 15 8 8 6 6 8 8 8 15 11 11 15 19 16 11 10 8 8 8
8 8 8 16 13 6 6 6 10 15 14 13 12 8 8 8 8 6 6 6 8 8 13 9 8 8 8 8 6 6 10 12 34 12 12 8 8 8 9 13 9 6 10 8 8 6 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 8 12 8 9 8 8 8 8 9 11 11 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 9 12 16 15 8 8 6 8 10 10 20 15 15 8 8 10 12 21 25 24 24 35 25 22 17 14 17 19 15
14 24 27 36 43 37 43 43 48 48 54 48 43 23 18 9 10 10 11 17 17 11 11 18 21 31 32 42 36 34 34 34 30 30 32 37 37 40 40 37 37 34 32 30 39 39 44 39 39 43
43 40 33 33 21 18 11 9 9 9 9 9 9 11 11 12 21 21 31 25 25 18 22 12 11 12 12 13 12 11 23 23 42 37 39 41 37 43 43 47 43 48 57 43 43 34 39 39 39 39
40 48 48 48 42 42 42 30 32 19 18 18 24 24 32 42 32 42 34 34 34 46 48 50 50 48 42 28 28 26 26 15 15 13 16 28 32 47 47 48 47 47 42 41 40 40 40 44 42 35
35 42 35 35 42 42 44 57 57 57 50 57 43 43 29 43 43 43 32 19 18 18 28 32 41 38 38 43 50 59 59 59 59 57 57 52 52 52 52 57 59 59 59 59 52 52 43 59 35 35
43 43 43 52 37 52 52 57 57 57 57 44 44 23 23 23 43 43 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 43 38 37 41 41 42 42 57 57 57 54 38 38 21 21 32 44 38 57 52 43 43
35 35 35 59 50 57 50 50 43 44 42 35 41 35 33 28 27 23 23 41 43 32 44 37 48 44 44 36 39 39 43 44 46 59 59 59 57 57 43 43 42 42 42 42 57 59 59 68 68 59
59 57 57 57 48 39 39 42 42 39 39 35 35 35 47 47 26 22 10 10 10 16 19 59 59 43 43 39 42 47 43 48 43 43 43 43 37 26 26 15 15 20 32 32 43 37 37 19 19 12
15 15 15 12 11 11 12 21 25 39 47 47 46 48 48 48 43 44 43 43 43 47 57 48 48 48 48 43 37 32 23 23 34 37 57 59 59 57 57 57 48 43 43 39 30 29 18 17 18 19
11 11 11 19 19 34 22 22 22 14 18 15 13 14 11 13 15 22 28 30 34 39 37 35 35 35 24 29 22 24 24 11 11 11 10 10 16 19 30 32 25 13 10 9 9 10 12 12 15 13
15 12 17 20 26 43 33 33 30 30 30 33 24 21 18 18 32 37 37 43 43 57 57 59 59 59 59 57 57 57 42 36 17 17 12 27 27 48 46 46 46 48 36 40 14 14 14 27 32 54
59 54 54 42 43 43 27 24 11 11 11 25 27 48 48 48 48 59 40 39 35 32 37 37 37 43 43 43 37 39 43 43 47 59 36 35 37 37 26 19 14 16 22 30 30 39 46 59 59 59
59 59 59 59 47 39 37 29 43 29 36 36 43 43 43 43 43 43 43 42 36 35 35 30 35 37 40 39 39 32 36 47 32 47 35 35 35 39 39 40 37 25 23 16 13 9 8 10 10 21
21 33 37 36 36 37 27 30 25 28 26 28 18 16 11 11 12 18 18 30 17 17 10 11 11 22 22 28 28 28 28 32 36 37 36 34 26 26 14 14 20 32 43 43 43 43 43 43 37 42
25 23 13 13 9 13 9 9 11 15 16 28 33 26 26 17 17 11 12 8 8 10 15 18 21 15 14 14 16 22 19 17 13 20 15 15 10 10 10 10 10 13 12 12 16 13 19 12 10 10
15 19 17 14 15 15 14 11 11 15 10 8 9 16 13 15 10 9 9 10 13 17 17 12 9 8 8 7 10 10 12 12 10 10 10 11 17 11 10 9 9 10 9 9 9 12 13 18 16 26
20 15 15 10 19 8 8 8 9 10 21 15 13 14 10 13 12 10 10 10 10 10 10 11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 15 11 10 10 10 10 10 10 11 9 7 8 11 10 8
8 10 10 11 10 10 10 17 10 8 10 8 8 8 8 8 6 7 8 6 8 8 8 10 8 8 9 9 9 12 12 10 10 10 13 12 15 12 12 11 9 8 6 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 9 10 10 10 15 13 10 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 9 9 9 9 16 18 23 24 17 13 11 10 10 10 9 8 8 10 8 10 8 8
8 10 10 10 9 10 10 15 14 10 10 10 20 19 22 11 13 10 10 11 11 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 25 23 11 10 10 10 10 10 10 15 10 10
10 7 7 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 11 11 8 8 10 13 8 8 10 9 9 9 8 9 7 7 8 8 8 8 10 11
13 18 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 11 13 9 9 9 11 12 12 8 8 7 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 10 8
8 12 11 6 6 8 8 9 9 9 10 10 9 9 8 8 9 9 10 9 8 8 8 6 8 6 8 8 8 10 8 6 8 8 6 7 10 11 13 13 10 12 11 8 8 6 6 14 15 18
10 6 6 6 8 8 9 9 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 8 10 7 9 7 8 10 12 11 11 11 8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 6
6 8 10 7 |