BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-086A10.T7 (MSMg01no086_a10.b1) | MSMg01-086A10.TJ (MSMg01no086_a10.g1) |
ACC | AG305446 | AG305447 |
length | 672 | 758 |
length of high quality (start - end) | 511 (49 - 559) | 228 (135 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no086_a10.b1 PHD_FILE: MSMg01no086_a10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:37:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no086_a10.g1 PHD_FILE: MSMg01no086_a10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:37:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTACCTATTCAGACGAGATCCGCGGAATTCACATGTTTGCTTACACAGAG
AAAATATGAATAGACAGCTAAATAAAATAAGACAATTTATTATATGAAAG
AAAAATTCAATAAAGAGAGGTTCTGGAAAAGTCAAGAAGAAATCTTGGAA
ATGAAAAGCTCAATAAATCAAATAAAAGGCTGAGTTAAAAGCTTCACCAA
TGACTGGATCAATGGGAAGAAGGCTTGAAGCAAGATTTATGGCTTAGAAC
ATTCAGACAGTATTACAAGAAAAATAAATTATAAACAGAACATGAATTAT
TTTTTGGGATAAGATTAAAAGACACACTTAGGAATCTTGGCATAGACTCA
GATATAGACATACAGAATAATGACATAGAAAAATCTATTCAGTGAAATGA
TCACATATAATCTCCCAAGTTGAGGGCAACATATGAATATTCAGACACAG
AAAGCATTAAGACTAAATGGACATGACCAGGAAAAGAACTTCCTCATGCC
ATATTATACCTAGAATGCCAAGAGTACAAAGAGGTGAGAACTGCAAGGTT
GCTTATAAAGGTAAACATGTTGGAATAACAGCAAATATTTGAGAAGAAAC
TCTAAAGGTCAGTAAGATATAGCATAATTTATTTCAAGTTCTACAAAATA
TTAACTCAACCTGTTTTATTAT
| NNNNNNNCCCCNNNNCCCCCCTTNCCGNNCCCTCCCCTCCCTCCCCCCTC
TTCTCCTTCNCCGATGATATGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCTGTTCCAAATGCT
TAGAGAGGTGTATCTAGTTATTCCATTGGCCAGGCTCTGGGAGTGGGGGT
GGGGTGGGAAATCCTTACATAAGGAAAGCTGTGACAACATTTGGGAGCAG
CTACAGGCCAGATCACTACCACAGGCCAGACCACTGCTACCTTAGAGGAT
TGAGTTAGAGTCCGTGCCTATCAGCAGAGACCATGAGTTCAAAGACCCAT
TTAACTCTGTGTCCTGGGCAAGCTCATGTTGTTTCCTATGTAAAATGGGT
ACCTGTGTCTGAGTTCATGGTAATGCAGAAACTCTCACGGAAGCTTCAGA
ATTCACTAACGTGTATTTCTGTGCAACCTCCTAGGAATCGGTTGTCTGCT
TCCTACTAGCAACCGACTGCCTGATGCCCGGACCGTCCTACCTCCGGTTT
GGTCGCTCTGGGCCCTTGGCCCTCTACACCACTCCTGCCTACACACTATT
TCACTCTCATTAATAAGTCTTCACCTCTCTTCAGTTTTGAAATCCCCCCT
CCTTTTCTATTTCTGATCTCCAATCTTCATCCAAAGACATTCTGTCCGAC
ATGTCATCTTCAGTACCCCTTTTAGTCTTTTATCCACCTCTCCCTCTGTC
CTCCTTAC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 7 6 6 6 6 6 6 9 9 15 18 22 32 33 33 33 30 28 28 25 19 22 10 9 14 13 9 9 9 11 10 9 8 8 8 8 15 13 20
33 33 50 50 36 36 36 36 36 36 35 37 37 37 40 42 42 40 42 48 42 42 48 48 48 54 57 42 42 42 41 41 41 47 47 50 57 68 68 68 57 57 50 50 50 42 42 35 37 37
42 42 48 57 57 57 57 54 54 47 57 57 68 68 57 57 57 47 47 47 47 42 42 57 48 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 54 50 57 57 57 50 50 57 52 57 50 50
50 50 50 50 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48
47 50 57 47 47 43 57 50 57 57 57 43 43 42 44 44 57 59 41 42 35 35 35 44 42 57 59 59 42 42 35 42 37 44 46 57 57 48 57 57 48 57 59 47 59 41 43 36 44 44
54 48 46 46 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 48 48 48 59 59 47 47 47 50 50 50 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 41 41 41 47 34 28 17 9 9 6 7 6 6
6 7 14 21 24 32 31 31 37 39 43 39 39 47 47 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 40 40 28 37 37 48 48 42 42 30 30 30 26 26 14 13 13 25 25 19 13
13 13 32 34 44 35 35 35 44 42 42 42 39 39 44 48 57 57 57 57 57 43 43 37 36 37 32 27 27 36 40 43 59 59 59 59 59 44 43 32 32 32 32 43 43 43 43 43 43 43
43 35 35 35 43 44 57 57 54 54 52 52 52 43 43 43 43 52 52 52 52 57 52 52 42 42 35 37 37 57 52 52 52 57 57 52 52 52 52 43 43 35 31 28 33 35 33 33 28 33
33 39 39 43 35 35 39 38 36 35 35 35 43 43 42 42 42 43 52 52 52 52 52 52 50 43 52 38 32 36 38 52 57 50 57 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 37 37 37 32
32 32 43 43 43 37 37 37 43 32 43 32 32 33 44 40 43 42 42 33 33 33 35 42 36 36 25 25 25 36 33 35 41 42 41 41 28 25 25 36 36 38 36 30 30 30 37 37 43 41
36 29 36 28 28 13 15 13 13 13 10 10 10 10 15 20 19 20 20 18 18 20 19 15 24 26 32 28 32 21 20 20 20 21 24 34 37 37 37 33 33 17 18 14 13 13 14 15 14 16
16 16 16 14 14 14 22 17 18 15 14 14 19 24 16 16 12 15 18 19 20 20 20 24 28 37 32 34 28 28 28 30 28 24 20 18 17 17 18 19 19 19 19 14 14 17 25 24 25 25
25 25 19 24 22 17 10 10 10 10 17 21 21 19 15 18 20 25 19 25 18 17 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 0 0 3 7 7 3 0 0 0 0 3 6 6 7 9 7 7 3 0 3 7 3 0 0 3 8 8 12 12 12 12 6 6 6 9 9 17 8 8 9 17 21 21 12 9
8 8 8 8 10 9 7 8 3 0 3 7 6 8 10 8 8 8 8 8 17 19 8 8 8 8 23 26 37 34 28 28 28 33 33 36 39 30 25 13 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8
8 13 15 19 12 19 30 27 27 12 11 11 26 27 42 41 28 23 16 10 8 8 8 7 7 7 10 16 12 14 24 28 28 26 33 36 36 47 48 57 36 38 37 37 42 34 43 43 57 41
57 57 59 57 57 43 48 42 42 42 48 48 54 54 48 57 57 51 51 68 68 68 68 54 54 47 57 47 44 44 37 39 35 42 47 59 47 44 42 42 42 47 47 47 48 48 48 47 47 47
47 43 43 37 42 37 37 35 28 42 37 57 57 50 47 43 43 35 43 37 37 35 35 42 43 43 37 37 37 50 43 43 35 35 28 32 27 27 27 36 43 38 21 20 20 32 32 42 37 43
43 43 57 37 35 35 35 35 38 34 27 29 43 42 42 45 57 57 57 52 52 45 52 52 52 43 44 43 35 35 43 43 57 52 52 52 52 52 52 52 57 43 43 27 20 20 43 43 39 39
35 39 31 31 32 32 29 39 39 35 35 35 43 38 39 43 43 57 43 43 34 34 17 20 20 29 21 24 15 15 19 19 27 32 36 23 23 23 23 23 23 27 35 43 43 50 59 43 43 37
38 36 20 20 20 32 32 43 32 32 14 14 12 32 24 14 13 13 13 19 19 32 36 28 24 13 14 13 18 24 15 19 19 32 32 23 23 19 32 24 15 15 13 15 15 15 12 11 12 11
12 11 11 11 17 18 36 41 41 31 28 20 20 23 28 30 30 27 21 19 15 13 13 11 12 12 12 12 11 12 12 18 34 23 25 22 19 21 15 15 14 14 14 14 28 25 23 13 12 12
22 22 15 11 11 9 14 10 10 11 10 11 9 10 10 10 13 28 26 32 28 18 18 11 10 10 11 16 30 37 29 22 15 11 8 8 8 13 15 19 20 15 15 12 12 12 21 24 29 43
43 36 34 23 16 12 11 9 9 8 8 8 8 8 8 10 15 13 10 9 9 9 9 11 11 12 12 12 12 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 10 10 10 13 10 10 10 10 10 10 10
10 11 11 11 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 22 19 21 17 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 11
11 10 10 9 9 9 13 18 15 15 8 8 8 10 8 8 8 9 10 9 9 9 12 9 10 12 11 11 8 6 6 6 6 8 10 9 9 9 11 12 12 12 12 11 11 13 10 9 8 8
8 8 10 14 10 11 11 10 10 9 9 10 9 10 10 10 10 13 11 8 8 10 10 8 8 16 11 9 9 9 9 9 10 8 8 11 11 11 11 11 11 12 11 11 8 8 6 6 8 8
8 9 10 10 10 11 11 13 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 14 12 12 11 11 10 13 9 9 10 8 12 8 8 8 8 8 9 9 9 10 17 12 12 11 11 11 11 9 10
16 9 10 10 12 8 8 8 |