BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123G17.T7 (MSMg01no123_g17.b1) | MSMg01-123G17.TJ (MSMg01no123_g17.g1) |
ACC | AG333026 | AG333027 |
length | 1,262 | 1,315 |
length of high quality (start - end) | 338 (128 - 465) | 334 (125 - 458) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_g17.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_g17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_g17.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_g17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTTTTCTTNNNNGACCATTCGCGCTATCGACTCCTATGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTTTAAATATGAATATCCCTTTAATACTTTTGATGGTATTTTT
GTGTGAAAAAAATTCCTTTATACATGAAATTTACTAGGTACAACATATTA
TGAATATATTTTTTACCATATGATGTATGAATGCTCAGACTGTACATTTA
CTACCAAACTCAAAGCCTGGTTAAATTTGGATCATAACATGTATCGCCCC
ATCAATACCCATTTTACATTTAATACAATGTCTATGCAATATAATTACAG
TACAGCATGTGACAACATAATACATTTGAAGATATATCTAAGAGAATGTT
TTCCTATCAAAATGTCTTTTCAGGGCACCCTTAATCTCATTATTCCTAAG
GCTGTATTTTAGTGGGTTCAACATGGGAACCACAACCATGTAGAACACAG
AGATTATTTTGTTCTGCCCCCTTGAATAGCTGGACTTAGGCATCACATAA
ATGAATGTAACTGTTCCGTAAAATAAAGTGACTGCAGTTGTTGGGAGCCG
CACCCACATTCGCCGTCACAAGATGGCGCTGACATCTTGTGTTCTAAGTG
GTAAACAAATAATCTGCGCATGTGCCAAGGGTATTTTACAACTACATGTA
CTCTGCCTTAACTCGGCCATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAGTGATGCGTC
CTAGGCAGAGAATAACTCTCCTAAATAGGGACGGCGGGTTTTCGCTTTCG
TTTATAAGGGGGCTTTCGTTTTTGGGGCTTGGGGTTTTGCGCTCCTGCTC
CTGAAGATGTTACCAATAAAGTTTTGCCGCAGAATATTCTGGTTTGTTGT
GTTCTTTCCTGGCCGGTCGCGTGAACGCCTGTAATATTTGGTGCCGAAAC
CCGGTACAAGAAAAATTCCTGTATTAAATATTCCTTAAAAACCTGGCACC
GGCACATAGAAAATCCCTTCTTTTGGGATCCATAACTGCGTTTCTCGTTT
ATAAGCCTTCCTCTTATTTTATAATGTTGTAAAAGTATTTTCCTGTCTGA
ATTTCTAAATTTTTCCTCTTGGGTAAACTAACTTCCCTGTGTAATTTCGC
TTTTCTAGGTTATTTCTGGTCTTTGTATTTTCTTTATTATATTTCTTTAA
ATTTTTTTATAATATATAGGGCTAAATTTCTTTCTTAGAGTAATTCTCAG
CCGCTCTAAACTTCTCCACTAGGCAATAAACCCTCTTTTTCCCTTCTATC
TATTTATATATC
| TTTTTTCTCCAGTGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTTTTCACAAGAGTTAGTAGGGTAGTAA
AGGACTCTAGCCTTTAATTGTATAAGCACACAGTAATCTTTGGTGTCATC
AAATACCAATGTTGACACACAGGGTGTCAGGCCTGTACTAACAGGCCCAC
CATTTATGTAGACCAGGAAACAAGTACCTAATGTTAGAAGTCTTAGGGCT
CTTAAGAGTTTCATTACATAAATGTTTGTAGGCAGCTGGTGGGTTTCCCA
AGCAGGTCCCTGTACCTGTAACCTTAGTAAGAGTCAGCCTATGACTAGTT
CCCCAAACACAAGCTTCATGGCTGGTGGTGTTGTTAAACATTCCCGACAC
TGCAATTCCTTCATAACAAGGAGGTCCTGAAGTGAGGCAAAGCCAACAAG
ACTCAGTCATATTAGGATTGGTTTGGATTATCACACTGAAGGCTCCCTGT
ATAAGATTGTGCAGTCTTTGTCCTGTCTTTATAGGGATCAGGAAGGAGCC
ACCTGATATTCTGATAGAGATCAGACCAGTATGGGGCATTGTTGGCGTAT
GCCTGATTGGGTTAGGCTGTAACAGCTGGAGTGTCTTACTGGGAATGGGG
GTCCCTGTTCAGCTAATACCTTGTTGGGCCTCACTGGTTGAGCTGGGGGT
TTTCTATTTTTAGGCAAAAAAGAAGATGTGAGCCTACCCTACCTCTATGT
TGGTAAAACCCAATGCCCCAAGTCATGCCTTTTTGCCGTCAAGAAAAGTC
TGTCATTTTTCCTATTTCACTGAACTTGCACTTTTACATAGTCTAAATCT
ATTGTCGCGCATGGCTTGTCTTTATTTAATTCCATTACCATGTATTTGCC
ATGCCCCTGTCTTTGACTATAGTAAAAAATCCTGCTTTCTCCTTCCTTAC
ATGACGTACCTCCTTTTCCTCTCCCCTTCATTTGAAATAAAATCTCTTCC
TTCCTCCTGTTATAAAAAATCTTGGTTTTCCTTCCTAATTTGGGGCTCCT
TTTTCCCAAATTCTTGGCTTACTTTTTATATTCTTGTTATCTTTCAACCC
ATATTTTGTGTTCTTCTTCTTTTTTTTCCTATCCTTTCTTATTCTTTCTC
TTCACTATAGTCATATCTTTTCTCTAATATTTTTTCTTACTCTCTCTATT
ATCTACTACCTATCCTCCTCTACTTTTCTAATTGTGATTATCCTTCCTCA
TCCTGACTCTCTATTATCTGTTCTTATTCTCTTCCACTTACTACCTATAT
CTATCCAGATCTCTA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 6 6 3 0 0 0 0 3 7 8 7 7 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 16 18 19 8 8 8 13 8 8 8 21 21 28 37 30 32 32 42 43 47 48 48
47 37 37 47 37 37 50 50 36 35 35 35 35 35 31 41 37 37 42 30 22 10 12 10 12 12 11 11 11 17 13 17 10 10 10 21 24 32 43 43 57 53 47 53 53 53 57 59 57 50
50 50 36 36 44 44 50 59 59 59 33 23 12 10 10 10 11 12 15 14 12 11 16 16 15 19 13 15 18 29 34 35 38 38 42 42 42 47 53 53 53 57 57 53 53 53 68 48 48 42
42 39 36 36 36 43 46 54 68 68 68 50 50 50 50 48 43 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 59 57 57 57 43 37 37 46 48 48 51 51 48 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 54 54 59 59 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68
57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 48 48 44 59 44 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 48 50 50
34 34 21 25 15 10 10 8 8 8 8 8 12 29 37 48 59 59 59 59 48 48 48 47 43 46 43 43 43 43 48 43 43 39 39 37 37 43 43 41 43 36 36 30 43 40 43 43 43 43
43 43 39 43 43 48 57 33 33 14 14 14 28 12 13 10 8 8 8 10 8 9 10 11 29 27 41 59 47 48 59 59 59 59 59 59 36 30 25 25 32 34 43 43 30 32 19 22 17 22
22 37 37 37 33 39 37 47 47 59 59 68 68 59 59 46 30 28 22 22 24 37 59 59 59 68 68 59 59 48 57 57 59 59 43 43 43 57 46 48 46 59 43 42 42 32 42 42 44 44
48 48 48 57 44 43 43 43 59 50 41 41 43 50 43 43 35 35 44 44 52 54 54 57 57 52 43 43 27 27 12 12 11 27 27 24 24 24 38 38 43 43 28 42 32 44 43 43 36 32
28 28 28 43 42 47 43 47 47 47 42 42 30 37 33 41 41 43 44 46 57 57 57 47 37 35 35 44 44 54 54 54 48 48 48 57 57 59 48 48 43 47 47 47 35 37 41 41 28 24
27 18 21 21 30 30 48 57 57 57 57 57 44 43 43 43 43 43 47 47 47 35 35 35 32 30 24 15 15 16 15 23 25 26 15 14 14 14 28 24 39 37 43 43 43 43 26 28 18 19
20 23 15 15 18 25 24 24 19 19 11 19 16 22 16 16 28 34 39 39 34 29 30 22 22 14 15 15 15 14 9 9 8 10 10 10 13 13 22 21 17 12 11 11 22 27 28 28 13 13
12 21 21 22 22 16 24 18 15 15 14 14 12 23 12 12 11 18 18 28 34 34 27 25 22 23 22 19 17 15 8 8 13 13 19 11 11 13 12 25 21 22 21 21 16 17 12 19 24 28
30 22 14 10 9 10 10 15 10 10 10 12 13 13 11 10 13 12 20 11 11 11 11 11 11 11 16 12 16 18 11 10 9 12 12 12 11 10 8 8 8 8 8 9 8 12 10 8 8 8
8 8 10 13 12 12 21 18 15 13 12 12 15 10 9 9 9 9 9 10 10 9 15 12 13 10 15 9 10 8 8 8 13 12 14 11 11 12 15 8 8 8 10 10 10 11 11 12 12 12
15 10 12 11 13 10 10 10 9 9 9 12 15 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 10 10 9 8 9 9 16 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11
11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 9 16 14 11 19 16 12 8 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8
11 11 8 8 8 8 13 15 11 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 13 10 10 9 9 8 8 8 9 12 12 10 10 10
12 9 10 9 9 10 8 8 10 10 12 14 11 12 11 11 11 11 12 12 11 7 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 10 8 6 6 10 6 6 8 8 9 9 9 10 10
17 18 17 16 10 10 9 9 9 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 10 13 15 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 7 13 9 9 10 8 10 8 8
8 12 15 11 11 12 12 8 8 8 10 19 9 13 11 18 11 11 8 8 8 6 8 6 9 10 10 12 10 11 11 11 11 11 12 11 9 9 8 8 7 6 8 8 10 11 8 8 6 6
9 9 9 8 10 12 10 10 10 13 8 10 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 13 15 16 11 11 14 7 8 9 9 14 17 13 13 9 9 8 8 7 9 11 8 9 8 10
8 9 8 8 6 8 6 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 6 6 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 9 15 10 10 9 11 10 13 9 8 10 8 8 8 9 19 19 17 8 9 10 21 21 33 30 30 35 36 36 36 36 37 37
33 25 24 25 31 50 57 50 53 50 50 50 50 47 41 27 23 9 11 9 9 9 9 12 10 13 10 8 8 8 8 8 12 18 23 30 36 42 42 43 57 57 43 43 42 42 42 38 53 53
53 50 41 39 37 33 33 22 16 10 10 11 10 15 16 23 16 15 13 13 16 17 15 19 12 16 30 41 59 59 53 47 47 47 47 47 50 57 57 57 68 68 68 68 54 54 54 54 48 42
42 37 32 32 32 42 43 48 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 57 48 50 47 47 47 47 47 47 57 57 57 48 48 57 57 57 47 47 57 57 47 47 54 57 50 43 43 43 43 48
50 50 57 57 57 57 57 57 57 52 43 50 50 50 52 57 57 50 50 50 52 52 57 57 52 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 44 44 52 52 43 44 43 54 43 38 34 39
43 57 38 38 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 45 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 52 52
43 43 26 26 18 21 18 15 20 15 28 24 35 59 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 57 57 44 57 37 37 32 43 43 43 35 43 43 52 52 52 54 59 59 57 57 57 50 50
38 43 43 44 27 27 11 16 16 14 30 24 27 12 11 11 12 16 18 12 12 13 24 34 43 57 57 57 44 59 48 48 48 57 57 54 57 44 42 28 28 31 42 36 43 42 36 28 23 23
28 32 44 43 44 44 57 59 57 47 44 41 28 28 32 37 44 46 57 54 57 54 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 43 43 43 43 43 57 57 25 21 9 9 9 21 21 57 59 34 34
28 30 37 34 23 19 11 8 8 6 6 6 10 21 33 59 59 59 47 47 37 37 28 37 37 39 39 35 32 32 37 36 47 42 48 48 48 43 43 43 48 39 43 37 43 43 43 46 59 57
48 54 54 32 32 19 15 15 23 18 30 30 42 37 41 39 43 39 43 43 44 43 42 37 35 35 42 35 35 35 28 25 19 17 17 24 27 30 19 18 9 9 12 14 32 32 42 42 43 42
42 28 32 32 36 36 33 36 42 42 30 32 32 42 44 57 57 57 39 39 32 32 20 15 15 21 18 20 15 24 25 28 28 19 19 25 21 28 36 36 25 23 34 24 18 14 15 15 16 19
26 34 39 36 36 39 43 43 48 37 37 30 20 20 20 15 12 9 11 12 15 12 12 12 9 9 9 11 13 18 21 20 15 24 21 19 12 14 9 11 9 9 8 15 10 10 10 13 18 19
15 9 9 10 12 13 14 13 11 10 12 12 21 23 33 28 28 28 19 17 14 15 22 10 8 8 12 8 11 14 19 24 24 27 21 17 12 11 11 11 16 11 10 10 13 14 11 17 11 15
15 15 11 12 18 13 19 11 10 9 15 11 12 10 12 12 17 17 10 9 9 8 8 8 10 7 7 7 8 8 13 19 19 10 10 8 8 8 8 10 10 10 11 16 12 14 8 10 6 9
10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 8 9 9 10 10 12 10 12 9 9 8 8 8 10 8 8 9 9 10 8 8 7 11 6 6 6 8 13 12 15 13 16 10 10 10 10 8
8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 10 9 15 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 21 20 20 19 12 12 10 9 9 9 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10
10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 15 13 10 10 10 8 8 10 6 6 8 8 9 9 10 10 10 11 12 10 10 10 10 11 11 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 14
14 12 10 10 10 8 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 14 14 10 15 9 9 10 8 8 8 8 8 10 15 8 8 6 7 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 10 13 11 11 12 12
13 21 24 15 12 11 11 10 10 10 8 10 7 7 8 8 9 8 10 10 10 8 8 9 9 12 9 9 10 9 9 9 10 10 9 10 8 6 6 7 10 10 10 9 9 9 10 9 9 9
8 8 6 6 11 13 9 9 9 9 8 8 8 8 7 7 11 8 9 9 10 10 16 16 10 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 6
7 6 6 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 13 8 8 8 8 6 6 9 8 8 8 10 12 8 8 8 8 10 10 13 12 12 7 6 8 8
8 8 10 10 9 7 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 6 8 10 10 8 8 8 9 6 6 6 6 10 8 8 8 11 13 9 9 9 9 10 8 8
8 8 8 6 6 6 6 10 12 8 8 8 8 8 10 13 10 8 9 6 8 6 7 10 6 6 6 8 8 8 8 8 13 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 12 8
10 11 10 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 |