| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-146D03.T7 (MSMg01no146_d03.b1) | MSMg01-146D03.TJ (MSMg01no146_d03.g1) |
|---|
| ACC | AG349798 | AG349799 |
|---|
| length | 1,224 | 1,178 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 621 (91 - 711) | 753 (129 - 881) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_d03.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_d03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:07:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_d03.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_d03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:07:41 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CCCAGCTTTTNTNNTACAGTGGGCGCTAACGACTCCTATGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTCAAAAAAGACACAAACATTTAAAGTCCTCGAATTAAAAC
TACTTTTGAGATTTCATCTTTGCCAGGTCAGAATGGCTAACACGAATAAA
AAAGCTGACAGTGAATGCTGAGGAGGGGGTGGGGAAGGAAGACTCTCATT
CACTGCGGCTGAGTTTGCAAACTGGTGCAGCCATGATAGGAATCAGTGTG
GAAAATCCTCAAAAAACTGAAAGTAGATTTATCACATGACCTACTACACC
ACTCCGCATCCTATTCCATAGACACCTGCGCAGCCATGTTAACTGCTCTG
TTCACAATAGCTAGAAAACAGAAACAAACCAAATGTTCTTCAGCTGATAA
ACTGACTGTGAAGATGTGGTGTATAAACACTACAGAATACTATACATATA
TAAAGGAAAAATGAAAGGCAAACAAAGTGAGCAAGAGATCATTATACTGA
TTGAGCTAACCCAGACCCAGAAAGACAAACACTGCATATTTTCTGCTGTT
TGTGAATCCTAACTCTGGATCCTTAGATGTGAGTATATAAACTGGAGTAG
CTGCAGATACCAGGAAAATAAAAAGGGCAGTGGGAAGGAGGAAAGAGTGA
GCTCCTAGAAAGGGGAAAATGGGAGAGGGAGGGATTAACTGGGAAGGATG
CTGGAGGGCAGGTCTGATGTAGAGGATGGGATAAATGAATCTCTGATGAT
GTTTGATTTGGTCTCGTGTAAACCTTATTTTTTCTTCTTTGTCATTCATT
CTTACTTACCTTCATTCCTACACCCATTCTCCCTTGCTTGCATACTTTTT
GTTTTGCCTGATTTGCCTCTTGTGCTTATACGTCTTTTGATTTTTTGTCC
TTTTGTATTCTTATTCTTCTCTTTATTACACTTTTGTTTTTTTTTTTTTT
TCCTTTTGTATTTTTTTTTCTATTTTAAATTCTTTCTCCCTTTTCACTTA
TTTTTTCTATTTTCCCTTTATTTTTTTGTTTTTATCCTTCTACTTTATAT
ACTTGTCTCTCTTATTTCTCTCCTTTTCCTTATTCTCCTATTTTTTTTTC
TTTTTTCCTTTTTTTTTCCCTTATCTCTCTATACTTCATTTTTCTTCCTC
TCTTTTATACTTTTTTATTTCTCTCTCCTTCTACTTTCTTATTCCTCTCC
TCCTCTTTATCTCTTTTCTTTTTT
| NCGTTCTTTTTTTTTAGATGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTATAAGCTCCTAACACAGNAG
GAGGAAGCAGTATAGACCTTGGAGGAGTTTCAAAGGACCCCTGTTCTGTT
TTGTTTTGTTTTGTTTCAGTTTCCAAGGTGAGTTTTCAAACTTTACTAAC
ACCAGAGATGAATTTAAATTTCTGTTTATTATTGTTAATGAAAGCAAATG
CATAAATCCTCAAAAAGAGTGATTAAACTAAAGACAAAAGACTAGTAATG
AATTAAAAATCCAAGAACAATGGAAACAATCAAAGAAATTCAACATTCTT
TGATTATAGTCATCGCTGTGTTAATATCTTATTGTTAGATACAATAATCA
ATAATTTTGTAAAACAATATAGAGGCTTTCGATGTGATAACCAGCAATGT
ATCAAATATCAGTACATCAAAAATATCAAAAATATTGTGCCAATATATTT
GAAAATTTAGAAGAAATGCTTAGTTTTAGTGAGTAATTTAAAGAGCCAAT
TTCACCCCAAGAAGCAGACCCAAATAGAGCAATACCTATTCCAATGTCTG
AGTCAGGCTGAGACTCTGCTGTTCCTTGCGGATAGCAGACCTCAACTATA
CAGGTAAATTTTACTTTAAGAAACAGTAGAAAGCATTGTGTGCTTTACAG
TTTTGTCAGCAGCACTTGTGTTTCCAGTATAGGGAGTCCTTAAGGAGAAG
TATCTCTGGTCTCAGATAAATGTTCTCACTGTTTGCACACATGAGAAGCA
CTAACAGGCTGGTGCTGTCTGTGCGCTATACCCCCAGCTCCTGGGGTATC
CCTTGCCTTGCTGCTGAGTTTTTCTTACTGGTAGCCAAAACAGTGTCTTC
TCCCTCTTTCTGGCAGCTTAAAGATGTTTCTAATCCGTGGCCTCATTTAT
ATTGTTAGTTTACAGCCGGGCTTTGCCAGTATGCCATATATAGCAATCTC
CCAGCCCAAATGTATGTATTCCTGATTGACGCCCAGTTACTTGCAAAATA
ACTTCCATCTGGTTCCGGAATAAGCTGTTCCTTTAAATAAAATTTGCGAA
AAATCGGGAATTCCCCTTCCCCACCTTTGTTTTTCCCTTGTCAGTGTGGG
TAAAAACAAATTTCTCTTTTCTTATTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 9 9 9 3 0 3 0 0 3 10 8 3 3 3 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 13 15 19 10 10 10 14 10 8 8 23 23 34 34 34 36 36 37 48 50
50 50 47 40 40 40 37 37 42 21 15 9 9 21 21 59 50 50 50 50 42 39 27 15 9 7 7 7 6 8 10 11 8 8 8 8 6 6 6 8 19 21 37 37 37 37 44 33 53 53
50 50 50 50 50 36 53 50 50 50 50 42 25 23 11 8 6 6 6 6 6 11 11 21 22 27 24 28 28 28 32 43 43 46 37 27 21 13 11 11 11 11 11 18 15 30 27 41 41 41
59 48 48 48 57 57 53 53 36 37 37 37 47 47 53 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 54 50 57 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 42 41 41 37 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 53 50 50 50 50
59 30 23 19 11 11 11 11 11 12 11 11 12 22 28 39 50 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 57 57 50 50 50 54 68 68 68 68 59 68 68 68 68 59 44 44
41 28 20 20 20 32 28 37 44 57 57 57 57 43 43 59 57 57 54 54 48 59 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 68
59 59 57 44 44 40 39 43 39 37 37 28 28 28 32 37 39 39 47 37 35 35 47 43 43 43 43 43 46 48 47 47 41 35 35 39 42 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48
48 48 48 59 59 59 35 35 35 37 37 39 39 36 33 33 28 24 25 27 24 19 20 24 31 33 39 35 39 34 27 19 11 11 19 25 26 39 37 32 24 20 20 20 32 32 42 42 39 36
33 40 29 35 26 28 15 12 11 12 12 11 11 11 15 24 18 18 16 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 12 22 10 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 12 15 11 10 8 8 8
8 10 15 22 21 13 11 11 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 11 8 8 8 10 10 10 8 8 10 13 15 12 14 12 12 11 8 8 7 6 10 8 9 10 11 8 8 8 8
9 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 7 8 8 8 13 10 8 8 6 6 8 8 9 11 11 11 12 9 7 7 8 8 13 13 15 8 10 9 11 9 10 10 17 13 13 10 12 12 9
9 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 8 8 8 10 12 15 10 10 10 18 15 12 10
12 10 11 11 11 9 9 10 7 7 6 7 10 15 10 8 8 8 8 8 9 13 13 19 19 14 9 9 9 9 9 9 10 12 12 12 16 14 14 14 15 13 12 13 13 13 8 10 10 8
8 6 7 8 12 9 7 7 6 6 8 10 10 11 11 18 19 17 10 10 8 8 8 9 10 11 9 9 9 9 9 12 10 14 10 10 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 13 13 13 10 10 6 7 6 7 8 8 13 19 10 10 10 10 15 16 10 10 6 6 8 8 8 8 9 10 9 10 10 13 13 10 9 8 10 10
14 10 15 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 12 10 9 9 8 8 10 10 10 10 13 10 9 11 12 12 11 9 10 12 12 12 12 11 9 10 10 15 15 10 8 8 6 6
8 11 14 11 11 8 8 8 10 8 8 11 12 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 15 12 8 7 6 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 13 10 12 14 20 20 19
15 10 9 8 8 9 9 10 10 13 10 12 17 21 12 8 6 6 7 10 13 8 10 8 10 9 8 8 10 10 7 7 8 8 8 9 8 10 10 8 6 6 8 8 8 13 15 10 10 10
10 12 8 8 8 8 11 12 8 8 8 7 15 10 10 6 6 8 8 10 9 9 13 10 | Open.Hide. 0 3 7 7 8 8 9 11 17 11 21 21 22 10 13 8 6 6 6 7 7 6 6 6 6 15 6 6 6 8 8 10 13 8 7 9 8 9 10 18 19 19 8 9 10 15 19 24 12 12
19 26 35 35 35 37 37 36 28 28 29 29 36 36 36 50 50 50 50 42 41 27 25 9 9 9 8 8 9 8 9 7 11 8 6 6 6 8 9 11 8 8 21 21 27 27 3 0 3 21
21 33 33 33 50 50 50 44 33 33 31 31 23 25 12 10 11 10 10 10 13 12 13 13 13 13 15 13 18 21 21 32 37 41 25 25 8 8 8 8 9 10 18 26 34 37 50 50 59 59
59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 50 53 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 53 57 57 57 57 57 68 68 53 68 57 57 54 54 59 57 57 68 50 50 51 51 50 68
68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 43 43 43 44 47 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
34 30 15 15 9 9 9 9 9 10 15 23 32 59 59 59 59 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 57 48 50 50 53 48 48 48 48 54 54 57 59 59 68 68 68 59 59 68 59 59
43 47 43 43 43 47 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 52 59
59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
54 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 68 68 57 57 43 59 35 35 35 43 43 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 48 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 41 41 41 41 37 37 43 59 59 59 46 46 46 48 48 43 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 57 57 53 50 50 48 57 57
59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 59 46 48 48 48 43 43 43 47 47 59 47 48 48 48 48 43 43 36 36
36 43 28 36 30 28 28 32 32 37 30 28 26 24 19 27 30 28 26 24 39 39 37 35 39 28 28 12 12 12 26 27 37 37 47 57 59 47 47 46 39 37 37 37 26 22 19 19 25 32
32 32 20 20 34 34 44 47 47 47 40 48 48 43 43 34 33 22 17 23 24 28 31 33 33 33 37 37 37 39 37 37 37 34 37 32 32 32 37 28 18 9 9 7 7 6 8 10 19 22
39 41 25 21 10 10 10 12 11 22 30 30 25 30 29 28 22 22 19 27 28 34 37 37 30 30 20 10 10 10 12 15 10 11 11 11 11 14 8 8 8 22 21 18 17 20 20 20 20 15
15 8 8 8 12 12 20 31 35 37 31 19 19 25 26 10 10 7 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 17 18 30 30 24 14 14 12 10 10 12 21 18 22 17 10 8 8 8
8 14 14 30 30 30 23 19 10 10 11 13 10 10 13 13 15 15 15 17 12 19 22 10 11 12 11 14 14 9 9 10 15 15 10 11 8 8 8 10 8 8 8 13 8 8 10 16 11 10
10 10 11 13 11 10 11 12 16 20 15 12 12 9 10 10 12 10 11 11 11 9 11 11 11 13 12 11 8 8 8 8 10 8 9 9 10 11 15 11 9 8 8 8 8 9 9 11 12 11
11 11 11 18 12 11 9 9 9 10 11 10 15 11 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 15 10 8 9 9 10 10 19 8 8 8 11 6 6 8 8 10 14
18 17 11 10 10 10 10 14 15 15 10 10 8 12 9 9 10 10 13 13 10 8 8 8 8 6 13 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 9 9 7 8 8 8 8 11 19 8 8 6 6
6 6 10 10 8 8 8 10 13 19 16 6 7 6 6 8 6 7 12 7 7 8 8 8 15 10 10 8 |
|---|
