BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161M20.T7 (MSMg01no161_m20.b1) | MSMg01-161M20.TJ (MSMg01no161_m20.g1) |
ACC | AG361112 | AG361113 |
length | 1,210 | 1,218 |
length of high quality (start - end) | 411 (44 - 454) | 381 (72 - 452) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_m20.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_m20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_m20.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_m20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:49 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNGGGCATTGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTGTGTTCAGAATGGGGAAAGGCCGAGAAACAGATGGCATGGTCTTAG
AGTTGTCACAGTGAGACCAGAAAGCATCTTCAGGAGGACTAGACCTTCGT
GATGACCCCACTTTCAGATGGATAGTCCAGACAAAACATCTGCCCTCCCG
AAGTTCCTGCTGCCCTCCTGCATCAAGAAGATAGGGGCTGGGTTGACAAG
GGGACTGTTTGGGCAAAGGTGCTTGCTTCCAAGCCTGATAAAGTCTGAGT
TTGGTCCCTCGGACCCATATGGTGGAAGACACAAGCCAACTCTTGCTTCC
ACATGCTTATAAACCCACATACCCCTCCCTCAATACAAAATAAATAAATT
ATTTTTTTAAAAGATGGGACTATTAAACCCGTGCTCCTGAAGCTCCAGCT
ATGATGTTTTCCCCCCCCCCCCCTCCCAGGTGTAACAAGCATCCTAACTT
GGTACGGCCATTGCCATCAGGACGAGCCTTGGGGCAGCAGCTGGATCTTC
TAAGCCTCAGGTTCTTTGTTTTGAAAAATGAGTCTTTCTGAACAATCCTG
GGACTCTAGAGTGATCCAAAAAGGTGATATGTGTAAAACATACTTACCAG
ACATTCCAATAGGTGGGTCTTGCTTAACTATTAACATTATTATTAAGGCC
AAGCATGATAGTACATGCCCGTAATCCCAGCTCCAGGAAGGCAGAGGTAC
CACATCACTTCAAGTTCCAGGCTAGCCTGGGTTACTTAGTGAGATCCTGC
CTCAGAAAAAAATAAAGTCATTGTCATAGGCTGTCATGATGCCTGAGTGG
CCAAAGAGCCTTGCTACTAAGCCTCACATCCTGAGTTCAAGTCCCAGGAC
CTACACGGTGGAAAGAGAGAATGGACTCCTACCAGTTGCTTCTTGACCTC
TATAATTATATGCGACATGCCTGTTGTCCCCCCCCTACTTTTCCAAATAA
TTTAATGTAAAGAAATTTTTAAAATCTTTATTAATTTTTTTTCTAGGTGG
AATTTTTTTTCTTATACTTTCGATCTTTTTCCTACAGAAAACTTTATTTG
GCACATTTTTTAAAAATACCTTATGGCGTCCTCTAATAAAAATAACTTTT
TGTTCTCTCTAAAAAACAACCGTGTTTGGGTTTCTCTCTCCCCACTGCTT
CTATATTTCT
| NNGGGGTCAAGGTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTCTGAAGAAACAGACTGGGAGGAAGA
AGCAGCTCATTATGAGGGAAAAGGGTACCAGCCAGATAAAGTGCTAGCTA
ATCATTAAGGAAAAAGCCAAAAGCGGCTGGCGAAGGCCAGTTTGCTGCTT
GGCCTCCGGGCAGTCGGCTTCAAGGTGCACTTCCGCCCTATGCGGAGCCC
CCGCCCTGCGTAGGGCGTCAGCCCTGCGCAAAGAGACAATGCGCAAAGAG
GCAATGCGCAAACTCATTCATTCCCAGAGAGGAACAAAGGAAAATACAAC
AGGCATTTCCGGTCTTTGAAGGAGCCGAGGGTGGGCGTGTCCACGCTCTG
GTATAATATGTGCAGATTAAAGAGCTTGCCGAGTCGGTCCGTAAATATGG
AATTTTTTTTCCCCCCCCCCCGGGGNAGTTAGACAGGCTAGAAAAAAGGG
GGGTAACTCCTGCCGACTGGCAAATGATTGCAAAAGCCGCTCTCCCTAGT
ATGGGCAAATATATGGAATGGAGAGCTCTATGGCAAGAGGCTGCACAAGC
GCAGGCCCGGTCAAACGCTGCTGCTTTGACTCCAGAGCAGAGAGATTGGA
CTTTTGACTTGTTAACGGGTCAGGGAGCTTATTCTGCTGATCAAACAAAC
TACCATTGGGGAGCTTATGCCCAAATTTCCTCCACGGCTATTAGGGCCTG
GAAGGCGCTCTCCCGAGCAGGTGAAGCCCCTGGACAACTAACAAAGATCG
TTCAGGGACCTCAAAAGTCCTTCTCAAATTTTGTGGCCAGAATGACAGAG
GCAGCAAAGCGTATTTTTGAAAATTCCAATGAAGCCGCACCTCTGGTAAA
ACAGCTCTTTTATGACCAAGCCCCCCCGGAATGCCGAGCGTCCATACCCC
TAAAAAAAAATAAGTTTCATGTTTTTGTCGGGAATTTGTGGTAACCTCTT
ACACATGGTGGGTTTTTGGTGTGCCATTCTTCTAATTCCCAAAAATTCTC
ATGTGTCCTAAAAGATATCTCCCCTTAAAATTTTGTCTGCTAAATTCATT
ATGGTATTTATTACTATAACCACTTTCTTGCAATGTTTACATAAAATCTT
CCTCTCCAGTTGTGGTGATTTCCTCTTCCTTTTTAATAAANTTATCTTTT
TTCTCTTCTTTATTTTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 8 9 10 9 10 15 11 10 10 10 12 13 10 10 19 21 28 28 19 24 15 18 16 29 29 42 47 36 42 42 42 42 48 48 48 50 54 57 50 50 68 68
68 68 50 43 43 43 43 43 48 43 50 50 50 57 57 38 27 17 14 13 18 15 15 14 14 15 24 28 38 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 42 35 35 35 50 50 57 50
50 50 50 50 57 57 57 57 41 46 38 30 30 35 36 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 50 50 43 43 43 28 44 44 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 52
59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 52 52 52 52 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59
59 59 68 68 68 59 59 41 41 35 42 44 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 46 57 43 57 57 59 59 59 59 59 47 47 30
27 16 8 8 6 6 6 11 12 12 12 12 13 17 15 21 14 14 11 17 16 25 28 34 34 59 59 59 59 50 50 53 48 57 48 48 43 43 32 28 19 15 12 12 9 9 9 10 10 10
20 11 11 11 21 22 32 32 41 41 59 59 59 59 59 41 34 23 23 23 34 34 46 57 48 48 48 43 59 47 35 35 41 37 32 30 30 30 37 33 43 30 32 19 23 28 36 39 43 59
44 47 43 43 43 44 59 59 57 59 59 68 59 68 59 59 59 54 54 41 41 20 21 18 34 34 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 50 48 47 50 50 50 50 57 57
44 41 41 46 46 57 46 46 44 48 48 57 41 41 41 38 20 26 13 13 13 26 26 40 44 57 57 57 57 44 42 30 30 30 44 37 48 48 48 42 46 43 41 47 48 46 42 43 36 36
36 43 43 48 48 59 48 48 48 48 37 40 33 33 37 37 37 48 57 59 53 30 30 28 28 24 28 34 28 34 32 34 32 32 32 37 37 41 41 42 33 29 29 28 24 22 24 36 32 32
33 39 36 29 32 25 26 13 15 11 15 15 32 32 34 25 28 28 30 29 19 15 15 19 19 30 30 35 28 20 15 15 11 10 15 22 22 18 22 19 18 20 19 19 8 8 8 8 10 8
8 8 10 15 18 23 23 23 21 19 14 13 13 16 28 27 37 40 37 19 19 10 10 10 19 26 25 30 22 12 14 12 11 15 8 8 8 10 9 10 10 15 15 13 8 8 8 13 24 23
19 16 18 13 14 8 8 8 9 16 18 30 28 28 23 34 28 18 10 10 10 12 13 19 24 19 14 10 10 9 10 15 25 25 18 17 16 30 29 22 22 28 31 22 19 12 9 9 9 9
12 16 17 18 18 16 14 9 10 10 10 10 10 17 21 28 28 26 24 16 15 14 12 16 14 18 18 18 24 23 21 19 28 13 13 13 19 19 20 14 14 13 11 12 15 18 16 15 17 13
11 13 11 11 11 18 20 12 12 10 9 9 14 11 11 8 8 8 8 9 11 18 17 15 13 10 9 11 9 12 9 10 10 10 9 9 15 10 8 8 6 6 8 12 14 19 14 14 14 14
13 10 10 10 8 8 10 12 8 8 9 9 9 11 11 11 10 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 13 12 10 10 8 8 6 6 8 8 11 17 11 11 11 12 16 12 9 8 8
8 8 8 8 8 8 10 15 12 12 11 11 11 14 12 12 13 10 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
10 12 16 16 17 28 17 19 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 11 9 9 9 13 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 12 8 8 6 8 8 9
8 8 6 6 8 8 16 21 10 9 6 6 8 6 8 11 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 8 13 8 8 10 8 9 9 12 14 12
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 13 19 15 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 10 10 7 6 7 8 8 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 10 8 8 8 13 15 9 9 9 12 12 18 19 10 10 10 15 15 29 24 29 17 28 17 28 28 34 34 34 34 34
39 43 36 36 29 40 37 48 48 48 43 43 33 33 25 25 23 32 28 43 43 47 47 43 37 37 29 24 19 19 19 23 37 32 40 25 24 20 20 16 15 15 15 20 32 24 32 23 20 20
24 27 28 40 32 32 32 42 37 37 37 37 35 35 32 43 27 31 31 44 43 43 43 27 19 11 11 19 27 27 43 38 38 20 22 22 43 43 32 32 17 17 15 38 38 37 32 32 32 36
35 37 35 43 37 43 35 43 32 38 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 42 30 22 14 13 22 27 22 29 39 44 52 52 57 52 52 43 39 33 33 35 35 35 35 43 27 35
20 43 43 39 43 43 43 43 43 43 43 43 35 35 35 43 20 31 31 43 43 52 43 43 20 20 20 43 32 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 39 43 35 43 31 31 31 41 41 62 62
52 52 52 43 43 27 27 15 38 18 23 19 19 20 23 43 27 31 31 43 43 36 36 35 24 19 34 32 35 26 26 26 27 27 39 39 43 43 31 23 20 34 34 39 27 24 20 20 20 35
38 38 38 23 23 23 38 27 39 29 29 29 43 43 35 35 33 43 29 29 29 43 43 44 43 33 33 33 38 38 38 32 32 43 43 57 52 54 54 57 54 54 52 52 43 43 35 33 33 33
43 43 43 27 27 29 43 43 43 43 36 27 20 20 41 34 43 43 43 59 28 28 17 25 25 15 15 15 32 32 23 23 23 37 36 36 20 20 20 20 20 36 36 32 42 28 37 28 28 23
18 10 13 8 8 8 14 23 23 28 28 32 41 20 20 20 28 28 28 32 20 20 20 28 28 28 30 28 37 23 20 20 28 28 33 39 35 35 24 30 14 14 14 30 23 28 25 30 20 16
11 12 12 17 16 21 23 24 13 12 11 9 9 12 16 10 10 10 12 12 14 11 9 12 3 0 3 23 23 37 34 32 28 18 15 12 19 17 12 11 11 12 11 11 11 15 10 10 13 12
12 11 11 11 21 21 30 26 30 23 28 23 34 23 25 25 21 19 13 27 27 28 28 18 25 25 37 34 39 35 47 47 57 48 46 46 41 41 32 32 32 36 36 37 47 26 26 13 19 19
13 24 19 25 25 30 34 27 32 35 42 42 37 37 32 32 27 18 18 14 21 15 18 18 19 19 25 36 36 42 36 28 25 21 30 21 23 28 32 20 20 15 19 19 22 32 37 39 43 47
43 46 43 43 43 43 43 47 41 35 35 35 43 43 43 43 39 37 32 32 32 32 30 30 30 37 37 37 36 36 28 26 24 14 14 14 23 23 24 24 14 18 12 18 18 19 19 18 19 20
34 34 59 39 37 37 30 30 8 8 8 8 8 8 15 21 17 10 8 8 8 17 19 18 15 15 19 17 19 16 17 19 26 23 30 32 32 28 33 25 28 33 39 39 39 39 29 29 20 20
23 30 32 32 32 23 28 22 30 24 24 24 23 21 22 24 22 28 34 34 37 35 26 26 27 23 24 20 28 28 19 19 14 18 16 14 11 11 11 17 16 19 12 19 13 13 13 18 22 14
14 14 28 30 19 16 12 12 11 15 15 14 19 12 15 13 11 11 11 19 16 24 21 22 14 10 8 8 8 10 10 11 12 15 14 11 9 9 9 11 11 16 12 14 15 10 10 15 19 19
15 16 10 10 8 10 8 10 21 21 19 18 12 18 12 9 9 8 8 10 13 15 8 8 9 11 12 11 10 9 16 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 15 15 11 11 11 14
12 14 12 12 12 16 16 20 16 16 11 11 10 12 22 22 11 10 8 9 9 9 11 13 18 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 13 15 21
20 18 12 10 8 8 8 8 9 15 11 8 8 8 10 15 14 18 19 19 15 26 13 10 10 9 8 9 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8
8 8 13 15 18 15 14 13 13 9 9 9 10 13 11 10 10 10 10 10 10 15 15 15 10 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7
7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 10 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 10 11 11 11 9 9 9
10 9 11 12 12 12 11 12 12 10 12 10 10 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 10 9 9 9 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8
8 8 11 11 10 11 11 11 7 6 8 6 7 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 10 17 15 9 9 9 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 11 11 10 15 6 6 6 7 8 9 9 12 12 12 12 8 12 7 8 12 10 10 8 3 0 3 12 8 8 7 7 8 6 8
10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 |