BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-173E20.T7 (MSMg01no173_e20.b1) | MSMg01-173E20.TJ (MSMg01no173_e20.g1) |
ACC | AG368944 | AG368945 |
length | 722 | 764 |
length of high quality (start - end) | 533 (47 - 579) | 234 (129 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_e20.b1 PHD_FILE: MSMg01no173_e20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_e20.g1 PHD_FILE: MSMg01no173_e20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:57 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCGCGG
AATTCCTTTACTATCCCGAGACTATCCATAAGTTCTGTGACTCTAGAGAA
CCCTGACTAATACACATGTGAATTCTACAGTTTCCTATTCATTCATATAT
GTATATAATGAATATATGAATGAATAGATATATATTAGGCTCTTTTCTAC
AGTGAAATGATTTAGGTAGGCTAACACTTCTGTTATCTCATATTTTTACC
TTTTTTGTGTGTAAGAACATCTAAAATCTCTTTTAGCTAATTGCAGGATG
CAGTCTTCTCTCTACAGTTCATCCTACTGCTCCTGCTGTAAGCTAACTAG
ATTTATCCTGCACAATTAAGGAAAGATGGACCATGAGCTCGTGGCCAGGA
GAAACAGCAAGTAAGATTTATACCCTTTGACCTACGTCTTCCAAAGCCCC
TCCCCCACCTCTGCTAACAACTTTTGTGGGTTTTCTATTTTGCATTTTTT
AGTTTCCCCATATGAGAATGCAATATTTTTTTCTGTCTGTCTTACTTCAT
CTAACATAAACTCCATGCTTTTCCACTGTATACGAATTCAGGATTTCCTT
CTTTTTGATATCTTATTACATGCATAAGCAATACTGTCTCTGTTCATTTA
TTGATGAATAATTGAGTTGCTACAATGTTTTGGTTATTGTGAATAGTGCC
ATACACAATGGAGTGCAGCTAT
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGCAGGAAGAACGCCAGATCCTGC
AGGTGCTACTGTAAGCTGGTTGACCCCTTAAGAACTGTCTTTTACCATTC
CTAGGTACATACACTGGACAAGTCCTTGTTCCTACTTAATAGTAGATATA
TACAAGGATTATGATGGCAATAATTTCTGAAGTAGAAGAAGCTTAGTAAT
TCAAATGGGTAAATTATGGTGTGTTGTATGACAGATGCTAAAATATCACT
ATAGAAAATAAAAGCTGTGCATGAGGCATATGCCTGCAAGCCCAACATGG
GGGCTGGGGGTGTTTTATTTTGACCCCCCCCCCCCCCCNANAATNTTAAT
AAAAGTTTTTTTTTGTTCTCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAACCAGGGGGTG
GGCGGGGGCCTCCCGATCTCTTGAATACTACAAGGATACCTTAATCCAAA
TTACTTTTTTCTCTTTCACTAACCAGCCTATTTTCGTTTTCCTCATACGT
CTACTTGTCCCTTTTTCCCCCTATCTGTCTTTCCCCCCCCACCCTTTTTC
TTCTTTTTTTTTTCCCCTCCTTTTTATAACCTTTTATTCTTTTTGATCTT
TATATCCCCGTAATATTTGTCCCCAACGTTTTCCCCTTTATTTTCCTTCA
CTCCTACCTCCCTCTCCTTTCTCCTTTTGCCTATTTTCACTTTTTTTCTT
TTCTTTCTCTTTTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 7 15 17 33 39 29 27 24 22 22 30 30 25 24 24 30 32 33 41 46 28 28 24 22 20 19 23 9 9 9 17 12 11 11 11 9 9 8 8 8 8 13 25 34 31
31 31 31 33 33 50 50 47 47 23 23 11 11 11 13 16 9 9 12 18 15 23 23 33 27 33 33 33 39 47 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 47 47 48 57 57 59 57 57 57 57
57 57 53 57 57 50 50 53 57 68 51 51 50 50 50 50 50 50 57 42 27 17 13 11 11 11 16 18 32 44 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 47 50 50 50 50 50 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 47 43
35 33 33 44 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 50 50 43 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 54
57 57 59 59 59 59 48 48 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 57 57 57 59 68 68 59 59 59 43 43 46 57 57 57 57 43 43 43 43 43 43 57 57
57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 48 48 48 41 41 41 39 23 19 10 10 10 16 18 20 20 20 32 34 59 59 59 48 48 48 48 48 57 59 59 59 48 57 57 59 59 59 57 57
57 57 57 68 59 59 59 59 47 43 43 32 32 32 30 39 32 28 20 23 24 41 41 43 37 37 39 37 37 37 44 57 57 57 57 43 47 47 48 59 59 59 59 47 44 35 42 35 35 42
44 44 47 47 54 57 57 47 43 43 59 57 50 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 54 54 57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 43 43 43 44 47 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 59 59 43 38 42 50 50 52 59 54 54 54 59 57 50 48 48 48 57 59 59 57 57
43 43 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 44 44 23 23 23 44 44 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 68 59 59 37 37 28 37 37 48 57 57 57 48 48 54 54 48 48 48 48 48
57 57 54 54 54 54 48 57 57 57 57 47 47 47 42 42 47 48 48 48 59 39 39 39 39 24 26 24 14 14 16 23 21 17 9 9 13 14 23 37 30 30 30 30 37 32 36 37 41 41
43 43 47 50 50 41 41 47 47 47 47 47 53 50 37 37 37 40 36 36 47 42 42 42 42 42 28 28 30 43 42 48 48 47 47 48 48 48 57 59 39 30 30 30 39 37 48 48 43 40
40 40 37 37 37 24 22 22 24 27 24 22 20 25 28 22 22 22 28 27 29 24 19 18 17 16 12 12 18 19 18 12 12 12 18 28 37 28 25 33 33 33 37 39 37 28 28 22 14 14
14 13 8 8 9 13 9 11 11 11 14 28 30 17 17 12 12 12 20 22 15 13 | Open.Hide. 6 6 8 14 14 9 11 9 11 21 21 37 37 47 47 50 50 50 53 53 57 57 53 53 50 50 50 50 47 41 25 25 11 11 10 13 13 10 19 12 19 20 28 22 25 12 12 12 27 26
50 50 36 36 33 37 37 28 34 30 25 15 10 10 10 17 12 14 16 18 15 22 29 29 29 29 29 36 36 47 48 48 57 57 50 50 53 53 53 53 48 48 48 53 53 53 53 53 53 53
53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 27 25 12 11 11 11 20 21 16 22 13 12 12 20 23 36 37 37 37 33 33 36 50 57 57 59 59 57 57 57 53 53 53 57
57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 54 54 68 68 68 50 51 51 51 50 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 50 50 50 51 50 50 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 59 68 68 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 52 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 54 54 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 48 44 30 28 13 13 12 12 12 12 12 25 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59
59 59 59 48 59 59 59 59 30 25 13 13 12 11 11 10 10 10 12 12 21 22 18 15 15 17 27 16 18 11 12 12 21 13 15 10 10 3 0 3 0 3 13 3 0 3 8 10 8 8
8 8 10 11 12 12 12 10 10 12 16 13 12 10 10 10 10 10 10 13 16 13 10 8 8 10 8 12 15 14 13 17 14 11 18 19 22 15 9 9 9 9 12 13 9 10 10 10 11 11
15 13 14 12 10 10 9 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 12 12 9 8 7 8 8 10 10 10 8 13 10 9 8 8 8 8 6 6 6 8 12 13 9 12 10 10 10 10 10 10
10 9 9 9 10 13 13 13 8 8 6 6 8 8 14 17 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 15 16 18 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 9 8 10 10 10 11 11 12 15 15 15 13 13 13 13 17 11 11 11 11 10 8 8 8 8 10 10 18 15 11 11 11 10 10 6 6 6 10 13 10 9 9 9 8 8
8 10 10 10 10 10 15 17 9 9 9 10 9 11 10 10 10 9 9 9 10 13 9 8 8 10 8 8 10 11 12 11 10 10 10 10 10 10 10 10 13 10 10 8 8 10 8 10 8 8
10 10 10 10 11 9 10 10 10 10 9 10 9 9 8 8 10 9 9 9 15 15 12 9 8 8 8 8 8 13 16 13 10 8 8 8 6 6 8 10 10 11 19 10 9 9 8 8 6 6
8 8 10 13 13 11 11 11 15 10 12 10 10 8 8 8 8 11 15 12 14 15 12 10 8 8 8 9 9 11 11 11 10 10 13 10 10 8 8 8 8 12 9 9 9 8 10 6 6 8
8 13 19 24 24 20 18 16 11 11 13 10 3 0 |