| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-263L01.T7 (MSMg01no263_l01.b1) | MSMg01-263L01.TJ (MSMg01no263_l01.g1) |
| ACC | AG405443 | AG405444 |
| length | 740 | 836 |
length of high quality (start - end) | 319 (52 - 370) | 150 (130 - 279) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no263_l01.b1 PHD_FILE: MSMg01no263_l01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:00:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no263_l01.g1 PHD_FILE: MSMg01no263_l01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:00:41 2005 |
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCCCCATCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCAAGACAGTGTTATAAAACGAAACAAAAGTGCTAATATGA
GTATTGGAATTTAAGATATAGGATTTTCACTATTTTAAAATTATGAAATT
TTACAGCAAACAAATCAAAAGGGTTGTTTAAAACAATAAAATGCTTAGCA
CATGGCTTACAATCAGTGAATGTTATCTTTTTAGAAAACACTCCAAATAT
CTTAAAATCAGCTAAACCTCTATTTTGAAAACCAGACTAAAAATACCCAA
AGAATACTTCAGAACTAAGACTCTCTTATGAATAAGATATAAAACTCTTC
AATGCCGTACATAACAAATATTTTTACATCCACGCACCCTCACAAAATTG
ACTGCATCACAACCAAGTGGCTATTCAATCTGAGAAAACATTCCAAATGC
AACCCAAGGCTGGCAAGATGGCTCAGCAGGTAAAGGCACTTGCTGCCAGA
CATGACACCTGGAGTTTGATCCCAAAACCCCCAGGGTAGACAGAGAGAAC
CAACTCCTACAATTTGTCCTCTGACCTTCATACACATGTGCCACAGCAGG
AGCACAAATACACTCATATGTATATGTATGCACATGCACACACATACTCA
AATTAATAAAGTAATAAATATCACCCATGACACAATGTTAACCTAAACAA
TGTGACATAATGACAAAATTCCACATGGCTGGCATGAGGT
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTACAGAGTGACTTTTTAATTATTA
CAGCAGTAGAGGAAATCTGTGTCTCCCAGATGGCTCAACAGTTAAAGTCA
CCTACTGCCAAGTCTGATGACCTGAGTTCAATCCTAGGGCCCATGTGGTA
GAAGAGAACCAGCTCCCACAAGGTGCCCTTGTATCCCCATATGTGGGCTG
GACTCGCCCCCCAAATACAAGTAAACACACAAAATAAAATGTGCTTGTGA
TGGTTTGTATATGCCCTGCCCAGGGAGCAGAACTATTTGAAGGTGTGGTC
CTGTTGTAGTATGTGTGTTTTTGTGCCCGCGCCCCATAAGATTTTTTCTT
AGTTGCCTGGAAATCCCCCCCCCATTTAATAACCTTTAAATGTATATGGT
TGTATTCTTCTCACCCCCCTGCCCTTTTTTCCGCCCTGTTTCCACCTCTG
GCCCCCGCCTTTTATTATTCTCGTTTTGTCTTCTCTCCCACCCTTTATAA
TTTCTCCTATTTTATCTTTTATCTTTCCCCCCCCTCCTACTACGTTTGGT
ATTTATACGGGCCCTGTTTTCTTATCATTCCCACCCCCCCTTCCCTATAT
ATTATTGTGTTTATTCTTTAGGTCTTTCCCGGCTCTCCTCTCCCTCTACA
CCCTTTCTTTCTTTTTTTTACCGTACCACTTTTTCTCTTTCTCTTCTAAT
TCTTACTCTCCCCTCTGTCTTCTTCCATCTGTCGTCTTTTTTCTTTTATC
GTCTTTTCCGTGGATTGTAAATTCCTGTTATTTTTG
|
| quality values | Open.Hide. 0 3 11 11 11 9 9 12 10 11 13 13 13 14 28 26 29 28 28 22 22 30 39 28 24 23 32 30 30 39 43 30 26 28 28 30 36 48 44 43 39 36 36 36 43 43 29 29 17 23
23 42 41 57 57 40 40 42 42 50 48 48 50 50 50 50 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 54 54 54 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
50 50 53 53 53 50 50 50 53 53 53 53 57 50 50 47 47 47 41 33 31 31 31 30 29 21 17 9 9 9 9 9 18 28 34 46 59 50 50 50 53 36 50 50 50 36 36 53 53 50
50 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 54 50 50 50 50 48 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 68 57 59 40 36 28 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 59 59 59 59 59 37 37 35 42 34 42 35 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 57 59 57 57 48
48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 24 13 12 10 10 10 12 13 13 10 10 12 12 18 25 25 9 8 8 8 8 8 10 14 11 10 10 10 11 16 16 28 34 39 50 50
59 59 59 59 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57 59 57 48 46 46 43 46 47 59 28 31 12 12 11 11 11 15 15 13 21 30 27 27 21 20 20 23 23 28 30 32 47 43 48 48 48
48 48 48 48 48 48 47 43 43 43 43 59 43 48 48 57 57 46 46 43 37 37 28 32 20 31 31 59 59 59 47 47 47 47 57 54 54 54 59 59 57 59 59 57 44 42 42 35 44 44
57 57 57 57 48 48 48 48 44 44 54 54 57 57 57 59 59 59 59 57 50 50 48 48 57 59 52 52 52 52 52 52 52 52 43 44 33 31 31 42 43 52 57 52 57 43 43 43 37 37
37 57 57 59 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 37 37 43 50 54 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 57 57 59 59 48 47 47 44 44 43 43 43 35 35 35
44 42 57 57 57 57 57 48 48 48 47 47 39 43 43 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 48 48 48 48 57 57 57 47 43 43 37 37 30 35 35 39 37 30 30 17 15
19 27 34 37 37 39 39 31 26 33 33 33 39 37 37 33 33 33 33 33 27 30 17 17 17 25 25 20 24 11 11 11 22 22 36 39 36 36 27 30 25 22 22 24 25 24 27 22 28 24
33 34 36 30 32 23 28 28 34 34 37 24 16 12 11 11 16 22 22 24 34 31 24 19 11 13 11 16 24 28 20 14 14 14 28 28 25 22 22 22 | Open.Hide. 8 8 8 8 11 9 9 15 10 12 14 20 20 30 32 25 25 32 29 26 37 37 39 34 31 39 37 30 30 22 21 11 10 15 13 10 10 10 17 16 30 24 32 32 37 43 43 36 36 36
42 36 36 41 41 28 28 28 34 19 13 17 10 8 8 11 11 11 9 10 19 19 30 31 46 59 32 24 18 18 31 31 44 36 36 37 37 37 47 57 57 48 48 48 57 57 57 59 42 33
22 22 29 29 33 33 33 32 32 35 39 39 39 47 37 27 26 22 26 20 18 18 12 11 8 8 8 8 8 15 23 33 33 37 26 32 19 23 23 37 30 59 43 43 36 34 34 29 29 32
36 43 43 57 57 43 40 29 28 30 37 43 57 57 48 50 48 47 47 47 47 43 41 48 47 48 48 57 57 44 59 43 43 43 47 42 44 43 42 42 35 42 42 57 44 57 54 41 41 27
23 23 36 36 43 46 46 47 47 47 57 47 42 42 42 42 44 43 44 44 44 57 57 34 34 24 24 39 44 44 44 37 41 43 47 43 43 43 46 48 54 54 54 46 46 37 43 43 47 43
54 48 48 40 40 25 28 28 30 26 28 23 29 36 43 34 34 23 23 23 32 28 30 28 37 23 23 20 20 20 20 20 18 17 22 23 20 15 10 10 10 10 9 10 10 18 18 23 23 31
24 20 28 28 28 28 36 32 32 37 23 24 11 11 11 22 27 36 28 23 23 16 12 11 11 11 12 12 11 22 12 14 18 23 28 28 34 34 39 39 28 28 16 11 10 15 10 10 10 20
21 36 32 32 31 20 15 15 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 13 10 11 11 10 10 9 7 8 8 11 11 12 11 17 17 12 17 10 12 9 9 9 10 9 9 9 10 10 16 13 13
10 11 11 12 13 17 17 13 13 10 12 10 11 11 9 8 8 10 8 8 8 10 8 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8 8 9 10 9 9 9
9 10 10 10 10 11 10 8 8 11 10 8 8 8 9 10 10 9 12 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 6 8 10 10 9 9 9 12 9 11 8 8
8 8 10 15 11 12 10 11 10 9 9 9 9 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 6 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8
8 13 9 15 8 8 8 6 6 6 8 10 10 11 11 11 11 9 10 9 9 9 9 8 8 8 9 13 9 12 12 10 16 16 12 12 10 10 8 8 8 8 10 10 10 11 9 9 9 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 6 8 6 6 8 8 10 9 12 10 10 13 15 16 13 13 11 11 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 12 11 11 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 6 6 10 10 10 9 8 8 8 8 10 8 13 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 10 8 8 8 10 15 12 8 8 8 10 18 24 19 21 12 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 21 15 17 12 10 8 10 8 7 7 7 7 8 8 8 6 6 6 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 12 15 10 11 8 8 6 6 8 10 12 13 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 13 8 8 9 13 13 9 8 8 6
6 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 11 11 9 8 8 6 6 10 8 9 9 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 15 9 9 |