BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-277J20.T7 (MSMg01no277_j20.b1) | MSMg01-277J20.TJ (MSMg01no277_j20.g1) |
ACC | AG415465 | AG415466 |
length | 757 | 776 |
length of high quality (start - end) | 264 (372 - 635) | 284 (77 - 360) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no277_j20.b1 PHD_FILE: MSMg01no277_j20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:17:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no277_j20.g1 PHD_FILE: MSMg01no277_j20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:17:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTTTGG
AACTCGCTTTGTAAACCAGGCTGGCCTCCAGAACTCAAGAGATCCTCTTG
CCTCTGCCTCCCCAGTGCTGAGATTAAAGGCAGAGTTTTATTTTCACAAT
ATTTGGTATATAATATCTACTGTATAAATATACTGAATGAGAAACAAATA
CTCTTTATATAACTATCTACTAAATGAAGGATCCTCCTCTAAAGACTATA
TAAGAATTTGTTTCAAACATAGGACTCTAAAAATAATTACACTCTAATGG
GGTATAGTGGTACATAACTTTAATCCCAACACCTGGAGGGCAGAGGCAGT
TTGTTACCAAAGCCAGCCTGGTCTACACAATAGTGCCAAACCTACACAGA
GACAGCACTTCTCAACATAATGTGTGAGTGTCTATGTGTAAACATGTATA
CACAGAAACACACACACACACACACAGACACACACAGACACACACAGACA
CACACACAGACACACAGACACACACACACACACACACACACACACACAGA
GTTATAGACAATGTTTTTTTTTTAAAATTCCAGTTATCTTAATTTCAGGT
TTAAATCAAGAAGAATTACCATGAACAAAGAGTCATACCAGAGAAAGTGC
TGATTGAGTCTGATGATAAAAAGGCTCCGGGAGGGATGAGAGGTGAATGC
ATTCAGGAATTTTAATAGTGCCTCCATCCAAATCTGCTATGATTACATCT
AACTAAA
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGGTGAAATTATTTATCTAGAT
GCTATTAAACTAGATTAATTTTACGTTTGATATTCATTTAAAAGTTCTGT
ATATTTTTAAAAATCAATCTGCCTTAATGTGTTAGAGAAAGTATTTGAAA
TGCTTTGTAAGTTAAACAATGTATTTCATGTGAAATAAACAAAAGATAAA
TTTTGCATAAGTGAAATACATTTTGAGGCTGAATTTGTGTGTGTGTGTAT
ACCATGGTGTGTGTGTGTGTGTATACCATGGCGTGTGTGTGTGTATACCA
TGGTGTATGTGTTTTTTTACCACGCCCCATGTGTGTGTGTACCATGGTGT
GTGTGTGTGTGTATACCATGTCTATATAAAAAAAAATAGCTTCCTGGAAT
GTGTTCTCTCCTACTAAGAATGTTCTGGAGATTTTACTTAGATCACCATA
CTTGGTGTCACCTTCTGTTCCATCTTCTTGGCTTACTTAATGTGATTTCT
TGTTACCTATTATCTCCCTTAATTGTTGCTCATTTATCACATGCACTGTA
TTTGTAATTGACCTCTAATTTACTTGTTGCATCTACTCATTATCTTTTTA
ACCCCTCCCCCCTCTTATCTTATTTCTCCACATCTCTCGATAACTTATTA
CAAATACCCCACACCATATTTACCCCTTCCTAATTCCGTTTATTTACCTT
CCCACCATATTACCTTCCCTTTATCT
|
quality values | Open.Hide.23 28 29 28 22 17 19 10 8 8 19 19 33 33 44 31 24 26 26 26 33 32 26 19 20 20 34 41 57 59 42 42 28 30 30 42 41 68 68 51 51 47 50 50 51 68 44 41 19 17
12 20 12 21 14 34 34 57 59 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 51 47 47 42 42 47 68 57 57 57 57 57 57 50 47 40 37 37 42 59 59 59 59 59
59 59 41 41 37 28 28 28 23 23 17 12 12 9 11 23 33 47 50 50 41 41 53 53 53 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 47 47 47 47 47 51 68 68
68 51 51 51 68 50 50 54 54 54 68 68 68 51 51 51 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68
68 68 68 68 68 59 44 36 21 20 20 31 28 39 42 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 50 53 53 50 59 59 41 31 24 15 10 10 10 10
9 8 10 11 12 12 12 15 15 12 12 11 12 11 11 11 11 16 16 11 11 12 18 30 34 48 48 48 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 50 50 50 53 57 50 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 44 44 27 27 23 28 28 27 27 25 28 28 42 42 59 59 68 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 59 59 59 54 54 54 59 59 57 57
48 48 48 57 57 68 57 57 57 57 50 50 48 50 50 57 57 54 48 50 44 43 43 39 37 43 43 46 48 48 47 47 47 47 43 47 44 48 48 48 48 48 48 48 48 48 47 47 43 44
57 43 39 39 37 37 41 41 39 43 43 43 47 46 46 48 46 46 43 36 37 39 39 39 43 43 43 43 43 43 40 43 43 39 36 37 39 37 32 28 28 32 32 32 31 32 31 31 39 39
39 32 28 39 37 36 36 36 35 31 31 43 37 41 41 47 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 47 59 35 35 35 35 35 39 59 47 43 41 30 29 31 29 37 37 37 37 40 40
40 48 39 39 32 32 32 31 31 34 30 31 32 29 23 25 32 28 28 33 34 40 41 39 39 39 38 32 34 37 37 32 24 16 14 14 21 22 20 19 19 17 17 17 26 24 35 36 31 32
28 28 22 24 16 21 11 18 19 21 24 30 30 18 15 7 7 7 9 8 14 12 12 15 28 22 22 15 21 22 25 28 24 11 10 10 15 19 12 13 11 12 12 24 24 34 28 26 21 15
19 15 13 10 10 10 12 18 19 16 17 16 15 12 14 15 13 17 16 15 17 17 24 28 25 28 24 18 18 16 17 18 25 28 31 23 28 28 34 26 25 21 17 12 18 12 15 11 12 12
17 10 11 11 14 16 14 | Open.Hide. 9 9 8 13 8 8 8 8 8 15 17 39 35 39 41 41 41 47 42 50 44 53 53 53 50 50 50 50 41 29 23 14 12 10 10 21 24 27 27 28 33 33 44 30 53 53 57 57 57 50
36 36 33 33 33 50 41 25 22 9 12 8 8 8 8 8 15 22 19 11 9 9 23 23 38 38 39 53 53 57 57 57 57 47 47 47 57 53 53 53 53 68 68 68 68 57 53 53 53 53
53 53 57 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 23 23 20 17 17 17 27 20 12 12 11 11 11 12 25 30 41 42 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59 57 57 53 53 53 53 57 53 53
53 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68
68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 41 41 30 30 32 41 33 43 32 43 42 54 47 47 43 43 46 57 59 59 59 48 48 57 57 48 59 59 59 59 59
59 48 47 36 36 25 25 22 22 11 11 11 17 17 24 15 14 13 21 16 10 8 8 8 8 10 11 11 11 12 11 11 12 12 18 28 41 48 48 48 57 57 48 43 43 43 43 36 43 43
44 40 39 35 35 35 32 32 32 28 28 23 23 28 28 34 37 30 25 15 11 11 12 9 10 9 9 9 11 11 9 9 9 9 9 10 10 10 14 14 24 30 37 34 28 17 14 14 15 15
15 12 13 21 22 21 21 15 23 13 16 16 16 11 12 12 11 11 11 15 13 16 22 14 10 10 11 11 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 13 15 10 12 11 13 18 21
22 17 17 10 10 10 10 10 11 17 15 27 27 30 17 10 10 9 8 12 13 14 16 14 10 10 14 12 13 10 14 14 10 12 7 7 7 10 10 11 10 12 9 9 9 8 15 10 10 10
10 8 9 9 9 7 7 8 8 8 10 10 9 10 10 10 10 10 12 12 12 15 15 15 20 11 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 7 9
9 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 10 8 6 6 8 8 11 11 11 8 8 6 6 8 10 9 7 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 15 13 10 10
11 9 9 8 8 8 8 10 8 11 10 10 10 10 16 10 9 9 10 8 10 9 7 10 8 11 11 12 12 9 9 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 10 10 10 10
10 10 11 9 9 9 9 9 8 8 7 6 8 6 6 9 7 10 8 8 8 9 9 10 10 12 10 10 8 7 7 7 8 10 15 15 11 11 11 13 13 19 17 24 9 9 9 10 8 8
8 8 9 8 8 6 7 6 6 6 8 8 11 11 11 15 15 15 15 13 10 8 8 8 8 8 |