BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-307B08.T7 (MSMg01no307_b08.b1) | MSMg01-307B08.TJ (MSMg01no307_b08.g1) |
ACC | AG431554 | AG431555 |
length | 726 | 728 |
length of high quality (start - end) | 656 (71 - 726) | 646 (77 - 722) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no307_b08.b1 PHD_FILE: MSMg01no307_b08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:48:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no307_b08.g1 PHD_FILE: MSMg01no307_b08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:48:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAGAGGAGGCGCG
GAATTCTCAATAGTTCCATCTCCAATGGCAGAGAGAAACACTTAACAACT
GTTTATCATCTTAGCTATCAGGGAAAAATACTAATCAAGACGACTCTGAG
ATTCCATCTTACACCTCTAAGATCAAAACCACAAGTGACAACTCACGCTG
GGGAGGCTATGGAATAAGGGAATAAGAGGAGCTACTCTTCCACTGCTGGT
GAGAAGGCAAGCCTGTACAGTCACTGTGACTCAATATGGCGGGTCCTCAG
AAAGTTGGGAATCAACTTACCTCTAGACCCACTAACATCATCTTAGGCAT
ATACCCAAAGGACACTCCATTCTACCACAGAAACACTTGCTTGCTAACTA
TGTCCATTGCAGCTTTACTCACAATATCCAGAAAGTGGAAGCAATCTAGA
TGTCTATCAACTGAAGAATGGATAAAGAAAATGGGGTATTTTACATAATC
GAGTATTTCTCAGCTGAAATAACATTTAAAATGACATAAAATTTTCAGAC
AAATGGATGCCACTAGAAAAAATCATCTTGAGTGAGCTGACCTTAACTCG
GAAAGACAAATGTGGCATGCACTCACTTATAAATGGACATTAAGCTGTTA
AGTAAATGATAATCAAGCTACACTCCACAGATCCAGAGAGGTTCGATACA
GAGGACTCTAGGGATACATGGATCAT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGCCAGCATCAGCTACATGAGT
TCAAGTTCAGTGTGAGCTACCTGAGACTGTGTCAAAAACAATATTGCTTT
GAACGGAATCAATGCACGCATTTGCTTTATGGGATAACCTCTTCAGGTTC
TGCGTTTACTAGCCAAGAGCATCCTGACTGGTGACAAGGTGACATAGGCT
GAGGGGCTGAATGACGGGTGAGCTGTGGTAATGAGCAGCAGGAAAAAGTG
GAAGGAGGACTCAACTCTCTTCCTCACACATCTGCAGATGACCAGGGAGG
TTATGAGTCTTCCTGGACGTGGGATACACCTTCAGGAAGGGGTCTGTTCA
AGGGGACCCCCACCACACCCAACCCTGGATCCACAGTTACCACTAGCACC
AGCAAGAGTCCCGGCCACCCCTTTCCAGCTCCAAGGGCCCGTGCAGGTGA
GGCATGGGCAAAGAGGCCTGGGGAGTATGTGCCCTGGGGTACAGAGATGG
GCTCCAAGCTCCTAGGGGTAACTACTTCTTACTTCAAAGATCAAGCAGAG
AGACAGCCTCGAACTCACACACTTCCTCCTGCCTCTGACTCTAAAAGGCT
GGGGTTGAAAGCATGGGCTACCACGCCTGACTAACTCACTTCTTTTCATT
CAGTTTAGAACCCCAGCCCAAGCGATAG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 8 8 12 15 28 39 43 37 37 32 31 31 28 30 28 24 24 30 30 30 39 47 30 28 25 22 19 10 13 9 16 11 8 8 7 9 9 12 12 8 8 8 10 10 21 33
33 33 33 33 39 37 37 37 34 23 12 7 7 7 6 6 7 6 8 10 15 24 28 28 33 29 43 44 44 50 53 53 59 59 59 53 57 57 50 50 50 53 57 47 47 42 42 42 47 54
68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 36 36 35 35 39 30 57 57 68 68 50 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 68 57 57 50 50
50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 51 51 50 50 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 43 27 24 11 11 11 16 27 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 43 36 34 20 20 9 9 7 8 8 10 13 30 59 59 47 37 35 35 59 39 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 59 59
59 59 59 59 59 59 43 41 35 39 44 59 59 59 59 54 57 57 57 54 54 54 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 54 48 46 47 43 43 44 47 57 57 57 57 59 57 54 54 48 47 47 47 43 46 46 48 54 54 57 46 46 42 48
47 48 48 43 43 39 43 43 43 39 39 39 32 30 30 39 39 57 57 37 37 30 30 37 37 37 41 40 41 39 39 30 28 25 31 31 30 37 34 41 29 29 17 24 24 37 32 37 28 37
37 43 39 42 47 47 47 47 47 43 43 36 36 33 37 37 30 30 21 19 16 23 23 34 34 30 | Open.Hide. 6 6 6 13 13 8 8 8 8 15 17 36 37 37 37 47 47 59 50 48 37 37 35 35 35 32 41 41 41 25 25 9 6 6 7 7 6 6 8 7 7 7 9 9 12 11 12 27 26 39
41 41 41 41 37 42 42 41 25 18 12 9 9 10 10 17 19 12 10 9 8 10 19 19 33 33 33 36 36 36 36 36 36 36 37 50 50 50 48 50 50 50 53 50 47 47 47 57 57 40
50 50 50 50 47 47 50 50 50 50 43 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 44 40 28 28 28 44 44 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57
68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 50 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 57 57 52 57 57
59 52 52 52 45 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 43 43 43 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 59 59 44 38 29 27 27 27 27 28 43 44 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 68 57 57 57 57 48 48 50 50 50
57 59 59 59 59 54 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 39 37 30 28 28 28 37 37 47 48 48 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 50 57 57 57
43 34 32 23 23 23 34 34 48 48 46 41 40 32 30 15 14 12 13 11 11 11 11 27 27 47 37 37 37 39 37 48 48 48 57 43 43 40 43 39 43 43 34 34 30 30 30 42 43 48
42 47 42 48 47 47 43 43 43 47 59 59 57 48 48 43 46 42 48 48 48 54 57 48 57 54 48 57 48 42 43 48 43 43 43 43 39 39 39 47 48 57 47 48 48 48 48 48 46 39
39 36 37 37 29 19 13 13 13 26 28 31 35 35 37 39 43 43 39 39 39 39 43 39 39 39 43 43 47 47 47 43 43 42 42 37 37 28 28 28 37 37 29 29 25 29 29 42 31 28
28 28 37 44 46 57 48 42 42 41 39 27 34 32 48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 54 54 57 57 57 59 57 48 43 43 40 40 43 43 48 47 47 42 39 39 37 39 32 32 20 28
28 41 39 41 41 39 34 28 30 18 17 25 25 28 30 35 35 37 37 36 36 36 37 43 46 46 46 47 47 43 41 32 37 43 43 37 37 37 37 37 37 43 43 39 41 37 37 37 37 32
30 25 30 30 35 34 37 31 31 30 30 17 13 12 18 14 28 28 32 30 34 32 28 25 24 22 24 19 29 22 22 19 29 30 37 37 33 35 36 33 32 30 28 23 21 30 30 30 33 28
28 28 28 29 25 34 21 11 8 8 8 8 17 23 32 28 24 21 19 28 24 34 18 19 16 15 14 12 |