BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-327J05.T7 (MSMg01no327_j05.b1) | MSMg01-327J05.TJ (MSMg01no327_j05.g1) |
ACC | AG444899 | AG444900 |
length | 745 | 729 |
length of high quality (start - end) | 379 (45 - 423) | 345 (73 - 417) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no327_j05.b1 PHD_FILE: MSMg01no327_j05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:12:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no327_j05.g1 PHD_FILE: MSMg01no327_j05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:12:30 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (127,315,640 - 127,316,007) | (127,487,093 - 127,487,434) |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCATTTGTCTTTGCGCCATGGGGGAGTCTGAGTTGGGATGGATTCCAG
GGTTATCAGCTCATGAGAGATGGATTTAGTGTGGAGAAAACATTGCAAAA
CTGAGTTTACGAGAGGGCACTTGGCATGTGTTTGAATTACAAGTCTGGCA
AAACTAGAATTTAATAAATTCATTGAATGAATCAACAAAAAGACCACCTA
CATGAAATAGTGGCATATGGGAATGGGATATGTTGAAGCTGTCCTCTGTG
GTTAGGGTAGCCCACAGCAATCTCCACCATGCAAATGAGGGCAGTCCTGA
TTGGCTAATATTTGATTTCCAGGACATACTGGGCTCACATGGTACAGCCT
GTGGTTCTGAGTTGTACTTGCCCCCCACCGGCCTTATTCACTTACATCAT
TCTGCAACCAGAAAGTGCTGTTTCCCTACTGCACTAGGGTGTAGCAGAGA
CTGATGGACAGTTCCTCCATAGACTGTCCTACCTATGTATCCTTCCCTTC
TGCCTACACCCTACCCAGACCCTATTGTTGATGTCAAGAAACACTTGCTT
ACCAGGACCTTGTTATACCTGTCCACCTTGACACGATCTCGTCATATCCC
GGCTACCATTTATCGACGCTCCAATGCCCATTTTCTAACCCCTCCTCACC
CGTCTCCCTTCCCCCTTTTACTCCCGATATCTTACTTCGCAATTC
| CATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTATGAAGCAAAGCCAGCCTTCAACAG
TGCGAGAGAGACTTCCTGGTTCTGGGACCATACATCAGGAGTTTGGTGTC
CTCAATACATTTCTGTTGTTGTTGTTTTATTATATTATTTACTACTAATA
ACTAAAAAGCTGGGGAAAACACTCCAGTTATCTGTCTGAGAGGAGAGGCG
ATACCTTTAATACTTGCTAGAGCTCTACAGAAGTATTTTTTTTATTATCA
TTGATACTAAAGTCATAAATTGCTCACATTATGGCATTAGTTATAATTTA
TAAAGGAAAATAATCAGAAGCAATATAGAAGAGGAAATGAGACGAGAATC
AAAGTGGAAGATACTAAGAAGCACCCCACGAGGCACATAAAATAGATGGT
TGAGTGTCAAACGGAACTCCTTCCTGACCAGGAATTACCTTACTTGTTTA
CATGGATTTAATGCAACAGCGAGAGTTAAATCCTGAAGTGGCTAAGGAGG
CAGAAGATGTTGGAAGCTCAAAGATACATATTTAATTGTGAGTCCAGAAT
AAAATAATTCTTGCCATATCCCAGAGAGAGTGAAATGGCTAAACTATCTT
TATGAAATGATAGATTTCAATACTCTAAGGATACTGTGCATATTTTCTTG
AGCTAAGGCCTTGCTTTGTATCCCTGTTA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 10 11 17 31 40 37 29 28 28 22 22 30 30 21 18 17 23 24 30 37 46 28 28 25 25 24 30 23 23 10 11 8 6 6 6 8 6 8 10 10 10 15 23 30 34 31 31
31 31 47 36 53 53 41 50 50 50 47 43 25 19 10 6 6 6 7 11 22 19 37 46 40 40 48 48 50 53 53 57 57 57 59 59 59 37 47 47 47 47 50 42 47 42 42 47 47 42
48 59 54 48 48 48 46 43 43 42 42 50 51 50 51 54 54 47 50 42 50 41 41 41 41 41 41 57 54 54 48 57 48 54 57 59 68 68 68 68 68 57 57 44 39 35 35 44 42 57
57 57 57 57 57 68 57 59 57 48 48 47 57 57 57 52 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 52 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 52 52 62 59 59
43 43 35 44 39 43 43 57 52 52 52 45 52 52 52 52 57 44 42 31 31 35 43 44 57 43 43 39 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 50 43 38
38 43 43 38 33 29 27 27 23 38 38 59 50 43 43 29 29 29 44 44 57 57 57 57 43 43 35 41 35 32 38 30 14 14 14 32 32 35 35 42 42 35 37 28 30 30 32 32 44 44
44 42 39 36 44 28 37 37 57 57 57 54 54 54 54 57 59 48 48 32 29 25 23 23 23 25 23 40 44 37 23 27 27 31 37 39 43 43 42 37 33 30 37 37 43 42 42 47 48 43
39 33 30 28 32 23 28 29 29 17 20 29 34 39 41 43 34 30 33 27 21 21 19 18 22 13 13 9 12 11 11 16 25 41 39 46 37 41 28 28 23 28 24 29 21 29 29 33 39 40
43 40 40 28 23 20 20 24 19 12 12 11 11 12 21 21 28 28 28 30 28 27 27 22 22 22 14 16 12 13 13 9 14 18 18 11 10 9 9 8 10 12 8 11 11 11 11 10 10 10
12 12 16 18 11 11 11 12 11 10 10 10 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 9 9 8 8 8 8 9 15 35 21 21 13 9 8 8 8 8 8 8 12 9 10 10 13 10 13 13 23
13 10 8 8 8 8 9 8 10 10 9 9 9 11 14 15 11 11 10 13 10 10 13 11 9 8 8 8 8 11 16 22 15 12 10 10 10 11 12 12 12 10 10 9 9 9 12 9 10 10
8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 13 10 10 15 10 8 8 13 10 12 10 9 8 8 8 8 8 8 15 15 12 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8
8 8 8 8 10 8 9 10 8 8 7 6 10 8 9 9 8 8 10 10 10 8 8 6 6 10 10 11 10 10 10 10 8 10 6 6 6 6 10 9 13 9 9 11 10 10 15 15 8 8
8 8 8 12 10 10 10 8 8 8 10 14 9 9 10 13 11 10 10 10 10 10 10 12 9 9 9 11 12 10 10 10 10 9 10 15 10 10 8 9 9 9 12 16 13 | Open.Hide.12 14 15 13 11 9 9 13 9 12 9 9 10 14 23 39 39 37 37 37 37 37 39 39 50 47 41 39 25 18 9 9 11 11 10 10 8 10 8 8 8 13 15 39 37 37 37 41 41 53
53 57 57 48 48 48 48 28 21 19 8 8 8 10 10 9 9 10 19 19 25 28 41 39 44 44 53 53 53 57 59 59 59 57 57 57 53 53 50 50 50 59 42 42 42 42 42 48 48 42
42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 54 54 57 57 57 68 68 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 59
59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 59 59 59 59 59 57 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 52
52 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 54 57 54 57 57 59 59 50 43 43 43 43 50 50 59 59 59 57 57 54 54 57 59 48 48 48 57 59 57 57 57 57 57 57 57
47 47 43 47 47 47 47 48 48 57 57 54 44 44 39 30 30 30 30 30 30 40 40 46 32 30 18 17 17 22 27 32 32 32 43 43 43 43 43 43 39 39 37 37 43 43 43 57 43 47
43 43 32 34 34 25 25 25 28 30 30 30 28 14 14 14 19 17 15 11 11 9 11 11 12 10 12 19 17 29 19 20 20 32 32 47 47 34 28 23 23 23 25 21 12 12 24 24 28 28
28 32 23 23 28 32 40 57 37 37 23 28 23 28 23 31 31 44 44 57 57 57 68 59 59 34 28 15 15 13 21 21 35 42 42 57 57 68 68 68 57 57 47 43 43 43 46 43 48 43
48 39 36 34 43 43 39 39 36 39 39 40 40 39 35 35 35 28 28 15 15 14 15 24 32 37 34 28 23 23 23 34 34 34 30 22 15 12 11 11 8 8 8 8 8 9 12 18 14 12
12 11 11 12 13 13 13 15 10 10 16 12 12 12 17 11 11 11 11 11 11 12 18 18 19 21 15 19 16 23 14 12 15 15 16 19 26 19 17 27 16 11 11 11 12 11 12 10 10 10
9 11 11 18 18 21 22 28 30 30 19 15 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 13 11 11 11 15 15 17 19 19 19 13 11 11 15 16 11 11 11 15 21 16 14 22 21 18
18 28 21 28 25 15 15 15 17 15 10 10 9 9 18 16 9 9 8 8 8 8 10 10 19 12 12 11 12 12 12 12 15 16 10 9 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 12 13 13 13
10 10 10 10 16 12 14 26 23 21 12 15 10 10 9 8 10 8 8 6 6 8 6 12 20 10 8 8 8 |