BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-342N19.T7 (MSMg01no342_n19.b1) | MSMg01-342N19.TJ (MSMg01no342_n19.g1) |
ACC | AG456312 | AG456313 |
length | 723 | 727 |
length of high quality (start - end) | 518 (54 - 571) | 495 (62 - 556) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_n19.b1 PHD_FILE: MSMg01no342_n19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_n19.g1 PHD_FILE: MSMg01no342_n19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:30 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCGCTATACGACTCACTTTTTCGAGAGGAGCCGCGGAATTCTGGCCTGGC
ACACTCCCTGGAATTCCTAGCTGAGAGGCCTAAGACACTTGTAGGTTTTT
TTATGGACAAAACCATTCAACCACTGTATTTTCCCATGGCTTCATTGTTA
TTTTCTAAGAACTGCAGCTCCCAGAATACAGAAGTTACCTCCCTTGCGTA
GGTGGGGTTTATGGGTTAATTTTGGGTCTTATATCTTTTACATAAAGGCA
ATGCCTTGGACTTACAAGCCATAGAACACTATGGAGTGCTGGGCTACTTA
TTTTTGCATTTATAAATGTAAACACGATTTAAGAAATCAATTACTAGTCA
TCGGGGCACTGCTATCAACTTCCTGTTGGGAAGGGAGAAGGGTTCTCTAA
CTAGGAGTCAGTCCCTGGGTAGACTCCTGCCAGGAAGTGAAATGAGATTA
GTCGTATGGATTCATTTCTTCTTAATTAGAATTTGTGATTAAAATTAACC
CCCATTGTGTGTGTGTTTCCCAGGAGCGCCCTAGCCACACCCTCTATGGG
TGTCTATTTGTGTTTCTTGATCCTGAATACTGCTGCCCTAGTGTTCTAAT
CTGAACAAAAGCCGCACTGCACTCTGATTTTATTTTTGTCATTCCTGACT
CCTCCATTCTCTTTGTTTTCATATAACCCAATTTTTATTCCCCTTTTAAC
CCCTTTTCTCTTAATTGAGGCTT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXACGAGAGAGAGGAGAAATAGCAAAGTCAGATAGAATAGA
ATAATTATGCAGGCCAAGGCCAACTGAAAAGCTGTCATGCACAAATGAAA
TCTATACAGCCATTGTCGAGGGCTAAGGTAGGGAGAAATGAGAACAACAC
GGGGCTGGTAGAGATGGCTCAGTGGTTAGGGGCATTTGCTGCCCCTGCAG
ATGACCTCGATTGGGCTCTCAGCACCCACGTGGCTGCCCATTACCATCTG
TAAACCCCAGTTCCAGGGAAGCTCATGCCCATTTGTGGCCCCCAAGGCCC
CAGGCAAGCAGGCGGTCCATAAACACATTCAGAGACAAACACTCATACAC
ATACAAATAATGTGTTTTTAAAATGTAGGTGTGAAACATACTGACTATAC
CTTAAGAACATGACCAACAGTGGGAGCCTGCCGTGCAGGTATATAATAGG
CCTCTGGACATGTCCGTTCTTACTCCAGTGGATAGCACTGACATGGGACT
TACTGAGCATCTAGCACGTACAAAGGGGACACAGAATCCCACCCTTGGAG
CTGCAGACAGAGTGAAACACAGTATAACACGGTGGCTGTCAGGAAGCAGG
CCCTGTGCTCCAGAAAAACAGAGGGGGTGTCCTGTAAAAAAAGAACAAAC
GCCCTCTTTGTACTCGGGATTGTTTTT
|
quality values | Open.Hide.10 10 15 10 8 8 13 15 25 28 59 26 17 13 12 12 9 12 12 11 9 8 8 7 10 11 15 15 12 11 11 16 23 34 59 23 21 18 21 23 25 23 23 9 9 9 9 9 7 7
7 7 11 15 22 32 37 34 37 43 30 35 30 30 36 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 43 37 37 35 42 42 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 57 43 43 43 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 47 47 44 27 19 9 9
8 10 10 18 21 11 11 12 16 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 39 35 35 39 59 57
57 59 59 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 48 52
52 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 50 50 50 47
54 54 59 59 43 43 47 47 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 57 50 43 43 43 43 43 50 50 47 32 32 20 20 20 32 32 39 36 36 39 39 39 39 37 41 44 44
43 43 46 46 43 47 39 39 39 43 43 43 39 39 30 30 30 40 40 48 48 48 48 43 48 48 48 48 39 39 37 37 32 30 30 32 37 37 37 31 34 39 59 59 39 40 40 37 37 22
30 14 15 15 32 32 41 27 15 8 8 8 8 10 25 25 59 32 29 19 17 12 16 11 10 13 14 13 16 16 21 15 18 14 18 16 18 17 23 13 14 19 12 10 10 8 13 10 16 15
14 14 14 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 15 9 12 11 12 9 9 9 9 15 10 10 13 13 8 10 8 8 8 19 21 10 9 9 9 9 16 15 12 8 9 13 10 10 10 10
14 9 9 11 11 11 12 8 8 8 15 10 6 6 6 8 6 10 11 12 8 10 9 8 8 10 8 9 9 9 10 7 9 9 9 12 12 17 20 28 28 22 25 25 15 16 13 10 8 8
9 13 10 11 10 10 10 8 8 8 16 13 11 8 10 8 8 10 8 10 10 10 10 | Open.Hide.25 25 30 30 37 39 39 37 37 39 39 39 44 44 27 30 10 10 9 10 10 13 16 26 16 18 18 34 27 57 57 53 50 43 43 47 42 42 43 43 53 68 35 34 16 12 10 10 15 15
27 33 57 68 68 50 50 50 50 50 47 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 48 48 48 59 59 68 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 53 50 50 57 57 50 57 57 57 57 57 57 50 59 59 50 50
50 46 43 41 41 43 37 41 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 32 32 35 39 39 39 41 41 47 48 59 59 43 43 43 43 43 43 43 43 46 47 57 48 48 48 48 46 39
39 39 37 37 39 29 31 37 37 37 41 41 41 34 34 28 24 24 30 29 37 37 37 37 36 32 43 43 41 28 28 26 33 28 28 36 34 37 37 37 37 28 15 9 9 9 9 12 19 32
39 32 31 19 22 14 15 14 17 21 19 19 12 12 24 30 34 35 32 18 14 15 9 9 9 16 18 18 14 14 10 19 15 16 19 18 21 28 22 16 8 8 8 10 12 13 11 12 16 15
18 15 13 16 17 13 11 11 11 13 13 10 10 10 10 9 11 12 9 9 9 17 17 13 8 9 9 9 9 13 19 14 14 9 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 10 8 8 9 10 11
12 18 12 13 9 9 9 13 13 10 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 16 12 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 13 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 13 9 10 10 10 9 9 9 9 9 11 16 19 10 8 8 8 8 10 8 |