BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-379O20.T7 (MSMg01no379_o20.b1) | MSMg01-379O20.TJ (MSMg01no379_o20.g1) |
ACC | AG484423 | AG484424 |
length | 755 | 755 |
length of high quality (start - end) | 474 (40 - 513) | 510 (69 - 578) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no379_o20.b1 PHD_FILE: MSMg01no379_o20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:20:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no379_o20.g1 PHD_FILE: MSMg01no379_o20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:20:49 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCC
ACACCCCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAACCCCTAGCTTTCGAGCCTTGT
GGCCGACATCCGTTATCTCCTGTGTGAGATACATGTCGGTCCGGAGCTCC
GTAATTTAACATCCTCATGTATTTACATCCAGATGATGGTCCTTCGTGAT
TTTTTGGGTGCATGCCGAATCGGGAATTGGGTGGGGGTTTCCCCACTAGG
TCTAACACTGTCAGTGTCAGAGTGGGCTTTGAGACACTCCAGCCTGCCTG
GGGAACTCGGAGTTCCTTCCATAGAGGAAATGGACCCTGCCTGGATTCTG
CTCTGCTTCTGTGATGATAATGGACTGAACCTCTAAAAGTGTAAGCCAGC
CCCAGTTAAATGTTGTCCTTATAAGAGTTGCCTTGGAGCTGGGCAGTGGT
GGTGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTTGGAGGCAGAAACAGGCCAGCCTG
GTCTACAAAGTGAGTTTCAGGACTGCCAGGGCTATACAGAGAAACCTTGT
CTTGAAAAACAAAACAAAACAAGAGTTGCCTTGGTCATGCTGTCCCTTCT
CTAGAATGGAAAACCTAATTAAGAATTTGCCTTTATGGAAAAGGCTTGCT
ACTTTTACCCAAGTTTCCTGTGTGTTTTGTTTATTGTTTGATCCCTCTTA
TAATTTTGGAATTTCTTCCTCAACCGTGTTTTGCTTAAAATAGCCCCACT
TTATG
| TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTATTTAGCTCTGTTATTTCAAACTTACTTT
TTTCATCTGTGATGCCATACAAATTTCAGTTTTCTCATTTGTCAAACTCT
TAATTATATTCTGGGAAGGCTGGTGCTGGTATTTGGCATCTACAGATAGC
ATGTTGTTCCATAAATAGTGTTTCTATCAGTAAACCCGCATCAATAAAGA
AAAAAGATGAAAAGTATTACTGGAACATGAGCAAATAGTAGGACTCTCCA
TTGCACAGATTAATAACACAGAAATATCAGCTTATAAAATGCTTCGACAA
ACAAAATACTAACAACACAAAGGAAACAAGATGGGAGGTTCTAGTACCCA
GGTATAACAAAGAAATAAGCAAAGACACGTGAGAACAGGAAGCATAGTCT
GAGGTCACTGGTATCCCCCTCACCACTACCCCACCCTACCCACACCTGAC
CGCTACACACACACCCAACCCCAGGCTCCAGAAAAAATAACGGGAGAGCT
TAGAGGAAAGACAAAGATCTGTGCAGTAGACATTCACAGCTCTAGTCTCT
AGGCTAGTAAGCCAGTTACTGATCCTCCAAGCCCACTTCCCATCTCAGCC
AGAAGCAGTCATGTGAACTAAGGGGGCCATCAGTACTGGTCTAATAAAGT
ACCAAATTTCCGATAGAAGGAGAATTATGTTCATTAGACCTGTTGTCCAC
ATGAA
|
quality values | Open.Hide.34 34 34 39 41 37 37 37 31 17 17 10 9 9 19 19 39 44 48 30 28 26 22 17 19 13 12 15 11 10 11 12 23 28 22 24 17 17 14 26 31 50 57 36 36 36 36 41 44 39
33 33 21 23 11 11 12 12 20 18 28 34 41 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 50 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 52 52 43 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 57 57 57 54 54 54 59
59 59 46 46 43 47 59 59 57 57 57 48 43 43 43 47 54 59 59 59 59 48 57 59 57 48 57 47 47 42 42 42 47 59 57 57 48 48 48 47 47 46 47 41 37 37 37 32 32 39
59 47 47 36 34 34 47 46 48 48 59 59 47 47 47 39 39 37 30 30 30 37 39 48 30 32 28 20 20 28 28 34 28 28 28 19 19 25 25 23 18 17 17 17 30 34 28 24 25 18
18 28 28 34 28 28 28 37 37 28 32 20 20 20 28 24 23 19 13 14 12 19 12 13 13 17 17 25 28 24 24 31 22 30 17 16 11 11 11 11 12 12 27 27 32 18 26 24 20 20
28 24 19 15 15 13 18 15 13 14 14 12 11 11 10 10 10 14 16 17 21 18 34 18 18 13 12 10 9 11 15 12 11 9 11 9 15 15 25 21 26 20 19 16 24 21 12 8 6 6
6 6 8 10 10 11 10 10 9 9 9 9 9 11 17 10 6 6 6 8 6 10 10 10 14 18 30 14 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8
8 9 13 15 16 14 10 10 8 8 8 8 10 10 11 12 12 12 9 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 9 9 9 9 6 8 6 6 8 8 14 12 17 14 8 8 13 10
10 8 11 11 12 8 9 8 8 8 8 16 11 13 13 15 15 24 13 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 7 8 10 8 8 8 9 12 8 8 8 8 8 8
15 10 11 9 9 | Open.Hide. 9 9 10 12 9 10 10 15 15 37 32 37 39 39 28 29 28 24 24 28 27 27 28 15 17 14 15 28 28 30 28 18 20 20 30 23 34 32 32 29 34 28 30 30 33 33 33 37 37 37
37 34 31 19 21 27 30 33 33 36 59 59 28 24 24 30 32 30 41 42 50 50 50 44 53 47 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 43 43 37 39 39 42 48 68 68 68 68 68 68 68
68 42 42 29 29 29 42 59 68 68 68 68 53 50 50 47 47 50 51 57 68 68 68 68 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 41 41 20 20 28 41 44 68 57 57 57 57 57 57 57 59
59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 62 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 52 52 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52
52 52 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 52 52 52 57 52 57 57 52 52 52 43 43 37 43 43 57 57 57 52 54 54 59 57 57 57 57 57 57 43 43 43 50 43 48 59 59 59
59 54 54 59 59 68 68 68 68 44 44 31 31 42 44 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 48 46 39 39 46 46 36 36 43 46 57 47 43 43 48 48 57 54 54
54 48 57 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 57 59 59 59 57 57 48 43 43 39 43 39 40 34 33 28 23 23 20 22 34 37 34 34 32 24 20 30 28 28 31 35 35 37 39 29 23
23 9 9 17 24 29 34 32 41 34 30 24 18 18 24 27 23 28 28 39 37 34 28 28 25 24 32 19 19 12 19 19 19 25 14 14 14 26 28 39 40 40 40 30 30 16 15 16 19 18
17 15 20 35 31 26 23 14 14 15 21 22 19 17 10 8 6 6 8 10 13 8 8 8 10 21 24 17 18 20 30 16 16 12 12 11 15 10 10 10 11 19 23 21 16 15 11 10 10 10
10 10 10 11 11 11 20 11 11 11 12 12 11 11 11 16 16 10 8 6 6 6 7 7 9 10 11 11 11 10 10 7 8 8 8 10 10 6 6 6 7 7 7 9 17 11 9 8 8 8
8 8 10 10 10 11 9 8 10 12 9 9 9 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 12 18 12 11 10 10 10 8 8 8 6 6 11 11 18 16 10 10 10 9 10 10 10 11
11 11 11 11 11 |