BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-388D16.T7 (MSMg01no388_d16.b1) | MSMg01-388D16.TJ (MSMg01no388_d16.g1) |
ACC | AG490774 | AG490775 |
length | 1,574 | 726 |
length of high quality (start - end) | --- | 536 (67 - 602) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_d16.b1 PHD_FILE: MSMg01no388_d16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_d16.g1 PHD_FILE: MSMg01no388_d16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:31 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTCTCTCTCCTTTTTTCTCNNNNNNNNTTATACACTAAGCAGAAGAGGA
AGATAGGAGGGGAAGTANATCATCTGAGANTCATAATTCTCTCCTCACAT
CATAAACGTCGTCTGAATGTGCGCGAGGNGTTATTATGTAGTTATATCTC
TCTATATGTCTAGATACTCATGAAGCACGTGACTGGAAGCGCTATTCTAC
GCTCATCTTAGGATGTGTCGCGTCCCCATACATAGTAGTCGTTATGTCCA
TGCTCGTAATGCTGCTCCACGCCGACAGTACTGCTATCATCATCGCGATC
CGTAACCCTCTCATATTCCTACTGTGGTGCTATAGTAANTGCCTAGTCAT
TAATCGGATAATCATGTGAGCGTGCGGGACGTATACATATCATTGACATG
ATGAGAGAGAAGAGAGAGAGAAGCATACGATGGAAGTACCGTCAGTATGA
GAGCTTATGTGTCGCTTCTTGACTTTAGCGTGNCATTGTCTTCGTCACTT
ACGCAAGATCTCTAGATGCCGTCTGCGCTGCTCGCCTTGTATCTATATGC
TCTTATCGCGCGTGNGGTCGCGGTGAGCGGCGAGCTGGTGTCTTCGTCGN
GCGTGATTAGTTACGCGTGTACTTGCGTATGAATCATTGTGATTCACGCG
ACGTTGCGNAGCTCACCGACCTGCCTATAACGCCTCCNATCTTATAACTA
CTATCAAATGTACGTATACACCTCATCTTAGATTCACTCTCTACACATCC
ATCCGATCATACCTCCTAACACTGTCGTCTCCTACTACTCATCCCTACGT
CACATATACTTCCACATCTTTACGTCATGGACCGATGATCGCATAGATCA
CGGATCNATCAGCGNGACTGCGGACGAGCGACTATCTCGTATCTGACACA
TTATCACACTATAATATATACTCACCAATATATACTACTATACCACGCGT
ACATACTGCTTGCGTATGCAGTACATCGCATCGGCTGAGCGACGTGATAG
CATGCGTATCGACACTCTCGAATTACACTCGATCGTATATATGTAGTCGT
CGACTAGAGCACTAGGTACGTAGTCGCACGTAGGTATATATCTCGTCACG
ATGAACGACTAGTACACTGCAGCATGATCACACATACGTATACATACATT
GACGTGCTAAGCGCTTGCAACTCTCACTCTGGCTCCGTGTGATTTGTCTA
CTTCACACGTCGTGTTCGCCATCACACGAGTTTGCTGCGTTNTGTGCTAG
GCGGCACATAAGGCGTCGCAGCGGCATGTGNCNTACTCTATTCATATCCA
CGTGACCGCGGATACGCCGCATATATGNTGATAGATGAGCAGCCCTGTTA
GATCGTTGTCTGGGAAGCGCNCTGACTACGTCTCTGTGCAGCACAAGNAG
GCGTGTCGGATCATAGTAGGTTATGCTCGAGANTATATNTATAAGCACGT
GGCAGACTAGCGCACGCGCTCACAATGCCGTGAGCTACTACGCGAGTGAC
GNCCCGGCCGTGTCATCATGTGTCGTACCGACTGCGNGACANTCGCGCCA
NAGAGATCTGCATGCAGCAGCCGN
| ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTGGGGAGTGCTGGGGTCAGCATGAGGCCTG
AGTGTCCATCAGTAATGAGCAAGCTTTCTCTGAGACACAACAGAGGTTAC
AGAGATGACAGAATGGAATGGGGTGGGAGTCAGGGTGGAGAGGGCTGGAG
TCCCTTCTTACCTACCTTGTCCCAGCACGGAGTTGTGAACAGTCCAAGAA
TTATGGCTTCCAACTAAGTCTTTCAGGTTGCCACATGGGGATTTGTGGAG
GCAACAGTTTTTTCACACTTCCTTTAGTGGTTTGATGACTCAAGTAATAA
ATTTCAAATATTTAGACAAATGGTTTAGAAGGTCTCCAACTCTTCCTACA
TCCTGGGGCTCCCAGACATGTTTGGGAAGTATTTGCCTTCCAGCTTCCCC
TTAGTCCTAGGTATGTGAGGCCCAGGATACCCCACCATTCACTAGCCCCT
TTGCAAGTGCCTTTTGTAAATAGATTGGTCTCACATTGTTCTATTTTGAG
TGGACCATCTGCTTGCTGTGGGAGCCCCCTGCTGATTCAGCAGGTGTTTC
AGACAGAGATGAGCTATAACCTCCCCCACCCCAGAACCTCAACACTCTCA
CATTCATCTCTTTTAGTCCCTCTAGGTACCGAGAGCAAAATGCACAGATG
CTCAGGGAAGCTTAATGGCTCAGATG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 10 6 6 6 7 8 6 8 8 8 9 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 14 15 22 17 8 8 8 7 8 8 8 10 8 8 8 10 12 9 9 6 6
6 7 8 8 11 10 11 10 9 9 9 9 10 8 8 6 3 0 3 8 8 8 8 6 6 8 6 6 3 0 3 8 7 6 8 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 6 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 13 13 3 0 3 11 10 8 8 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 9 8 10 10 10
10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 10 10 10 10 10 10 10 9 10 8 6 6 6 6 6 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 11
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 7 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8
8 9 11 9 8 8 6 6 8 10 13 10 10 10 10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 8 8 12 6 6 8 6 6 6 6 7 8 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 10 9 6 6
6 6 8 8 9 9 9 11 10 12 10 10 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 10 10 6 6 6 6 10 10 11 6 6 6 6 6
6 8 8 7 6 8 6 9 12 10 10 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 7 7 7 8 11 11 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 8 9 9
9 9 9 9 8 6 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 7 6 8 6 9 6 8 6 6 6 6 6 8 8 7 7 7 8 6 6 6 3 0
3 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 16 15 10 8 8 8 6 6 6 7 10 10 8 8 10 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 8 11 13 10 10 10 8 8 7 7 10 6 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 8 8 12 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 15 12 11 8 8 8 8 10 9 9 9 7 6 10 8 7 6 8
8 8 8 6 7 6 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 7 9 9 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 12 13 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6
6 6 8 6 8 8 11 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 11 10 10 9 8 8 8 8 8 10
10 10 10 9 9 3 0 3 8 6 6 8 6 3 0 3 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 9 7 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 9 6 8 6 6 8 8 10
13 10 14 9 7 6 6 6 8 8 10 15 10 10 10 12 11 11 6 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 7 9
9 9 9 8 8 8 11 10 8 9 9 9 9 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6
6 6 8 8 10 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 6 9 7 9 9 7 8
8 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 13 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 10 8 9 8 8 8 8 8 11 11 9 9 12 8 6 6 6 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 7 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6
6 6 6 13 18 18 12 8 8 8 6 8 8 10 10 10 10 9 8 8 8 10 11 11 11 12 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 3 0 3 9 10 11 11 8 8 8
8 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6
8 8 10 13 10 11 13 10 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 11 13 11 11 8 8 6 3 0 3 11 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 7 9 10 10 10 9 9 9 9 10
10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 11 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 10 9 12 9 9 9 10 10 10 9 9 9 3 0 3 8
6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 8 8 3 0 3 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 6 6 9 9 10 9 9 8 7 6 6 8 6 7 8 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8
3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 8 8 7 3 0 3 9 9 3 0 3 12 12 18 10 9 9 3
0 3 12 12 13 13 10 8 6 6 6 6 9 9 11 11 9 6 6 6 6 6 3 0 | Open.Hide. 6 6 8 8 9 8 8 8 12 21 33 39 39 44 44 44 44 44 39 36 34 23 17 23 9 9 9 9 9 12 15 13 10 15 13 19 16 28 23 30 30 22 18 18 21 27 22 34 24 13
10 10 10 10 12 12 27 23 39 36 17 13 13 19 22 25 47 47 50 50 50 50 53 53 53 53 50 50 42 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 54 50 50
53 68 50 46 42 33 31 31 37 42 48 48 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 54 54 47 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 44 43 37 37 37 42 42 35 35 42 48 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 54 54 68 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 53
50 50 50 36 36 28 20 22 16 17 14 12 11 12 12 16 22 34 41 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 47 43 43
43 43 47 47 47 43 43 43 48 48 68 57 59 54 57 57 44 48 43 44 46 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 42 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 50 43 43 43 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57
44 44 44 59 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 54 54 54 59 57 59 59 59 59 59 59
57 57 57 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 43 44 42 48 50 43 43 39 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 43
43 43 48 42 43 42 42 42 43 48 48 48 48 57 48 48 48 48 39 39 39 39 39 39 37 37 37 32 28 28 34 34 39 37 31 22 19 19 18 17 17 23 19 19 28 28 28 28 22 13
13 18 18 17 17 26 21 21 21 23 23 14 20 28 28 30 17 17 17 17 26 24 31 32 17 17 9 9 10 13 29 20 28 14 10 10 14 15 15 10 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6
6 9 9 21 10 11 10 10 11 10 22 22 24 12 12 10 17 10 8 8 10 10 10 9 15 15 9 9 10 14 17 23 14 13 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7 10
10 16 11 11 11 11 11 13 15 15 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |